Ядерный транслокатор арилуглеводородного рецептора - Aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator

ARNT
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4PKY, 1X0O, 2A24, 2B02, 2HV1, 2К7С, 3F1N, 3F1O, 3F1P, 3H7W, 3H82, 4EQ1, 4GHI, 4GS9, 4H6J, 4ЛПЗ, 4XT2
Идентификаторы
Псевдонимы	ARNT, HIF-1-бета, HIF-1beta, HIF1-бета, HIF1B, HIF1BETA, TANGO, bHLHe2, ядерный транслокатор рецептора арильных углеводородов
Внешние идентификаторы	OMIM: 126110 MGI: 88071 ГомолоГен: 1261 Генные карты: ARNT
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q21.3 Начните 150,809,713 бп[1] Конец 150,876,708 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 F2.1 | 3 40,74 см Начните 95,434,388 бп[2] Конец 95,497,240 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • последовательное связывание ДНК • Связывание ДНК • активность димеризации белков • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • связывание арилуглеводородного рецептора • связывание фактора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков • активность фактора транскрипции, связывание с дистальной энхансерной последовательностью РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • активность гомодимеризации белков • Последовательно-специфичное связывание двухцепочечной ДНК • GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 активность ядерного рецептора Сотовый компонент • цитоплазма • комплекс регуляторов транскрипции • нуклеоплазма • Комплекс факторов транскрипции РНК-полимеразы II • ядро клетки • ядерное тело Биологический процесс • положительная регуляция сигнального пути рецептора фактора роста эндотелия сосудов • дифференциация клеток • ответ на гипоксию • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительная регуляция пролиферации эндотелиальных клеток • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на окислительный стресс • положительная регуляция дифференцировки эритроцитов • эмбриональное развитие плаценты • транскрипция мРНК с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция сумоилирования белков • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • путь передачи сигнала внутриклеточного рецептора • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на гипоксию • положительная регуляция продукции фактора роста эндотелия сосудов • положительная регуляция гликолитического процесса • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция процесса биосинтеза гормонов • ксенобиотический метаболический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	405	11863
Ансамбль	ENSG00000143437	ENSMUSG00000015522
UniProt	P27540	P53762
RefSeq (мРНК)	NM_001197325 NM_001286035 NM_001286036 NM_001668 NM_178426 NM_178427 NM_001350224 NM_001350225 NM_001350226	NM_001037737 NM_009709
RefSeq (белок)	NP_001184254 NP_001272964 NP_001272965 NP_001659 NP_848514 NP_001337153 NP_001337154 NP_001337155	NP_001032826 NP_033839
Расположение (UCSC)	Chr 1: 150.81 - 150.88 Мб	Chr 3: 95,43 - 95,5 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

В ARNT ген кодирует Ядерный транслокатор арилуглеводородного рецептора белок который образует комплекс с лиганд-связанным рецептор арильных углеводородов (AhR) и требуется для рецепторной функции. Кодируемый белок также был идентифицирован как бета-субъединица гетеродимерного фактора транскрипции, фактор, индуцируемый гипоксией 1 (HIF1). Транслокация t (1; 12) (q21; p13), которая приводит к TEL-ARNT гибридный белок, связан с острый миелобластный лейкоз. Для этого гена описаны три альтернативно сплайсированных варианта, кодирующих разные изоформы.

Рецептор арилуглеводородов (AhR) участвует в индукции нескольких ферменты которые участвуют в ксенобиотик метаболизм. Безлиганд, цитозольный форма рецептор арильных углеводородов сложен с белок теплового шока 90. Связывание лиганда, которое включает диоксин и полициклические ароматические углеводороды, приводит к перемещению лиганд-связывающей субъединицы только в^[5] ядро. Индукция ферментов, участвующих в метаболизме ксенобиотиков, происходит посредством связывания связанного лигандом AhR с элементами, отвечающими за ксенобиотики, в промоторах генов этих ферментов.

Взаимодействия

Было показано, что ядерный транслокатор арилуглеводородного рецептора взаимодействовать с:

• AIP,^[6][7]
• AHR,^{[8][9][10][11]}
• EPAS1,^[12]
• HIF1A,^[12][13]
• NCOA2,^[14]
• SIM1,^[13][15] и
• SIM2.^{[13][15][16][17]}

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000143437 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015522 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Hughes, D .; Guttenplan, J. B .; Marcus, C.B .; Subbaramaiah, K .; Данненберг, А. Дж. (2008). «Ингибиторы белка теплового шока 90 подавляют опосредованную арилуглеводородными рецепторами активацию транскрипции CYP1A1 и CYP1B1 и образование аддукта ДНК». Исследования по профилактике рака. 1 (6): 485–493. Дои:10.1158 / 1940-6207.CAPR-08-0149. ЧВК  2680610. PMID  19138996.
6. Карвер Л.А., Брэдфилд Калифорния (апрель 1997 г.). «Лиганд-зависимое взаимодействие арилуглеводородного рецептора с новым гомологом иммунофилина in vivo». J. Biol. Chem. 272 (17): 11452–6. Дои:10.1074 / jbc.272.17.11452. PMID  9111057.
7. Казлаускас А., Сундстрём С., Пёллингер Л., Понграц I (апрель 2001 г.). «Шапероновый комплекс hsp90 регулирует внутриклеточную локализацию рецептора диоксина». Мол. Cell. Биол. 21 (7): 2594–607. Дои:10.1128 / MCB.21.7.2594-2607.2001. ЧВК  86890. PMID  11259606.
8. Lindebro MC, Poellinger L, Whitelaw ML (июль 1995 г.). «Взаимодействие белок-белок через домены PAS: роль домена PAS в положительной и отрицательной регуляции комплекса bHLH / PAS диоксиновый рецептор-фактор транскрипции Arnt». EMBO J. 14 (14): 3528–39. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07359.x. ЧВК  394421. PMID  7628454.
9. Whitelaw M, Pongratz I, Wilhelmsson A, Gustafsson JA, Poellinger L (апрель 1993 г.). «Лиганд-зависимое привлечение корегулятора Arnt определяет распознавание ДНК рецептором диоксина». Мол. Cell. Биол. 13 (4): 2504–14. Дои:10.1128 / MCB.13.4.2504. ЧВК  359572. PMID  8384309.
10. Yamaguchi Y, Kuo MT (октябрь 1995 г.). «Функциональный анализ взаимодействий ядерного транслокатора рецептора арильного углеводорода с рецептором арильного углеводорода в дрожжевой двугибридной системе». Biochem. Pharmacol. 50 (8): 1295–302. Дои:10.1016/0006-2952(95)02016-6. PMID  7488247.
11. Мимура Дж., Эма М., Согава К., Фудзи-Курияма Й. (январь 1999 г.). «Идентификация нового механизма регуляции функции рецептора Ah (диоксина)». Genes Dev. 13 (1): 20–5. Дои:10.1101 / gad.13.1.20. ЧВК  316371. PMID  9887096.
12. Хогенеш Дж. Б., Чан В. К., Джеки В. Х., Браун Р. К., Гу Ю. З., Прей-Грант М., Пердью Г. Х., Брэдфилд, Калифорния (март 1997 г.). «Характеристика подмножества суперсемейства basic-helix-loop-helix-PAS, которое взаимодействует с компонентами пути передачи сигналов диоксина». J. Biol. Chem. 272 (13): 8581–93. Дои:10.1074 / jbc.272.13.8581. PMID  9079689.
13. Woods SL, Whitelaw ML (март 2002 г.). «Дифференциальная активность мышиных однонаправленных 1 (SIM1) и SIM2 на элементе гипоксического ответа. Перекрестная связь между факторами транскрипции основной спираль-петля-спираль / per-Arnt-Sim». J. Biol. Chem. 277 (12): 10236–43. Дои:10.1074 / jbc.M110752200. PMID  11782478.
14. Beischlag TV, Wang S, Rose DW, Torchia J, Reisz-Porszasz S, Muhammad K, Nelson WE, Probst MR, Rosenfeld MG, Hankinson O (июнь 2002 г.). «Рекрутирование семейства транскрипционных коактиваторов NCoA / SRC-1 / p160 комплексом ядерного транслокатора арилуглеводородного рецептора / арилуглеводородного рецептора». Мол. Cell. Биол. 22 (12): 4319–33. Дои:10.1128 / mcb.22.12.4319-4333.2002. ЧВК  133867. PMID  12024042.
15. Probst MR, Fan CM, Tessier-Lavigne M, Hankinson O (февраль 1997 г.). «Два мышиных гомолога однозначного белка дрозофилы, которые взаимодействуют с белком ядерного транслокатора мышиного арилуглеводородного рецептора». J. Biol. Chem. 272 (7): 4451–7. Дои:10.1074 / jbc.272.7.4451. PMID  9020169.
16. Оое Н., Сайто К., Миками Н., Накатука И., Канеко Х. (январь 2004 г.). «Идентификация нового основного фактора спираль-петля-спираль-PAS, NXF, показывает конкурентную положительную регуляторную роль Sim2 в экспрессии гена дребрина, модулятора дендритного цитоскелета». Мол. Cell. Биол. 24 (2): 608–16. Дои:10.1128 / mcb.24.2.608-616.2004. ЧВК  343817. PMID  14701734.
17. Моффет П., Рис М., Пеллетье Дж. (Сентябрь 1997 г.). «Мышиный продукт гена Sim-2 ингибирует транскрипцию за счет активной репрессии и функционального вмешательства». Мол. Cell. Биол. 17 (9): 4933–47. Дои:10.1128 / mcb.17.9.4933. ЧВК  232345. PMID  9271372.

дальнейшее чтение

• Хаазе В.Х. (2006). «Факторы, индуцируемые гипоксией в почках». Am. J. Physiol. Почечная физиология. 291 (2): F271–81. Дои:10.1152 / айпренал.00071.2006. ЧВК  4232221. PMID  16554418.
• Reyes H, Reisz-Porszasz S, Hankinson O (1992). «Идентификация белка ядерного транслокатора рецептора Ah (Arnt) как компонента формы связывания ДНК рецептора Ah». Наука. 256 (5060): 1193–5. Bibcode:1992Научный ... 256.1193R. Дои:10.1126 / science.256.5060.1193. PMID  1317062. S2CID  34075046.
• Хоффман Э. К., Рейес Х., Чу Ф. Ф., Сандер Ф., Конли Л. Х., Брукс Б. А., Хэнкинсон О. (1991). «Клонирование фактора, необходимого для активности рецептора Ah (диоксина)». Наука. 252 (5008): 954–8. Bibcode:1991Наука ... 252..954H. Дои:10.1126 / science.1852076. PMID  1852076.
• Yamaguchi Y, Kuo MT (1995). «Функциональный анализ взаимодействий ядерного транслокатора рецептора арильного углеводорода с рецептором арильного углеводорода в дрожжевой двугибридной системе». Biochem. Pharmacol. 50 (8): 1295–302. Дои:10.1016/0006-2952(95)02016-6. PMID  7488247.
• Ван Г.Л., Цзян Б.Х., Рю Е.А., Семенца Г.Л. (1995). «Гипоксия-индуцибельный фактор 1 представляет собой гетеродимер базисной спирали-петли-спирали-PAS, регулируемый клеточным натяжением O2». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (12): 5510–4. Bibcode:1995PNAS ... 92,55 10 Вт. Дои:10.1073 / пнас.92.12.5510. ЧВК  41725. PMID  7539918.
• Линдебро М.С., Поллингер Л., Вайтлоу М.Л. (1995). «Взаимодействие белок-белок через домены PAS: роль домена PAS в положительной и отрицательной регуляции комплекса bHLH / PAS диоксиновый рецептор-фактор транскрипции Arnt». EMBO J. 14 (14): 3528–39. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07359.x. ЧВК  394421. PMID  7628454.
• Abbott BD, Probst MR, Perdew GH (1995). «Иммуногистохимическое двойное окрашивание рецепторов Ah и ARNT в небных полках человеческого эмбриона». Тератология. 50 (5): 361–6. Дои:10.1002 / tera.1420500507. PMID  7716743.
• Reisz-Porszasz S, Probst MR, Fukunaga BN, Hankinson O (1994). «Идентификация функциональных доменов белка ядерного транслокатора арилуглеводородного рецептора (ARNT)». Мол. Cell. Биол. 14 (9): 6075–86. Дои:10.1128 / mcb.14.9.6075. ЧВК  359134. PMID  8065341.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Джонсон Б., Брукс Б.А., Хайнцманн С., Дип А., Мохандас Т., Спаркс Р.С., Рейес Х., Хоффман Э., Ланге Е., Гатти Р.А. (1993). «Ген ядерного транслокатора рецептора Ah (ARNT) расположен на q21 хромосомы 1 человека и на хромосоме 3 мыши рядом с Cf-3». Геномика. 17 (3): 592–8. Дои:10.1006 / geno.1993.1377. PMID  8244375.
• Whitelaw M, Pongratz I, Wilhelmsson A, Gustafsson JA, Poellinger L (1993). «Лиганд-зависимое привлечение корегулятора Arnt определяет распознавание ДНК рецептором диоксина». Мол. Cell. Биол. 13 (4): 2504–14. Дои:10.1128 / MCB.13.4.2504. ЧВК  359572. PMID  8384309.
• Цзян Б. Х., Рю Э, Ван Г. Л., Роу Р., Семенза Г. Л. (1996). «Димеризация, связывание ДНК и трансактивационные свойства фактора 1, индуцируемого гипоксией». J. Biol. Chem. 271 (30): 17771–8. Дои:10.1074 / jbc.271.30.17771. PMID  8663540.
• Роулендс Дж. К., МакЭван И. Дж., Густафссон Дж. А. (1996). «Трансактивация человеческим арилуглеводородным рецептором и белками ядерного транслокатора арилуглеводородного рецептора: прямые взаимодействия с основными факторами транскрипции». Мол. Pharmacol. 50 (3): 538–48. PMID  8794892.
• Эма М., Морита М., Икава С., Танака М., Мацуда Й., Гото О, Сайджо Й., Фуджи Х., Хамада Х., Кикучи Й, Фудзи-Курияма Й (1996). «Два новых члена семейства генов Sim мыши являются репрессорами транскрипции и демонстрируют различные паттерны экспрессии во время эмбриогенеза мыши». Мол. Cell. Биол. 16 (10): 5865–75. Дои:10.1128 / MCB.16.10.5865. ЧВК  231588. PMID  8927054.
• Свонсон Х.И., Ян Дж. (1997). «Картирование участков контакта белок / ДНК рецептора Ah и ядерного транслокатора рецептора Ah». J. Biol. Chem. 271 (49): 31657–65. Дои:10.1074 / jbc.271.49.31657. PMID  8940186.
• Probst MR, Fan CM, Tessier-Lavigne M, Hankinson O (1997). «Два мышиных гомолога однозначного белка дрозофилы, которые взаимодействуют с белком ядерного транслокатора мышиного арилуглеводородного рецептора». J. Biol. Chem. 272 (7): 4451–7. Дои:10.1074 / jbc.272.7.4451. PMID  9020169.
• Хогенеш Дж. Б., Чан В. К., Джеки В. Х., Браун Р. К., Гу Ю. З., Молитва-Грант М., Пердью Г. Х., Брэдфилд, Калифорния (1997). «Характеристика подмножества суперсемейства basic-helix-loop-helix-PAS, которое взаимодействует с компонентами пути передачи сигналов диоксина». J. Biol. Chem. 272 (13): 8581–93. Дои:10.1074 / jbc.272.13.8581. PMID  9079689.
• Карвер Л.А., Брэдфилд Калифорния (1997). «Лиганд-зависимое взаимодействие арилуглеводородного рецептора с новым гомологом иммунофилина in vivo». J. Biol. Chem. 272 (17): 11452–6. Дои:10.1074 / jbc.272.17.11452. PMID  9111057.
• Эма М., Тая С., Йокотани Н., Согава К., Мацуда Ю., Фуджи-Курияма Ю. (1997). «Новый фактор bHLH-PAS с близким сходством последовательности с индуцируемым гипоксией фактором 1альфа регулирует экспрессию VEGF и потенциально участвует в развитии легких и сосудов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (9): 4273–8. Дои:10.1073 / пнас.94.9.4273. ЧВК  20712. PMID  9113979.
• Моффет П., Рис М., Пеллетье Дж. (1997). «Мышиный продукт гена Sim-2 ингибирует транскрипцию за счет активной репрессии и функционального вмешательства». Мол. Cell. Биол. 17 (9): 4933–47. Дои:10.1128 / mcb.17.9.4933. ЧВК  232345. PMID  9271372.

внешняя ссылка

• Арил + углеводород + рецептор + ядро ​​+ транслокатор в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.