KLF6 - KLF6

KLF6
Идентификаторы
Псевдонимы	KLF6, BCD1, CBA1, COPEB, CPBP, GBF, PAC1, ST12, ZF9, фактор Круппеля 6, фактор Круппеля 6
Внешние идентификаторы	OMIM: 602053 MGI: 1346318 ГомолоГен: 996 Генные карты: KLF6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10п15.2 Начинать 3,775,996 бп[1] Конец 3,785,281 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 A1 Начинать 5,861,482 бп[2] Конец 5,870,394 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • связывание нуклеиновой кислоты • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание двухцепочечной ДНК Сотовый компонент • фибриллярный центр • ядро клетки • ядрышко • цитозоль • внутриклеточная мембраносвязанная органелла Биологический процесс • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • Дифференцировка В-клеток • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • цитокин-опосредованный сигнальный путь Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1316	23849
Ансамбль	ENSG00000067082	ENSMUSG00000000078
UniProt	Q99612	O08584 Q8BPQ2
RefSeq (мРНК)	NM_001008490 NM_001160124 NM_001160125 NM_001300	NM_011803
RefSeq (белок)	NP_001153596 NP_001153597 NP_001291	NP_035933
Расположение (UCSC)	Chr 10: 3.78 - 3.79 Мб	Chr 13: 5,86 - 5,87 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор Крюппеля 6 это белок что у людей кодируется KLF6 ген.^[5]

Это ген-супрессор опухоли.^[6]

Функция

Этот ген кодирует ядерный белок, который имеет три цинковых пальца на конце его C-концевого домена, богатую серином / треонином центральную область и кислый домен, лежащий в N-концевой области. Цинковые пальцы этого белка отвечают за специфическое связывание ДНК с богатыми гуанином коровыми промоторными элементами. Центральная область может участвовать в активации или посттрансляционных регуляторных путях, а кислый N-концевой домен может играть важную роль в процессе активации транскрипции. Он способен активировать транскрипцию примерно в 4 раза на гомологичных или гетерологичных промоторах. Связывание ДНК и транскрипционная активность этого белка в сочетании с его паттерном экспрессии предполагает, что этот белок может участвовать в регуляции и / или поддержании базовой экспрессии генов гликопротеинов, специфичных для беременности, и, возможно, других генов, не содержащих ТАТА-боксов. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок.^[7]

Взаимодействия

KLF6 был показан взаимодействовать с Фактор транскрипции Sp1.^[8]

Смотрите также

• Факторы типа Круппеля

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000067082 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000078 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Оньянго П., Коричонер Н.П., Патрито Л.С., Зенке М., Вейт А. (февраль 1998 г.). «Отнесение гена, кодирующего белок, связывающий основной промоторный элемент (COPEB), хромосоме 10p15 человека с помощью соматического гибридного анализа и флуоресцентной гибридизации in situ». Геномика. 48 (1): 143–4. Дои:10.1006 / geno.1997.5124. PMID  9503030.
6. Ли Д., Да С., Долиос Дж., Мартиньетти Дж. А., Нарла Дж., Ван Р., Уолш М. Дж., Фридман С. Л. (октябрь 2005 г.). "Регулирование опухолевой супрессорной активности фактора Круппеля 6 путем ацетилирования". Исследования рака. 65 (20): 9216–25. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-1040. PMID  16230382.
7. "Entrez Gene: KLF6 Kruppel-подобный фактор 6".
8. Ботелла Л.М., Санчес-Эльснер Т., Санс-Родригес Ф., Кодзима С., Шимада Дж., Герреро-Эстео М., Куреман М.П., ​​Ратциу В., Ланга С., Вари С.П., Рамирес Дж. Р., Фридман С., Бернабеу С. (декабрь 2002 г.). «Активация транскрипции эндоглина и компонентов передачи сигналов трансформирующего фактора роста-бета путем кооперативного взаимодействия между Sp1 и KLF6: их потенциальная роль в ответе на повреждение сосудов». Кровь. 100 (12): 4001–10. Дои:10.1182 / blood.V100.12.4001. PMID  12433697.

дальнейшее чтение

• Нарла Г., Фридман С.Л., Мартинетти Дж. А. (апрель 2003 г.). "Krüppel калечит рак простаты: успехи и перспективы KLF6". Американский журнал патологии. 162 (4): 1047–52. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 63901-6. ЧВК  1851219. PMID  12651597.
• Эль-Руби С., Ньюкомб Е.В. (декабрь 1996 г.). «Идентификация Bcd, нового протоонкогена, экспрессируемого в B-клетках». Онкоген. 13 (12): 2623–30. PMID  9000136.
• Коричонер Н.П., Бокко Д.Л., Панцетта-Дутари Г.М., Думур К.И., Флури А., Патрито Л.С. (апрель 1997 г.). «Новый белок цинкового пальца человека, который взаимодействует с основным промоторным элементом гена без бокса ТАТА». Журнал биологической химии. 272 (14): 9573–80. Дои:10.1074 / jbc.272.14.9573. PMID  9083102.
• Судзуки Т., Ямамото Т., Курабаяши М., Нагай Р., Ядзаки Ю., Хорикоши М. (август 1998 г.). «Выделение и начальная характеристика GBF, нового ДНК-связывающего белка с цинковыми пальцами, который связывается с GC-богатыми сайтами связывания промотора ВИЧ-1». Журнал биохимии. 124 (2): 389–95. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022124. PMID  9685731.
• Ратциу В., Лалазар А., Вонг Л., Данг К., Коллинз С., Шаулиан Е., Дженсен С., Фридман С.Л. (август 1998 г.). «Zf9, фактор транскрипции, подобный Круппелю, активируемый in vivo во время раннего фиброза печени». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (16): 9500–5. Дои:10.1073 / пнас.95.16.9500. ЧВК  21367. PMID  9689109.
• Окано Дж., Опиц О.Г., Накагава Х., Дженкинс Т.Д., Фридман С.Л., Растги А.К. (май 2000 г.). «Подобные Krüppel транскрипционные факторы Zf9 и GKLF коактивируют промотор кератина 4 человека и физически взаимодействуют». Письма FEBS. 473 (1): 95–100. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 01468-X. PMID  10802067. S2CID  34923598.
• Нарла Джи, Хит К.Э., Ривз Х.Л., Ли Д., Жионо Л.Э., Киммельман А.С., Глюксман М.Дж., Нарла Дж., Энг Ф.Дж., Чан А.М., Ferrari AC, Мартинетти Дж.А., Фридман С.Л. (декабрь 2001 г.). «KLF6, кандидатный ген-супрессор опухоли, мутировавший при раке простаты». Наука. 294 (5551): 2563–6. Дои:10.1126 / science.1066326. PMID  11752579. S2CID  31619019.
• Ботелла Л. М., Санчес-Эльснер Т., Санс-Родригес Ф., Кодзима С., Шимада Дж., Герреро-Эстео М., Куреман М. П., Ратциу В., Ланга С., Вари С. П., Рамирес Дж. Р., Фридман С., Бернабеу С. (декабрь 2002 г.). «Активация транскрипции эндоглина и компонентов передачи сигналов трансформирующего фактора роста-бета путем кооперативного взаимодействия между Sp1 и KLF6: их потенциальная роль в ответе на повреждение сосудов». Кровь. 100 (12): 4001–10. Дои:10.1182 / blood.V100.12.4001. PMID  12433697.
• Chen HK, Liu XQ, Lin J, Chen TY, Feng QS, Zeng YX (октябрь 2002 г.). «[Мутационный анализ гена KLF6 при карциноме носоглотки человека]». AI Zheng = Aizheng = Китайский журнал рака. 21 (10): 1047–50. PMID  12508640.
• Варке В.Г., Намбияр М.П., ​​Кришнан С., Тенброк К., Геллер Д.А., Коричонер Н.П., Аткинс Дж.Л., Фарбер Д.Л., Цокос Г.К. (апрель 2003 г.). «Транскрипционная активация человеческого промотора индуцибельной синтазы оксида азота с помощью фактора Круппеля 6». Журнал биологической химии. 278 (17): 14812–9. Дои:10.1074 / jbc.M300787200. PMID  12590140.
• Chen C, Hyytinen ER, Sun X, Helin HJ, Koivisto PA, Frierson HF, Vessella RL, Dong JT (апрель 2003 г.). «Делеция, мутация и потеря экспрессии KLF6 при раке простаты человека». Американский журнал патологии. 162 (4): 1349–54. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 63930-2. ЧВК  1851229. PMID  12651626.
• Jeng YM, Hsu HC (июль 2003 г.). «KLF6, предполагаемый ген-супрессор опухоли, мутирует в астроцитарных глиомах». Международный журнал рака. 105 (5): 625–9. Дои:10.1002 / ijc.11123. PMID  12740910. S2CID  25600692.
• Баят А., Уотсон Дж. С., Стэнли Дж. К., Фергюсон М. В., Оллиер В. Е. (июнь 2003 г.). «Генетическая предрасположенность к болезни Дюпюитрена: ассоциация гена фактора транскрипции Zf9». Пластическая и реконструктивная хирургия. 111 (7): 2133–9. Дои:10.1097 / 01.PRS.0000060531.98180.32. PMID  12794452. S2CID  22210744.
• Ривз Х.Л., Нарла Г., Огунбийи О., Хак А.И., Кац А., Бензено С., Ход Э, Харпаз Н., Голдберг С., Тал-Кремер С., Энг Ф. Дж., Артур М. Дж., Мартинетти Д. А., Фридман С. Л. (апрель 2004 г.). «Kruppel-подобный фактор 6 (KLF6) представляет собой ген-супрессор опухоли, часто инактивируемый при колоректальном раке». Гастроэнтерология. 126 (4): 1090–103. Дои:10.1053 / j.gastro.2004.01.005. PMID  15057748.
• Kimmelman AC, Qiao RF, Narla G, Banno A, Lau N, Bos PD, Nuñez Rodriguez N, Liang BC, Guha A, Martignetti JA, Friedman SL, Chan AM (июнь 2004 г.). «Подавление онкогенности глиобластомы с помощью фактора транскрипции Kruppel-подобного KLF6». Онкоген. 23 (29): 5077–83. Дои:10.1038 / sj.onc.1207662. PMID  15064720.
• Глинский Г.В., Глинский А.Б., Стивенсон А.Дж., Хоффман Р.М., Джеральд В.Л. (март 2004 г.). «Профилирование экспрессии генов предсказывает клинический исход рака простаты». Журнал клинических исследований. 113 (6): 913–23. Дои:10.1172 / JCI20032. ЧВК  362118. PMID  15067324.
• Рубинштейн М., Идельман Г., Плимат С.Р., Нарла Г., Фридман С.Л., Вернер Х. (август 2004 г.). «Транскрипционная активация гена рецептора инсулиноподобного фактора роста I белком-супрессором Kruppel-подобного фактора 6 (KLF6): потенциальные взаимодействия между KLF6 и p53». Эндокринология. 145 (8): 3769–77. Дои:10.1210 / en.2004-0173. PMID  15131018.

внешняя ссылка

• KLF6 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.