IKZF1 - IKZF1

«Фактор транскрипции Икароса» перенаправляется сюда. Для использования в других целях см. Икар (значения).

IKZF1
Идентификаторы
Псевдонимы	IKZF1, Hs.54452, IK1, IKAROS, LYF1, LyF-1, PPP1R92, PRO0758, ZNFN1A1, CVID13, цинковый палец семейства IKAROS 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 603023 MGI: 1342540 ГомолоГен: 55948 Генные карты: IKZF1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7п12.2 Начните 50,304,068 бп[1] Конец 50,405,101 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 A1 | 11 7,02 см Начните 11,685,003 бп[2] Конец 11,772,926 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • связывание нуклеиновой кислоты • специфическое связывание белкового домена • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки • ядерный перицентрический гетерохроматин • нуклеоплазма • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • дифференцировка эритроцитов • клеточный цикл • развитие многоклеточного организма • развитие мезодермы • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • дифференцировка лимфоцитов • гетероолигомеризация белков • организация хроматина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10320	22778
Ансамбль	ENSG00000185811	ENSMUSG00000018654
UniProt	Q13422	Q03267
RefSeq (мРНК)	NM_001220765 NM_001220766 NM_001220767 NM_001220768 NM_001220769 NM_001220770 NM_001220771 NM_001220772 NM_001220773 NM_001220774 NM_001220775 NM_001220776 NM_001291837 NM_001291838 NM_001291839 NM_001291840 NM_001291841 NM_001291842 NM_001291843 NM_001291844 NM_001291845 NM_001291846 NM_001291847 NM_006060	NM_001025597 NM_001301863 NM_001301865 NM_001301866 NM_001301868 NM_009578
RefSeq (белок)	NP_001207694 NP_001207696 NP_001207697 NP_001207699 NP_001207700 NP_001278766 NP_001278767 NP_001278768 NP_001278769 NP_001278770 NP_001278771 NP_001278772 NP_001278773 NP_001278774 NP_001278775 NP_001278776 NP_006051	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 7: 50,3 - 50,41 Мб	Chr 11: 11.69 - 11.77 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ДНК-связывающий белок Икарос также известен как Цинк-пальцевый протеин 1 семейства Икарос это белок что у людей кодируется IKZF1 ген.^[5][6][7]

Икарос - фактор транскрипции

Икарос - это фактор транскрипции, который кодируется IKZF гены семейства Икарос цинковый палец группа. Цинковый палец - это небольшой структурный мотив белка, который позволяет белку связываться с молекулой ДНК или РНК, которая характеризуется координацией одного или нескольких ионов цинка (Zn²⁺), чтобы стабилизировать складку.

Икарос отображает важные функции в кроветворный системы и является известным регулятором иммунные клетки развитие, в основном в начале В-клетки, CD4 + Т-клетки. Его дисфункция связана с развитием хронического лимфолейкоза.^{[8] [9]} В частности, в последние годы было обнаружено, что Икарос является основным супрессором опухолей, участвующим в остром лимфобластном лейкозе В-клеток человека. ^[8] и что он также участвует в дифференциации и функции отдельных Т помощник клетки. ^[10]

Икарос также играет роль на более поздних стадиях развития В-клеток во время VDJ рекомбинация в классе выключателей антитело изотипы и выражение Рецептор В-клеток. ^[11]

У мышей с нокаутом Ikaros Т-клетки, но не В-клетки, образуются на поздних стадиях развития мышей из-за поздней компенсаторной экспрессии родственного гена Aiolos (IKZF3).^[12] Мыши с точечными мутантами Ikaros являются эмбриональными летальными из-за анемии; у них есть серьезные дефекты дифференцировки терминальных эритроцитов и гранулоцитов, а также чрезмерное образование макрофагов.^[13] SNP, расположенные около 3 'области IKZF1 у людей, были связаны с восприимчивостью в детстве острый лимфобластный лейкоз (ОЛЛ) ^[14] а также диабет 1 типа. ^[15] Эти два эффекта, по-видимому, направлены в противоположные стороны, при этом чувствительность маркирования аллелей к ВСЕ защита от T1D и наоборот.^[15]

Гены группы семейства цинковых пальцев Икароса

Семейство Ikaros Zinc Finger (IkZF) факторы транскрипции являются известными регуляторами развития гемопоэтических клеток и многих иммунных клеток, включая клетки CD4.⁺ Т-клетки.

Семейство IkZF состоит из пяти членов: Ikaros (кодируется геном Ikzf1), Гелиос (Ikzf2 ), Айолос (Ikzf3 ), Эос (Ikzf4 ) и Пегас (Ikzf5 ). Эти факторы содержат N-концевые домены цинковых пальцев (ZF), которые ответственны за опосредование прямых взаимодействий с ДНК, и C-концевые ZF, которые способствуют гомо- и гетеродимеризации между членами семейства IkZF. ^[16]

IKZF1 активируется в гранулоцитах, В-клетках, CD4 и CD8 Т-клетках и NK-клетках и подавляется в эритробластах, мегакариоцитах и ​​моноцитах.^[17]

Дефицит Икароса

Мутация в IKZF1 ген может вызывать дисфункцию фактора транскрипции Икароса. Дисфункция влияет на выражение в В-клетки это может привести к нарушению регуляции передачи сигналов BCR во время развития В-клеток и связано с трансформацией В-клеток. Отмена регулирования может привести к снижению распространение скорость и увеличился апоптоз B-клеток. Дерегулирование может быть связано с лимфопролиферативные расстройства и различные формы лейкемия. ^[18]

Взаимодействия

IKZF1 был показан взаимодействовать с участием:

• CTBP1,^[19]
• HDAC1,^[20][21]
• HDAC7A,^[21]
• Гистоновая деацетилаза 5,^[21]
• IKZF2,^[22]
• IKZF3,^[23][20][24]
• IKZF4,^[25][26]
• SIN3A,^[20][21][27]
• Цереблон
• SIN3B.^[20][21]
• GATA2^[28]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000185811 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000018654 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Георгопулос К., Мур Д.Д., Дерфлер Б. (октябрь 1992 г.). «Икарос, ранний лимфоид-специфический фактор транскрипции и предполагаемый медиатор для приверженности Т-лимфоцитам». Наука. 258 (5083): 808–12. Дои:10.1126 / science.1439790. PMID  1439790.
6. Хам К., Эрнст П., Ло К., Ким Г.С., Терк С., Смейл С.Т. (ноябрь 1994 г.). «Фактор лимфоидной транскрипции LyF-1 кодируется специфическими, альтернативно сплайсированными мРНК, происходящими из гена Ikaros». Молекулярная и клеточная биология. 14 (11): 7111–23. Дои:10.1128 / mcb.14.11.7111. ЧВК  359245. PMID  7935426.
7. "Entrez Gene: IKZF1 Цинковый палец 1 семейства IKAROS (Ikaros)".
8. Кастнер П., Чан С. (июнь 2011 г.). «Роль Икароса в Т-клеточном остром лимфобластном лейкозе». Всемирный журнал биологической химии. 2 (6): 108–14. Дои:10.4331 / wjbc.v2.i6.108. ЧВК  3135856. PMID  21765975.
9. Oliveira VC, Lacerda MP, Moraes BB, Gomes CP, Maricato JT, Souza OF, et al. (Июль 2019). «Дерегуляция экспрессии Ikaros в клетках B-1: новые взгляды на злокачественную трансформацию в хронический лимфолейкоз». Журнал биологии лейкоцитов. 106 (3): 581–594. Дои:10.1002 / JLB.MA1118-454R. PMID  31299112. S2CID  196350761.
10. Пауэлл, доктор медицины, Рид К.А., Срикумар Б.К., Острайх К.Дж. (2019). «+ Дифференцировка Т-хелперных клеток». Границы иммунологии. 10: 1299. Дои:10.3389 / fimmu.2019.01299. ЧВК  6563078. PMID  31244845.
11. Селларс М., Кастнер П., Чан С. (июнь 2011 г.). «Икарос в развитии и функционировании В-клеток». Всемирный журнал биологической химии. 2 (6): 132–9. Дои:10.4331 / wjbc.v2.i6.132. ЧВК  3135860. PMID  21765979.
12. Георгопулос К., Винанди С., Авиталь Н. (1997). «Роль гена Ikaros в развитии лимфоцитов и гомеостазе». Ежегодный обзор иммунологии. 15: 155–76. Дои:10.1146 / annurev.immunol.15.1.155. PMID  9143685.
13. Папатанасиу П., Перкинс А.С., Кобб Б.С., Феррини Р., Шридхаран Р., Хойн Г.Ф. и др. (Июль 2003 г.). «Широко распространенная недостаточность дифференцировки гематолимфоидов, вызванная рецессивным аллелем заполнения ниши фактора транскрипции Ikaros». Иммунитет. 19 (1): 131–44. Дои:10.1016 / с1074-7613 (03) 00168-7. PMID  12871645.
14. Папаэммануил Э., Хоскинг Ф.Дж., Виджаякришнан Дж., Прайс А, Олвер Б., Шеридан Э и др. (Сентябрь 2009 г.). «Локусы на 7p12.2, 10q21.2 и 14q11.2 связаны с риском развития острого лимфобластного лейкоза у детей». Природа Генетика. 41 (9): 1006–10. Дои:10,1038 / нг.430. ЧВК  4915548. PMID  19684604.
15. Swafford AD, Howson JM, Davison LJ, Wallace C, Smyth DJ, Schuilenburg H, et al. (Март 2011 г.). «Аллель IKZF1 (Ikaros), отвечающий за предрасположенность к детскому острому лимфобластному лейкозу, защищает от диабета 1 типа». Сахарный диабет. 60 (3): 1041–4. Дои:10.2337 / db10-0446. ЧВК  3046822. PMID  21270240.
16. Пауэлл, доктор медицины, Рид К.А., Срикумар Б.К., Острайх К.Дж. (06.06.2019). «+ Дифференцировка Т-хелперных клеток». Границы иммунологии. 10: 1299. Дои:10.3389 / fimmu.2019.01299. ЧВК  6563078. PMID  31244845.
17. Уоткинс Н.А., Гуснанто А., де Боно Б., Де С., Миранда-Сааведра Д., Харди Д.Л. и др. (Май 2009 г.). «HaemAtlas: характеристика экспрессии генов в дифференцированных клетках крови человека». Кровь. 113 (19): e1-9. Дои:10.1182 / кровь-2008-06-162958. ЧВК  2680378. PMID  19228925.
18. Oliveira VC, Lacerda MP, Moraes BB, Gomes CP, Maricato JT, Souza OF, et al. (Июль 2019). «Дерегуляция экспрессии Ikaros в клетках B-1: новые взгляды на злокачественную трансформацию в хронический лимфолейкоз». Журнал биологии лейкоцитов. 106 (3): 581–594. Дои:10.1002 / JLB.MA1118-454R. PMID  31299112. S2CID  196350761.
19. Койпалли Дж., Георгопулос К. (июнь 2000 г.). «Взаимодействия Ikaros с CtBP выявляют механизм репрессии, который не зависит от активности гистондеацетилазы». Журнал биологической химии. 275 (26): 19594–602. Дои:10.1074 / jbc.M000254200. PMID  10766745.
20. Койпалли Дж., Ренольд А., Ким Дж., Георгопулос К. (июнь 1999 г.). «Репрессия со стороны Ikaros и Aiolos опосредуется комплексами гистондеацетилазы». Журнал EMBO. 18 (11): 3090–100. Дои:10.1093 / emboj / 18.11.3090. ЧВК  1171390. PMID  10357820.
21. Койпалли Дж., Георгопулос К. (август 2002 г.). "Молекулярное вскрытие репрессивной схемы Икароса". Журнал биологической химии. 277 (31): 27697–705. Дои:10.1074 / jbc.M201694200. PMID  12015313.
22. Келли С.М., Икеда Т., Койпалли Дж., Авитал Н., Ву Л., Георгопулос К., Морган Б.А. (апрель 1998 г.). «Гелиос, новый партнер Ikaros по димеризации, экспрессируемый в самых ранних гемопоэтических предшественниках». Текущая биология. 8 (9): 508–15. Дои:10.1016 / s0960-9822 (98) 70202-7. PMID  9560339. S2CID  17835058.
23. Морган Б., Сан Л., Авитал Н., Андрикопулос К., Икеда Т., Гонсалес Е. и др. (Апрель 1997 г.). «Aiolos, фактор транскрипции, ограниченный лимфоидом, который взаимодействует с Ikaros, чтобы регулировать дифференцировку лимфоцитов». Журнал EMBO. 16 (8): 2004–13. Дои:10.1093 / emboj / 16.8.2004. ЧВК  1169803. PMID  9155026.
24. Ким Дж., Сиф С., Джонс Б., Джексон А., Койпалли Дж., Хеллер Е. и др. (Март 1999 г.). «ДНК-связывающие белки Ikaros направляют образование комплексов ремоделирования хроматина в лимфоцитах». Иммунитет. 10 (3): 345–55. Дои:10.1016 / с1074-7613 (00) 80034-5. PMID  10204490.
25. Хонма Ю., Киёсава Х., Мори Т., Огури А., Никайдо Т., Канадзава К. и др. (Март 1999 г.). «Эос: новый член семейства генов Икарос, экспрессирующийся преимущественно в развивающейся нервной системе». Письма FEBS. 447 (1): 76–80. Дои:10.1016 / s0014-5793 (99) 00265-3. PMID  10218586. S2CID  28898354.
26. Пердомо Дж, Холмс М., Чонг Б., Кроссли М. (декабрь 2000 г.). «Eos и pegasus, два члена семейства белков Ikaros с различными ДНК-связывающими активностями». Журнал биологической химии. 275 (49): 38347–54. Дои:10.1074 / jbc.M005457200. PMID  10978333.
27. Койпалли Дж., Георгопулос К. (июнь 2002 г.). «Взаимодействия Ikaros-CtIP не требуют C-концевого связывающего белка и участвуют в деацетилазонезависимом режиме репрессии». Журнал биологической химии. 277 (26): 23143–9. Дои:10.1074 / jbc.M202079200. PMID  11959865.
28. Кацумура К. Р., Бресник Э. Х. (апрель 2017 г.). «Революция фактора GATA в гематологии». Кровь. 129 (15): 2092–2102. Дои:10.1182 / кровь-2016-09-687871. ЧВК  5391619. PMID  28179282.

дальнейшее чтение

• Тоннель С., Калмельс Б., Марок С., Габерт Дж., Шабаннон С. (январь 2002 г.). «Экспрессия гена Икароса и лейкемия». Лейкемия и лимфома. 43 (1): 29–35. Дои:10.1080/10428190210186. PMID  11908734. S2CID  23932398.
• Вестман Б.Дж., Маккей Дж. П., Гелл Д. (октябрь 2002 г.). «Икарос: ключевой регулятор гемопоэза». Международный журнал биохимии и клеточной биологии. 34 (10): 1304–7. Дои:10.1016 / S1357-2725 (02) 00070-5. PMID  12127581.
• Мольнар А., Ву П., Ларгеспада Д.А., Ворткамп А., Шерер С., Коупленд Н.Г. и др. (Январь 1996 г.). «Ген Ikaros кодирует семейство ограниченных лимфоцитами белков, связывающих ДНК цинкового пальца, высоко консервативных у человека и мыши». Журнал иммунологии. 156 (2): 585–92. PMID  8543809.
• Нитфельд В., Мейерханс А. (январь 1996 г.). «Клонирование и секвенирование hIk-1, кДНК, кодирующей человеческий гомолог мышиного Ikaros / LyF-1». Письма иммунологии. 49 (1–2): 139–41. Дои:10.1016/0165-2478(95)02479-4. PMID  8964602.
• Морган Б., Сан Л., Авитал Н., Андрикопулос К., Икеда Т., Гонсалес Е. и др. (Апрель 1997 г.). «Aiolos, фактор транскрипции, ограниченный лимфоидом, который взаимодействует с Ikaros, чтобы регулировать дифференцировку лимфоцитов». Журнал EMBO. 16 (8): 2004–13. Дои:10.1093 / emboj / 16.8.2004. ЧВК  1169803. PMID  9155026.
• Келли С.М., Икеда Т., Койпалли Дж., Авитал Н., Ву Л., Георгопулос К., Морган Б.А. (апрель 1998 г.). «Гелиос, новый партнер Ikaros по димеризации, экспрессируемый в самых ранних гемопоэтических предшественниках». Текущая биология. 8 (9): 508–15. Дои:10.1016 / S0960-9822 (98) 70202-7. PMID  9560339. S2CID  17835058.
• Сан Л., Херема Н., Кротти Л., Ву Х, Навара С., Василев А. и др. (Январь 1999 г.). «Экспрессия доминантно-отрицательных и мутантных изоформ антилейкемического фактора транскрипции Ikaros при остром лимфобластном лейкозе у младенцев». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (2): 680–5. Дои:10.1073 / пнас.96.2.680. ЧВК  15196. PMID  9892693.
• Ким Дж., Сиф С., Джонс Б., Джексон А., Койпалли Дж., Хеллер Е. и др. (Март 1999 г.). «ДНК-связывающие белки Ikaros направляют образование комплексов ремоделирования хроматина в лимфоцитах». Иммунитет. 10 (3): 345–55. Дои:10.1016 / S1074-7613 (00) 80034-5. PMID  10204490.
• Хонма Ю., Киёсава Х., Мори Т., Огури А., Никайдо Т., Канадзава К. и др. (Март 1999 г.). «Эос: новый член семейства генов Икарос, экспрессирующийся преимущественно в развивающейся нервной системе». Письма FEBS. 447 (1): 76–80. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00265-3. PMID  10218586. S2CID  28898354.
• Койпалли Дж., Ренольд А., Ким Дж., Георгопулос К. (июнь 1999 г.). «Репрессия со стороны Ikaros и Aiolos опосредуется комплексами гистондеацетилазы». Журнал EMBO. 18 (11): 3090–100. Дои:10.1093 / emboj / 18.11.3090. ЧВК  1171390. PMID  10357820.
• Сан Л., Гудман П.А., Вуд С.М., Кротти М.Л., Сенсель М., Сатер Х и др. (Декабрь 1999 г.). «Экспрессия аберрантно сплайсированных онкогенных изоформ икароса при остром лимфобластном лейкозе у детей». Журнал клинической онкологии. 17 (12): 3753–66. Дои:10.1200 / JCO.1999.17.12.3753. PMID  10577847.
• Хосокава Ю., Маэда Ю., Итинохасама Р., Миура И., Таниваки М., Сэто М. (апрель 2000 г.). «Ген Ikaros, центральный регулятор лимфоидной дифференцировки, сливается с геном BCL6 в результате транслокации t (3; 7) (q27; p12) у пациента с диффузной большой B-клеточной лимфомой». Кровь. 95 (8): 2719–21. Дои:10.1182 / кровь.V95.8.2719. PMID  10753856.
• Койпалли Дж., Георгопулос К. (июнь 2000 г.). «Взаимодействия Ikaros с CtBP выявляют механизм репрессии, который не зависит от активности гистондеацетилазы». Журнал биологической химии. 275 (26): 19594–602. Дои:10.1074 / jbc.M000254200. PMID  10766745.
• Пердомо Дж, Холмс М., Чонг Б., Кроссли М. (декабрь 2000 г.). «Eos и pegasus, два члена семейства белков Ikaros с различными ДНК-связывающими активностями». Журнал биологической химии. 275 (49): 38347–54. Дои:10.1074 / jbc.M005457200. PMID  10978333.
• Пейн К.Дж., Николас Дж. Х., Чжу Дж. Ю., Барский Л. В., Крукс Г. М. (август 2001 г.). «Передний край: преобладающее выражение новой изоформы Ikaros в нормальном гемопоэзе человека». Журнал иммунологии. 167 (4): 1867–70. Дои:10.4049 / jimmunol.167.4.1867. PMID  11489963.
• Койпалли Дж., Хеллер Э. Дж., Сивитт Дж. Р., Георгопулос К. (апрель 2002 г.). «Нетрадиционное усиление экспрессии генов с помощью Икароса». Журнал биологической химии. 277 (15): 13007–15. Дои:10.1074 / jbc.M111371200. PMID  11799125.
• Dorsam G, Goetzl EJ (апрель 2002 г.). «Вазоактивный кишечный пептидный рецептор-1 (VPAC-1) представляет собой новую генную мишень гемолимфопоэтического фактора транскрипции Ikaros». Журнал биологической химии. 277 (16): 13488–93. Дои:10.1074 / jbc.M107922200. PMID  11812772.

внешние ссылки

• IKZF1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• IKZF1 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• IKZF1 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.