Трехсторонняя семья мотивов - Tripartite motif family
В трехсторонняя семья мотивов (ПОДРЕЗАТЬ) это белок семья.[1]
Функция
Многие белки TRIM индуцируются интерфероны, которые являются важным компонентом устойчивости к патогенам, и известно, что несколько белков TRIM необходимы для ограничения инфекции посредством лентивирусы. Белки TRIM участвуют в распознавании патогенов и в регуляции транскрипционных путей в защите хозяина.[2]
Структура
Трехсторонний мотив всегда присутствует в N-конец белков TRIM. Мотив TRIM включает следующие три домена:[1]
- (1) а Безымянный палец домен
- (2) один или два Цинковый палец B-box домены
- когда присутствует только один B-бокс, это всегда B-бокс типа 2
- когда присутствуют два B-бокса, B-блок типа 1 всегда предшествует B-блоку типа 2
- (3) спиральная катушка область, край
В C-конец белков TRIM содержат:
- Белки группы 1: C-концевой домен, выбранный из следующего списка:
- НХЛ и IGFLMN, либо в ассоциации, либо по отдельности
- Домен PHD связанный с бромодомен
- MATH домен (например, TRIM37 )
- ARF домен (например, TRIM23 )
- EXOIII домен (например, TRIM19 ) или же
- Белки группы 2: C-концевой домен SPRY
- например TRIM21
Члены семьи
Семейство TRIM разделено на две группы, различающиеся доменной структурой и геномной организацией:[3]
- Члены группы 1 обладают множеством C-терминал домены, и представлены как у позвоночных, так и у беспозвоночных
- Группа 2 отсутствует у беспозвоночных, имеет С-концевой домен SPRY.[4]
Члены семьи включают:
- Группа 1
- Домен PHD-BROMO, содержащий: TRIM24 (TIF1α), TRIM28 (TIF1β), TRIM33 (TIF1γ) - действовать как корепрессоры
- 1-10: TRIM1, TRIM2, TRIM3, TRIM8, TRIM9
- 11-20: TRIM12, TRIM13, TRIM14, TRIM16, TRIM18, TRIM19
- 21-30: TRIM23, TRIM25, TRIM29, TRIM30
- 31-40: TRIM32, TRIM36, TRIM37
- 41-50: TRIM42, TRIM44, TRIM45, TRIM46, TRIM47
- 51-60: TRIM51, TRIM53, ОТДЕЛКА54, TRIM55, TRIM56, TRIM57, ОТДЕЛКА59
- 61-70: TRIM62, TRIM63, TRIM65, TRIM66, TRIM67, TRIM69, ОТДЕЛКА70
- 71-75: TRIM71
- Группа 2
- 1-10: TRIM4, TRIM5, TRIM6, TRIM7, TRIM10
- 11-20: TRIM11, TRIM12, TRIM15, TRIM17, TRIM20
- 21-30: TRIM21, TRIM22, TRIM26, TRIM27, TRIM30
- 31-40: TRIM31, TRIM34, TRIM35, ОТДЕЛКА38, TRIM39, TRIM40
- 41-50: TRIM41, TRIM43, TRIM48, TRIM49, TRIM50
- 51-60: TRIM51, TRIM52, TRIM53, TRIM57, TRIM58, TRIM60
- 61-70: ОТДЕЛКА61, TRIM64, TRIM68, TRIM69, ОТДЕЛКА70
- 71-75: TRIM72, TRIM73, ОТДЕЛКА74, TRIM75
Рекомендации
- ^ а б Реймонд А., Мерони Дж., Фантоцци А., Мерла Дж., Каир С., Лузи Л., Риганелли Д., Занария Е., Мессали С., Кайнарка С., Гуффанти А., Минуччи С., Пеликчи П. Г., Баллабио А. (май 2001 г.). «Семейство трехчастных мотивов идентифицирует клеточные компартменты». EMBO J. 20 (9): 2140–51. Дои:10.1093 / emboj / 20.9.2140. ЧВК 125245. PMID 11331580.
- ^ Озато К., Шин Д.М., Чанг Т.Х., Морс ХК (ноябрь 2008 г.). «Белки семейства TRIM и их новые роли в врожденном иммунитете». Nat. Преп. Иммунол. 8 (11): 849–60. Дои:10.1038 / nri2413. ЧВК 3433745. PMID 18836477.
- ^ Сардиелло М., Каир С., Фонтанелла Б., Баллабио А., Мерони Г. (2008). «Геномный анализ семейства TRIM показывает две группы генов с различными эволюционными свойствами». BMC Evol. Биол. 8: 225. Дои:10.1186/1471-2148-8-225. ЧВК 2533329. PMID 18673550.
- ^ Понтинг К., Шульц Дж., Борк П. (июнь 1997 г.). «Домены SPRY в рецепторах рианодина (каналы высвобождения Са (2 +))». Trends Biochem. Наука. 22 (6): 193–4. Дои:10.1016 / S0968-0004 (97) 01049-9. PMID 9204703.
 | Этот белок -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |