Эомесодермин - Eomesodermin

EOMES
Идентификаторы
Псевдонимы	EOMES, TBR2, Эомесодермин
Внешние идентификаторы	OMIM: 604615 MGI: 1201683 ГомолоГен: 3971 Генные карты: EOMES
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3п24.1 Начинать 27,715,949 бп[1] Конец 27,722,711 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 70,21 см | 9 F3 Начинать 118,478,212 бп[2] Конец 118,486,132 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • связывание хроматина • последовательное связывание ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК • РНК-полимераза II, активирующая связывание фактора транскрипции • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • ядро клетки • внутриклеточный • ядерный хроматин Биологический процесс • поддержание популяции стволовых клеток • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция нейрогенеза • гаструляция • дифференцировка трофэктодермальных клеток • дифференциация клеток скелетных мышц • адаптивный иммунный ответ • развитие многоклеточного организма • производство интерферона-гамма • дифференциация клеток • развитие бластоцисты • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • дифференциация нейронов коры головного мозга • регуляция дифференцировки нейронов • CD8-положительная дифференцировка альфа-бета Т-клеток, участвующих в иммунном ответе • транскрипция, ДНК-шаблон • развитие обонятельной луковицы • спецификация судьбы энтодермальных клеток • регионализация коры головного мозга • кардиобластная дифференцировка • иммунная система • положительное регулирование дифференцировки клеток • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • развитие мозга • регуляция экспрессии генов • образование мезодермы • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • мезодермальный переход в мезенхимальный, участвующий в гаструляции • формирование энтодермы • дифференцировка клеток, участвующих в развитии эмбриональной плаценты • отрицательная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции • нейрогенез • дифференциация нейронов • развитие энтодермы • морфогенез анатомической структуры • развитие мезендодермы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8320	13813
Ансамбль	ENSG00000163508	ENSMUSG00000032446
UniProt	O95936	O54839
RefSeq (мРНК)	NM_001278182 NM_001278183 NM_005442	NM_001164789 NM_010136
RefSeq (белок)	NP_001265111 NP_001265112 NP_005433	NP_001158261 NP_034266
Расположение (UCSC)	Chr 3: 27.72 - 27.72 Мб	Chr 9: 118.48 - 118.49 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Эомесодермин также известный как Т-бокс мозговой белок 2 (Tbr2) - это белок что у людей кодируется EOMES ген.^[5]

Представление ДНК-связывающего домена Т-бокса

Ген эомезодермина / Tbr2, EOMES, кодирует член консервативное семейство белков который имеет общий ДНК-связывающий домен, Т-образная коробка.^[6] Гены Т-бокса кодируют факторы транскрипции, которые контролируют экспрессия гена, участвующие в регуляции процессов развития. Сам эомесодермин / Tbr2 контролирует регуляцию радиальная глия, а также другие родственные клетки.^[6] Эомезодермин / Tbr2 также играет роль в иммунная реакция, и есть некоторые неубедительные доказательства его связи с другими системами.^[7]

Разработка

Эомезодермин / Tbr2 высоко экспрессируется на промежуточной стадии-предшественнике развивающегося нейрон.^[8] Нейроны, основные функциональные клетки головного мозга, развиваются из rклетки адиальной глии. Этот процесс превращения клеток в другие типы клеток называется дифференциация. Радиальная глия присутствует в желудочковой зоне мозг, которые находятся на боковых стенках боковые желудочки.^[9] Радиальная глия разделять и мигрируют к поверхности мозга, церебральным кора. Во время этой миграции есть три стадии клеточного развития: радиальная глия, промежуточные предшественники и постмитотические проекционные нейроны.^[8] Радиальная глия экспресс Pax6, в то время как промежуточные клетки-предшественники экспрессируют эомезодермин / Tbr2, а нейроны постмитотической проекции экспрессируют Tbr1.^[8] Этот процесс, известный как нейрогенез, происходит в основном в развивающейся коре головного мозга до того, как организм полностью развился, и, таким образом, эомезодермин / Tbr2 участвует в развитие нервной системы.^[8] Однако было обнаружено, что нейрогенез в некоторой степени происходит в зоне желудочков у полностью развитых организмов.^[10]

Субвентрикулярная зона

Кора головного мозга

Это было установлено экспериментально через выбивать исследования, что у мышей, лишенных Eomesodermin / Tbr2 на раннем этапе развития, снижено количество активно делящихся клеток, называемых пролиферирующие клетки, в субвентрикулярная зона, ключевая область нейрогенеза в головном мозге.^[11] Это может привести к микроцефалия (маленький размер головы из-за неправильного развития мозга) наблюдается у мышей с дефицитом эомезодермина / Tbr2.^[11] У мышей с отсутствием эомезодермина / Tbr2 верхняя корковые слои и меньший субвентрикулярная зона в мозгу, и отсутствие митральная клетка (нейроны, участвующие в обонятельном пути), а митральные клетки разбросаны повсюду.^[11] Что касается поведения мышей, у мышей с недостатком Eomesodermin / Tbr2 наблюдается высокий злость уровни и выполнять детоубийство.^[6] Мыши, лишенные эомезодермина / Tbr2, также имеют проблемы с аксон соединения.^[11] Аксоны - это проекции нейронов, которые соединяются с другими клетками в так называемом синапс и отправить нейротрансмиттеры. Таким образом, они могут общаться с другими клетками и формировать процессинг, который позволяет мозгу функционировать. У мышей с отсутствием эомезодермина / Tbr2, по-видимому, отсутствуют полностью сформированные комиссуральные волокна, которые соединяют два полушария мозга и не хватает мозолистое тело, еще одна область мозга, участвующая в связях между полушариями.^[11]

Микроцефалия

Эомезодермин / Tbr2 также участвует в других ключевых системах разработки. Было обнаружено

что на ранней стадии развития Eomesodermin / Tbr2 контролирует раннюю дифференцировку сердечный мезодерма.^[12] Фактически, недостаток Eomesodermin / Tbr2, по-видимому, приводит к тому, что клетки не могут дифференцироваться в кардиомиоциты, которые являются клетками сердечной мышцы. Эомезодермин / Tbr2 контролирует экспрессию кардиоспецифичных генов Mesp1, Myl7, Myl2, Миокардин, Nkx2.5 и Mef2c.^[12]

Человеческое сердце с сердечными мышцами

Кроме того, хотя нейрогенез происходит в основном на ранних стадиях развития, в головном мозге есть участки, которые, как было обнаружено, выполняют нейрогенез в совершеннолетие.^[7] Одна из этих областей, гиппокамп, который участвует в объем памяти при удалении эомезодермина / Tbr2 наблюдается снижение нейрогенеза.^[13] Также было обнаружено, что эомесодермин / Tbr2 действует за счет уменьшения количества Sox2, который связан с лучевой глией.^[13] Другое исследование показало, что у мышей без Eomesodermin / Tbr2 не хватало Долгосрочная память образование, которое может быть связано с эффектами Eomesodermin / Tbr2 на гиппокамп.

^[14]

Иммунная реакция

Сканирующая электронная микрофотография Т-клетки человека

Эомезодермин / Tbr2 высоко экспрессируется в CD8 + Т-клетки, но нет CD4 + Т-клетки.^[7] CD4 + Т-клетки - помощники Т-клетки которые обнаруживают инородные частицы в теле и вызывают CD8 + Т-клетки для облегчения гибели инородных частиц. Было обнаружено, что эомезодермин / Tbr2 играет роль в анти рак свойства CD8 + Т-клеток.^[7] Недостаток эомесодермина / Tbr2, наряду с T ставка другой белок Т-бокса заставлял CD8 + Т-клетки не проникать опухоли чтобы они могли выполнять свои обязанности по борьбе с раком.^[7] Эомезодермин / Tbr2 предотвращает дифференцировку CD8 + клеток в другие типы Т-клеток, но не играет роли в производстве самих CD8 + Т-клеток.^[7] Несмотря на то, что эомезодермин / Tbr2 играет роль в способности CD8 + Т-клеток проникать в опухоли, он играет лишь небольшую роль в производстве Интерферон-гамма, которая представляет собой молекулу, которая взаимодействует с другими иммунными клетками во время иммунного ответа.^[7]

Смотрите также

• Т-образная коробка семья
• TBR1

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163508 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032446 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Джин: Эомесодермин». Получено 2011-11-01.
6. Арнольд SJ, Хуанг GJ, Cheung AF, Era T, Nishikawa S, Bikoff EK, Molnár Z, Robertson EJ, Groszer M (2008). «Фактор транскрипции T-box Eomes / Tbr2 регулирует нейрогенез в корковой субвентрикулярной зоне». Гены и развитие. 22 (18): 2479–84. Дои:10.1101 / gad.475408. ЧВК  2546697. PMID  18794345.
7. Чжу Ю., Джу С., Чен Э, Дай С., Ли К., Морел П., Лю Л., Чжан Х, Лу Б. (сентябрь 2010 г.). «Т-бет и эомезодермин необходимы для опосредованного Т-клетками противоопухолевого иммунного ответа». Журнал иммунологии. 185 (6): 3174–83. Дои:10.4049 / jimmunol.1000749. PMID  20713880.
8. Энглунд С., Финк А., Лау С., Фам Д., Даза Р.А., Булфоне А., Ковальчик Т., Хевнер РФ (январь 2005 г.). «Pax6, Tbr2 и Tbr1 последовательно экспрессируются радиальной глией, промежуточными клетками-предшественниками и постмитотическими нейронами в развивающемся неокортексе». Журнал неврологии. 25 (1): 247–51. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.2899-04.2005. ЧВК  6725189. PMID  15634788.
9. Киньонес-Инохоса А., Санаи Н., Сориано-Наварро М., Гонсалес-Перес О, Мирзаде З., Гиль-Перотин С., Ромеро-Родригес Р., Бергер М.С., Гарсия-Вердуго Дж. М., Альварес-Буйла А. (январь 2006 г.). «Клеточный состав и цитоархитектура субвентрикулярной зоны взрослого человека: ниша нервных стволовых клеток». Журнал сравнительной неврологии. 494 (3): 415–34. Дои:10.1002 / cne.20798. PMID  16320258. S2CID  11713373.
10. Мин Г.Л., Сонг Х (май 2011 г.). «Взрослый нейрогенез в мозге млекопитающих: важные ответы и важные вопросы». Нейрон. 70 (4): 687–702. Дои:10.1016 / j.neuron.2011.05.001. ЧВК  3106107. PMID  21609825.
11. Сесса А., Мао Калифорния, Хаджантонакис А.К., Кляйн WH, Брокколи V (октябрь 2008 г.). «Tbr2 направляет преобразование радиальной глии в базальные предшественники и направляет нейрональную амплификацию посредством непрямого нейрогенеза в развивающемся неокортексе глиши». Нейрон. 60 (1): 56–69. Дои:10.1016 / j.neuron.2008.09.028. ЧВК  2887762. PMID  18940588.
12. Костелло И., Пимейсл И.М., Dräger S, Бикофф Е.К., Робертсон Е.Дж., Арнольд С.Дж. (сентябрь 2011 г.). «Фактор транскрипции T-box Eomesodermin действует выше Mesp1, определяя сердечную мезодерму во время гаструляции мыши». Природа клеточной биологии. 13 (9): 1084–91. Дои:10.1038 / ncb2304. ЧВК  4531310. PMID  21822279.
13. Ходж Р.Д., Нельсон Б.Р., Кауд Р.Дж., Ян Р., Муссар К.Э., Райнер С.Л., Хевнер РФ (май 2012 г.). «Tbr2 необходим для прогрессирования клонов гиппокампа от нервных стволовых клеток к промежуточным предшественникам и нейронам». Журнал неврологии. 32 (18): 6275–87. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.0532-12.2012. ЧВК  3366485. PMID  22553033.
14. Нокс Дж. Дж., Косма Г. Л., Беттс М. Р., Маклейн Л. М. (2014-05-14). «Характеристика T-bet и eomes в периферических иммунных клетках человека». Границы иммунологии. 5: 217. Дои:10.3389 / fimmu.2014.00217. ЧВК  4030168. PMID  24860576.

дальнейшее чтение

• Кимура Н., Накашима К., Уэно М., Кияма Х., Тага Т. (июнь 1999 г.). «Новый ген T-box-содержащий млекопитающих, Tbr2, экспрессируемый в развивающемся мозге мышей». Исследование мозга. Развитие мозга. 115 (2): 183–93. Дои:10.1016 / s0165-3806 (99) 00064-4. PMID  10407135.
• Intlekofer AM, Takemoto N, Wherry EJ, Longworth SA, Northrup JT, Palanivel VR, Mullen AC, Gasink CR, Kaech SM, Miller JD, Gapin L, Ryan K, Russ AP, Lindsten T, Orange JS, Goldrath AW, Ahmed R , Reiner SL (декабрь 2005 г.). «Эффекторная судьба CD8 + Т-клеток памяти, связанная с T-bet и эомезодермином». Иммунология природы. 6 (12): 1236–44. Дои:10.1038 / ni1268. PMID  16273099. S2CID  10917617.
• Baala L, Briault S, Etchevers HC, Laumonnier F, Natiq A, Amiel J, Boddaert N, Picard C, Sbiti A, Asermouh A, Attié-Bitach T, Encha-Razavi F, Munnich A, Sefiani A, Lyonnet S (апр. 2007). «Гомозиготное молчание фактора транскрипции Т-бокса EOMES приводит к микроцефалии с полимикрогирией и агенезом мозолистого тела». Природа Генетика. 39 (4): 454–6. Дои:10,1038 / ng1993. PMID  17353897. S2CID  9421118.
• Атрея I, Шимански С.С., Беккер С., Вирц С., Дорнхофф Х., Шнюрер Э., Бергер М.Р., Галле П.Р., Герр В., Нейрат М.Ф. (ноябрь 2007 г.). «Фактор транскрипции Т-бокса эомезодермин контролирует активность Т-лимфоцитов CD8 и метастазирование в лимфатические узлы при колоректальном раке человека». Кишечник. 56 (11): 1572–8. Дои:10.1136 / gut.2006.117812. ЧВК  2095672. PMID  17566017.
• Араки Ю., Фанн М., Версто Р., Вен Н. П. (июнь 2008 г.). «Ацетилирование гистонов способствует быстрому и устойчивому ответу Т-клеток памяти CD8 за счет дифференциальной экспрессии эффекторных молекул (эомезодермин и его мишени: перфорин и гранзим B)». Журнал иммунологии. 180 (12): 8102–8. Дои:10.4049 / jimmunol.180.12.8102. ЧВК  2493419. PMID  18523274.
• Сесса А., Мао Калифорния, Хаджантонакис А.К., Кляйн WH, Брокколи V (октябрь 2008 г.). «Tbr2 направляет превращение радиальной глии в базальные предшественники и направляет нейрональную амплификацию посредством непрямого нейрогенеза в развивающемся неокортексе». Нейрон. 60 (1): 56–69. Дои:10.1016 / j.neuron.2008.09.028. ЧВК  2887762. PMID  18940588.
• Д'Круз Л.М., Рубинштейн депутат, Goldrath AW (апрель 2009 г.). «Пережить аварию: переход от эффекторных CD8 + Т-клеток к памяти». Семинары по иммунологии. 21 (2): 92–8. Дои:10.1016 / j.smim.2009.02.002. ЧВК  2671236. PMID  19269192.
• Ван Х.Т., Гэ XS, Сюэ З.П., Ли Б.К. (январь 2010 г.). «[Роль фактора транскрипции T-bet и Eomes в секреции IFN-гамма различных субпопуляций Т-клеток человека]». Си Бао Ю Фен Цзи Миан И Сюэ За Чжи = Китайский журнал клеточной и молекулярной иммунологии. 26 (1): 31–4. PMID  20056084.
• Нараянан С., Сильва Р., Перуцци Дж., Альварес И., Симхадри В.Р., Дебелл К., Колиган Дж. Э., Боррего Ф. (2010). Unutmaz D (ред.). «Клетки Th1 человека, которые экспрессируют CD300a, являются полифункциональными и после стимуляции активируют фактор транскрипции Т-бокса эомезодермин». PLOS ONE. 5 (5): e10636. Bibcode:2010PLoSO ... 510636N. Дои:10.1371 / journal.pone.0010636. ЧВК  2869357. PMID  20498708.
• Кинджио И., Гордон С.М., Интлекофер А.М., Дауделл К., Муни Э.С., Кариккио Р., Групп С.А., Тичи Д.Т., Рао В.К., Линдстен Т., Райнер С.Л. (декабрь 2010 г.). «Передний край: лимфопролиферация, вызванная дефицитом Fas, зависит от фактора транскрипции эомезодермина». Журнал иммунологии. 185 (12): 7151–5. Дои:10.4049 / jimmunol.1003193. ЧВК  2997140. PMID  21076068.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.