ZNF366 - ZNF366

ZNF366
Идентификаторы
Псевдонимы	ZNF366, DCSCRIPT, белок цинкового пальца 366, DC-SCRIPT
Внешние идентификаторы	OMIM: 610159 MGI: 2178429 ГомолоГен: 17637 Генные карты: ZNF366
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q13.2 | 5q13.2 Начинать 72,439,903 бп[1] Конец 72,507,410 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание рецептора эстрогена • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • связывание ионов металлов • связывание нуклеиновой кислоты • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II Сотовый компонент • ядро клетки Биологический процесс • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция внутриклеточного сигнального пути рецептора эстрогена • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • ответ на эстроген Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	167465	238803
Ансамбль	ENSG00000178175	ENSMUSG00000050919
UniProt	Q8N895	Q6NS86
RefSeq (мРНК)	NM_152625	NM_001004149
RefSeq (белок)	NP_689838	NP_001004149
Расположение (UCSC)	Chr 5: 72,44 - 72,51 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цинк-палец протеин 366, также известный как DC-SCRIPT (Транскрипт, специфичный для дендритных клеток), представляет собой белок что у людей кодируется ZNF366 ген.^[4] Ген ZNF366 был впервые идентифицирован в исследовании сравнения ДНК между 85 т.п.н. Fugu rubripes последовательность, содержащая 17 генов с ее гомологичными локусами в проекте человека геном.^[5]

Функция

В 2006 году DC-SCRIPT был выделен и охарактеризован у человека. дендритные клетки, полученные из моноцитов (МО-ДК).^[6]

DC-SCRIPT содержит ДНК-связывающий домен (11 C₂ЧАС₂ цинковые (Zn) пальцы), фланкированный богатой пролином и кислой областью, которая может взаимодействовать с C-концевым связывающим белком 1 (CtBP1), глобальным корепрессор. В иммунной системе обоих мышей и люди Было обнаружено, что DC-SCRIPT специфически экспрессируется в дендритных клетках (DC).^[7]

Было показано, что в клетках COS-1 DC-SCRIPT взаимодействует с рецептор эстрогена ДНК-связывающий домен (ERDBD) и репрессирует активность ER за счет ассоциации с RIP140, CtBP и гистоновыми деацетилазами.^[8]

Рак молочной железы

В 2010 году было показано, что DC-SCRIPT может действовать как корегулятор множества ядерных рецепторов, оказывая противоположные эффекты на NR типа I и типа II. DC-SCRIPT способен подавлять транскрипцию, опосредованную ER и PR, тогда как он может активировать транскрипцию, опосредованную RAR и PPAR. В том же исследовании было показано, что ткань опухоли груди экспрессирует более низкие уровни DC-SCRIPT, чем нормальная ткань груди того же пациента, и что экспрессия мРНК DC-SCRIPT является независимым прогностическим фактором для хорошей выживаемости рак молочной железы пациенты с опухолями, положительными по рецепторам эстрогена и / или рецепторам прогестерона.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000178175 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ген Entrez: ZNF366, белок цинкового пальца 366».
5. Гиллиган П., Бреннер С., Венкатеш Б. (июль 2002 г.). «Сравнение последовательностей Fugu и человека позволяет идентифицировать новые гены человека и консервативные некодирующие последовательности». Ген. 294 (1–2): 35–44. Дои:10.1016 / S0378-1119 (02) 00793-X. PMID  12234665.
6. Triantis V, Trancikova DE, Looman MW, Hartgers FC, Janssen RA, Adema GJ (январь 2006 г.). «Идентификация и характеристика DC-SCRIPT, нового экспрессируемого дендритными клетками члена семейства транскрипционных регуляторов« цинковые пальцы »». J. Immunol. 176 (2): 1081–9. Дои:10.4049 / jimmunol.176.2.1081. PMID  16393996.
7. Triantis V, Moulin V, Looman MW, Hartgers FC, Janssen RA, Adema GJ (май 2006 г.). «Молекулярная характеристика мышиного гомолога DC-производного белка DC-SCRIPT». J. Leukoc. Биол. 79 (5): 1083–91. Дои:10.1189 / jlb.1005588. HDL:2066/49437. PMID  16522745. S2CID  27847791.
8. Лопес-Гарсия Дж., Периясами М., Томас Р.С., Кристиан М., Леао М., Джат П., Kindle KB, Хери Д.М., Паркер М.Г., Булувела Л., Камалати Т., Али С. (2006). «ZNF366 представляет собой корепрессор рецептора эстрогена, который действует через CtBP и гистоновые деацетилазы». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (21): 6126–36. Дои:10.1093 / нар / gkl875. ЧВК  1693901. PMID  17085477.
9. Ансемс М., Хонтелес С., Луман М.В., Картхаус Н., Булт П., Боненкамп Дж. Дж., Янсен Дж. Х., Свип ФК, Спан ПН, Адема Дж. Дж. (Январь 2010 г.). «DC-SCRIPT: модуляция ядерных рецепторов и прогностическое значение при первичном раке груди». J. Natl. Институт рака. 102 (1): 54–68. Дои:10.1093 / jnci / djp441. PMID  20008677.

дальнейшее чтение

• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.

внешняя ссылка

• ZNF366 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.