Гамма рецепторов ретиноидов X - Retinoid X receptor gamma

RXRG
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2GL8
Идентификаторы
Псевдонимы	RXRG, NR2B3, RXRC, гамма-рецептор ретиноида X
Внешние идентификаторы	OMIM: 180247 MGI: 98216 ГомолоГен: 21373 Генные карты: RXRG
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q23.3 Начинать 165,400,922 бп[1] Конец 165,445,355 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 H2.3 | 1 74,99 см Начинать 167,598,384 бп[2] Конец 167,639,623 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • связывание ионов цинка • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • Связывание ДНК • связывание ионов металлов • последовательное связывание ДНК • активность рецепторов стероидных гормонов • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 активность ядерного рецептора • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • сигнальный путь рецептора ретиноевой кислоты • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • гомотетрамеризация белков • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II, участвующего в клеточном ответе на химический стимул • транскрипция, ДНК-шаблон • сигнальный путь, опосредованный стероидными гормонами • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6258	20183
Ансамбль	ENSG00000143171	ENSMUSG00000015843
UniProt	P48443	P28705
RefSeq (мРНК)	NM_001256570 NM_001256571 NM_006917	NM_001159731 NM_009107
RefSeq (белок)	NP_001243499 NP_001243500 NP_008848	NP_001153203 NP_033133
Расположение (UCSC)	Chr 1: 165.4 - 165.45 Мб	Chr 1: 167,6 - 167,64 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гамма рецепторов ретиноидов X (RXR-гамма), также известный как NR2B3 (подсемейство ядерных рецепторов 2, группа B, член 3) представляет собой ядерный рецептор что у людей кодируется RXRG ген.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует член рецептор ретиноида X (RXR) семейство ядерных рецепторов, которые участвуют в опосредовании антипролиферативных эффектов ретиноевая кислота (РА). Этот рецептор образует гетеродимеры с ретиноевая кислота, гормон щитовидной железы, и рецепторы витамина D, увеличивая как связывание ДНК, так и функцию транскрипции на их соответствующих элементах ответа. Этот ген экспрессируется на значительно более низких уровнях в клетках немелкоклеточного рака легкого. Альтернативная транскрипционная сплайсинг варианты, кодирующие разные изоформы, были охарактеризованы.^[6]

Смотрите также

• Ретиноидный рецептор X

Взаимодействия

Было показано, что гамма-рецептор ретиноида X взаимодействовать с ITGB3BP.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000143171 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015843 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Алмасан А., Мангельсдорф Д. Д., Онг Э. С., Валь Г. М., Эванс Р. М. (апрель 1994 г.). «Хромосомная локализация рецепторов ретиноида X человека». Геномика. 20 (3): 397–403. Дои:10.1006 / geno.1994.1193. PMID  8034312.
6. «Энтрез Ген: RXRG ретиноидный рецептор X, гамма».
7. Ли Д., Ван Ф, Сэмюэлс Х. Х. (декабрь 2001 г.). «Доменная структура корегуляторов семейства NRIF3 предполагает потенциальную двойную роль в регуляции транскрипции». Мол. Клетка. Биол. 21 (24): 8371–84. Дои:10.1128 / MCB.21.24.8371-8384.2001. ЧВК  100002. PMID  11713274.

дальнейшее чтение

• Сзанто А., Наркар В., Шен К., Урай И. П., Дэвис П. Дж., Надь Л. (2005). «Ретиноидные X-рецепторы: X-проявляют свои (пато) физиологические функции». Разница в гибели клеток. 11 Приложение 2: S126–43. Дои:10.1038 / sj.cdd.4401533. PMID  15608692.
• Лейд М., Кастнер П., Лайонс Р., Накшатри Х., Сондерс М., Захаровски Т., Чен Дж.Й., Стауб А., Гарнье Дж. М., Мадер С. (1992). «Очистка, клонирование и идентичность RXR клеточного фактора HeLa, с которым RAR или TR гетеродимеризуются для эффективного связывания целевых последовательностей». Клетка. 68 (2): 377–95. Дои:10.1016 / 0092-8674 (92) 90478-У. PMID  1310259. S2CID  40617478.
• Mangelsdorf DJ, Borgmeyer U, Heyman RA, Zhou JY, Ong ES, Oro AE, Kakizuka A, Evans RM (1992). «Характеристика трех генов RXR, которые опосредуют действие 9-цис-ретиноевой кислоты». Genes Dev. 6 (3): 329–44. Дои:10.1101 / gad.6.3.329. PMID  1312497.
• Нагата Т., Вайс Э.Х., Абе К., Китагава К., Андо А., Яра-Кикути Ю., Селдин М.Ф., Озато К., Иноко Х., Такето М. (1995). «Физическое картирование гена ретиноидного X рецептора B у мышей и человека». Иммуногенетика. 41 (2–3): 83–90. Дои:10.1007 / BF00182317. PMID  7806300. S2CID  29455544.
• Muscat GE, Mynett-Johnson L, Dowhan D, Downes M, Griggs R (1994). «Активация транскрипции гена myoD 3,5,3'-трийод-L-тиронином: прямая роль гормона щитовидной железы и рецепторов ретиноидов X». Нуклеиновые кислоты Res. 22 (4): 583–91. Дои:10.1093 / nar / 22.4.583. ЧВК  307847. PMID  8127707.
• Kamei Y, Xu L, Heinzel T, Torchia J, Kurokawa R, Gloss B, Lin SC, Heyman RA, Rose DW, Glass CK, Rosenfeld MG (1996). «Комплекс интегратора CBP опосредует активацию транскрипции и ингибирование AP-1 ядерными рецепторами». Клетка. 85 (3): 403–14. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81118-6. PMID  8616895.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Санно Н., Сугавара А., Терамото А., Абэ И., Йен П.М., Чин В.В., Осамура Р.Й. (1997). «Иммуногистохимическая экспрессия изоформ ретиноидных рецепторов Х в гипофизе человека и аденомах гипофиза». Нейроэндокринология. 65 (4): 299–306. Дои:10.1159/000127188. PMID  9143002.
• Райхрат Дж., Миттманн М, Камрад Дж., Мюллер С.М. (1997). «Экспрессия рецепторов ретиноида-X (-альфа, -бета, -гамма) и рецепторов ретиноевой кислоты (-альфа, -бета, -гамма) в нормальной коже человека: иммуногистологическая оценка». Histochem. J. 29 (2): 127–33. Дои:10.1023 / А: 1026481205135. PMID  9147069. S2CID  24005650.
• Сюй XC, Соцци Дж., Ли Дж. С., Ли Дж. Дж., Пасторино Ю., Пилотти С., Кури Дж. М., Хонг В. К., Лотан Р. (1997). «Подавление рецептора ретиноевой кислоты бета при немелкоклеточном раке легкого in vivo: значение для развития рака легкого». J. Natl. Институт рака. 89 (9): 624–9. Дои:10.1093 / jnci / 89.9.624. PMID  9150186.
• Юста Б., Аларид Е.Т., Гордон Д.Ф., Риджвей ЕС, Меллон П.Л. (1998). «Ген бета-субъединицы тиреотропина репрессируется гормоном щитовидной железы в новой линии тиреотропных клеток, T alphaT1-клетках мыши». Эндокринология. 139 (11): 4476–82. Дои:10.1210 / en.139.11.4476. PMID  9794455.
• Ито К., Сузуки Т., Мория Т., Уцуномия Х., Сугавара А., Конно Р., Сато С., Сасано Х. (2001). «Ретиноидные рецепторы в эндометрии человека и его нарушения: возможный модулятор 17-бета-гидроксистероиддегидрогеназы». J. Clin. Эндокринол. Метаб. 86 (6): 2721–7. Дои:10.1210 / jc.86.6.2721. PMID  11397877.
• Ким С.В., Ким Х.Дж., Чон DJ, Ли СК, Ким Ю.С., Ким Дж.Х., Ким Т.С., Ли Дж.В. (2001). «Ретиноид-зависимый антагонизм трансактивации сывороточного фактора ответа, опосредованный белками-коактиваторами транскрипции». Онкоген. 20 (45): 6638–42. Дои:10.1038 / sj.onc.1204695. PMID  11641790. S2CID  7377737.
• Брабендер Дж, Даненберг К.Д., Мецгер Р., Шнайдер П.М., Лорд Р.В., Грошен С., Цао-Вей Д.Д., Парк Дж., Салонга Д., Хёльшер А.Х., Даненберг П.В. (2002). «Роль экспрессии матричной РНК рецептора ретиноида X в лечении немелкоклеточного рака легкого после резекции». Clin. Рак Res. 8 (2): 438–43. PMID  11839661.
• Ванса К.Д., Харрис Дж.М., Маскат Г.Е. (2002). «Домен функции активации-1 Nur77 / NR4A1 опосредует трансактивацию, клеточную специфичность и рекрутирование коактиватора». J. Biol. Chem. 277 (36): 33001–11. Дои:10.1074 / jbc.M203572200. PMID  12082103.
• Ван Кью, Фудзи Х, Книпп Г.Т. (2003). «Экспрессия изоформ PPAR и RXR в развивающейся плаценте крысы и человека». Плацента. 23 (8–9): 661–71. Дои:10.1053 / plac.2002.0855. PMID  12361685.
• Кимура Ю., Сузуки Т., Канеко С., Дарнел А.Д., Мория Т., Сузуки С., Ханда М., Эбина М., Нукива Т., Сасано Х. (2003). «Ретиноидные рецепторы в развивающихся легких человека». Clin. Наука. 103 (6): 613–21. Дои:10.1042 / cs1030613. PMID  12444914.
• Альфаро JM, Fraile B, Lobo MV, Royuela M, Paniagua R, Arenas MI (2003). «Иммуногистохимическое обнаружение ретиноидных рецепторов X альфа, бета и гамма в простате человека». Дж. Андрол. 24 (1): 113–9. PMID  12514092.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.