CDX4 (ген) - CDX4 (gene)

CDX4
Идентификаторы
Псевдонимы	CDX4, гомеобокс каудального типа 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 300025 MGI: 88362 ГомолоГен: 3806 Генные карты: CDX4
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq13.2 Начинать 73,447,254 бп[1] Конец 73,455,245 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X D | X 46,06 см Начинать 103,321,398 бп[2] Конец 103,330,592 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • Связывание ДНК • последовательное связывание ДНК • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции Сотовый компонент • ядро клетки Биологический процесс • морфогенез органов животных • развитие многоклеточного организма • развитие лабиринтного слоя • дифференциация клеток • развитие кровеносных сосудов • спецификация передней / задней оси • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • спецификация переднего / заднего рисунка • плацентация • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1046	12592
Ансамбль	ENSG00000131264	ENSMUSG00000031326
UniProt	O14627	Q07424
RefSeq (мРНК)	NM_005193	NM_007674
RefSeq (белок)	NP_005184	NP_031700
Расположение (UCSC)	Chr X: 73,45 - 73,46 Мб	Chr X: 103.32 - 103.33 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гомеобокс протеин CDX-4 это белок что у человека кодируется CDX4 ген. Этот ген является членом каудальный -связанные с гомеобокс фактор транскрипции семейство, которое также включает CDX1 и CDX2.^[5]

Функция

Фактор транскрипции, кодируемый геном CDX4, участвует в формировании внеэмбриональных тканей, формировании передне-заднего паттерна и кроветворении во время эмбриогенеза. Это происходит за счет регуляции экспрессии гена Hox. ^{[6] [7][8]}

До того, как произойдет плацентация, CDX4 играет роль в ее развитии. Мутанты CDX4 рождаются здоровыми и плодовитыми, однако его важность раскрывается в составных мутантах CDX. Сложные мутанты, несущие один нулевой аллель CDX2 и гомозиготный нулевой по CDX4, не способны генерировать заднюю ткань каудальнее задних конечностей, и большинство этих эмбрионов умирают около 10,5 дня эмбриона из-за отсутствия развития плаценты. Около 10% этого фенотипа могут развиться до полного срока, но вскоре после рождения умирают. При осмотре прослежен морфогенез тканей аноректальной и уретральной областей. ^{[9] [10]}

Наиболее хорошо описанная функция генов CDX - это их роль в формировании каудального тела. Факторы транскрипции семейства генов CDX частично контролируют экспрессию гена Hox, отвечая на сигнальные молекулы ретиноевой кислоты, Wnt и FGF. Избыточный вклад CDX4 в удлинение оси показан тем, что ни нуль CDX4, ни мутанты соединения CDX1 / CDX4 не появляются с нарушенным удлинением оси. Однако CDX4 действительно играет роль в определении количества B-клеток поджелудочной железы, определяя передне-заднее расположение органов передней кишки, включая поджелудочную железу и печень. Таким образом, аномальное состояние проявляется у эмбрионов, дефицитных по CDX4 из-за сдвинутых кзади поджелудочной железы, печени и тонкого кишечника. ^{[11] [12]}

В кроветворении регуляция CDX4 Hox генов необходима для спецификации судьбы гематопоэтических клеток во время эмбриогенеза. Это демонстрируется тем фактом, что дефицит крови у мутантов CDX4 может быть устранен за счет сверхэкспрессии определенных Hox-генов. ^[13]

Модели нокаута были созданы на мышах, как описано в разделе «Роль CDX4 в формировании хвостового тела».

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000131264 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031326 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: фактор транскрипции 4 гомеобокса каудального типа CDX1».
6. ван Нес Дж, де Грааф В., Лебрин Ф., Герхард М., Бек Ф., Дешам Дж. (февраль 2006 г.). «Мутация Cdx4 влияет на осевое развитие и показывает важную роль генов Cdx в онтогенезе плацентарного лабиринта у мышей». Разработка. 133 (3): 419–28. Дои:10.1242 / dev.02216. PMID  16396910.
7. ван де Вен Ч., Бялецка М., Нейтс Р., Янг Т., Роуленд Дж. Э., Стрингер Э. Дж. и др. (Август 2011 г.). «Согласованное участие генов Cdx / Hox и передачи сигналов Wnt в морфогенезе каудальной нервной трубки и производных клоаки из задней зоны роста». Разработка. 138 (16): 3451–62. Дои:10.1242 / dev.066118. PMID  21752936.
8. Дэвидсон А.Дж., Эрнст П., Ван Й., Депутат Декенс, П.Д. Кингсли, Палис Дж. И др. (Сентябрь 2003 г.). «мутанты cdx4 не могут определить предков крови и могут быть спасены множеством hox-генов». Природа. 425 (6955): 300–6. Дои:10.1038 / природа01973. PMID  13679919. S2CID  4315496.
9. ван Нес Дж, де Грааф В., Лебрин Ф., Герхард М., Бек Ф., Дешам Дж. (февраль 2006 г.). «Мутация Cdx4 влияет на осевое развитие и показывает важную роль генов Cdx в онтогенезе плацентарного лабиринта у мышей». Разработка. 133 (3): 419–28. Дои:10.1242 / dev.02216. PMID  16396910.
10. ван де Вен Ч., Бялецка М., Нейц Р., Янг Т., Роуленд Дж. Э., Стрингер Э. Дж. и др. (Август 2011 г.). «Согласованное участие генов Cdx / Hox и передачи сигналов Wnt в морфогенезе каудальной нервной трубки и производных клоаки из задней зоны роста». Разработка. 138 (16): 3451–62. Дои:10.1242 / dev.066118. PMID  21752936.
11. ван де Вен Ч., Бялецка М., Нейц Р., Янг Т., Роуленд Дж. Э., Стрингер Э. Дж. и др. (Август 2011 г.). «Согласованное участие генов Cdx / Hox и передачи сигналов Wnt в морфогенезе каудальной нервной трубки и производных клоаки из задней зоны роста». Разработка. 138 (16): 3451–62. Дои:10.1242 / dev.066118. PMID  21752936.
12. Kinkel MD, Eames SC, Alonzo MR, Prince VE (март 2008 г.). «Cdx4 необходим в энтодерме для локализации поджелудочной железы и ограничения количества бета-клеток». Разработка. 135 (5): 919–29. Дои:10.1242 / dev.010660. PMID  18234725.
13. Дэвидсон А.Дж., Эрнст П., Ван Й., Депутат Декенс, П.Д. Кингсли, Палис Дж. И др. (Сентябрь 2003 г.). «Мутанты cdx4 не могут определить предков крови и могут быть спасены множеством hox-генов». Природа. 425 (6955): 300–6. Дои:10.1038 / природа01973. PMID  13679919. S2CID  4315496.

внешняя ссылка

• Человек CDX4 расположение генома и CDX4 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.