BCL6 - BCL6

BCL6
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1R28, 1R29, 1R2B, 2EN2, 2EOS, 2LCE, 2YRM, 3BIM, 3E4U, 3LBZ, 4CP3, 4U2M
Идентификаторы
Псевдонимы	BCL6, BCL5, BCL6A, LAZ3, ZBTB27, ZNF51, B-клеточный CLL / лимфома 6, B-клеточный CLL / лимфома 6, репрессор транскрипции, репрессор транскрипции BCL6
Внешние идентификаторы	OMIM: 109565 MGI: 107187 ГомолоГен: 7640 Генные карты: BCL6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q27.3 Начинать 187,721,377 бп[1] Конец 187,745,725 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 16 (мышь)[2] Группа 16 B1 | 16 15,26 см Начинать 23,965,052 бп[2] Конец 23,988,852 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • последовательное связывание ДНК • Связывание ДНК • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК с последовательностью интронной регуляторной области транскрипции • связывание хроматина • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание нуклеиновой кислоты • связывание хроматина с ДНК • идентичное связывание с белками • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II Сотовый компонент • вилка репликации • ядро клетки • нуклеоплазма • аппарат Гольджи Биологический процесс • регуляция образования зародышевого центра • положительная регуляция деацетилирования гистонов • отрицательная регуляция дифференцировки Т-хелперов 2 клеток • локализация белка • отрицательная регуляция выработки цитокинов тучными клетками • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • иммунная система • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 регуляция активности GTPase • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция дифференцировки клеток • формирование зародышевого центра • отрицательная регуляция передачи сигнала белка Rho • отрицательная регуляция переключения изотипа на изотипы IgE • отрицательная регуляция апоптотического процесса • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • иммунный ответ 2 типа • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • отрицательная регуляция адгезии клеточного матрикса • регулирование пролиферации клеток • положительное регулирование пролиферации В-клеток • отрицательная регуляция роста клеток • Передача сигнала белка Rho • клеточный морфогенез • сперматогенез • регуляция дифференцировки Т-клеток памяти • положительная регуляция дифференцировки нейронов • регуляция воспалительного ответа • регуляция иммунного ответа • положительная регуляция апоптотического процесса • отрицательная регуляция иммунного ответа 2 типа • отрицательная регуляция процесса апоптоза В-клеток • положительная регуляция движения клеточного компонента • Дифференцировка В-клеток • воспалительная реакция • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • организация актинового цитоскелета • отрицательное регулирование пролиферации клеток • отрицательная регуляция сигнального пути Notch • развитие эритроцитов • отрицательная регуляция клеточного старения • регуляция апоптотического процесса • отрицательная регуляция репликации ДНК митотического клеточного цикла • положительная регуляция дифференцировки регуляторных Т-клеток • цитокин-опосредованный сигнальный путь Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	604	12053
Ансамбль	ENSG00000113916	ENSMUSG00000022508
UniProt	P41182	P41183
RefSeq (мРНК)	NM_001130845 NM_001134738 NM_001706 NM_138931	NM_009744 NM_001348026
RefSeq (белок)	NP_001124317 NP_001128210 NP_001697	NP_001334955 NP_033874
Расположение (UCSC)	Chr 3: 187.72 - 187.75 Мб	Chr 16: 23.97 - 23.99 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок В-клеточной лимфомы 6 это белок что у людей кодируется BCL6 ген.^[5] Нравиться BCL2, BCL3, BCL5, BCL7A, BCL9 и BCL10, имеет клиническое значение в лимфома.

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является эволюционно консервативным. цинковый палец фактора транскрипции и содержит N-концевой домен POZ / BTB. Этот белок действует как специфичный для последовательности репрессор транскрипции и, как было показано, модулирует STAT-зависимый Интерлейкин 4 (ИЛ-4) ответы В-клетки. Этот белок может взаимодействовать с несколькими корепрессорными комплексами, подавляя транскрипция. Обнаружено, что этот ген часто транслоцируется и гипермутируется в диффузная В-клеточная лимфома большого размера (DLBCL)^[6][7][8] и способствует патогенезу DLBCL. Вариант сплайсинга с пропуском экзона 7 кодирует более короткую форму белка, в которой отсутствуют первые два цинковых пальца ДНК-связывающий домен.^[9]

Физиологически BCL6 является основным фактором транскрипции, который приводит к дифференцировке наивных хелперных Т-клеток в Фолликулярные Т-клетки-помощники (Клетки TFH).^[10] Его действие негативно регулируется геном PRDM1 кодирующий фактор транскрипции Blimp-1.^[11]

Диагностическая утилита

Наличие BCL6 можно продемонстрировать на срезах ткани с помощью иммуногистохимия. Он присутствует исключительно в B-клетках как здоровых, так и неопластический зародышевые центры. Таким образом, он демонстрирует как реактивная гиперплазия в лимфатических узлах и ряде лимфомы происходит из фолликулярных B-клеток, таких как Лимфома Беркитта, фолликулярная лимфома и преобладающий подтип узловых лимфоцитов Болезнь Ходжкина. Часто используется вместе с антителами к Bcl-2 антиген, чтобы отличить неопластические фолликулы от фолликулов, обнаруженных при доброкачественной гиперплазии, для которой Bcl-2 отрицательный.^[12]

Взаимодействия

BCL6 показал взаимодействовать с

• BCOR,^[13]
• C-июн,^[14]
• HDAC1,^[15][16]
• HDAC4,^[17]
• HDAC7A,^[17]
• HDAC5,^[17]
• IRF4,^[18]
• NCOR2,^[13][16][19]
• SMRT,^[15][19]
• ZBTB7A^[20]
• Т-ставка,^[21]
• ZBTB16^[22]

Смотрите также

• Лимфома Ходжкина с преобладанием узловых лимфоцитов
• Диффузная В-клеточная лимфома большого размера

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113916 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000022508 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: BCL6 B-клеточный CLL / лимфома 6 (белок цинкового пальца 51)».
6. Йе БХ, Листа Ф, Ло Коко Ф, Ноулз Д.М., Оффит К., Чаганти Р.С., Далла-Фавера Р. (октябрь 1993 г.). «Изменения гена, кодирующего цинковый палец, BCL-6, при диффузной крупноклеточной лимфоме». Наука. 262 (5134): 747–50. Bibcode:1993Научный ... 262..747Y. Дои:10.1126 / science.8235596. PMID  8235596.
7. Kerckaert JP, Deweindt C, Tilly H, Quief S, Lecocq G, Bastard C (сентябрь 1993 г.). «LAZ3, новый ген, кодирующий цинковые пальцы, нарушается повторяющимися транслокациями хромосомы 3q27 в лимфомах человека». Природа Генетика. 5 (1): 66–70. Дои:10.1038 / ng0993-66. PMID  8220427. S2CID  12575122.
8. Мильяцца А., Мартинотти С., Чен В., Фуско С., Йе Б. Х., Ноулз Д. М., Оффит К., Чаганти Р. С., Далла-Фавера Р. (декабрь 1995 г.). «Частая соматическая гипермутация 5 'некодирующей области гена BCL6 при В-клеточной лимфоме». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (26): 12520–4. Bibcode:1995ПНАС ... 9212520М. Дои:10.1073 / пнас.92.26.12520. ЧВК  40389. PMID  8618933.
9. Шен Й, Ге Би, Рамачандраредди Х, МакКейтан Т., Чан В.Ч. (октябрь 2008 г.). «Альтернативный сплайсинг генерирует короткую изоформу BCL6 (BCL6S), кодирующую компактный репрессор». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 375 (2): 190–3. Дои:10.1016 / j.bbrc.2008.07.116. ЧВК  2573862. PMID  18675787.
10. Нуриева Р.И., Чанг Й., Мартинес Г.Дж., Ян Х.О., Танака С., Мацкевич Т.Д., Ван Й.Х., Донг С. (август 2009 г.). «Bcl6 опосредует развитие Т-фолликулярных хелперов». Наука. 325 (5943): 1001–5. Bibcode:2009Научный ... 325.1001N. Дои:10.1126 / science.1176676. ЧВК  2857334. PMID  19628815.
11. Джонстон Р.Дж., Похолек А.С., ДиТоро Д., Юсуф И., Это Д., Барнетт Б., Дент А.Л., Крафт Дж., Кротти С. (август 2009 г.). «Bcl6 и Blimp-1 являются реципрокными и антагонистическими регуляторами дифференцировки Т-фолликулярных клеток-помощников». Наука. 325 (5943): 1006–10. Bibcode:2009Sci ... 325.1006J. Дои:10.1126 / science.1175870. ЧВК  2766560. PMID  19608860.
12. Леонг, Энтони С-И; Купер, Кумарасон; Леонг, Ф. Джоэл В.М. (2003). Руководство по диагностической цитологии (2-е изд.). Гринвич Медикал Медиа, Лтд. Стр. 29. ISBN  978-1-84110-100-2.
13. Huynh KD, Fischle W., Verdin E, Bardwell VJ (июль 2000 г.). «BCoR, новый корепрессор, участвующий в репрессии BCL-6». Гены и развитие. 14 (14): 1810–23. Дои:10.1101 / gad.14.14.1810 (неактивно 11.10.2020). ЧВК  316791. PMID  10898795.
14. Васанвала Ф. Х., Кусам С., Тони Л. М., Дент А. Л. (август 2002 г.). «Подавление функции AP-1: механизм регуляции экспрессии Blimp-1 и дифференцировки В-лимфоцитов протоонкогеном В-клеточной лимфомы-6». Журнал иммунологии. 169 (4): 1922–9. Дои:10.4049 / jimmunol.169.4.1922. PMID  12165517.
15. Дэвид Дж., Алланд Л., Хонг Ш., Вонг С. В., Де Пиньо Р. А., Дежан А. (май 1998 г.). «Гистоновая деацетилаза, связанная с mSin3A, опосредует репрессию белком PLZF, связанным с острым промиелоцитарным лейкозом». Онкоген. 16 (19): 2549–56. Дои:10.1038 / sj.onc.1202043. PMID  9627120.
16. Deltour S, Guerardel C, Leprince D (декабрь 1999 г.). «Рекрутирование комплексов, репрессирующих SMRT / N-CoR-mSin3A-HDAC, не является общим механизмом для репрессоров транскрипции BTB / POZ: случай HIC-1 и gammaFBP-B». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (26): 14831–6. Bibcode:1999PNAS ... 9614831D. Дои:10.1073 / пнас.96.26.14831. ЧВК  24733. PMID  10611298.
17. Lemercier C, Brocard MP, Puvion-Dutilleul F, Kao HY, Albagli O, Khochbin S (июнь 2002 г.). «Гистоновые деацетилазы класса II напрямую задействуются репрессором транскрипции BCL6». Журнал биологической химии. 277 (24): 22045–52. Дои:10.1074 / jbc.M201736200. PMID  11929873.
18. Гупта С., Цзян М., Энтони А., Пернис А.Б. (декабрь 1999 г.). «Клон-специфическая модуляция передачи сигналов интерлейкина 4 с помощью фактора регуляции 4 интерферона». Журнал экспериментальной медицины. 190 (12): 1837–48. Дои:10.1084 / jem.190.12.1837. ЧВК  2195723. PMID  10601358.
19. Вонг К.В., Привальский М.Л. (октябрь 1998 г.). «Компоненты корепрессорного комплекса SMRT демонстрируют отличительные взаимодействия с онкобелками POZ домена PLZF, PLZF-RARalpha и BCL-6». Журнал биологической химии. 273 (42): 27695–702. Дои:10.1074 / jbc.273.42.27695. PMID  9765306.
20. Дэвис Дж. М., Хаве Н., Кабаровски Дж., Хуанг К. Х., Чжу Дж., Брэнд Н. Дж., Лепринс Д., Дхордайн П., Кук М., Моррисс-Кей Дж., Зелент А. (январь 1999 г.). «Новый белок цинкового пальца с доменом BTB / POZ, LRF, является потенциальной мишенью для онкогена LAZ-3 / BCL-6». Онкоген. 18 (2): 365–75. Дои:10.1038 / sj.onc.1202332. PMID  9927193.
21. Острайх К.Дж., Хуанг А.С., Вайнманн А.С. (май 2011 г.). «Факторы, определяющие родословную T-bet и Bcl-6, взаимодействуют, чтобы регулировать паттерны экспрессии гена Th1». Журнал экспериментальной медицины. 208 (5): 1001–13. Дои:10.1084 / jem.20102144. ЧВК  3092354. PMID  21518797.
22. Dhordain P, Albagli O, Оноре N, Guidez F, Lantoine D, Schmid M, The HD, Zelent A, Koken MH (декабрь 2000 г.). «Совместная локализация и гетеромеризация между двумя человеческими онкогенными POZ / белками цинкового пальца, LAZ3 (BCL6) и PLZF». Онкоген. 19 (54): 6240–50. Дои:10.1038 / sj.onc.1203976. PMID  11175338.

дальнейшее чтение

• Уэда К., Акасака Т., Оно Х (июль 2002 г.). «Слияние гена неиммуноглобулина / BCL6 в диффузной большой B-клеточной лимфоме: прогностические последствия». Лейкемия и лимфома. 43 (7): 1375–81. Дои:10.1080/10428190290033305. PMID  12389616. S2CID  27096971.
• Ниу Х (декабрь 2002 г.). «Протоонкоген BCL-6 в развитии нормальных и злокачественных В-клеток». Гематологическая онкология. 20 (4): 155–66. Дои:10.1002 / hon.689. PMID  12469325. S2CID  24245607.
• Токухиса Т. (декабрь 2002 г.). «[Роль Bcl6 в развитии иммунной памяти]». Tanpakushitsu Kakusan Koso. Белок, нуклеиновая кислота, фермент. 47 (16 Дополнение): 2306–12. PMID  12518453.
• Оно Х (апрель 2004 г.). «Патогенетическая роль транслокации BCL6 в В-клеточной неходжкинской лимфоме». Гистология и гистопатология. 19 (2): 637–50. PMID  15024721.
• Паскуалуччи Л., Берещенко О., Берещенко О., Ню Х., Кляйн Ю., Бассо К., Гульельмино Р., Катторетти Г., Далла-Фавера Р. (2004). «Молекулярный патогенез неходжкинской лимфомы: роль Bcl-6». Лейкемия и лимфома. 44 Дополнение 3: S5–12. Дои:10.1080/10428190310001621588. PMID  15202519. S2CID  25565667.
• Жардин Ф., Румини П., Ублюдок С., Тилли Х. (февраль 2007 г.). «Протоонкоген BCL6: ведущая роль в развитии зародышевого центра и лимфомагенезе». Патология-Биология. 55 (1): 73–83. Дои:10.1016 / j.patbio.2006.04.001. PMID  16815642.

внешняя ссылка

• BCL6 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• Человек BCL6 расположение генома и BCL6 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.