SIN3B - SIN3B

SIN3B
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1E91, 1PD7, 2CR7, 2CZY, 2F05
Идентификаторы
Псевдонимы	SIN3B, Парный белок амфипатической спирали Sin3b, член семейства регуляторов транскрипции SIN3 B
Внешние идентификаторы	OMIM: 607777 MGI: 107158 ГомолоГен: 81810 Генные карты: SIN3B
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19п13.11 Начните 16,829,400 бп[1] Конец 16,880,353 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 B3.3 | 8 35,08 см Начните 72,723,285 бп[2] Конец 72,758,201 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • активность гистондеацетилазы • связывание хроматина • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • Х хромосома • Y-хромосома • аутосом • Sin3 комплекс • нуклеоплазма • XY тело • ядро клетки • хроматин Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • деацетилирование гистонов • регуляция липидного обмена Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	23309	20467
Ансамбль	ENSG00000127511	ENSMUSG00000031622
UniProt	O75182	Q62141
RefSeq (мРНК)	NM_001297595 NM_001297597 NM_015260	NM_001113248 NM_009188
RefSeq (белок)	NP_001284524 NP_001284526 NP_056075	NP_001106719 NP_033214
Расположение (UCSC)	Chr 19: 16.83 - 16.88 Мб	Chr 8: 72.72 - 72.76 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Парный амфипатический спиральный белок Sin3b это белок что у людей кодируется SIN3B ген.^[5][6]

Взаимодействия

SIN3B был показан взаимодействовать с участием HDAC1,^[7][8] Цинковый палец и белок, содержащий домен BTB 16,^[9] SUDS3^[10] и IKZF1.^[8][11]

Смотрите также

• Корегулятор транскрипции

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000127511 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031622 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Исикава К., Нагасе Т., Суяма М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (июнь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК исследования. 5 (3): 169–76. Дои:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID  9734811.
6. «Ген Entrez: SIN3B гомолог SIN3 B, регулятор транскрипции (дрожжи)».
7. Чжан Ю., Нг Х. Х., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Берд А., Рейнберг Д. (август 1999 г.). «Анализ субъединиц NuRD показывает основной комплекс гистондеацетилазы и связь с метилированием ДНК». Гены и развитие. 13 (15): 1924–35. Дои:10.1101 / гад.13.15.1924. ЧВК  316920. PMID  10444591.
8. Койпалли Дж., Ренольд А., Ким Дж., Георгопулос К. (июнь 1999 г.). «Репрессия со стороны Ikaros и Aiolos опосредуется комплексами гистондеацетилазы». Журнал EMBO. 18 (11): 3090–100. Дои:10.1093 / emboj / 18.11.3090. ЧВК  1171390. PMID  10357820.
9. Дэвид Дж., Алланд Л., Хонг Ш., Вонг С. В., Де Пиньо Р. А., Дежан А. (май 1998 г.). «Гистоновая деацетилаза, связанная с mSin3A, опосредует репрессию белком PLZF, ассоциированным с острым промиелоцитарным лейкозом». Онкоген. 16 (19): 2549–56. Дои:10.1038 / sj.onc.1202043. PMID  9627120.
10. Алланд Л., Дэвид Дж., Шен-Ли Х, Потес Дж., Мюле Р., Ли ХК, Хоу Х, Чен К., ДеПиньо Р. А. (апрель 2002 г.). «Идентификация Sds3 млекопитающих как неотъемлемого компонента корепрессорного комплекса Sin3 / гистондеацетилазы». Молекулярная и клеточная биология. 22 (8): 2743–50. Дои:10.1128 / MCB.22.8.2743-2750.2002. ЧВК  133736. PMID  11909966.
11. Койпалли Дж., Георгопулос К. (август 2002 г.). "Молекулярное вскрытие репрессивной схемы Икароса". Журнал биологической химии. 277 (31): 27697–705. Дои:10.1074 / jbc.M201694200. PMID  12015313.

дальнейшее чтение

• Ayer DE, Lawrence QA, Eisenman RN (март 1995 г.). «Репрессия транскрипции Mad-Max опосредована образованием тройного комплекса с гомологами дрожжевого репрессора Sin3 млекопитающих». Ячейка. 80 (5): 767–76. Дои:10.1016/0092-8674(95)90355-0. PMID  7889570. S2CID  8749951.
• Дэвид Дж., Алланд Л., Хонг Ш., Вонг С. В., Де Пиньо Р. А., Дежан А. (май 1998 г.). «Гистоновая деацетилаза, связанная с mSin3A, опосредует репрессию белком PLZF, связанным с острым промиелоцитарным лейкозом». Онкоген. 16 (19): 2549–56. Дои:10.1038 / sj.onc.1202043. PMID  9627120.
• Койпалли Дж., Ренольд А., Ким Дж., Георгопулос К. (июнь 1999 г.). «Репрессия со стороны Ikaros и Aiolos опосредуется комплексами гистондеацетилазы». Журнал EMBO. 18 (11): 3090–100. Дои:10.1093 / emboj / 18.11.3090. ЧВК  1171390. PMID  10357820.
• Нарусэ Й., Аоки Т., Кодзима Т., Мори Н. (ноябрь 1999 г.). «Нейронный рестриктивный фактор сайленсера привлекает комплекс mSin3 и гистондеацетилазы для репрессии нейрон-специфичных генов-мишеней». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (24): 13691–6. Дои:10.1073 / пнас.96.24.13691. ЧВК  24126. PMID  10570134.
• Spronk CA, Tessari M, Kaan AM, Jansen JF, Vermeulen M, Stunnenberg HG, Vuister GW (декабрь 2000 г.). «Взаимодействие Mad1-Sin3B включает новую спиральную складку». Структурная биология природы. 7 (12): 1100–4. Дои:10.1038/81944. PMID  11101889. S2CID  12451972.
• Spronk CA, Jansen JF, Tessari M, Kaan AM, Aelen J, Lasonder E, Stunnenberg HG, Vuister GW (апрель 2001 г.). «Последовательно-специфическое назначение домена PAH2 Sin3B, свободного и связанного с Mad1». Журнал биомолекулярного ЯМР. 19 (4): 377–8. Дои:10.1023 / А: 1011262214741. PMID  11370785. S2CID  31789681.
• Алланд Л., Дэвид Дж., Шен-Ли Х, Потес Дж., Мюле Р., Ли ХК, Хоу Х, Чен К., ДеПиньо Р. А. (апрель 2002 г.). «Идентификация Sds3 млекопитающих как неотъемлемого компонента корепрессорного комплекса Sin3 / гистондеацетилазы». Молекулярная и клеточная биология. 22 (8): 2743–50. Дои:10.1128 / MCB.22.8.2743-2750.2002. ЧВК  133736. PMID  11909966.
• Rayman JB, Takahashi Y, Indjeian VB, Dannenberg JH, Catchpole S, Watson RJ, te Riele H, Dynlacht BD (апрель 2002 г.). «E2F опосредует зависимую от клеточного цикла репрессию транскрипции in vivo путем привлечения корепрессорного комплекса HDAC1 / mSin3B». Гены и развитие. 16 (8): 933–47. Дои:10.1101 / gad.969202. ЧВК  152357. PMID  11959842.
• Койпалли Дж., Георгопулос К. (август 2002 г.). "Молекулярное вскрытие репрессивной схемы Икароса". Журнал биологической химии. 277 (31): 27697–705. Дои:10.1074 / jbc.M201694200. PMID  12015313.
• Ян Л., Мей К., Зелинска-Квятковска А., Мацуи Ю., Блэкберн М.Л., Бенедетти Д., Крумм А.А., Таборски Г.Дж., Чански А.А. (февраль 2003 г.). «Гистон-метилтрансфераза, ассоциированная с ERG (ген, связанный с ets), взаимодействует с гистоновыми деацетилазами 1/2 и транскрипционными ко-репрессорами mSin3A / B». Биохимический журнал. 369 (Pt 3): 651–7. Дои:10.1042 / BJ20020854. ЧВК  1223118. PMID  12398767.
• Петри К., Гайдез Ф, Хауэлл Л., Хили Л., Ваксман С., Гривз М., Зелент А. (май 2003 г.). «Ген гистондеацетилазы 9 кодирует несколько изоформ белка». Журнал биологической химии. 278 (18): 16059–72. Дои:10.1074 / jbc.M212935200. PMID  12590135.
• Wysocka J, Myers MP, Laherty CD, Eisenman RN, Herr W (апрель 2003 г.). «Деацетилаза Sin3 человека и связанная с тритораксом Set1 / Ash2 гистон H3-K4 метилтрансфераза селективно связаны вместе фактором пролиферации клеток HCF-1». Гены и развитие. 17 (7): 896–911. Дои:10.1101 / gad.252103. ЧВК  196026. PMID  12670868.
• Дугаст-Дарзак К., Пирити М., Бланк Дж. К., Шерл А., Шрайбер-Агус Н. (ноябрь 2004 г.). «Mxi1-SRalpha: новая изоформа Mxi1 с усиленным потенциалом репрессии транскрипции». Онкоген. 23 (55): 8887–99. Дои:10.1038 / sj.onc.1208107. PMID  15467743.
• Рампалли С., Павитра Л., Бхатт А., Кунду Т.К., Чаттопадхьяй С. (октябрь 2005 г.). «Супрессор опухоли SMAR1 опосредует репрессию циклина D1 путем привлечения комплекса SIN3 / гистондеацетилаза 1». Молекулярная и клеточная биология. 25 (19): 8415–29. Дои:10.1128 / MCB.25.19.8415-8429.2005. ЧВК  1265755. PMID  16166625.
• Сюй Ю., Сенгупта П.К., Сето Э., Смит Б.Д. (апрель 2006 г.). «Регуляторный фактор для белков семейства X-box дифференциально взаимодействует с гистоновыми деацетилазами, подавляя экспрессию гена коллагена альфа2 (I) (COL1A2)». Журнал биологической химии. 281 (14): 9260–70. Дои:10.1074 / jbc.M511724200. ЧВК  1434794. PMID  16464847.

внешние ссылки

• SIN3B + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.