ТОКС - TOX

Эта статья про белок. Для использования в других целях см. Токс (значения).

ТОКС
Идентификаторы
Псевдонимы	ТОКС, TOX1, блок группы с высокой подвижностью, связанный с отбором тимоцитов
Внешние идентификаторы	OMIM: 606863 MGI: 2181659 ГомолоГен: 8822 Генные карты: ТОКС
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q12.1 Начинать 58,805,412 бп[1] Конец 59,119,147 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 A1 Начинать 6,686,353 бп[2] Конец 6,991,557 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • ядро клетки Биологический процесс • дифференцировка лимфоцитов • положительная регуляция естественной дифференцировки клеток-киллеров • развитие лимфатических узлов • Разработка патча Пейера • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9760	252838
Ансамбль	ENSG00000198846	ENSMUSG00000041272
UniProt	O94900	Q66JW3
RefSeq (мРНК)	NM_014729	NM_145711 NM_001377078 NM_001377079
RefSeq (белок)	NP_055544	NP_663757 NP_001364007 NP_001364008
Расположение (UCSC)	Chr 8: 58.81 - 59.12 Мб	Chr 4: 6.69 - 6.99 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Связанный с селекцией тимоцитов белок группового бокса с высокой подвижностью TOX это белок что у людей кодируется ТОКС ген.^[5][6][7]

Структура и функции

Ген TOX кодирует белок который принадлежит к большому суперсемейству хроматин связанные белки, которые разделяют примерно 75 аминокислот ДНК-связывающий мотив, то HMG (группа высокой мобильности) -box (назван в честь того, что обнаружен у канонического члена семейства, протеина 1 группы с высокой подвижностью). Немного группа высокой мобильности (HMG) бокс-белки (например, LEF1 ) содержат один мотив бокса HMG и связывают ДНК специфичным для последовательности образом, в то время как другие члены этого семейства (например, HMGB1 ) имеют несколько боксов HMG и связывают ДНК независимым от последовательности, но структурно-зависимым образом. В то время как TOX имеет один мотив коробки HMG,^[7] предполагается, что он будет связывать ДНК независимым от последовательности образом.^[8] TOX также является членом небольшого подсемейства белков (TOX2, TOX3, и TOX4 ), которые имеют почти идентичные последовательности HMG-бокса.^[8] TOX3 был идентифицирован как локус восприимчивости к раку груди.^[9][10] TOX сильно выражен в вилочковая железа, сайт разработки Т-лимфоциты. Нокаут-мыши у которых отсутствует TOX, есть серьезный дефект в развитии определенных субпопуляций Т-лимфоцитов.^[11]

Роль в болезнях

При раке или во время хронической вирусной инфекции TOX необходим для персистенции Т-клеток, но он также вызывает «истощение» Т-клеток, что способствует снижению противоопухолевой или противовирусной функции этих клеток.^[12][13][14].

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000198846 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041272 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (апрель 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (5): 277–86. Дои:10.1093 / днарес / 5.5.277. PMID  9872452.
6. Уилкинсон Б., Чен Дж.Й., Хан П., Руфнер К.М., Гуларте О.Д., Кэй Дж. (Март 2002 г.). «TOX: белок HMG-бокса, участвующий в регуляции отбора тимоцитов». Нат Иммунол. 3 (3): 272–80. Дои:10.1038 / ni767. PMID  11850626. S2CID  19716719.
7. «Ген Entrez: связанный с селекцией тимоцитов ген TOX группового бокса с высокой подвижностью».
8. О'Флаэрти Э, Кэй Дж (апрель 2003 г.). «TOX определяет консервативное подсемейство белков HMG-бокса». BMC Genomics. 4 (1): 13. Дои:10.1186/1471-2164-4-13. ЧВК  155677. PMID  12697058.
9. Истон Д.Ф., Пули К.А., Даннинг А.М. и др. (Июнь 2007 г.). «Полногеномное ассоциативное исследование выявляет новые локусы восприимчивости к раку груди». Природа. 447 (7148): 1087–93. Bibcode:2007 Натур.447.1087E. Дои:10.1038 / природа05887. ЧВК  2714974. PMID  17529967.
10. Стейси С.Н., Манолеску А., Сулем П. и др. (Июль 2007 г.). «Общие варианты хромосом 2q35 и 16q12 придают предрасположенность к эстроген-рецептор-положительному раку груди». Nat. Genet. 39 (7): 865–9. Дои:10,1038 / ng2064. PMID  17529974. S2CID  7346190.
11. Алиахмад, Париназ; Кэй, Джонатан (21 января 2008 г.). «Развитие всех линий CD4 T требует ядерного фактора TOX». Журнал экспериментальной медицины. 205 (1): 245–256. Дои:10.1084 / jem.20071944. ISSN  1540-9538. ЧВК  2234360. PMID  18195075.
12. Алфей, Франческа; Канев, Кристиан; Хофманн, Майке; Ву, Мин; Ghoneim, Hazem E .; Роэлли, Патрик; Utzschneider, Daniel T .; фон Хёсслин, Мадлен; Каллен, Джоли Г. (2019). «ТОКС усиливает фенотип и продолжительность жизни истощенных Т-клеток при хронической вирусной инфекции». Природа. 571 (7764): 265–269. Дои:10.1038 / s41586-019-1326-9. ISSN  1476-4687. PMID  31207605. S2CID  190528786.
13. Хан, Омар; Джайлз, Жозефина Р .; Макдональдс, Сьерра; Манн, Сасикант; Нгиоу, Шин Фунг; Patel, Kunal P .; Вернер, Майкл Т .; Хуанг, Александр С .; Александр, Катерина А. (2019). «TOX транскрипционно и эпигенетически программирует истощение CD8 + Т-клеток». Природа. 571 (7764): 211–218. Дои:10.1038 / с41586-019-1325-х. ISSN  1476-4687. ЧВК  6713202. PMID  31207603.
14. Скотт, Эндрю С .; Дюндар, Фридерике; Зумбо, Пол; Chandran, Smita S .; Klebanoff, Christopher A .; Шакиба, Модждех; Триведи, Прерак; Менокал, Лаура; Эпплби, Хизер (2019). «ТОКС - критический регулятор дифференцировки опухолеспецифических Т-клеток». Природа. 571 (7764): 270–274. Дои:10.1038 / с41586-019-1324-у. ISSN  1476-4687. PMID  31207604. S2CID  190538130.

дальнейшее чтение

• Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Н. и др. (2003). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Res. 9 (3): 99–106. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID  12168954.
• Себастьяни П., Ван Л., Нолан В. Г. и др. (2008). «Гемоглобин плода при серповидно-клеточной анемии: байесовское моделирование генетических ассоциаций». Являюсь. J. Hematol. 83 (3): 189–95. Дои:10.1002 / ajh.21048. PMID  17918249. S2CID  24667609.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Алиахмад П., О'Флаэрти Э., Хан П. и др. (2004). «TOX обеспечивает связь между активацией кальциневрина и предопределением клонов CD8». J. Exp. Med. 199 (8): 1089–99. Дои:10.1084 / jem.20040051. ЧВК  2211890. PMID  15078895.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.