NFATC2 - NFATC2

NFATC2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1A02, 1OWR, 1P7H, 1ПЗУ, 2AS5, 2O93, 3QRF
Идентификаторы
Псевдонимы	NFATC2, NFAT1, NFATP, ядерный фактор активированных Т-клеток 2, ядерный фактор активированных Т-клеток 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 600490 MGI: 102463 ГомолоГен: 7861 Генные карты: NFATC2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q13.2 Начинать 51,386,957 бп[1] Конец 51,562,831 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 H3 | 2 88,91 см Начинать 168,476,410 бп[2] Конец 168,601,657 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • последовательное связывание ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание фактора транскрипции • связывание хроматина • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области транскрипции • связывание фосфатазы • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • цитоплазма • комплекс регуляторов транскрипции • нуклеоплазма • ядро клетки • ядерный хроматин • цитозоль • рибонуклеопротеин Биологический процесс • Путь передачи сигналов рецептора В-клеток • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • производство цитокинов • сигнальный каскад кальциневрин-NFAT • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • развитие клеток миотрубки • транскрипция, ДНК-шаблон • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • положительная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • Сигнальный путь рецептора Fc-эпсилон • положительная регуляция слияния миобластов • положительная регуляция экспрессии генов • положительное регулирование пролиферации В-клеток • миграция клеток • ответ на наркотик • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция дифференцировки регуляторных Т-клеток • отрицательная регуляция дифференцировки клеток гладких мышц сосудов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4773	18019
Ансамбль	ENSG00000101096	ENSMUSG00000027544
UniProt	Q13469	Q60591
RefSeq (мРНК)	NM_001136021 NM_001258292 NM_001258294 NM_001258295 NM_001258296 NM_001258297 NM_012340 NM_173091	NM_001037177 NM_001037178 NM_001136073 NM_001291168 NM_001291169 NM_001291170 NM_001291171 NM_001291172 NM_001291173 NM_001291174 NM_001291175 NM_001291176 NM_001291177 NM_001291178 NM_001291179 NM_010899
RefSeq (белок)	NP_001129493 NP_001245221 NP_001245223 NP_001245224 NP_001245225 NP_001245226 NP_036472 NP_775114	NP_001032254 NP_001032255 NP_001129545 NP_001278097 NP_001278098 NP_001278099 NP_001278100 NP_001278101 NP_001278102 NP_001278103 NP_001278104 NP_001278105 NP_001278106 NP_001278107 NP_001278108 NP_035029
Расположение (UCSC)	Chr 20: 51.39 - 51.56 Мб	Chr 2: 168,48 - 168,6 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ядерный фактор активированных Т-клеток, цитоплазматический 2 это белок что у людей кодируется NFATC2 ген.^[5]

Функция

Этот ген является членом ядерного фактора активированных Т-клеток (NFAT ) семья. Продукт этого гена - ДНК-связывающий белок с областью гомологии REL (RHR) и областью гомологии NFAT (NHR). Этот белок присутствует в цитозоль и перемещается в ядро ​​только при стимуляции Т-клеточного рецептора (TCR), где он становится членом ядерных факторов транскрипционного комплекса активированных Т-клеток. Этот комплекс играет центральную роль в индукции транскрипции генов во время иммунного ответа. Были охарактеризованы альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга, кодирующие разные изоформы.^[6]

Клиническое значение

Транслокация, образующая продукт слияния в рамке между Ген EWSR1 и ген NFATc2 был описан в опухоли кости с клинической картиной, подобной саркоме Юинга. Точка разрыва транслокации привела к потере контролирующих элементов белка NFATc2, а слияние N-концевой области гена EWSR1 обеспечило постоянную активацию белка.^[7]

Взаимодействия

NFATC2 был показан взаимодействовать с MEF2D,^[8] EP300,^[9] IRF4^[10] и Протеинкиназа Mζ.^[11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101096 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000027544 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нортроп Дж. П., Хо С. Н., Чен Л., Томас Д. Д., Тиммерман Л. А., Нолан Г. П., Адмон А., Крэбтри Г. Р. (июнь 1994 г.). «Компоненты NF-AT определяют семейство факторов транскрипции, нацеленных на активацию Т-клеток». Природа. 369 (6480): 497–502. Bibcode:1994Натура.369..497Н. Дои:10.1038 / 369497a0. PMID  8202141. S2CID  9920546.
6. «Ген Entrez: ядерный фактор NFATC2 активированных Т-клеток, цитоплазматический, кальциневрин-зависимый 2».
7. Szuhai K, Ijszenga M, de Jong D, Karseladze A, Tanke HJ, Hogendoorn PC (апрель 2009 г.). «Ген NFATc2 участвует в новой клонированной транслокации в варианте саркомы Юинга, которая сочетает его функции в иммунологии с онкологией». Клинические исследования рака. 15 (7): 2259–68. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-08-2184. PMID  19318479.
8. Youn HD, Chatila TA, Liu JO (август 2000 г.). «Интеграция сигналов кальциневрина и MEF2 коактиватором p300 во время апоптоза Т-клеток». Журнал EMBO. 19 (16): 4323–31. Дои:10.1093 / emboj / 19.16.4323. ЧВК  302027. PMID  10944115.
9. Гарсиа-Родригес К., Рао А. (июнь 1998 г.). «Ядерный фактор активированных Т-клеток (NFAT) -зависимая трансактивация, регулируемая коактиваторами p300 / CREB-связывающий белок (CBP)». Журнал экспериментальной медицины. 187 (12): 2031–6. Дои:10.1084 / jem.187.12.2031. ЧВК  2212364. PMID  9625762.
10. Ренгараджан Дж., Моуэн К.А., Макбрайд К.Д., Смит Э.Д., Сингх Х., Глимчер Л.Х. (апрель 2002 г.). «Фактор регуляции интерферона 4 (IRF4) взаимодействует с NFATc2, чтобы модулировать экспрессию гена интерлейкина 4». Журнал экспериментальной медицины. 195 (8): 1003–12. Дои:10.1084 / jem.20011128. ЧВК  2193700. PMID  11956291.
11. Сан-Антонио Б., Иньигес, Массачусетс, Фресно, М. (июль 2002 г.). «Протеинкиназа Czeta фосфорилирует ядерный фактор активированных Т-клеток и регулирует его трансактивирующую активность». Журнал биологической химии. 277 (30): 27073–80. Дои:10.1074 / jbc.M106983200. PMID  12021260.

дальнейшее чтение

• Рао А., Ло С., Хоган П. Г. (1997). «Факторы транскрипции семейства NFAT: регуляция и функция». Ежегодный обзор иммунологии. 15: 707–747. Дои:10.1146 / annurev.immunol.15.1.707. PMID  9143705.
• Crabtree GR (март 1999 г.). «Общие сигналы и конкретные результаты: передача сигналов через Ca2 +, кальциневрин и NF-AT». Клетка. 96 (5): 611–614. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80571-1. PMID  10089876. S2CID  8817053.
• Хорсли В., Павлат Г.К. (март 2002 г.). «NFAT: повсеместный регулятор дифференцировки и адаптации клеток». Журнал клеточной биологии. 156 (5): 771–774. Дои:10.1083 / jcb.200111073. ЧВК  2173310. PMID  11877454.
• Арамбуру Дж., Аззони Л., Рао А., Перуссия Б. (сентябрь 1995 г.). «Активация и экспрессия ядерных факторов активированных Т-клеток, NFATp и NFATc, в естественных клетках-киллерах человека: регуляция связывания лиганда CD16». Журнал экспериментальной медицины. 182 (3): 801–810. Дои:10.1084 / jem.182.3.801. ЧВК  2192167. PMID  7650486.
• Auffray C, Behar G, Bois F, Bouchier C, Da Silva C, Devignes MD, Duprat S, Houlgatte R, Jumeau MN, Lamy B (февраль 1995 г.). «[ИЗОБРАЖЕНИЕ: молекулярная интеграция анализа генома человека и его экспрессии]». Comptes Rendus de l'Académie des Sciences, Série III. 318 (2): 263–72. PMID  7757816.
• Ли Х, Хо С. Н., Луна Дж., Джакалоне Дж., Томас Д. Д., Тиммерман Л. А., Крэбтри Г. Р., Франк У. (1995). «Клонирование и хромосомная локализация генов человека и мыши для факторов транскрипции Т-клеток NFATc и NFATp». Цитогенетика и клеточная генетика. 68 (3–4): 185–191. Дои:10.1159/000133910. PMID  7842733.
• Хо С., Тиммерман Л., Нортроп Дж., Крэбтри Г. Р. (1995). «Клонирование и характеристика NF-ATc и NF-ATp: цитоплазматические компоненты NF-AT». Достижения экспериментальной медицины и биологии. 365: 167–73. Дои:10.1007/978-1-4899-0987-9_17. ISBN  978-1-4899-0989-3. PMID  7887301.
• Jabado N, Le Deist F, Fisher A, Hivroz C (ноябрь 1994 г.). «Взаимодействие gp120 ВИЧ и антител к CD4 с молекулой CD4 на человеческих CD4 + Т-клетках ингибирует связывающую активность NF-AT, NF-каппа B и AP-1, трех ядерных факторов, регулирующих активность энхансера гена интерлейкина-2». Европейский журнал иммунологии. 24 (11): 2646–2652. Дои:10.1002 / eji.1830241112. PMID  7957556.
• Vacca A, Farina M, Maroder M, Alesse E, Screpanti I, Frati L, Gulino A (ноябрь 1994 г.). «Вирус иммунодефицита человека типа 1 tat усиливает активность промотора интерлейкина-2 за счет синергизма со сложным эфиром форбола и опосредованной кальцием активации цис-регуляторного мотива NF-AT». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 205 (1): 467–474. Дои:10.1006 / bbrc.1994.2689. PMID  7999066.
• Джайн Дж., Маккаффри П.Г., Майнер З., Керппола Т.К., Ламберт Дж. Н., Вердин Г.Л., Карран Т., Рао А. (сентябрь 1993 г.). «Фактор транскрипции Т-клеток NFATp является субстратом для кальциневрина и взаимодействует с Fos и Jun». Природа. 365 (6444): 352–355. Bibcode:1993Натура.365..352J. Дои:10.1038 / 365352a0. PMID  8397339. S2CID  4283223.
• Луо С., Берджон Э., Кэрью Дж. А., Маккаффри П. Г., Бадалян TM, Лейн В. С., Хоган П. Г., Рао А. (июль 1996 г.). «Рекомбинантный NFAT1 (NFATp) регулируется кальциневрином в Т-клетках и опосредует транскрипцию нескольких генов цитокинов». Молекулярная и клеточная биология. 16 (7): 3955–66. Дои:10.1128 / mcb.16.7.3955. ЧВК  231392. PMID  8668213.
• Ди Сомма М.М., Майолини М.Б., Бурастеро С.Е., Телфорд Дж.Л., Балдари Коннектикут (сентябрь 1996 г.). «Чувствительность длинного концевого повтора ВИЧ-1 к циклоспорину А позволяет идентифицировать различные p56lck-зависимые пути, активируемые запуском CD4». Европейский журнал иммунологии. 26 (9): 2181–2188. Дои:10.1002 / eji.1830260933. PMID  8814265.
• Коупленд К.Ф., Маккей П.Дж., Розенталь К.Л. (январь 1996 г.). «Подавление длинного концевого повтора вируса иммунодефицита человека CD8 + Т-клетками зависит от элемента NFAT-1». Исследования СПИДа и ретровирусы человека. 12 (2): 143–148. Дои:10.1089 / помощь.1996.12.143. PMID  8834464.
• Боналду М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Ходж М.Р., Чун Х.Д., Ренгараджан Дж., Альтернатива А, Либерсон Р., Глимчер Л.Х. (декабрь 1996 г.). «NF-AT-управляемая транскрипция интерлейкина-4, усиленная NIP45». Наука. 274 (5294): 1903–1905. Bibcode:1996Sci ... 274.1903H. Дои:10.1126 / science.274.5294.1903. PMID  8943202. S2CID  29436825.
• Лях Л., Гош П., Райс Н.Р. (май 1997 г.). «Экспрессия белков семейства NFAT в нормальных Т-клетках человека». Молекулярная и клеточная биология. 17 (5): 2475–84. Дои:10.1128 / mcb.17.5.2475. ЧВК  232096. PMID  9111316.
• Амасаки Ю., Масуда Е.С., Имамура Р., Араи К., Араи Н. (март 1998 г.). «Определенные белки семейства NFAT вовлечены в ядерные комплексы связывания NFAT-ДНК из субпопуляций тимоцитов человека». Журнал иммунологии. 160 (5): 2324–33. PMID  9498773.
• Чен Л., Гловер Дж. Н., Хоган П. Г., Рао А., Харрисон СК (март 1998 г.). «Структура ДНК-связывающих доменов из NFAT, Fos и Jun, специфически связанных с ДНК». Природа. 392 (6671): 42–48. Bibcode:1998 Натур 392 ... 42C. Дои:10.1038/32100. PMID  9510247. S2CID  4305535.

внешняя ссылка

• NFATC2 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.