ILF2 - ILF2

ILF2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4AT7, 4AT8, 4AT9, 4ATB
Идентификаторы
Псевдонимы	ILF2, NF45, PRO3063, фактор связывания усилителя интерлейкина 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 603181 MGI: 1915031 ГомолоГен: 26894 Генные карты: ILF2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q21.3 Начните 153,661,788 бп[1] Конец 153,671,028 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 F1 Начните 90,476,126 бп[2] Конец 90,488,379 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • Связывание ДНК • связывание двухцепочечной РНК • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание АТФ • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • ядрышко • мембрана • ядро клетки • специфический просвет гранулы • просвет третичной гранулы • Просвет гранул, богатых фиколином-1 • внеклеточная область • рибонуклеопротеин Биологический процесс • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • иммунная реакция • транскрипция, ДНК-шаблон • дегрануляция нейтрофилов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	3608	67781
Ансамбль	ENSG00000143621	ENSMUSG00000001016
UniProt	Q12905	Q9CXY6
RefSeq (мРНК)	NM_004515 NM_001267809	NM_026374
RefSeq (белок)	NP_001254738 NP_004506	NP_080650
Расположение (UCSC)	Chr 1: 153.66 - 153.67 Мб	Chr 3: 90.48 - 90.49 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор связывания энхансера интерлейкина 2 это белок что у людей кодируется ILF2 ген.^[5][6]

Функция

Ядерный фактор активированных Т-клеток (NFAT) - это фактор транскрипции, необходимый для экспрессии Т-клетками гена интерлейкина 2. NFAT связывается с последовательностью энхансера гена интерлейкина 2, известной как ответный элемент антигенного рецептора 2. Кроме того, NFAT может связывать РНК и является важным компонентом для инкапсуляция и белковое праймирование вирусной полимеразы гепатита В. NFAT представляет собой гетеродимер белков 45 кДа и 90 кДа, меньший из которых является продуктом этого гена. Кодируемый белок прочно связывается с белком 90 кДа и стимулирует его способность усиливать экспрессию гена.^[6]

Взаимодействия

Было показано, что ILF2 взаимодействовать с участием CDC5L^[7] и ДНК-PKcs.^[8]

ILF2 и ILF3 были идентифицированы как аутоантигены у мышей с индуцированной волчанкой,^[9][10] при системном ревматическом аутоиммунном заболевании собак,^[11][12] и как редкая находка у людей с аутоиммунным заболеванием.^[13]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000143621 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000001016 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Као П.Н., Чен Л., Брок Дж., Нг Дж., Кенни Дж., Смит А.Дж., Кортизи Б. (август 1994 г.). «Клонирование и экспрессия чувствительного к циклоспорину А и FK506 ядерного фактора активированных Т-клеток: NF45 и NF90». Журнал биологической химии. 269 (32): 20691–9. PMID  7519613.
6. «Ген Entrez: фактор связывания 2 интерлейкина ILF2, 45 кДа».
7. Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ человеческого комплекса CDC5L и идентификация его компонентов с помощью масс-спектрометрии». Журнал EMBO. 19 (23): 6569–81. Дои:10.1093 / emboj / 19.23.6569. ЧВК  305846. PMID  11101529.
8. Тинг Н.С., Као П.Н., Чан Д.В., Линтотт Л.Г., Лис-Миллер С.П. (январь 1998 г.). «ДНК-зависимая протеинкиназа взаимодействует с белками, связывающими антигенный рецепторный элемент, NF90 и NF45». Журнал биологической химии. 273 (4): 2136–45. Дои:10.1074 / jbc.273.4.2136. PMID  9442054.
9. Сато М., Шахин В.М., Као П.Н., Окано Т., Шоу М., Йошида Х., Ричардс Х.Б., Ривз WH (декабрь 1999 г.). «Аутоантитела определяют семейство белков с консервативными двухцепочечными РНК-связывающими доменами, а также ДНК-связывающей активностью». Журнал биологической химии. 274 (49): 34598–604. Дои:10.1074 / jbc.274.49.34598. PMID  10574923.
10. Курода Й., Оно Н., Акаоги Дж., Насионалес, округ Колумбия, Ямасаки Ю., Баркер Т. Т., Ривз У. С., Сато М. (февраль 2006 г.). «Индукция специфических аутоантител, связанных с волчанкой, путем неспецифического воспаления, вызванного внутрибрюшинной инъекцией н-гексадекана мышам BALB / c». Токсикология. 218 (2–3): 186–96. Дои:10.1016 / j.tox.2005.10.011. PMID  16309812.
11. Bremer HD, Landegren N, Sjöberg R, Hallgren Å, Renneker S, Lattwein E, Leonard D, Eloranta ML, Rönnblom L, Nordmark G, Nilsson P, Andersson G, Lilliehöök I, Lindblad-Toh K, Kämpe O, Hansson-Hamlin H (март 2018 г.). «ILF2 и ILF3 являются аутоантигенами при системном аутоиммунном заболевании собак». Научные отчеты. 8 (1): 4852. Bibcode:2018НатСР ... 8.4852B. Дои:10.1038 / с41598-018-23034-в. ЧВК  5859008. PMID  29556082.
12. Ханна, Бремер (2018). Иммуноопосредованное заболевание собак. Acta Universitatis Agriculturae Sueciae. ISBN  978-91-7760-166-1.
13. Сато М., Шахин В.М., Као П.Н., Окано Т., Шоу М., Йошида Х., Ричардс Х.Б., Ривз WH (декабрь 1999 г.). «Аутоантитела определяют семейство белков с консервативными двухцепочечными РНК-связывающими доменами, а также ДНК-связывающей активностью». Журнал биологической химии. 274 (49): 34598–604. Дои:10.1074 / jbc.274.49.34598. PMID  10574923.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Маркулатос П., Куссидис Г., Мамурис З., Велиссариу В., Вамвакопулос, Северная Каролина (декабрь 1996 г.). «Картирование гена фактора связывания усилителя интерлейкина 2 (ILF2) на хромосоме 1 человека (1q11-qter и 1p11-p12) с помощью амплификации полимеразной цепной реакции гибридных ДНК-матриц соматических клеток человека и грызунов». Журнал исследований интерферона и цитокинов. 16 (12): 1035–8. Дои:10.1089 / jir.1996.16.1035. PMID  8974006.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Тинг Н.С., Као П.Н., Чан Д.В., Линтотт Л.Г., Лис-Миллер С.П. (январь 1998 г.). «ДНК-зависимая протеинкиназа взаимодействует с белками, связывающими антигенный рецепторный элемент, NF90 и NF45». Журнал биологической химии. 273 (4): 2136–45. Дои:10.1074 / jbc.273.4.2136. PMID  9442054.
• Langland JO, Kao PN, Jacobs BL (май 1999 г.). «Ядерный фактор-90 активированных Т-клеток: двухцепочечный РНК-связывающий белок и субстрат для двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы, PKR». Биохимия. 38 (19): 6361–8. Дои:10.1021 / bi982410u. PMID  10320367.
• Сато М., Шахин В.М., Као П.Н., Окано Т., Шоу М., Йошида Х., Ричардс Х.Б., Ривз WH (декабрь 1999 г.). «Аутоантитела определяют семейство белков с консервативными двухцепочечными РНК-связывающими доменами, а также ДНК-связывающей активностью». Журнал биологической химии. 274 (49): 34598–604. Дои:10.1074 / jbc.274.49.34598. PMID  10574923.
• Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ человеческого комплекса CDC5L и идентификация его компонентов с помощью масс-спектрометрии». Журнал EMBO. 19 (23): 6569–81. Дои:10.1093 / emboj / 19.23.6569. ЧВК  305846. PMID  11101529.
• Паркер Л.М., Фиерро-Монти I, Мэтьюз М.Б. (август 2001 г.). «Ядерный фактор 90 является субстратом и регулятором киназы эукариотического фактора инициации 2, двухцепочечной РНК-активируемой протеинкиназы». Журнал биологической химии. 276 (35): 32522–30. Дои:10.1074 / jbc.M104408200. PMID  11438540.
• Райхман Т.В., Муньис Л.С., Мэтьюз МБ (январь 2002 г.). «Ядерный фактор 90 связывающего РНК белка функционирует как положительный, так и отрицательный регулятор экспрессии генов в клетках млекопитающих». Молекулярная и клеточная биология. 22 (1): 343–56. Дои:10.1128 / MCB.22.1.343-356.2002. ЧВК  134226. PMID  11739746.
• Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х., Люнг А. К., Лам Ю. В., Стин Х, Манн М., Ламонд А. И. (январь 2002 г.). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Текущая биология. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298. S2CID  14132033.
• Шин Х.Дж., Ким С.С., Чо Й.Х., Ли С.Г., Ро Х.М. (март 2002 г.). «Белки клетки-хозяина, связывающиеся с сигналом инкапсидации эпсилон в РНК вируса гепатита В». Архив вирусологии. 147 (3): 471–91. Дои:10.1007 / s007050200001. PMID  11958450. S2CID  23653290.
• Scherl A, Couté Y, Déon C, Callé A, Kindbeiter K, Sanchez JC, Greco A, Hochstrasser D, Diaz JJ (ноябрь 2002 г.). «Функциональный протеомный анализ ядрышка человека». Молекулярная биология клетки. 13 (11): 4100–9. Дои:10.1091 / mbc.E02-05-0271. ЧВК  133617. PMID  12429849.
• Ли Дж., Хокинс И.С., Харви К.Д., Дженнингс Дж. Л., Линк А. Дж., Паттон Дж. Г. (ноябрь 2003 г.). «Регулирование альтернативного сплайсинга с помощью SRrp86 и взаимодействующих с ним белков». Молекулярная и клеточная биология. 23 (21): 7437–47. Дои:10.1128 / MCB.23.21.7437-7447.2003. ЧВК  207616. PMID  14559993.
• Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Леунг А.К., Онг С.Е., Лион CE, Ламонд А.И., Манн М. (январь 2005 г.). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005Натура 433 ... 77А. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Чжао Г., Ши Л., Цю Д., Ху Х., Као П.Н. (май 2005 г.). «Экспрессия в ткани NF45 / ILF2, анализ промотора и трансактивирующая функция интерлейкина-2». Экспериментальные исследования клеток. 305 (2): 312–23. Дои:10.1016 / j.yexcr.2004.12.030. PMID  15817156.
• Не Й, Дин Л., Као П. Н., Браун Р., Ян Дж. Х. (август 2005 г.). «ADAR1 взаимодействует с NF90 через двухцепочечную РНК и регулирует экспрессию гена, опосредованную NF90, независимо от редактирования РНК». Молекулярная и клеточная биология. 25 (16): 6956–63. Дои:10.1128 / MCB.25.16.6956-6963.2005. ЧВК  1190226. PMID  16055709.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламозас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж. Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.

внешние ссылки

• ILF2 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для фактора связывания энхансера интерлейкина 2 мыши (ILF2)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.