SIM1 - SIM1

SIM1
Идентификаторы
Псевдонимы	SIM1, bHLHe14, однобокий фактор транскрипции bHLH семейства 1, фактор транскрипции SIM bHLH 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 603128 MGI: 98306 ГомолоГен: 3715 Генные карты: SIM1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q16.3 Начните 100,385,015 бп[1] Конец 100,464,929 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 B3 | 10 24,87 см Начните 50,894,754 бп[2] Конец 50,989,152 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК • активность димеризации белков • активность гетеродимеризации белков • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • ядро клетки Биологический процесс • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • развитие многоклеточного организма • дифференциация клеток • развитие зачатка мочеточника • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • развитие нервной системы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6492	20464
Ансамбль	ENSG00000112246	ENSMUSG00000019913
UniProt	P81133	Q61045
RefSeq (мРНК)	NM_005068 NM_001374769	NM_011376
RefSeq (белок)	NP_005059 NP_001361698	NP_035506
Расположение (UCSC)	Chr 6: 100.39 - 100.46 Мб	Chr 10: 50,89 - 50,99 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Целеустремленный гомолог 1 также известен как основной белок спираль-петля-спираль класса E 14 (bHLHe14) - это белок что у людей кодируется SIM1 ген.^[5][6][7]

Функция

SIM1 и SIM2 гены являются гомологами Drosophila melanogaster целеустремленный (sim), названный так потому, что клетки в средней линии мутантного эмбриона sim не могут должным образом развиваться и в конечном итоге погибают, и, таким образом, парные продольные пучки аксонов, которые охватывают передне-задняя ось эмбриона (аналогично спинному мозгу эмбриона) схлопываются в «единственный» рудиментарный пучок аксонов по средней линии. Сим - это основная спираль-петля-спираль -PAS домен фактор транскрипции который регулирует экспрессию генов в клетках средней линии. Поскольку ген sim играет важную роль в развитии дрозофилы и имеет пиковые уровни экспрессии в период нейрогенез было высказано предположение, что человеческий ген SIM2, который находится в критической области хромосомы 21, является кандидатом на участие в определенных дисморфических особенностях (в частности, характеристиках лица и черепа), аномалиях развития мозга и / или умственной отсталости. Синдром Дауна.^[7]

Клиническое значение

Гаплонедостаточность SIM1 вызывает тяжелое раннее начало ожирения у девочки-человека с de novo сбалансированной транслокацией между хромосомами 1p22.1 и 6q16.2. ^[8] и было предложено вызывать фенотип, подобный Прадеру-Вилли, в других случаях.^[9] Кроме того, исследования на мышах показали, что гаплонедостаточность Sim1 вызывает ожирение, связанное с гиперфагия и не реагируют должным образом на повышенное потребление жиров.^[6][10] Сверхэкспрессия SIM1 защищает от ожирения, вызванного диетой, и избавляет от гиперфагии у мышей агути-желтого.^[11] кто нарушил меланокортин сигнализация. Ожирение и гиперфагия могут быть опосредованы нарушением активации меланокортина. PVN нейроны ^[12] и окситоцин дефицит у этих мышей.^[13] Было продемонстрировано, что постнатальное регулирование уровней Sim1 также приводит к гиперфагии и ожирению,^[14][15] подтверждая физиологическую роль Sim1 отдельно от его роли в развитии.

Взаимодействия

SIM1 был показан взаимодействовать с Ядерный транслокатор арилуглеводородного рецептора.^[16][17]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000112246 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000019913 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Chrast R, Scott HS, Chen H, Kudoh J, Rossier C, Minoshima S, Wang Y, Shimizu N, Antonarakis SE (июнь 1997 г.). «Клонирование двух человеческих гомологов однонаправленного гена SIM1 дрозофилы на хромосоме 6q и SIM2 на 21q в хромосомной области синдрома Дауна». Геномные исследования. 7 (6): 615–24. Дои:10.1101 / гр.7.6.615. ЧВК  310662. PMID  9199934.
6. Мишо Дж. Л., Буше Ф., Мельник А., Готье Ф., Гошу Э., Леви Э., Митчелл Г. А., Химмс-Хаген Дж., Фан К. М. (июль 2001 г.). «Гаплонедостаточность Sim1 вызывает гиперфагию, ожирение и сокращение паравентрикулярного ядра гипоталамуса». Молекулярная генетика человека. 10 (14): 1465–73. Дои:10.1093 / hmg / 10.14.1465. PMID  11448938.
7. «Ген Entrez: SIM1-односторонний гомолог 1 (Drosophila)».
8. Держатель JL, Батт Н.Ф., Зинн А.Р. (январь 2000 г.). «Глубокое ожирение, связанное со сбалансированной транслокацией, нарушающей ген SIM1». Молекулярная генетика человека. 9 (1): 101–8. Дои:10.1093 / hmg / 9.1.101. PMID  10587584.
9. Faivre L, Cormier-Daire V, Lapierre JM, Colleaux L, Jacquemont S, Geneviéve D, Saunier P, Munnich A, Turleau C, Romana S, Prieur M, De Blois MC, Vekemans M (август 2002 г.). «Делеция гена SIM1 (6q16.2) у пациента с фенотипом Прадера-Вилли». Журнал медицинской генетики. 39 (8): 594–6. Дои:10.1136 / jmg.39.8.594. ЧВК  1735217. PMID  12161602.
10. Держатель JL, Zhang L, Kublaoui BM, DiLeone RJ, Oz OK, Bair CH, Lee YH, Zinn AR (июль 2004 г.). «Дозировка гена Sim1 модулирует гомеостатический отклик при кормлении мышей на увеличение количества жиров в рационе». Американский журнал физиологии. Эндокринология и метаболизм. 287 (1): E105-13. Дои:10.1152 / ajpendo.00446.2003. PMID  14982752.
11. Кублауи Б.М., Холдер JL, Толсон К.П., Джемелли Т., Зинн А.Р. (октябрь 2006 г.). «Сверхэкспрессия SIM1 частично спасает агути желтый и ожирение, вызванное диетой, за счет нормализации потребления пищи». Эндокринология. 147 (10): 4542–9. Дои:10.1210 / en.2006-0453. PMID  16709610.
12. Кублауи Б.М., Держатель JL, Джемелли Т., Зинн А.Р. (октябрь 2006 г.). «Гаплонедостаточность Sim1 ослабляет меланокортин-опосредованную анорексию и активацию нейронов паравентрикулярного ядра». Молекулярная эндокринология. 20 (10): 2483–92. Дои:10.1210 / me.2005-0483. PMID  16728530.
13. Кублауи Б.М., Джемелли Т., Толсон К.П., Ван И, Зинн А.Р. (июль 2008 г.). «Дефицит окситоцина опосредует гиперфагическое ожирение у мышей с гаплонедостаточностью Sim1». Молекулярная эндокринология. 22 (7): 1723–34. Дои:10.1210 / мне.2008-0067. ЧВК  2453606. PMID  18451093.
14. Толсон К.П., Джемелли Т., Готрон Л., Элмквист Дж. К., Зинн А. Р., Кублауи Б. М. (март 2010 г.). «Послеродовой дефицит Sim1 вызывает гиперфагическое ожирение и снижает экспрессию Mc4r и окситоцина». Журнал неврологии. 30 (10): 3803–12. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.5444-09.2010. ЧВК  3285557. PMID  20220015.
15. Ян С., Ганьон Д., Вашон П., Трембле А., Леви Е., Масси Б., Мишо Д. Л. (июнь 2006 г.). «Аденовирусная модуляция экспрессии Sim1 в паравентрикулярном ядре влияет на потребление пищи». Журнал неврологии. 26 (26): 7116–20. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.0672-06.2006. ЧВК  6673926. PMID  16807340.
16. Probst MR, Fan CM, Tessier-Lavigne M, Hankinson O (февраль 1997 г.). «Два мышиных гомолога однозначного белка дрозофилы, которые взаимодействуют с белком ядерного транслокатора мышиного арилуглеводородного рецептора». Журнал биологической химии. 272 (7): 4451–7. Дои:10.1074 / jbc.272.7.4451. PMID  9020169.
17. Woods SL, Whitelaw ML (март 2002 г.). «Дифференциальная активность мышиных однонаправленных 1 (SIM1) и SIM2 на элементе гипоксического ответа. Перекрестная связь между факторами транскрипции основной спираль-петля-спираль / per-Arnt-Sim». Журнал биологической химии. 277 (12): 10236–43. Дои:10.1074 / jbc.M110752200. PMID  11782478.

дальнейшее чтение

• Fan CM, Kuwana E, Bulfone A, Fletcher CF, Copeland NG, Jenkins NA, Crews S, Martinez S, Puelles L, Rubenstein JL, Tessier-Lavigne M (январь 1996). «Паттерны экспрессии двух мышиных гомологов дрозофилы-единомышленника предполагают возможную роль в формировании эмбрионального паттерна и в патогенезе синдрома Дауна». Молекулярная и клеточная нейронауки. 7 (1): 1–16. Дои:10.1006 / mcne.1996.0001. PMID  8812055. S2CID  11411254.
• Probst MR, Fan CM, Tessier-Lavigne M, Hankinson O (февраль 1997 г.). «Два мышиных гомолога однозначного белка дрозофилы, которые взаимодействуют с белком ядерного транслокатора мышиного арилуглеводородного рецептора». Журнал биологической химии. 272 (7): 4451–7. Дои:10.1074 / jbc.272.7.4451. PMID  9020169.
• Держатель JL, Батт Н.Ф., Зинн А.Р. (январь 2000 г.). «Глубокое ожирение, связанное со сбалансированной транслокацией, нарушающей ген SIM1». Молекулярная генетика человека. 9 (1): 101–8. Дои:10.1093 / hmg / 9.1.101. PMID  10587584.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Woods SL, Whitelaw ML (март 2002 г.). «Дифференциальная активность мышиных однонаправленных 1 (SIM1) и SIM2 на элементе гипоксического ответа. Перекрестная связь между факторами транскрипции основной спираль-петля-спираль / per-Arnt-Sim». Журнал биологической химии. 277 (12): 10236–43. Дои:10.1074 / jbc.M110752200. PMID  11782478.
• Faivre L, Cormier-Daire V, Lapierre JM, Colleaux L, Jacquemont S, Geneviéve D, Saunier P, Munnich A, Turleau C, Romana S, Prieur M, De Blois MC, Vekemans M (август 2002 г.). «Делеция гена SIM1 (6q16.2) у пациента с фенотипом Прадера-Вилли». Журнал медицинской генетики. 39 (8): 594–6. Дои:10.1136 / jmg.39.8.594. ЧВК  1735217. PMID  12161602.
• Ямаки А., Кудо Дж., Симидзу Н., Симидзу Й. (январь 2004 г.). «Новый сигнал ядерной локализации в человеческих белках SIM1 и SIM2». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 313 (3): 482–8. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.11.168. PMID  14697214.
• Meyre D, Lecoeur C, Delplanque J, Francke S, Vatin V, Durand E, Weill J, Dina C, Froguel P (март 2004 г.). «Полногеномное сканирование на признаки детского ожирения во французских семьях показывает значительную связь на хромосоме 6q22.31-q23.2». Сахарный диабет. 53 (3): 803–11. Дои:10.2337 / диабет.53.3.803. PMID  14988267.
• Кублауи Б.М., Холдер JL, Толсон К.П., Джемелли Т., Зинн А.Р. (октябрь 2006 г.). «Сверхэкспрессия SIM1 частично спасает агути желтый и ожирение, вызванное диетой, за счет нормализации потребления пищи». Эндокринология. 147 (10): 4542–9. Дои:10.1210 / en.2006-0453. PMID  16709610.