ШЕСТЬ2 Идентификаторы Псевдонимы ШЕСТЬ2 , SIX homeobox 2Внешние идентификаторы OMIM: 604994 MGI: 102778 ГомолоГен: 56518 Генные карты: ШЕСТЬ2 Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 E4 | 17 55,72 см Начинать 85,684,277 бп [2] Конец 85,688,274 бп [2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • последовательное связывание ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание фактора транскрипции • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области транскрипции Сотовый компонент • ядро клетки • комплекс регуляторов транскрипции Биологический процесс • морфогенез эмбриональной скелетной системы • регуляция дифференцировки хондроцитов • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительное регулирование пролиферации хондроцитов • дифференцировка хондроцитов • импорт белка в ядро • развитие почек • отрицательная регуляция дифференцировки клеток • морфогенез анатомической структуры • поддержание мезенхимальных стволовых клеток, участвующих в морфогенезе нефронов • переход от мезенхимы к эпителию, участвующий в морфогенезе метанефроса • дифференцировка мезенхимальных клеток, участвующих в развитии почек • пролиферация мезенхимальных стволовых клеток • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • регуляция ветвления, участвующая в морфогенезе зачатка мочеточника • развитие многоклеточного организма • морфогенез нефрона • развитие нефрона • морфогенез среднего уха • эмбриональный морфогенез пищеварительного тракта • морфогенез эмбрионального черепного скелета • регулирование окостенения • клеточная пролиферация • спецификация судьбы мезодермальных клеток • спецификация передней / задней оси • развитие метанефроса • миграция клеток • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • пролиферация конденсированных мезенхимальных клеток • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие анатомической структуры Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи Разновидность Человек Мышь Entrez Ансамбль UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (белок) Расположение (UCSC) Chr 2: 45.01 - 45.01 Мб Chr 17: 85.68 - 85.69 Мб PubMed поиск[3] [4] Викиданные
Гомеобокс протеин SIX2 это белок что у людей кодируется ШЕСТЬ2 ген .[5] [6]
Рекомендации
дальнейшее чтение
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ . 99 (26): 16899–903. Дои :10.1073 / pnas.242603899 . ЧВК 139241 . PMID 12477932 . Лопес-Риос Дж., Тессмар К., Лоосли Ф. и др. (2003). «Активность Six3 и Six6 регулируется членами семейства граучо» . Разработка . 130 (1): 185–95. Дои :10.1242 / dev.00185 . PMID 12441302 . Икеда К., Ватанабе И, Ото Х, Каваками К. (2002). «Молекулярное взаимодействие и синергетическая активация промотора белками Six, Eya и Dach, опосредованная связывающим белком CREB» . Мол. Клетка. Биол . 22 (19): 6759–66. Дои :10.1128 / MCB.22.19.6759-6766.2002 . ЧВК 134036 . PMID 12215533 . Buller C, Xu X, Marquis V и др. (2002). «Молекулярные эффекты мутаций домена Eya1, вызывающие дефекты органов при синдроме BOR». Гм. Мол. Genet . 10 (24): 2775–81. Дои :10.1093 / hmg / 10.24.2775 . PMID 11734542 . Boucher CA, Winchester CL, Hamilton GM и др. (2000). «Структура, картирование и экспрессия человеческого гена, кодирующего гомеодоменный белок, SIX2». Ген . 247 (1–2): 145–51. Дои :10.1016 / S0378-1119 (00) 00105-0 . PMID 10773454 . Челли Дж., Ван Бойзеком Э., Хеннекам Р.С. и др. (2000). «Семейная синдромальная атрезия пищевода соответствует 2p23-p24» . Являюсь. J. Hum. Genet . 66 (2): 436–44. Дои :10.1086/302779 . ЧВК 1288096 . PMID 10677303 . Каваками К., Ото Х., Такидзава Т., Сайто Т. (1996). «Идентификация и экспрессия шести семейных генов в сетчатке мышей». FEBS Lett . 393 (2–3): 259–63. Дои :10.1016 / 0014-5793 (96) 00899-X . PMID 8814301 . S2CID 20829948 .
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния (bZIP )(1.2) Базовая спираль-петля-спираль (bHLH )
Группа А Группа B Группа C bHLH-PAS Группа D Группа E Группа F bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP (1.4) НФ-1 (1.5) RF-X (1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
(2) Цинковый палец ДНК-связывающие домены
(2.1) Ядерный рецептор (Cys4 )
подсемейство 1 подсемейство 2 подсемейство 3 подсемейство 4 подсемейство 5 подсемейство 6 подсемейство 0
(2.2) Другой Cys4 (2.3) Cys2 Его2 (2.4) Cys6 (2.5) Чередующийся состав (2.6) WRKY
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(0) Другие факторы транскрипции
смотрите также дефицит фактора транскрипции / корегулятора