RFX3 - RFX3

RFX3
Идентификаторы
Псевдонимы	RFX3, регуляторный фактор X3
Внешние идентификаторы	OMIM: 601337 MGI: 106582 ГомолоГен: 7917 Генные карты: RFX3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9п24.2 Начинать 3,218,297 бп[1] Конец 3,526,004 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 C1 Начинать 27,761,721 бп[2] Конец 28,011,166 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • последовательное связывание ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • активность фактора транскрипции, связывание с дистальной энхансерной последовательностью РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II Сотовый компонент • комплекс регуляторов транскрипции • ядерный хроматин • ядро клетки • внеклеточная область Биологический процесс • дифференциация клеток • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительная регуляция развития клеток поджелудочной железы типа B • регулирование секреции инсулина • движение эпителиальных ресничек, участвующих в определении асимметрии влево / вправо • созревание клеток • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие многоклеточного организма • созревание клеток поджелудочной железы типа B • определение левой / правой симметрии • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • цилиозависимая подвижность клеток • эндокринное развитие поджелудочной железы • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • дифференцировка клеток поджелудочной железы типа B • морфогенез ресничек • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5991	19726
Ансамбль	ENSG00000080298	ENSMUSG00000040929
UniProt	P48380	P48381
RefSeq (мРНК)	NM_001282116 NM_001282117 NM_002919 NM_134428 NM_001377999	NM_001166414 NM_011265 NM_001360357 NM_001360358
RefSeq (белок)	NP_001269045 NP_001269046 NP_002910 NP_602304 NP_001364928	NP_001159886 NP_035395 NP_001347286 NP_001347287
Расположение (UCSC)	Chr 9: 3.22 - 3.53 Мб	Chr 19: 27.76 - 28.01 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции RFX3 это белок что у людей кодируется RFX3 ген.^[5][6]

Этот ген является членом семейства регуляторных генов фактора X, который кодирует факторы транскрипции которые содержат высококонсервативный ДНК-связывающий домен крылатой спирали. Белок, кодируемый этим геном, структурно связан с регуляторными факторами X1, X2, X4 и X5. Это активатор транскрипции что может связать ДНК как мономер или как гетеродимер с другими членами семейства RFX. Два варианта транскрипции, кодирующие разные изоформы были описаны для этого гена, и по крайней мере один из вариантов использует альтернативные полиаденилирование сигналы.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000080298 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040929 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Reith W., Ucla C, Barras E, Gaud A, Durand B, Herrero-Sanchez C, Kobr M, Mach B (февраль 1994 г.). «RFX1, трансактиватор энхансера I вируса гепатита B, принадлежит к новому семейству гомодимерных и гетеродимерных ДНК-связывающих белков». Mol Cell Biol. 14 (2): 1230–44. Дои:10.1128 / mcb.14.2.1230. ЧВК  358479. PMID  8289803.
6. «Ген Entrez: регуляторный фактор RFX3 X, 3 (влияет на экспрессию HLA класса II)».

дальнейшее чтение

• Эмери П., Дюран Б., Мах Б., Райт В. (1996). «RFX-белки, новое семейство ДНК-связывающих белков, сохраненных в эукариотическом царстве». Нуклеиновые кислоты Res. 24 (5): 803–7. Дои:10.1093 / nar / 24.5.803. ЧВК  145730. PMID  8600444.
• Ивама А., Пан Дж., Чжан П. и др. (1999). «Димерные белки RFX способствуют активности и клональной специфичности альфа-промотора рецептора интерлейкина-5 посредством доменов активации и репрессии». Мол. Клетка. Биол. 19 (6): 3940–50. Дои:10.1128 / mcb.19.6.3940. ЧВК  104353. PMID  10330134.
• Моротоми-Яно К., Яно К., Сайто Х. и др. (2002). «Человеческий регуляторный фактор X 4 (RFX4) представляет собой димерный ДНК-связывающий белок, специфичный для семенников, который взаимодействует с другими членами RFX человека». J. Biol. Chem. 277 (1): 836–42. Дои:10.1074 / jbc.M108638200. PMID  11682486.
• Накаяма А., Мураками Х., Маэяма Н. и др. (2003). «Роль факторов транскрипции RFX в не-нейрональной клеточно-специфической инактивации промотора белка MAP1A, связанного с микротрубочками». J. Biol. Chem. 278 (1): 233–40. Дои:10.1074 / jbc.M209574200. PMID  12411430.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Maijgren S, Sur I, Nilsson M, Toftgård R (2004). «Участие белков RFX в активации транскрипции от Ras-чувствительного элемента энхансера». Arch. Дерматол. Res. 295 (11): 482–9. Дои:10.1007 / s00403-004-0456-5. PMID  15024578. S2CID  2408607.
• Хамфрей С.Дж., Оливер К., Хант А.Р. и др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 9 человека». Природа. 429 (6990): 369–74. Bibcode:2004Натура 429..369H. Дои:10.1038 / природа02465. ЧВК  2734081. PMID  15164053.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.