YY1 - YY1

YY1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1UBD, 1ZNM, 4C5I
Идентификаторы
Псевдонимы	YY1, ДЕЛЬТА, INO80S, NF-E1, UCRBP, YIN-YANG-1, фактор транскрипции YY1, GADEVS
Внешние идентификаторы	OMIM: 600013 MGI: 99150 ГомолоГен: 2556 Генные карты: YY1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 14 (человек)[1] Группа 14q32.2 Начинать 100,238,298 бп[1] Конец 100,282,788 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 12 (мышь)[2] Группа 12 F1 | 12 59,58 см Начинать 108,792,973 бп[2] Конец 108,820,148 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • четырехстороннее связывание ДНК • GO: 0001158 Связывание с ДНК проксимальной области корового промотора, специфичное для последовательности • Связывание РНК • связывание нуклеиновой кислоты • Привязка SMAD • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • последовательное связывание ДНК • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание гистондеацетилазы • РНК-полимераза II репрессирует связывание фактора транскрипции Сотовый компонент • Ино80 комплекс • ядерная матрица • ядро клетки • нуклеоплазма • ядерный хроматин • комплекс регуляторов транскрипции • цитоплазма • Белковый комплекс PcG Биологический процесс • дифференциация клеток • Рекомбинация ДНК • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • клеточный ответ на УФ • отрицательная регуляция экспрессии генов • транскрипция, ДНК-шаблон • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • репарация двухцепочечных разрывов посредством гомологичной рекомбинации • сперматогенез • Ремонт ДНК • деубиквитинирование белков • отрицательное регулирование выработки интерферона-бета • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • Локализация РНК • спецификация переднего / заднего рисунка • ответ на УФ-С • положительная регуляция экспрессии генов • ответ на простагландин F • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • морфогенез глаза камерного типа • хромосомная организация • клеточный ответ на интерлейкин-1 • отрицательная регуляция транскрипции pri-miRNA с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция роста клеток, участвующих в развитии клеток сердечной мышцы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7528	22632
Ансамбль	ENSG00000100811	ENSMUSG00000021264
UniProt	P25490	Q00899
RefSeq (мРНК)	NM_003403	NM_009537
RefSeq (белок)	NP_003394	NP_033563
Расположение (UCSC)	Chr 14: 100,24 - 100,28 Мб	Chr 12: 108,79 - 108,82 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

YY1 (Инь Ян 1)^[5] репрессор транскрипции белок у людей это кодируется YY1 ген.^[6][7]

Функция

YY1 представляет собой повсеместно распространенный фактор транскрипции, принадлежащий к классу белков цинковых пальцев GLI-Kruppel. Белок участвует в репрессии и активации множества промоторов. Следовательно, YY в названии означает "Инь Янь «YY1 может направлять гистоновые деацетилазы и гистоновые ацетилтрансферазы к промотору, чтобы активировать или репрессировать промотор, тем самым вовлекая модификацию гистона в функцию YY1.^[8] YY1 способствует петлям хроматина энхансер-промотор, образуя димеры и способствуя взаимодействиям с ДНК. Его нарушение регуляции нарушает петли энхансер-промотор и экспрессию генов.^[9][10]

Клиническое значение

YY1 гетерозиготные делеции, миссенс-мутации и бессмысленные мутации вызывают синдром Габриэле-ДеВри (GADEVS) ^{[11] [12]}, аутосомно-доминантное расстройство нервного развития, характеризующееся умственной отсталостью, дисморфическими чертами лица, проблемами с кормлением, ограничением внутриутробного развития, различными когнитивными нарушениями, поведенческими проблемами и другими врожденными пороками развития.^[10] Доступен веб-сайт для сбора и обмена клинической информацией между врачами и семьями пострадавших.^[13]

Взаимодействия

YY1 был показан взаимодействовать с:

• ATF6,^[14]
• EP300^[15][16]
• FKBP3^[17]
• HDAC3^[15][18]
• Гистоновая деацетилаза 2^[15][18][19]
• Мой с^[20]
• NOTCH1^[21]
• RYBP^[22] и
• SAP30^[23]
• Серин-тРНК-лигаза^[24]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100811 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021264 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Тиавилль М.М., Ким Дж. (2011). «Онкогенный потенциал инь-янь 1, опосредованный контролем импринтированных генов». Критические обзоры онкогенеза. 16 (3–4): 199–209. Дои:10.1615 / critrevoncog.v16.i3-4.40. ЧВК  3392609. PMID  22248054.
6. Ши И, Сэто Э, Чанг Л.С., Шенк Т. (октябрь 1991 г.). «Репрессия транскрипции с помощью YY1, человеческого белка, родственного GLI-Krüppel, и облегчение репрессии с помощью белка E1A аденовируса». Клетка. 67 (2): 377–88. Дои:10.1016/0092-8674(91)90189-6. PMID  1655281. S2CID  19399858.
7. Чжу В., Лосси А.С., Кампер С.А., Гумусио Д.Л. (апрель 1994 г.). «Хромосомная локализация фактора транскрипции YY1 у мышей и человека». Геном млекопитающих. 5 (4): 234–6. Дои:10.1007 / BF00360552. HDL:2027.42/47010. PMID  7912122. S2CID  27296553.
8. «Ген Entrez: фактор транскрипции YY1 YY1».
9. Weintraub AS, Li CH, Zamudio AV, Sigova AA, Hannett NM, Day DS, et al. (Декабрь 2017 г.). «YY1 - структурный регулятор петель энхансер-промотор». Клетка. 171 (7): 1573–1588.e28. Дои:10.1016 / j.cell.2017.11.008. ЧВК  5785279. PMID  29224777.
10. Габриэле М., Вулто-ван Силфхаут А.Т., Жермен П.Л., Витриоло А., Кумар Р., Дуглас Э. и др. (Июнь 2017 г.). «Гаплонедостаточность YY1 вызывает синдром умственной отсталости, проявляющийся дисфункцией транскрипции и хроматина». Американский журнал генетики человека. 100 (6): 907–925. Дои:10.1016 / j.ajhg.2017.05.006. ЧВК  5473733. PMID  28575647.
11. "OMIM: СИНДРОМ ГАБРИЭЛЬ-ДЕ ФРИ".
12. Nabais Sá, M.J .; Габриэле, М .; Testa, G .; де Фрис BBA; Adam, M. P .; Ardinger, H.H .; Pagon, R.A .; Wallace, S.E .; Bean LJH; Стивенс, К .; Амемия, А. (1993). «Синдром Габриэля-де Фриза». PMID  31145572.
13. «YY1 - Сбор информации об управлении клиникой и исследовательских проектах». YY1.
14. Ли М., Баумейстер П., Рой Б., Фан Т., Фоти Д., Ло С., Ли А.С. (июль 2000 г.). «ATF6 как активатор транскрипции стрессового элемента эндоплазматического ретикулума: стресс-индуцированные изменения тапсигаргина и синергетические взаимодействия с NF-Y и YY1». Молекулярная и клеточная биология. 20 (14): 5096–106. Дои:10.1128 / mcb.20.14.5096-5106.2000. ЧВК  85959. PMID  10866666.
15. Яо Ю.Л., Ян В.М., Сэто Э. (сентябрь 2001 г.). «Регулирование фактора транскрипции YY1 путем ацетилирования и деацетилирования». Молекулярная и клеточная биология. 21 (17): 5979–91. Дои:10.1128 / mcb.21.17.5979-5991.2001. ЧВК  87316. PMID  11486036.
16. Ли Дж. С., Галвин К. М., См. Р. Х., Экнер Р., Ливингстон Д., Моран Е., Ши И. (май 1995 г.). «Ослабление репрессии транскрипции YY1 аденовирусом E1A опосредовано E1A-ассоциированным белком p300». Гены и развитие. 9 (10): 1188–98. Дои:10.1101 / gad.9.10.1188. PMID  7758944.
17. Ян В.М., Яо Ю.Л., Сето Э. (сентябрь 2001 г.). «FK506-связывающий белок 25 функционально связывается с гистоновыми деацетилазами и с фактором транскрипции YY1». Журнал EMBO. 20 (17): 4814–25. Дои:10.1093 / emboj / 20.17.4814. ЧВК  125595. PMID  11532945.
18. Ян В.М., Яо Ю.Л., Сунь Дж.М., Дэви-младший, Сэто Э. (октябрь 1997 г.). «Выделение и характеристика кДНК, соответствующих дополнительному члену семейства генов гистондеацетилазы человека». Журнал биологической химии. 272 (44): 28001–7. Дои:10.1074 / jbc.272.44.28001. PMID  9346952.
19. Каленик Дж.Л., Чен Д., Брэдли М.Э., Чен С.Дж., Ли Т.К. (февраль 1997 г.). «Дрожжевое двугибридное клонирование нового белка цинкового пальца, который взаимодействует с многофункциональным фактором транскрипции YY1». Исследования нуклеиновых кислот. 25 (4): 843–9. Дои:10.1093 / nar / 25.4.843. ЧВК  146511. PMID  9016636.
20. Шривастава А., Салеке С., Калпана Г.В., Артанди С., Гофф С.П., Каламе К. (декабрь 1993 г.). «Ингибирование регулятора транскрипции Инь-Ян-1 путем ассоциации с c-Myc». Наука. 262 (5141): 1889–92. Bibcode:1993Научный ... 262.1889С. Дои:10.1126 / science.8266081. PMID  8266081.
21. Йе Т.С., Линь Ю.М., Се Р.Х., Ценг М.Дж. (октябрь 2003 г.). «Ассоциация фактора транскрипции YY1 с высокомолекулярным комплексом Notch подавляет трансактивационную активность Notch». Журнал биологической химии. 278 (43): 41963–9. Дои:10.1074 / jbc.M304353200. PMID  12913000.
22. Гарсия Э., Маркос-Гутьеррес К., дель Мар Лоренте М., Морено Дж. К., Видаль М. (июнь 1999 г.). «RYBP, новый белок-репрессор, который взаимодействует с компонентами комплекса Polycomb млекопитающих и с фактором транскрипции YY1». Журнал EMBO. 18 (12): 3404–18. Дои:10.1093 / emboj / 18.12.3404. ЧВК  1171420. PMID  10369680.
23. Хуан Н.Э., Лин Ч., Линь Ю.С., Ю В.К. (июнь 2003 г.). «Модуляция активности YY1 с помощью SAP30». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 306 (1): 267–75. Дои:10.1016 / s0006-291x (03) 00966-5. PMID  12788099.
24. Fu CY, Wang P, Tsai HJ (ноябрь 2017 г.). «Конкурентное связывание между комплексом серил-тРНК синтетаза / YY1 и NFKB1 в дистальном сегменте приводит к дифференциальной регуляции активности промотора vegfa человека во время ангиогенеза». Исследования нуклеиновых кислот. 45 (5): 2423–2437. Дои:10.1093 / нар / gkw1187. ЧВК  5389716. PMID  27913726.

дальнейшее чтение

• Томас MJ, Сето Э. (август 1999). «Разблокировка механизмов фактора транскрипции YY1: являются ли ферменты, модифицирующие хроматин, ключевым?». Ген. 236 (2): 197–208. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00261-9. PMID  10452940.
• Парк К., Атчисон М.Л. (ноябрь 1991 г.). «Выделение кандидата в репрессор / активатор, NF-E1 (YY-1, дельта), который связывается с энхансером каппа 3 'иммуноглобулина и сайтом mu E1 тяжелой цепи иммуноглобулина». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 88 (21): 9804–8. Bibcode:1991ПНАС ... 88.9804П. Дои:10.1073 / pnas.88.21.9804. ЧВК  52809. PMID  1946405.
• Ян В.М., Иноуэ CJ, Сето Э. (июнь 1995 г.). «Циклофилин A и FKBP12 взаимодействуют с YY1 и изменяют его транскрипционную активность». Журнал биологической химии. 270 (25): 15187–93. Дои:10.1074 / jbc.270.25.15187. PMID  7541038.
• Ли Дж. С., Галвин К. М., См. Р. Х., Экнер Р., Ливингстон Д., Моран Е., Ши И. (май 1995 г.). «Ослабление репрессии транскрипции YY1 аденовирусом E1A опосредовано E1A-ассоциированным белком p300». Гены и развитие. 9 (10): 1188–98. Дои:10.1101 / gad.9.10.1188. PMID  7758944.
• Чжоу К., Гедрич Р.В., Энгель Д.А. (июль 1995 г.). «Репрессия транскрипции гена c-fos с помощью YY1 опосредуется прямым взаимодействием с ATF / CREB». Журнал вирусологии. 69 (7): 4323–30. Дои:10.1128 / JVI.69.7.4323-4330.1995. ЧВК  189172. PMID  7769693.
• Шривастава А., Салеке С., Калпана Г.В., Артанди С., Гофф С.П., Каламе К. (декабрь 1993 г.). «Ингибирование регулятора транскрипции Инь-Ян-1 путем ассоциации с c-Myc». Наука. 262 (5141): 1889–92. Bibcode:1993Научный ... 262.1889С. Дои:10.1126 / science.8266081. PMID  8266081.
• Беккер К.Г., Сверголд Г.Д., Озато К., Тайер Р.Э. (октябрь 1993 г.). «Связывание повсеместно распространенного фактора ядерной транскрипции YY1 с цис-регуляторной последовательностью в человеческом мобильном элементе LINE-1». Молекулярная генетика человека. 2 (10): 1697–702. Дои:10.1093 / hmg / 2.10.1697. PMID  8268924.
• Марголис Д.М., Сомасундаран М., Грин М.Р. (февраль 1994 г.). «Фактор транскрипции человека YY1 подавляет транскрипцию вируса иммунодефицита человека типа 1 и продукцию вирионов». Журнал вирусологии. 68 (2): 905–10. Дои:10.1128 / JVI.68.2.905-910.1994. ЧВК  236527. PMID  8289393.
• Ли Дж. С., Гальвин К. М., Ши И (июль 1993 г.). «Доказательства физического взаимодействия между факторами транскрипции« цинковый палец »YY1 и Sp1». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 90 (13): 6145–9. Bibcode:1993ПНАС ... 90.6145Л. Дои:10.1073 / пнас.90.13.6145. ЧВК  46884. PMID  8327494.
• Ян В.М., Иноуе С., Цзэн Й., Берсс Д., Сето Э. (ноябрь 1996 г.). «Репрессия транскрипции с помощью YY1 опосредуется взаимодействием с млекопитающим, гомологом глобального регулятора дрожжей RPD3». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (23): 12845–50. Bibcode:1996PNAS ... 9312845Y. Дои:10.1073 / пнас.93.23.12845. ЧВК  24008. PMID  8917507.
• Хубавий Х.Б., Ушева А., Шенк Т., Берли С.К. (ноябрь 1996 г.). «Сокристаллическая структура YY1, связанного с инициатором P5 аденоассоциированного вируса». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (24): 13577–82. Bibcode:1996PNAS ... 9313577H. Дои:10.1073 / пнас.93.24.13577. ЧВК  19349. PMID  8942976.
• Каленик Дж.Л., Чен Д., Брэдли М.Э., Чен С.Дж., Ли Т.К. (февраль 1997 г.). «Дрожжевое двугибридное клонирование нового белка цинкового пальца, который взаимодействует с многофункциональным фактором транскрипции YY1». Исследования нуклеиновых кислот. 25 (4): 843–9. Дои:10.1093 / nar / 25.4.843. ЧВК  146511. PMID  9016636.
• Коул Э.Г., Гастон К. (сентябрь 1997 г.). «Функциональный сайт связывания YY1 необходим и достаточен для активации активности промотора Surf-1 в ответ на сывороточные факторы роста». Исследования нуклеиновых кислот. 25 (18): 3705–11. Дои:10.1093 / nar / 25.18.3705. ЧВК  146936. PMID  9278494.
• Ян В.М., Яо Ю.Л., Сунь Дж.М., Дэви-младший, Сэто Э. (октябрь 1997 г.). «Выделение и характеристика кДНК, соответствующих дополнительному члену семейства генов гистондеацетилазы человека». Журнал биологической химии. 272 (44): 28001–7. Дои:10.1074 / jbc.272.44.28001. PMID  9346952.
• Ромерио Ф., Габриэль М.Н., Марголис Д.М. (декабрь 1997 г.). «Подавление вируса иммунодефицита человека типа 1 за счет нового взаимодействия человеческих факторов YY1 и LSF». Журнал вирусологии. 71 (12): 9375–82. Дои:10.1128 / JVI.71.12.9375-9382.1997. ЧВК  230241. PMID  9371597.
• McNeil S, Guo B, Stein JL, Lian JB, Bushmeyer S, Seto E, Atchison ML, Penman S, van Wijnen AJ, Stein GS (март 1998 г.). «Нацеливание фактора транскрипции YY1 на ядрышко и ядерный матрикс in situ: С-конец является основным детерминантом ядерного трафика». Журнал клеточной биохимии. 68 (4): 500–10. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19980315) 68: 4 <500 :: AID-JCB9> 3.0.CO; 2-U. PMID  9493912.
• Виллс Дж. Х., Патель С. Дж., Митчелл Дж. Б., Муди С. М., Джастис Д. Е., Аппенбринк Дж., Дойл П. М., Харрис С. Дж., Сэдлер П. Дж., Торнтон Дж. М. (июнь 1998 г.). «Дизайн, синтез и конструкция цинкового пальца с искусственным бета-витком». Журнал молекулярной биологии. 279 (4): 973–86. Дои:10.1006 / jmbi.1998.1764. PMID  9642075.
• Яо Ю.Л., Дюпон Б.Р., Гош С., Фанг Й., Лич Р.Дж., Сето Э. (август 1998 г.). «Клонирование, хромосомная локализация и анализ промотора человеческого фактора транскрипции YY1». Исследования нуклеиновых кислот. 26 (16): 3776–83. Дои:10.1093 / nar / 26.16.3776. ЧВК  147783. PMID  9685495.

внешняя ссылка

• FactorBook YY1
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P25490 (Транскрипционный репрессорный белок YY1) на PDBe-KB.