GTF2F2 - GTF2F2

GTF2F2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1BBY, 1F3U, 2BBY, 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
Идентификаторы
Псевдонимы	GTF2F2, BTF4, RAP30, TF2F2, TFIIF, субъединица 2 общего фактора транскрипции IIF
Внешние идентификаторы	OMIM: 189969 MGI: 1915955 ГомолоГен: 37884 Генные карты: GTF2F2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 13 (человек)[1] Группа 13q14.12-q14.13 Начинать 45,120,510 бп[1] Конец 45,284,893 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[2] Группа 14 | 14 D3 Начинать 75,896,937 бп[2] Конец 76,010,865 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание нуклеотидов • GO: 0008026 геликазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • гидролазная активность • Связывание АТФ Сотовый компонент • цитоскелет микротрубочек • нуклеоплазма • комплекс фактора транскрипции TFIIF • ядро клетки • транскрипционный преинициационный комплекс Биологический процесс • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • Кеппинг мРНК 7-метилгуанозина • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция инициации транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция вирусной транскрипции • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция мяРНК с промотора РНК-полимеразы II • сигнальный путь рецептора фактора роста фибробластов • положительная регуляция элонгации транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • Метаболический процесс РНК • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2963	68705
Ансамбль	ENSG00000188342	ENSMUSG00000067995
UniProt	P13984	Q8R0A0
RefSeq (мРНК)	NM_004128	NM_026816
RefSeq (белок)	NP_004119	NP_081092
Расположение (UCSC)	Chr 13: 45.12 - 45.28 Мб	Chr 14: 75.9 - 76.01 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица 2 общего фактора транскрипции IIF это белок что у людей кодируется GTF2F2 ген.^[5][6]

Взаимодействия

GTF2F2 был показан взаимодействовать с POLR2E^[7] и HTATSF1.^[8]

Смотрите также

• Фактор транскрипции II F

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000188342 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000067995 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Хэн Х. Х., Сяо Х., Ши Х. М., Гринблатт Дж., Цуй Л.К. (май 1994 г.). «Гены, кодирующие общие факторы инициации транскрипции РНК-полимеразы II, рассредоточены в геноме человека». Гм. Мол. Genet. 3 (1): 61–4. Дои:10,1093 / hmg / 3.1.61. PMID  8162052.
6. «Ген Entrez: общий фактор транскрипции GTF2F2 IIF, полипептид 2, 38 кДа».
7. Вэй В., Доржсурен Д., Линь И, Цинь В., Номура Т., Хаяси Н., Мураками С. (апрель 2001 г.). «Прямое взаимодействие между субъединицей RAP30 фактора транскрипции IIF (TFIIF) и субъединицей 5 РНК-полимеразы, которое способствует ассоциации между TFIIF и РНК-полимеразой II». J. Biol. Chem. 276 (15): 12266–73. Дои:10.1074 / jbc.M009634200. PMID  11278533.
8. Kim JB, Yamaguchi Y, Wada T, Handa H, Sharp PA (сентябрь 1999 г.). «Белок Tat-SF1 связывается с белками RAP30 и SPT5 человека». Мол. Клетка. Биол. 19 (9): 5960–8. Дои:10.1128 / mcb.19.9.5960. ЧВК  84462. PMID  10454543.

дальнейшее чтение

• Като Х., Сумимото Х., Погнонек П., Чен Ч., Розен К. А., Рёдер Р. Г. (1992). «ВИЧ-1 Tat действует как фактор процессивности in vitro в сочетании с факторами клеточного удлинения». Genes Dev. 6 (4): 655–66. Дои:10.1101 / gad.6.4.655. PMID  1559613.
• Хорикоши М., Фудзита Х, Ван Дж, Такада Р., Родер Р. (1991). «Нуклеотидная и аминокислотная последовательность RAP30». Нуклеиновые кислоты Res. 19 (19): 5436. Дои:10.1093 / nar / 19.19.5436. ЧВК  328912. PMID  1840667.
• Сопта М., Бертон З.Ф., Гринблатт Дж. (1989). «Структура и связанная ДНК-геликазная активность общего фактора инициации транскрипции, который связывается с РНК-полимеразой II». Природа. 341 (6241): 410–4. Bibcode:1989Натура.341..410S. Дои:10.1038 / 341410a0. PMID  2477704. S2CID  4321793.
• Сопта М., Картью Р.В., Гринблатт Дж. (1985). «Выделение трех белков, которые связываются с РНК-полимеразой II млекопитающих». J. Biol. Chem. 260 (18): 10353–60. PMID  3860504.
• Тан С., Асо Т., Конавей Р.К., Конавей Дж. В. (1994). «Роли субъединиц RAP30 и RAP74 фактора транскрипции IIF в инициации и удлинении транскрипции с помощью РНК-полимеразы II». J. Biol. Chem. 269 (41): 25684–91. PMID  7929273.
• Йонаха М., Асо Т., Кобаяси Ю., Васавада Х., Ясукочи Ю., Вайсман С.М., Китадзима С. (1993). «Доменная структура человеческого общего фактора инициации транскрипции, TFIIF». Нуклеиновые кислоты Res. 21 (2): 273–9. Дои:10.1093 / nar / 21.2.273. ЧВК  309103. PMID  8441635.
• Тан Х, Сан Х, Рейнберг Д., Эбрайт Р. Х. (1996). «Белковые взаимодействия в инициации транскрипции эукариот: структура преинициативного комплекса». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (3): 1119–24. Bibcode:1996PNAS ... 93.1119T. Дои:10.1073 / pnas.93.3.1119. ЧВК  40041. PMID  8577725.
• Мартин М.Л., Либерман П.М., Курран Т. (1996). «Димеризация Fos-Jun способствует взаимодействию основной области с TFIIE-34 и TFIIF». Мол. Клетка. Биол. 16 (5): 2110–8. Дои:10.1128 / mcb.16.5.2110. ЧВК  231198. PMID  8628277.
• Фанг С.М., Бертон З.Ф. (1996). «Связанный с РНК-полимеразой II белок (RAP) 74 связывает фактор транскрипции (TF) IIB и блокирует связывание TFIIB-RAP30». J. Biol. Chem. 271 (20): 11703–9. Дои:10.1074 / jbc.271.20.11703. PMID  8662660.
• Дубровская В., Лавин А.С., Дэвидсон И., Акер Дж., Стауб А., Тора Л. (1996). «Определенные домены hTAFII100 необходимы для функционального взаимодействия с фактором транскрипции TFIIF beta (RAP30) и включения в комплекс TFIID». EMBO J. 15 (14): 3702–12. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00740.x. ЧВК  452026. PMID  8758937.
• Роулендс Дж. К., МакЭван И. Дж., Густафссон Дж. А. (1996). «Трансактивация человеческим арилуглеводородным рецептором и белками ядерного транслокатора арилуглеводородного рецептора: прямые взаимодействия с основными факторами транскрипции». Мол. Pharmacol. 50 (3): 538–48. PMID  8794892.
• Чжоу Q, Шарп PA (1996). «Tat-SF1: кофактор для стимуляции элонгации транскрипции с помощью Tat ВИЧ-1». Наука. 274 (5287): 605–10. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. Дои:10.1126 / science.274.5287.605. PMID  8849451. S2CID  13266489.
• Parada CA, Roeder RG (1996). «Повышенная процессивность РНК-полимеразы II, вызванная Tat-индуцированным фосфорилированием ее карбоксиконцевого домена». Природа. 384 (6607): 375–8. Bibcode:1996Натура.384..375P. Дои:10.1038 / 384375a0. PMID  8934526. S2CID  4278432.
• Кодзима С., Кобаяси А., Гото О, Окума Ю., Фуджи-Курияма Ю., Согава К. (1997). «Транскрипционный домен активации BTEB2 человека, фактор связывания GC бокса». J. Biochem. 121 (2): 389–96. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a021600. PMID  9089417.
• Cujec TP, Cho H, Maldonado E, Meyer J, Reinberg D, Peterlin BM (1997). «Трансактиватор вируса иммунодефицита человека Tat взаимодействует с холоферментом РНК-полимеразы II». Мол. Клетка. Биол. 17 (4): 1817–23. Дои:10.1128 / mcb.17.4.1817. ЧВК  232028. PMID  9121429.
• МакЭван И. Дж., Густафссон Дж. (1997). «Взаимодействие функции трансактивации андрогенных рецепторов человека с общим фактором транскрипции TFIIF». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (16): 8485–90. Bibcode:1997PNAS ... 94.8485M. Дои:10.1073 / пнас.94.16.8485. ЧВК  22967. PMID  9238003.
• Newberry EP, Latifi T, Battaile JT, Towler DA (1997). «Структурно-функциональный анализ Msx2-опосредованного подавления транскрипции». Биохимия. 36 (34): 10451–62. Дои:10.1021 / bi971008x. PMID  9265625.
• Лян Г., Хай Т. (1997). «Характеристика человеческого активирующего фактора транскрипции 4, активатора транскрипции, который взаимодействует с несколькими доменами белка, связывающего цАМФ-чувствительный элемент-связывающий белок (CREB)». J. Biol. Chem. 272 (38): 24088–95. Дои:10.1074 / jbc.272.38.24088. PMID  9295363.
• Окамото Т., Ямамото С., Ватанабэ Ю., Охта Т., Ханаока Ф., Рёдер Р.Г., Окума Ю. (1998). «Анализ роли TFIIE в регуляции транскрипции посредством структурно-функциональных исследований субъединицы TFIIEbeta». J. Biol. Chem. 273 (31): 19866–76. Дои:10.1074 / jbc.273.31.19866. PMID  9677423.

внешняя ссылка

• GTF2F2 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.