ETV4 - ETV4

ETV4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4CO8, 4UV
Идентификаторы
Псевдонимы	ETV4, E1A-F, E1AF, PEA3, PEAS3, вариант ETS 4, вариант фактора транскрипции ETS 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 600711 MGI: 99423 ГомолоГен: 1504 Генные карты: ETV4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q21.31 Начинать 43,527,844 бп[1] Конец 43,579,620 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 D | 11 65,48 см Начинать 101,769,742 бп[2] Конец 101,785,371 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • последовательное связывание ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • нуклеоплазма • ядрышко • ядро клетки Биологический процесс • дифференциация клеток • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2118	18612
Ансамбль	ENSG00000175832	ENSMUSG00000017724
UniProt	P43268	P28322
RefSeq (мРНК)	NM_001079675 NM_001261437 NM_001261438 NM_001261439 NM_001986 NM_001369366 NM_001369367 NM_001369368	NM_008815 NM_001316365 NM_001316366
RefSeq (белок)	NP_001073143 NP_001248366 NP_001248367 NP_001248368 NP_001977 NP_001356295 NP_001356296 NP_001356297	NP_001303294 NP_001303295 NP_032841
Расположение (UCSC)	Chr 17: 43,53 - 43,58 Мб	Chr 11: 101.77 - 101.79 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Вариант транслокации ETS 4 (ETV4), также известный как активатор усилителя полиомы 3 (PEA3), является членом Подсемейство PEA3 из Факторы транскрипции ETS.^[5][6][7]

Маркер заболевания

Два варианта заболевания, связанного с ETV4, - это саркома Юинга и внекостная саркома Юинга. Хотя обе являются злокачественными опухолями, первая растет в костях, чаще всего поражающих руки, ноги, бедра и позвоночник, а вторая поражает мягкие ткани груди, стопы, таза и позвоночника.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000175832 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017724 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Исобе М., Ямагиши Ф., Ёсида К., Хигасино Ф., Фудзинага К. (июль 1995 г.). «Отнесение гена фактора транскрипции E1A-F (ETV4), связанного с ets, к области 17q21 хромосомы человека». Геномика. 28 (2): 357–9. Дои:10.1006 / geno.1995.1158. PMID  8530053.
6. «Ген Entrez: ген 4 варианта Ets ETV4 (белок, связывающий энхансер E1A, E1AF)».
7. "Ген ETV4 - Генные карты | Белок ETV4 | Антитело ETV4". www.genecards.org. Получено 2019-10-20.

дальнейшее чтение

• Фридман Л.С., Остермейер Е.А., Линч Э.Д., Велч П., Сабо С.И., Меза Дж.Э., Андерсон Л.А., Дауд П., Ли М.К., Роуэлл С.Е. (январь 1995 г.). «22 гена из хромосомы 17q21: клонирование, секвенирование и характеристика мутаций в семьях рака груди и опухолях». Геномика. 25 (1): 256–63. Дои:10.1016/0888-7543(95)80133-7. PMID  7774926.
• Лю С.Х., Пэн Б.Х., Ма Дж.Т., Лю Ю.С., Нг SY (1995). «Факторы транскрипции, связанные с элементом ответа сыворотки в эмбрионах мыши: фактор ответа сыворотки, YY1 и фактор PEA3». Генетика развития. 16 (3): 229–40. Дои:10.1002 / dvg.1020160303. PMID  7796532.
• Фридман Л.С., Остермейер Е.А., Линч Э.Д., Сабо К.И., Андерсон Л.А., Дауд П., Ли МК, Роуэлл С.Е., Бойд Дж., Кинг М.С. (декабрь 1994 г.). «В поисках BRCA1». Исследования рака. 54 (24): 6374–82. PMID  7987831.
• Хигашино Ф., Йошида К., Фудзинага Ю., Камио К., Фудзинага К. (февраль 1993 г.). «Выделение кДНК, кодирующей белок, связывающий энхансер аденовируса E1A: новый человеческий член семейства онкогенов ets». Исследования нуклеиновых кислот. 21 (3): 547–53. Дои:10.1093 / nar / 21.3.547. ЧВК  309151. PMID  8441666.
• Урано Ф., Умедзава А., Хонг В., Кикучи Х., Хата Дж. (Февраль 1996 г.). «Новый химерный ген между EWS и E1A-F, кодирующий аденовирусный белок, связывающий энхансер E1A, при внекостной саркоме Юинга». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 219 (2): 608–12. Дои:10.1006 / bbrc.1996.0281. PMID  8605035.
• Coutte L, Monté D, Baert J, de Launoit Y (ноябрь 1999 г.). «Геномная организация гена e1af человека, члена факторов транскрипции Ets». Ген. 240 (1): 201–7. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00400-X. PMID  10564827.
• Мастранжело Т., Модена П., Торниелли С., Буллрих Ф., Тести М.А., Меззелани А., Радис П., Аззарелли А., Пилотти С., Кроче С.М., Пьеротти М.А., Соцци Г. (август 2000 г.). «Новый ген цинкового пальца слит с EWS в небольшой круглоклеточной опухоли». Онкоген. 19 (33): 3799–804. Дои:10.1038 / sj.onc.1203762. PMID  10949935.
• Дэвидсон Б., Гольдберг И., Готлиб У.Х., Кополович Дж., Бен-Барух Г., Райх Р. (апрель 2003 г.). «PEA3 - второй фактор транскрипции семейства Ets, участвующий в прогрессировании опухоли при карциноме яичников». Клинические исследования рака. 9 (4): 1412–9. PMID  12684413.
• Span PN, Manders P, Heuvel JJ, Beex LV, Sweep CG (май 2003 г.). «Уровни экспрессии E1AF не связаны с прогнозом рака груди человека». Исследования и лечение рака груди. 79 (1): 129–31. Дои:10.1023 / А: 1023338424677. PMID  12779089. S2CID  6629346.
• Андерсон Н.Л., Полански М., Пипер Р., Гатлин Т., Тирумалай Р.С., Конрадс Т.П., Винстра Т.Д., Адкинс Дж.Н., Паундс Дж. Г., Фаган Р., Лобли А. (апрель 2004 г.). «Протеом плазмы человека: неизбыточный список, составленный из четырех отдельных источников». Молекулярная и клеточная протеомика. 3 (4): 311–26. Дои:10.1074 / mcp.M300127-MCP200. PMID  14718574.
• Лю Ю., Борхерт Г.Л., Панг Дж.М. (апрель 2004 г.). «Активатор усилителя полиомы 3, фактор транскрипции ets, опосредует индукцию циклооксигеназы-2 оксидом азота в клетках колоректального рака». Журнал биологической химии. 279 (18): 18694–700. Дои:10.1074 / jbc.M308136200. PMID  14976201.
• Судзуки Ю., Ямасита Р., Широта М., Сакакибара Ю., Чиба Дж., Мидзусима-Сугано Дж., Накай К., Сугано С. (сентябрь 2004 г.). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях». Геномные исследования. 14 (9): 1711–8. Дои:10.1101 / гр.2435604. ЧВК  515316. PMID  15342556.
• Дэвидсон Б., Гольдберг И., Телль Л., Вигдорчик С., Бэкеландт М., Бернер А., Кристенсен Г. Б., Райх Р., Кополович Дж. (2004). «Клиническая роль фактора транскрипции PEA3 при раке яичников и молочной железы при выпотах». Клинические и экспериментальные метастазы. 21 (3): 191–9. Дои:10.1023 / B: CLIN.0000037703.37275.35. PMID  15387369. S2CID  22579184.
• Fauquette V, Perrais M, Cerulis S, Jonckheere N, Ducourouble MP, Aubert JP, Pigny P, Van Seuningen I (февраль 2005 г.). «Антагонистическая регуляция человеческих генов MUC4 и ErbB-2 с помощью белка Ets PEA3 в раковых клетках поджелудочной железы: последствия для баланса пролиферации / дифференцировки в клетках». Биохимический журнал. 386 (Чт 1): 35–45. Дои:10.1042 / BJ20040706. ЧВК  1134764. PMID  15461591.
• Чжу X, Цзян Дж., Шен Х, Ван Х, Цзун Х, Ли З, Ян И, Ню З, Лю В., Чен Х, Ху И, Гу Дж (апрель 2005 г.). «Повышенный уровень бета1,4-галактозилтрансферазы I в высокометастатических клетках рака легких человека. Идентификация E1AF как важного активатора транскрипции». Журнал биологической химии. 280 (13): 12503–16. Дои:10.1074 / jbc.M413631200. PMID  15611127.
• Такахаши А., Хигасино Ф., Аояги М., Йошида К., Ито М., Кобаяси М., Тоцука Ю., Кохго Т., Шиндох М. (февраль 2005 г.). «Расщепление E1AF по пути убиквитин-протеасома». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 327 (2): 575–80. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.12.045. PMID  15629152.
• Ношо К., Йошида М., Ямамото Х., Танигучи Х., Адачи Й., Миками М., Хинода Й., Имаи К. (май 2005 г.). «Связь экспрессии связанного с Ets транскрипционного фактора E1AF с избыточной экспрессией матриксных металлопротеиназ, COX-2 и iNOS на ранней стадии колоректального канцерогенеза». Канцерогенез. 26 (5): 892–9. CiteSeerX  10.1.1.567.1603. Дои:10.1093 / carcin / bgi029. PMID  15695237.

внешняя ссылка

• ETV4 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P43268 (Вариант 4 транслокации ETS) на PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.