Бета-орфанный рецептор, связанный с RAR - RAR-related orphan receptor beta

RORB
Идентификаторы
Псевдонимы	RORB, NR1F2, ROR-BETA, RZR-BETA, RZRB, bA133M9.1, RAR-родственный сиротский рецептор бета, RAR-родственный сиротский рецептор B, EIG15
Внешние идентификаторы	OMIM: 601972 MGI: 1343464 ГомолоГен: 38250 Генные карты: RORB
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q21.13 Начинать 74,497,335 бп[1] Конец 74,693,177 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 млрд Начинать 18,930,605 бп[2] Конец 19,111,196 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • последовательное связывание ДНК • Связывание ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • связывание ионов цинка • связывание фактора транскрипции • связывание ионов металлов • активность рецепторов стероидных гормонов • GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 активность ядерного рецептора • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II • активность рецептора мелатонина Сотовый компонент • нуклеоплазма • ядро клетки Биологический процесс • клеточный ответ на ретиноевую кислоту • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • ответ на стимул • ритмический процесс • развитие клеток колбочек сетчатки • отрицательная регуляция дифференцировки остеобластов • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие многоклеточного организма • регулирование циркадного ритма • развитие стержневых клеток сетчатки • развитие фоторецепторных клеток глаза • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • визуальное восприятие • сигнальный путь, опосредованный стероидными гормонами • путь передачи сигнала внутриклеточного рецептора • дифференцировка амакриновых клеток • развитие сетчатки глаза камерного типа • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6096	225998
Ансамбль	ENSG00000198963	ENSMUSG00000036192
UniProt	Q92753 Q58EY0	Q8R1B8
RefSeq (мРНК)	NM_006914 NM_001365023	NM_001043354 NM_001289921 NM_146095
RefSeq (белок)	NP_008845 NP_001351952	NP_001036819 NP_001276850 NP_666207
Расположение (UCSC)	Chr 9: 74,5 - 74,69 Мб	Chr 19: 18.93 - 19.11 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Бета-орфанный рецептор, связанный с RAR (ROR-beta), также известный как NR1F2 (подсемейство ядерных рецепторов 1, группа F, член 2) представляет собой ядерный рецептор что у людей кодируется RORB ген.^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом подсемейства NR1 рецепторов ядерных гормонов. Это ДНК-связывающий белок, который может связываться как мономер или как гомодимер с элементы гормонального ответа перед несколькими генами, чтобы усилить экспрессию этих генов. Конкретные функции этого белка неизвестны, но было показано, что он взаимодействует с NM23-2, а нуклеозид-дифосфаткиназа участвует в органогенезе и дифференцировке.^[6]

В головном мозге ROR-бета концентрируется в слое 4 коры головного мозга, где он играет роль в развитии таких структур, как цилиндрические колонны.^[7]

Взаимодействия

RAR-связанный орфанный рецептор бета, как было показано, взаимодействовать с NME1.^[8]

Смотрите также

• RAR-родственный орфанный рецептор

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000198963 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000036192 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Giguère V, Tini M, Flock G, Ong E, Evans RM, Otulakowski G (март 1994). «Специфичные для изоформ амино-концевые домены определяют ДНК-связывающие свойства ROR альфа, нового семейства ядерных рецепторов орфанных гормонов». Genes Dev. 8 (5): 538–53. Дои:10.1101 / gad.8.5.538. PMID  7926749.
6. «Ген Entrez: RORB RAR-связанный орфанный рецептор B».
7. Jabaudon D, Shnider SJ, Tischfield DJ, Galazo MJ, Macklis JD (май 2012 г.). «RORβ индуцирует бочкообразные нейрональные кластеры в развивающемся неокортексе». Цереб. Кора. 22 (5): 996–1006. Дои:10.1093 / cercor / bhr182. ЧВК  3328343. PMID  21799210.
8. Паравичини Г., Стейнмайр М., Андре Э., Беккер-Андре М. (октябрь 1996 г.). «Нуклеотиддифосфаткиназа NM23-кандидат в супрессоры метастазов специфически взаимодействует с членами подсемейства ядерных орфанных рецепторов ROR / RZR». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 227 (1): 82–7. Дои:10.1006 / bbrc.1996.1471. PMID  8858107.

дальнейшее чтение

• Бисон В.М., Перри Т.В., Цурчер Т.Д. (1977). «Влияние дополнительного цинка на рост, а также на шерсть и уровни сыворотки крови мясного скота». J. Anim. Наука. 45 (1): 160–5. Дои:10.2527 / jas1977.451160x. PMID  885817.
• Карлберг С., Хофт ван Хейсдуйнен Р., Стейпл Дж. К., ДеЛамартер Дж. Ф., Беккер-Андре М. (1994). «RZR, новое семейство ретиноидных орфанных рецепторов, которые функционируют как мономеры, так и гомодимеры». Мол. Эндокринол. 8 (6): 757–70. Дои:10.1210 / me.8.6.757. PMID  7935491.
• Грейнер Э.Ф., Кирфель Дж., Грещик Х., Дёрфлингер У., Беккер П., Мерсеп А., Шюле Р. (1996). «Функциональный анализ ретиноидного рецептора Z бета, специфического для мозга ядерного рецептора орфана». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (19): 10105–10. Bibcode:1996PNAS ... 9310105G. Дои:10.1073 / пнас.93.19.10105. ЧВК  38344. PMID  8816759.
• Паравичини Г., Стейнмайр М., Андре Э., Беккер-Андре М. (1996). «Нуклеотиддифосфаткиназа NM23-кандидат в супрессоры метастазов специфически взаимодействует с членами подсемейства ядерных орфанных рецепторов ROR / RZR». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 227 (1): 82–7. Дои:10.1006 / bbrc.1996.1471. PMID  8858107.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1996). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Пак Х.Т., Пэк С.Ю., Ким Б.С., Ким Дж.Б., Ким Дж.Дж. (1996). «Развитие экспрессии мРНК« RZR beta, предполагаемого ядерного рецептора мелатонина »в супрахиазматическом ядре крысы». Neurosci. Латыш. 217 (1): 17–20. Дои:10.1016 / S0304-3940 (96) 13060-3. PMID  8905729.
• Андре Э, Конке Ф, Штайнмайр М, Страттон СК, Порсиатти В, Беккер-Андре М (1998). «Нарушение бета-рецепторов орфанов, связанных с ретиноидами, изменяет циркадное поведение, вызывает дегенерацию сетчатки и приводит к фенотипу Vacillans у мышей». EMBO J. 17 (14): 3867–77. Дои:10.1093 / emboj / 17.14.3867. ЧВК  1170722. PMID  9670004.
• Грейнер Э. Ф., Кирфель Дж., Грещик Х., Хуанг Д., Беккер П., Капфхаммер Дж. П., Шюле Р. (2000). «Дифференциальные лиганд-зависимые белок-белковые взаимодействия между ядерными рецепторами и нейронально-специфическим кофактором». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (13): 7160–5. Bibcode:2000PNAS ... 97.7160G. Дои:10.1073 / пнас.97.13.7160. ЧВК  16516. PMID  10860982.
• Гавлас К., Штунненберг Х.Г. (2000). «Дифференциальное связывание и транскрипционное поведение двух очень родственных орфанных рецепторов, ROR альфа (4) и ROR бета (1)». Биохим. Биофиз. Acta. 1494 (3): 236–41. Дои:10.1016 / s0167-4781 (00) 00237-2. PMID  11121580.
• Гавлас К., Штунненберг Х.Г. (2001). «Дифференциальная транскрипция орфанного рецептора RORbeta в ядерных экстрактах, полученных из клеток Neuro2A и HeLa». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (16): 3424–32. Дои:10.1093 / nar / 29.16.3424. ЧВК  55847. PMID  11504880.
• Stehlin C, Wurtz JM, Steinmetz A, Greiner E, Schüle R, Moras D, Renaud JP (2001). «Рентгеновская структура лиганд-связывающего домена орфанного ядерного рецептора RORbeta в активной конформации». EMBO J. 20 (21): 5822–31. Дои:10.1093 / emboj / 20.21.5822. ЧВК  125710. PMID  11689423.
• Суми Ю., Ягита К., Ямагути С., Исида Ю., Курода Ю., Окамура Н. (2002). «Ритмическая экспрессия мРНК ROR бета в супрахиазматическом ядре мышей». Neurosci. Латыш. 320 (1–2): 13–6. Дои:10.1016 / S0304-3940 (02) 00011-3. PMID  11849752. S2CID  54411407.
• Stehlin-Gaon C, Willmann D, Zeyer D, Sanglier S, Van Dorsselaer A, Renaud JP, Moras D, Schüle R (2003). «Полностью транс-ретиноевая кислота является лигандом для орфанного ядерного рецептора ROR бета». Nat. Struct. Биол. 10 (10): 820–5. Дои:10.1038 / nsb979. PMID  12958591. S2CID  10108247.

внешняя ссылка

• сирота + ядерный + рецептор + ROR-бета в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)