PKNOX2 - PKNOX2

PKNOX2
Идентификаторы
Псевдонимы	PKNOX2, PREP2, PBX / узел 1, гомеобокс 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 613066 MGI: 2445415 ГомолоГен: 32527 Генные карты: PKNOX2
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 11 (человек)
Конец	125,433,389 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 9 (мышь)
Конец	37,147,407 бп
Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание ДНК; • последовательное связывание ДНК; • связывание актиновой нити; • связывание мономера актина; • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • цитоскелет микротрубочек; • актиновый цитоскелет; • ядро клетки; • нуклеоплазма; • межклеточный мостик;
Биологический процесс	• регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	63876
	208076
	ENSG00000165495
	ENSMUSG00000035934
	Q96KN3
	Q8BG99
	NM_022062
	NM_001029838; NM_148950
NP_001369252; NP_001369253; NP_001369254; NP_001369255; NP_001369256;
	NP_001369257; NP_001369258; NP_001369259; NP_001369260; NP_001369261; NP_001369262; NP_001369263; NP_001369264; NP_001369265; NP_001369266; NP_001369267; NP_001369268; NP_001369269; NP_001369270
	NP_001025009; NP_683752
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

АТС / Узловая 1 Homeobox 2 (PKNOX2) белок принадлежит к классу удлинения петли из трех аминокислот (TALE) гомеодомен белками и кодируется PKNOX2 ген у человека. Белок регулирует транскрипцию других генов и влияет на анатомическое развитие.^[5]

Функция

Белок PKNOX2 регулирует экспрессию других генов посредством привязка к ДНК специфическим для последовательности образом, то есть конкретным последовательностям ДНК. Он связывается с уникальным распознаванием ДНК мотивы, действуя как ядерный фактор транскрипции.^[6] Фактор ядерной транскрипции - это белок, регулирующий транскрипция генетической информации из ДНК к информационная РНК. Другие функции PKNOX2 включают: актин переплет нити. Важно паралог из PKNOX2 ген PKNOX1.

Структура

PKNOX2 принадлежит к классу удлинения петли из трех аминокислот (TALE) гомеодоменных белков. Этот класс характеризуется удлинением из 3 аминокислот между альфа-спиралями 1 и 2 в гомеодомене.^[7]

Гомеодоменные белки представляют собой факторы транскрипции, специфичные для последовательности, которые имеют общий высококонсервативный ДНК-связывающий домен и играют решающую роль в пролиферации, дифференцировке и гибели клеток.^[7]

Клиническое значение

В 2014 году обзорная статья из результаты общегеномной ассоциации из алкогольная зависимость, исследователи пришли к выводу, что на основе функционального анализа (демонстрация причинно-следственной связи),^[8] генетические варианты, связанные с геном PKNOX2, могут играть роль в риске алкогольной зависимости, хотя и второстепенную по сравнению с ролью, которую играют гены, расположенные в кластере алкогольдегидрогеназы.^[9]

Смотрите также

Homeobox
Связывание с конкретными последовательностями ДНК
Человек PKNOX2 расположение генома и PKNOX2 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

Рекомендации

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000165495 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035934 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Имото I, Сонода I, Юки Y, Инадзава Дж. (Сентябрь 2001 г.). «Идентификация и характеристика человеческого PKNOX2, нового гена, содержащего гомеобокс». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 287 (1): 270–6. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5578. PMID 11549286.
^ Fognani C, Kilstrup-Nielsen C, Berthelsen J, Ferretti E, Zappavigna V, Blasi F (май 2002 г.). «Характеристика PREP2, паралога PREP1, который определяет новое подсемейство факторов транскрипции гомеодомена MEINOX TALE». Исследования нуклеиновых кислот. 30 (9): 2043–51. Дои:10.1093 / nar / 30.9.2043. ЧВК 113854. PMID 11972344.
^ ^а ^б "PKNOX2 PBX / узловая 1 гомеобокс 2 - Ген - GTR - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Национальный центр биотехнологической информации. Получено 31 августа 2020. Гомеодоменные белки представляют собой факторы транскрипции, специфичные для последовательности, которые имеют общий высококонсервативный ДНК-связывающий домен и играют фундаментальную роль в пролиферации, дифференцировке и гибели клеток. PKNOX2 принадлежит к классу гомеодоменовых белков TALE (удлинение петли из 3 аминокислот), характеризующихся удлинением из 3 аминокислот между альфа-спиралями 1 и 2 в пределах гомеодомена. Эта статья включает текст из этого источника, который находится в всеобщее достояние.
^ Ивата Б.А., Дозье С.Л. (2008). «Клиническое применение методологии функционального анализа». Поведенческий анализ на практике. 1 (1): 3–9. Дои:10.1007 / BF03391714. ЧВК 2846577. PMID 22477673.
^ Zuo L, Lu L, Tan Y, Pan X, Cai Y, Wang X и др. (2014). «Общегеномные ассоциации открытий алкогольной зависимости». Американский журнал о зависимостях. 23 (6): 526–39. Дои:10.1111 / j.1521-0391.2014.12147.x. ЧВК 4187224. PMID 25278008.

Эта статья о ген на хромосома человека 11 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000165495 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035934 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid11549286-5] Имото I, Сонода I, Юки Y, Инадзава Дж. (Сентябрь 2001 г.). «Идентификация и характеристика человеческого PKNOX2, нового гена, содержащего гомеобокс». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 287 (1): 270–6. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5578. PMID 11549286.

[pmid11972344-6] Fognani C, Kilstrup-Nielsen C, Berthelsen J, Ferretti E, Zappavigna V, Blasi F (май 2002 г.). «Характеристика PREP2, паралога PREP1, который определяет новое подсемейство факторов транскрипции гомеодомена MEINOX TALE». Исследования нуклеиновых кислот. 30 (9): 2043–51. Дои:10.1093 / nar / 30.9.2043. ЧВК 113854. PMID 11972344.

[AutoMO-1-7] а ^б "PKNOX2 PBX / узловая 1 гомеобокс 2 - Ген - GTR - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Национальный центр биотехнологической информации. Получено 31 августа 2020. Гомеодоменные белки представляют собой факторы транскрипции, специфичные для последовательности, которые имеют общий высококонсервативный ДНК-связывающий домен и играют фундаментальную роль в пролиферации, дифференцировке и гибели клеток. PKNOX2 принадлежит к классу гомеодоменовых белков TALE (удлинение петли из 3 аминокислот), характеризующихся удлинением из 3 аминокислот между альфа-спиралями 1 и 2 в пределах гомеодомена. Эта статья включает текст из этого источника, который находится в всеобщее достояние.

[pmid22477673-8] Ивата Б.А., Дозье С.Л. (2008). «Клиническое применение методологии функционального анализа». Поведенческий анализ на практике. 1 (1): 3–9. Дои:10.1007 / BF03391714. ЧВК 2846577. PMID 22477673.

[pmid25278008-9] Zuo L, Lu L, Tan Y, Pan X, Cai Y, Wang X и др. (2014). «Общегеномные ассоциации открытий алкогольной зависимости». Американский журнал о зависимостях. 23 (6): 526–39. Дои:10.1111 / j.1521-0391.2014.12147.x. ЧВК 4187224. PMID 25278008.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]