ZNF638 - ZNF638

ZNF638
Идентификаторы
Псевдонимы	ZNF638, NP220, ZFML, Zfp638, белок цинковых пальцев 638
Внешние идентификаторы	OMIM: 614349 MGI: 1203484 ГомолоГен: 7447 Генные карты: ZNF638
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п13.3-п13.2 Начните 71,276,561 бп[1] Конец 71,435,069 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 C3 Начните 83,867,109 бп[2] Конец 83,989,550 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • Связывание ДНК • связывание ионов цинка • связывание двухцепочечной ДНК • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • ядерное пятнышко • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • Сплайсинг РНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	27332	18139
Ансамбль	ENSG00000075292	ENSMUSG00000030016
UniProt	Q14966	Q61464
RefSeq (мРНК)	NM_001014972 NM_001252612 NM_001252613 NM_014497	NM_001166371 NM_008717 NM_001355284 NM_001355285 NM_001355286
RefSeq (белок)	NP_001014972 NP_001239541 NP_001239542 NP_055312	NP_001159843 NP_032743 NP_001342213 NP_001342214 NP_001342215
Расположение (UCSC)	Chr 2: 71,28 - 71,44 Мб	Chr 6: 83,87 - 83,99 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цинковые пальцы 638 это белок что у людей кодируется ZNF638 ген.^[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой нуклеоплазматический белок. Он связывает богатые цитидином последовательности в двухцепочечной ДНК. Этот белок имеет три типа доменов: MH1, MH2 (повторяется трижды) и MH3. Это связано с упаковкой, передачей или обработкой стенограмм. Для этого гена было обнаружено множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, но биологическая ценность некоторых вариантов не была определена.^[6]

Взаимодействия

ZNF638 был показан взаимодействовать с FHL2.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000075292 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030016 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Инагаки Х., Мацусима Ю., Накамура К., Охима М., Кадоваки Т., Китагава Ю. (июль 1996 г.). «Большой ДНК-связывающий ядерный белок с мотивом распознавания РНК и доменом, богатым серином / аргинином». J Biol Chem. 271 (21): 12525–31. Дои:10.1074 / jbc.271.21.12525. PMID  8647861.
6. «Ген Entrez: ZNF638, белок цинкового пальца 638».
7. Нг, Эндерс Кай Он; Чан Квок Кеунг; Вонг Чи Ханг; Крыло Цуй Стивена Квок; Нгаи Сай Мин; Ли Саймон Мин Юэнь; Котака Масайо; Ли Чеук Ю; Уэй Мэри Миу Йи; Фунг Квок Пуи (2002). «Взаимодействие специфического для сердца белка домена LIM, FHL2, с ДНК-связывающим ядерным белком, hNP220». J. Cell. Биохим. Соединенные Штаты. 84 (3): 556–66. Дои:10.1002 / jcb.10041. ISSN  0730-2312. PMID  11813260. S2CID  2842198.

дальнейшее чтение

• Окумара К., Ногами М., Мацусима Ю. и др. (1998). «Картирование ДНК-связывающего ядерного белка человека (NP220) на полосу хромосомы 2p13.1-p13.2 и его связь с матрином 3». Biosci. Biotechnol. Биохим. 62 (8): 1640–2. Дои:10.1271 / bbb.62.1640. PMID  9757574.
• Эйхмюллер С., Усенер Д., Даммер Р. и др. (2001). «Серологическое обнаружение антигенов, связанных с кожной Т-клеточной лимфомой». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (2): 629–34. Дои:10.1073 / pnas.021386498. ЧВК  14639. PMID  11149944.
• Нг Е.К., Чан К.К., Вонг Ч.Х. и др. (2002). «Взаимодействие специфического для сердца белка LIM домена, FHL2, с ДНК-связывающим ядерным белком, hNP220». J. Cell. Биохим. 84 (3): 556–66. Дои:10.1002 / jcb.10041. PMID  11813260. S2CID  2842198.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Бензингер А., Мустер Н., Кох HB и др. (2005). «Целевой протеомный анализ 14-3-3 сигма, эффектора р53, который обычно подавляется при раке». Мол. Клетка. Протеомика. 4 (6): 785–95. Дои:10.1074 / mcp.M500021-MCP200. PMID  15778465.
• Hillier LW, Graves TA, Fulton RS и др. (2005). «Создание и аннотирование последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека». Природа. 434 (7034): 724–31. Bibcode:2005Натура.434..724H. Дои:10.1038 / природа03466. PMID  15815621.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, et al. (2006). «Фосфопротеомный анализ митотического веретена человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (14): 5391–6. Bibcode:2006PNAS..103.5391N. Дои:10.1073 / pnas.0507066103. ЧВК  1459365. PMID  16565220.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.

внешняя ссылка

• ZNF638 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.