Семейство факторов транскрипции ETS - ETS transcription factor family

Ets-домен
PDB 1r36 EBI.jpg
Структура аутоингибирования связывания ДНК Ets-1.[1]
Идентификаторы
СимволEts
PfamPF00178
Pfam кланCL0123
ИнтерПроIPR000418
УМНАЯSM00413
PROSITEPDOC00374
SCOP21r36 / Объем / СУПФАМ

В области молекулярная биология, то ETS (E26 зависит от трансформации[2] или же E-двадцать шесть. (Специфическая трансформация эритробластов)[3]) семья одна из самых больших семей факторы транскрипции и уникален для животные. Всего 29 гены у людей, 28 у мышей, 10 у Caenorhabditis elegans и 9 в Дрозофила. Член-основатель этого семейства был идентифицирован как ген, трансдуцированный вирусом лейкемии, E26. Члены семьи были вовлечены в развитие различных тканей, а также в прогрессирование рака.

Подсемейства

Семейство ETS (Erythroblast Transformation Specific) делится на 12 подсемейств, которые перечислены ниже:[4]

ПодсемействоЧлены семьи млекопитающихОртологи беспозвоночных
ELFELF1, ELF2 (NERF), ELF4 (MEF)
ELGGABPαELG
ЭРГЭРГ, FLI1, ВРЭ
ERFERF (PE2), ETV3 (PE1)
ESEELF3 (ESE1 / ESX), ELF5 (ESE2), ESE3 (КВЧ)
ETSETS1, ETS2ЗАОСТРЕННЫЙ
PDEFSPDEF (PDEF / PSE)
PEA3ETV4 (PEA3 / E1AF), ETV5 (ERM), ETV1 (ER81)
ER71ETV2 (ER71)
SPISPI1 (PU.1), СПИБ, СПИК
TCFELK1, ELK4 (SAP1), ELK3 (NET / SAP2)LIN
ТЕЛETV6 (ТЕЛ), ETV7 (ТЕЛ2)ЯН

Структура

Все члены семейства ETS (Erythroblast Transformation Specific) идентифицируются с помощью высококонсервативного ДНК-связывающий домен, то ETS домен, который является крылатым спираль-поворот-спираль структура, которая связывается с участками ДНК с центральным GGA (A / T) Последовательность ДНК. Данные свидетельствуют о том, что помимо функций связывания ДНК, домен ETS также участвует в белок-белковые взаимодействия За пределами ДНК-связывающего домена ETS сходство ограничено.

Также присутствуют и другие домены, которые варьируются от члена ETS к члену ETS, в том числе домен Pointed, подкласс семейства доменов SAM.

Функция

Семейство ETS присутствует во всем организме и участвует в большом количестве функций, включая регуляцию клеточная дифференциация, клеточный цикл контроль, миграция клеток, распространение клеток, апоптоз (запрограммированная гибель клеток) и ангиогенез.

Было обнаружено, что с раком связаны многочисленные факторы ETS, например, через слияние генов. Например, ЭРГ Фактор транскрипции ETS слит с EWS ген, в результате чего возникает состояние, называемое саркома Юинга.[5] Слияние ТЕЛ к JAK2 белок приводит к раннему пре-B острому лимфоидному лейкозу.[6] ERG и ETV1 - известные слияния генов, обнаруженные в рак простаты.[7]

Кроме того, факторы ETS, например позвоночное Etv1 и беспозвоночное Ast-1, как было показано, играют важную роль в спецификации и дифференциации дофаминергические нейроны в обоих C. elegans и обонятельные луковицы из мышей.[8]

Способ действия

Среди членов семейства ETS существует обширная консервативность ДНК-связывающего домена ETS и, следовательно, большая избыточность в связывании ДНК. Считается, что взаимодействие с другими белками (например, модулятор активности Ets, называемый Mae) является одним из способов достижения специфического связывания с ДНК. Фактор транскрипции Ets - это сайт конвергенции сигналов.[9]Факторы ETS действуют как транскрипционные репрессоры, активаторы транскрипции, или оба.[10]

Рекомендации

  1. ^ Ли Г.М., Дональдсон Л.В., Пуфалл М.А. и др. (Февраль 2005 г.). «Структурные и динамические основы аутоингибирования связывания ДНК Ets-1». J. Biol. Chem. 280 (8): 7088–99. Дои:10.1074 / jbc.M410722200. PMID  15591056.
  2. ^ Nunn, M. F .; Seeburg, P.H .; Moscovici, C .; Дюсберг, П. Х. (1983). «Трехчастная структура гена, трансформирующего Е26 вируса эритробластоза птиц». Природа. 306 (5941): 391–395. Bibcode:1983Натура 306..391Н. Дои:10.1038 / 306391a0. PMID  6316155. S2CID  4302399.
  3. ^ Лепринс, Д .; Gegonne, A .; Coll, J .; De Taisne, C .; Schneeberger, A .; Lagrou, C .; Stehelin, Д. (1983). «Предполагаемый второй клеточный онкоген ретровируса птичьего лейкоза E26». Природа. 306 (5941): 395–397. Bibcode:1983Натура 306..395л. Дои:10.1038 / 306395a0. PMID  6316156. S2CID  4318034.
  4. ^ Гутьеррес-Хартман А., Дюваль Д.Л., Брэдфорд А.П. (2007). «Факторы транскрипции ETS в эндокринной системе». Тенденции метаболизма эндокринола. 18 (4): 150–8. Дои:10.1016 / j.tem.2007.03.002. PMID  17387021. S2CID  24617218.
  5. ^ Ида К., Кобаяси С., Таки Т., Ханада Р., Бесшо Ф., Ямамори С., Сугимото Т., Оки М., Хаяси Ю. (1995). «Химерные мРНК EWS-FLI-1 и EWS-ERG в саркоме Юинга и примитивной нейроэктодермальной опухоли». Int J Рак. 63 (4): 500–4. Дои:10.1002 / ijc.2910630407. PMID  7591257.
  6. ^ Петерс П., Рейно С.Д., Коулс Дж., Влодарска И., Гросджордж Дж., Филип П., Монпу Ф., Ван Ромпей Л., Баенс М., Ван ден Берге Х., Маринен П. (1997). «Слияние TEL, гена 6-варианта ETS (ETV6), с рецептор-ассоциированной киназой JAK2 в результате t (9; 12) в лимфоиде и t (9; 15; 12) при миелоидном лейкозе». Кровь. 90 (7): 2535–40. Дои:10.1182 / кровь.V90.7.2535. PMID  9326218.
  7. ^ Tomlins SA, Rhodes DR, Perner S, Dhanasekaran SM, Mehra R, Sun XW, Varambally S, Cao X, Tchinda J, Kuefer R, Lee C, Montie JE, Shah RB, Pienta KJ, Rubin MA, Chinnaiyan AM (октябрь 2005 г. ). «Рекуррентное слияние генов факторов транскрипции TMPRSS2 и ETS при раке простаты». Наука. 310 (5748): 644–8. Bibcode:2005Наука ... 310..644Т. Дои:10.1126 / science.1117679. PMID  16254181. S2CID  85788789.
  8. ^ Пламя Н., Хоберт О. (2009). «Генная регуляторная логика дифференцировки дофаминергических нейронов». Природа. 458 (7240): 885–890. Дои:10.1038 / природа07929. ЧВК  2671564. PMID  19287374.
  9. ^ Верже А, Дютерк-Кокийо М (2002). «Когда факторы транскрипции Ets встречаются со своими партнерами». BioEssays. 24 (4): 362–70. Дои:10.1002 / bies.10068. PMID  11948622.
  10. ^ Sharrocks AD (2001). «Семейство факторов транскрипции ETS-домена». Нат Рев Мол Cell Biol. 2 (11): 827–37. Дои:10.1038/35099076. PMID  11715049. S2CID  5407789.

дальнейшее чтение