TRIM22 - TRIM22

TRIM22
Идентификаторы
Псевдонимы	TRIM22, GPSTAF50, RNF94, STAF50, трехчастный мотив, содержащий 22
Внешние идентификаторы	OMIM: 606559 ГомолоГен: 48399 Генные карты: TRIM22
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11п15.4 Начинать 5,689,697 бп[1] Конец 5,737,089 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание с белками, мостик • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • связывание протеинкиназы • трансферазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • Тело Кахала • ядерное пятнышко • внутриклеточный • нуклеоплазма • ядро клетки • ядерное тело • аппарат Гольджи Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительное регулирование аутофагии • интерферон-гамма-опосредованный сигнальный путь • тримеризация белков • ответ на вирус • положительная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции • транскрипция, ДНК-шаблон • регулирование локализации белка • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • защитный ответ на вирус • убиквитинирование белков • иммунная реакция • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • GO: 0022415 вирусный процесс • отрицательная регуляция транскрипции с использованием шаблона нуклеиновой кислоты Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10346	н / д
Ансамбль	ENSG00000132274	н / д
UniProt	Q8IYM9	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_006074 NM_001199573	н / д
RefSeq (белок)	NP_001186502 NP_006065	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 11: 5.69 - 5.74 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Трехчастный мотив, содержащий 22, также известный как TRIM22, это белок который у человека кодируется TRIM22 ген.^[3][4][5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом трехсторонний мотив (TRIM) семья.^[6] Мотив TRIM включает три цинк-связывающих домена: ЗВЕНЕТЬ, B-бокс типа 1 и B-бокса типа 2, а также область спиральной катушки. Этот белок локализуется в цитоплазма и его выражение индуцируется интерферон.^[3] TRIM22 также является целевым геном подавитель опухолей белок p53.^[7]

TRIM22 обладает Убиквитинлигаза E3 активность и умеет убиквитинат сам с помощью фермента E2 UbcH5B. Кроме того, TRIM22 расположен в ядре и, следовательно, может функционировать как ядерная убиквитинлигаза E3.^[8]

Клиническое значение

Белок подавляет транскрипцию из ВИЧ-1 длинный терминальный повтор область промотора, предполагая, что функция этого белка может быть посредником противовирусных эффектов интерферона.^[3][4] Другие белки, которые ограничивают репликацию ВИЧ, включают: TRIM5alpha и APOBEC3G.^[9]

Было продемонстрировано, что обработка клеток интерферон I типа подавляет ВИЧ репликация и TRIM22 сильно повышается при лечении интерфероном. Кроме того, высвобождение частиц ВИЧ из клеток, лишенных TRIM22 с РНК-интерференция усиливается. TRIM22, по-видимому, предотвращает перемещение ВИЧ Кляп белок к плазматической мембране и, следовательно, TRIM22 может блокировать репликацию ВИЧ в культурах клеток, предотвращая сборку вируса.^[10][11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000132274 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Entrez Gene: TRIM22, содержащий трехкомпонентный мотив 22".
4. Tissot C, Mechti N (июнь 1995 г.). «Молекулярное клонирование нового интерферон-индуцированного фактора, который подавляет экспрессию длинных концевых повторов вируса иммунодефицита человека типа 1». J. Biol. Chem. 270 (25): 14891–8. Дои:10.1074 / jbc.270.25.14891. PMID  7797467.
5. Gongora C, Tissot C, Cerdan C, Mechti N (ноябрь 2000 г.). «Интерферон-индуцируемый ген Staf50 подавляется во время костимуляции Т-клеток CD2 и CD28». J. Интерферон цитокин Res. 20 (11): 955–61. Дои:10.1089/10799900050198390. PMID  11096452.
6. Реймонд А., Мерони Дж., Фантоцци А., Мерла Дж., Каир С., Лузи Л., Риганелли Д., Занария Е., Мессали С., Кайнарка С., Гуффанти А., Минуччи С., Пеликчи П. Г., Баллабио А. (май 2001 г.). «Семейство трехчастных мотивов определяет клеточные компартменты». EMBO J. 20 (9): 2140–51. Дои:10.1093 / emboj / 20.9.2140. ЧВК  125245. PMID  11331580.
7. Обад С., Олофссон Т., Мечти Н., Гуллберг Ю., Дротт К. (октябрь 2007 г.). «Регулирование индуцируемого интерфероном гена-мишени р53 TRIM22 (Staf50) при активации Т-лимфоцитов человека». J. Интерферон цитокин Res. 27 (10): 857–64. Дои:10.1089 / июл.2006.0180. PMID  17970695.
8. Дуань З., Гао Б., Сюй В., Сюн С. (сентябрь 2008 г.). «Идентификация TRIM22 как убиквитинлигазы Е3 КОЛЬЦО пальца». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 374 (3): 502–6. Дои:10.1016 / j.bbrc.2008.07.070. PMID  18656448.
9. Huthoff H, Towers GJ (декабрь 2008 г.). «Ограничение репликации ретровирусов APOBEC3G / F и TRIM5alpha». Тенденции Microbiol. 16 (12): 612–9. Дои:10.1016 / j.tim.2008.08.013. ЧВК  3556578. PMID  18976920.
10. «Исследователи открывают ген, блокирующий ВИЧ». Медицина и здоровье / ВИЧ и СПИД. PhysOrg.com. 2008-02-29. Получено 2009-02-22.
11. Барр С.Д., Смайли-младший, Бушман Ф.Д. (февраль 2008 г.). Надежда TJ (ред.). «Интерфероновый ответ подавляет продукцию частиц ВИЧ за счет индукции TRIM22». PLOS Pathog. 4 (2): e1000007. Дои:10.1371 / journal.ppat.1000007. ЧВК  2279259. PMID  18389079.

внешняя ссылка

• TRIM22 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• TRIM22 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.