STAT6 - STAT6

STAT6
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1OJ5, 4Y5W, 4Y5U
Идентификаторы
Псевдонимы	STAT6, D12S1644, IL-4-STAT, STAT6B, STAT6C, преобразователь сигнала и активатор транскрипции 6
Внешние идентификаторы	OMIM: 601512 MGI: 103034 ГомолоГен: 2373 Генные карты: STAT6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q13.3 Начинать 57,095,408 бп[1] Конец 57,132,139 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 D3 | 10 74,59 см Начинать 127,642,986 бп[2] Конец 127,660,957 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • идентичное связывание с белками • последовательное связывание ДНК • связывание протеинфосфатазы • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II Сотовый компонент • ядро клетки • нуклеоплазма • ядерный хроматин • мембранный плот • цитоплазма • цитозоль • не мембрана Биологический процесс • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • Обязательство к линии Т-хелперов 1 • регулирование пролиферации клеток • ответ на цитокин • сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-4 • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • клеточный ответ на перекись водорода • пролиферация эпителиальных клеток молочной железы • клеточный ответ на активные формы азота • положительное регулирование выработки интерферона I типа • положительная регуляция переключения изотипа на изотипы IgE • морфогенез молочной железы • отрицательная регуляция иммунного ответа 2 типа • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • преобразование сигнала • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • цитокин-опосредованный сигнальный путь • положительное регулирование термогенеза, вызванного холодом • ответ защиты • Каскад JAK-STAT • ответ на пептидный гормон • Каскад JAK-STAT участвует в сигнальном пути гормона роста Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6778	20852
Ансамбль	ENSG00000166888	ENSMUSG00000002147
UniProt	P42226	P52633
RefSeq (мРНК)	NM_001178078 NM_001178079 NM_001178080 NM_001178081 NM_003153	NM_009284
RefSeq (белок)	NP_001171549 NP_001171550 NP_001171551 NP_001171552 NP_003144	NP_033310
Расположение (UCSC)	Chr 12: 57,1 - 57,13 Мб	Chr 10: 127.64 - 127.66 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Преобразователь сигналов и активатор транскрипции 6 (STAT6) человек ген. В белок кодируемый этим геном, является членом Семья СТАТ из факторы транскрипции.^[5][6]

В ответ на цитокины и факторы роста члены семейства STAT фосфорилируются киназами, ассоциированными с рецепторами, а затем образуют гомо- или гетеродимеры, которые перемещаются в ядро ​​клетки, где действуют как активаторы транскрипции. Этот белок играет центральную роль в обеспечении IL4 опосредованные биологические ответы. Обнаружено, что он индуцирует экспрессию BCL2L1 / BCL-X (L), который отвечает за антиапоптотическую активность IL4. Нокаут-исследования у мышей предположили роль этого гена в дифференцировке Т-помощник 2 (Th2), экспрессия маркеров клеточной поверхности и переключение класса иммуноглобулинов.^[7]

Взаимодействия

STAT6 был показан взаимодействовать с:

• CREB-связывающий белок,^[8][9]
• EP300,^[8]
• IRF4,^[10]
• NFKB1,^[11]
• Коактиватор ядерного рецептора 1,^[9][12] и
• SND1.^[13]

Патология

• Слияние генов
  • Повторяющиеся соматические слияния двух генов, NGFI-A-связывающий белок 2 (NAB2 ) и STAT6, расположенный в хромосомной области 12q13, были идентифицированы в солитарные фиброзные опухоли.^[14]
• Усиление
  • STAT6 амплифицируется в подмножестве дедифференцированной липосаркомы.^[15]

Смотрите также

• Интерлейкин 4

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000166888 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000002147 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лик Дж. П., Хэмлин П. Дж., Белл С. М., Ленч Нью-Джерси (1997). «Присвоение гена STAT6 (STAT6) полосе хромосомы человека 12q13 путем гибридизации in situ». Цитогенетика и клеточная генетика. 79 (3–4): 208–9. Дои:10.1159/000134723. PMID  9605853.
6. Hou J, Schindler U, Henzel WJ, Ho TC, Brasseur M, McKnight SL (сентябрь 1994 г.). «Интерлейкин-4-индуцированный фактор транскрипции: IL-4 Stat». Наука. 265 (5179): 1701–6. Bibcode:1994Научный ... 265.1701H. Дои:10.1126 / science.8085155. PMID  8085155.
7. «Ген Entrez: преобразователь сигнала STAT6 и активатор транскрипции 6, индуцированный интерлейкином-4».
8. McDonald C, Reich NC (июль 1999 г.). «Сотрудничество транскрипционных коактиваторов CBP и p300 со Stat6». Журнал исследований интерферона и цитокинов. 19 (7): 711–22. Дои:10.1089/107999099313550. PMID  10454341.
9. Litterst CM, Pfitzner E (декабрь 2001 г.). «Активация транскрипции с помощью STAT6 требует прямого взаимодействия с NCoA-1». Журнал биологической химии. 276 (49): 45713–21. Дои:10.1074 / jbc.M108132200. PMID  11574547.
10. Гупта С., Цзян М., Энтони А., Пернис А.Б. (декабрь 1999 г.). «Клон-специфическая модуляция передачи сигналов интерлейкина 4 с помощью фактора регуляции 4 интерферона». Журнал экспериментальной медицины. 190 (12): 1837–48. Дои:10.1084 / jem.190.12.1837. ЧВК  2195723. PMID  10601358.
11. Шен СН, Ставнезер Дж (июнь 1998 г.). «Взаимодействие stat6 и NF-kappaB: прямая ассоциация и синергетическая активация транскрипции, индуцированной интерлейкином-4». Молекулярная и клеточная биология. 18 (6): 3395–404. Дои:10.1128 / mcb.18.6.3395. ЧВК  108921. PMID  9584180.
12. Litterst CM, Pfitzner E (сентябрь 2002 г.). «Мотив LXXLL в домене трансактивации STAT6 опосредует рекрутирование NCoA-1 / SRC-1». Журнал биологической химии. 277 (39): 36052–60. Дои:10.1074 / jbc.M203556200. PMID  12138096.
13. Ян Дж., Айттомаки С., Песу М., Картер К., Сааринен Дж., Калккинен Н., Кифф Е., Сильвеннойнен О. (сентябрь 2002 г.). «Идентификация p100 как коактиватора для STAT6, который связывает STAT6 с РНК-полимеразой II». Журнал EMBO. 21 (18): 4950–8. Дои:10.1093 / emboj / cdf463. ЧВК  126276. PMID  12234934.
14. Kabbinavar FF, Hambleton J, Mass RD, Hurwitz HI, Bergsland E, Sarkar S (июнь 2005 г.). «Комбинированный анализ эффективности: добавление бевацизумаба к фторурацилу / лейковорину улучшает выживаемость пациентов с метастатическим колоректальным раком». Журнал клинической онкологии. 23 (16): 3706–12. Дои:10.1200 / JCO.2005.00.232. PMID  15867200.
15. Дойл Л.А., Тао Д., Мариньо-Энрикес А. (сентябрь 2014 г.). «STAT6 усиливается в подгруппе дедифференцированной липосаркомы». Современная патология. 27 (9): 1231–7. Дои:10.1038 / modpathol.2013.247. PMID  24457460.

дальнейшее чтение

• Цзян Х., Харрис МБ, Ротман П. (июнь 2000 г.). «Передача сигналов IL-4 / IL-13 за пределы JAK / STAT». Журнал аллергии и клинической иммунологии. 105 (6 Pt 1): 1063–70. Дои:10.1067 / mai.2000.107604. PMID  10856136.
• Киселева Т., Бхаттачарья С., Браунштейн Дж., Шиндлер К.В. (февраль 2002 г.). «Передача сигналов по пути JAK / STAT, недавние достижения и будущие проблемы». Ген. 285 (1–2): 1–24. Дои:10.1016 / S0378-1119 (02) 00398-0. PMID  12039028.
• Hou J, Schindler U, Henzel WJ, Ho TC, Brasseur M, McKnight SL (сентябрь 1994 г.). «Интерлейкин-4-индуцированный фактор транскрипции: IL-4 Stat». Наука. 265 (5179): 1701–6. Bibcode:1994Научный ... 265.1701H. Дои:10.1126 / science.8085155. PMID  8085155.
• Такеда К., Танака Т., Ши В., Мацумото М., Минами М., Касивамура С., Наканиси К., Ёсида Н., Кисимото Т., Акира С. (апрель 1996 г.). «Важная роль Stat6 в передаче сигналов IL-4». Природа. 380 (6575): 627–30. Bibcode:1996Натура. 380..627T. Дои:10.1038 / 380627a0. PMID  8602263. S2CID  4340375.
• Шимода К., ван Дерсен Дж., Сангстер М.Ю., Саравар С.Р., Карсон Р.Т., Трипп Р.А., Чу С., Квелле Ф.В., Носака Т., Виньяли Д.А., Доэрти П.К., Гросвельд Дж., Пол В.Е., Иле Дж. Н. (апрель 1996 г.). «Отсутствие IL-4-индуцированного ответа Th2 и переключения классов IgE у мышей с нарушенным геном Stat6». Природа. 380 (6575): 630–3. Bibcode:1996Натура. 380..630S. Дои:10.1038 / 380630a0. PMID  8602264. S2CID  4334441.
• Kotanides H, Reich NC (октябрь 1996 г.). «Интерлейкин-4-индуцированный STAT6 распознает и активирует целевой сайт в промоторе гена рецептора интерлейкина-4». Журнал биологической химии. 271 (41): 25555–61. Дои:10.1074 / jbc.271.41.25555. PMID  8810328.
• Никита Т., Кэмпбелл Д., Ву П., Уильямсон К., Шиндлер Ю. (октябрь 1996 г.). «Требования к экспрессии гена, индуцированной интерлейкином-4, и функциональная характеристика Stat6». Молекулярная и клеточная биология. 16 (10): 5811–20. Дои:10.1128 / mcb.16.10.5811. ЧВК  231582. PMID  8816495.
• Шен СН, Ставнезер Дж. (Июнь 1998 г.). «Взаимодействие stat6 и NF-kappaB: прямая ассоциация и синергетическая активация транскрипции, индуцированной интерлейкином-4». Молекулярная и клеточная биология. 18 (6): 3395–404. Дои:10.1128 / mcb.18.6.3395. ЧВК  108921. PMID  9584180.
• Лик Дж. П., Хэмлин П. Дж., Белл С. М., Ленч Нью-Джерси (1998). «Присвоение гена STAT6 (STAT6) полосе хромосомы человека 12q13 путем гибридизации in situ». Цитогенетика и клеточная генетика. 79 (3–4): 208–9. Дои:10.1159/000134723. PMID  9605853.
• Никита Т., Курама М., Шиндлер Ю. (август 1998 г.). «Синергетическая активация промотора эпсилон зародышевой линии, опосредованная Stat6 и C / EBP beta». Журнал иммунологии. 161 (4): 1822–8. PMID  9712049.
• Патель Б.К., Кек С.Л., О'Лири Р.С., Попеску, Северная Каролина, Ла-Рошель, В.Дж. (сентябрь 1998 г.). «Локализация гена stat6 человека в хромосоме 12q13.3-q14.1, области, связанной с множественными солидными опухолями». Геномика. 52 (2): 192–200. Дои:10.1006 / geno.1998.5436. PMID  9782085.
• Чжу М., Джон С., Берг М., Леонард В.Дж. (январь 1999 г.). «Функциональная ассоциация Nmi со Stat5 и Stat1 в IL-2- и IFN-гамма-опосредованной передаче сигналов». Клетка. 96 (1): 121–30. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80965-4. PMID  9989503. S2CID  14758136.
• McDonald C, Reich NC (июль 1999 г.). «Сотрудничество транскрипционных коактиваторов CBP и p300 со Stat6». Журнал исследований интерферона и цитокинов. 19 (7): 711–22. Дои:10.1089/107999099313550. PMID  10454341.
• Харрис МБ, Чанг С.К., Бертон М.Т., Даниал Н.Н., Чжан Дж., Кюнер Д., Е Б.Х., Кватюк М., Пандольфи П.П., Катторетти Г., Далла-Фавера Р., Ротман П.Б. (октябрь 1999 г.). «Транскрипционная репрессия Stat6-зависимых генов, индуцированных интерлейкином-4, посредством BCL-6: специфическая регуляция транскрипции иепсилона и переключение иммуноглобулина E». Молекулярная и клеточная биология. 19 (10): 7264–75. Дои:10.1128 / mcb.19.10.7264. ЧВК  84719. PMID  10490661.
• Гупта С., Цзян М., Пернис А.Б. (октябрь 1999 г.). «IFN-альфа активирует Stat6 и приводит к образованию комплексов Stat2: Stat6 в В-клетках». Журнал иммунологии. 163 (7): 3834–41. PMID  10490982.
• Гупта С., Цзян М., Энтони А., Пернис А.Б. (декабрь 1999 г.). «Клон-специфическая модуляция передачи сигналов интерлейкина 4 с помощью фактора регуляции 4 интерферона». Журнал экспериментальной медицины. 190 (12): 1837–48. Дои:10.1084 / jem.190.12.1837. ЧВК  2195723. PMID  10601358.
• Даниэль С., Сальвекар А., Шиндлер У. (май 2000 г.). "Мутация увеличения функции в STAT6". Журнал биологической химии. 275 (19): 14255–9. Дои:10.1074 / jbc.C000129200. PMID  10747856.
• Аринобу Ю., Сугимото Р., Акаива М., Арима К., Оцука Т., Хамасаки Н., Изухара К. (октябрь 2000 г.). «Увеличение сигнального преобразователя и активация транскрипции (STAT) 6 и экспрессии STAT3 в стимулированных В- и Т-клетках». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 277 (2): 317–24. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3674. PMID  11032724.
• Масуда А., Мацугути Т., Ямаки К., Хаякава Т., Ёсикай Ю. (июль 2001 г.). «Интерлейкин-15 предотвращает апоптоз тучных клеток мышей посредством STAT6-опосредованной экспрессии Bcl-xL». Журнал биологической химии. 276 (28): 26107–13. Дои:10.1074 / jbc.M011475200. PMID  11369758.

внешняя ссылка

• STAT6 + транскрипция + фактор в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)