Гамма рецепторов ретиноевой кислоты - Retinoic acid receptor gamma

RARG
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1EXA, 1EXX, 1FCX, 1FCY, 1FCZ, 1FD0, 2LBD, 3LBD, 4LBD
Идентификаторы
Псевдонимы	RARG, NR1B3, RARC, гамма-рецептор ретиноевой кислоты
Внешние идентификаторы	OMIM: 180190 MGI: 97858 ГомолоГен: 20263 Генные карты: RARG
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q13.13 Начинать 53,210,567 бп[1] Конец 53,232,980 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 F3 | 15 57,4 см Начинать 102,234,938 бп[2] Конец 102,257,517 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • последовательное связывание ДНК • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • активность рецепторов стероидных гормонов • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК • связывание рецептора ретиноида X • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области транскрипции • связывание фактора транскрипции • коактиватор транскрипции лиганд-зависимого ядерного рецептора • сигнальная активность рецептора • GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 активность ядерного рецептора Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • нуклеоплазма • ядерный хроматин • ядро клетки • комплекс регуляторов транскрипции • Комплекс факторов транскрипции РНК-полимеразы II Биологический процесс • регулирование размера ячеек • рост пластинки хряща • клеточный ответ на ретиноевую кислоту • развитие железы • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция развития хряща • ответ на ретиноевую кислоту • рост многоклеточного организма • отрицательная регуляция дифференцировки клеток • костный морфогенез • развитие хондроцитов • отрицательная регуляция апоптотического процесса • развитие пигментного эпителия сетчатки • транскрипция, ДНК-шаблон • развитие эпителия • эмбриональное развитие глазного типа • развитие репродуктивной структуры • развитие конечностей • развитие лица • закрытие нервной трубки • отрицательная регуляция дифференцировки хондроцитов • Развитие желез Хардера • морфогенез эпителия предстательной железы • регулирование миелинизации • положительная регуляция экспрессии генов • развитие сетчатки глаза камерного типа • положительное регулирование пролиферации клеток • рост пластинки хряща рост хондроцитов • канонический путь передачи сигналов Wnt • регуляция экспрессии генов • развитие глаз по типу камеры • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция дифференцировки миелоидных клеток • развитие костей • развитие хряща трахеи • спецификация переднего / заднего рисунка • развитие железистых эпителиальных клеток • сигнальный путь, опосредованный стероидными гормонами • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • эмбриональный морфогенез задних конечностей • сигнальный путь рецептора ретиноевой кислоты • отрицательное регулирование пролиферации клеток • эмбриональный морфогенез глаза • положительная регуляция апоптотического процесса • положительная регуляция запрограммированной гибели клеток • клеточный ответ на фактор ингибирования лейкемии • развитие многоклеточного организма • гормонально-опосредованный сигнальный путь • дифференциация клеток • ответ на липид Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5916	19411
Ансамбль	ENSG00000172819	ENSMUSG00000001288
UniProt	P13631	P18911
RefSeq (мРНК)	NM_000966 NM_001042728 NM_001243730 NM_001243731 NM_001243732	NM_001042727 NM_011244
RefSeq (белок)	NP_000957 NP_001036193 NP_001230659 NP_001230660 NP_001230661	NP_001036192 NP_035374
Расположение (UCSC)	Chr 12: 53.21 - 53.23 Мб	Chr 15: 102,23 - 102,26 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гамма рецепторов ретиноевой кислоты (RAR-γ), также известный как NR1B3 (подсемейство ядерных рецепторов 1, группа B, член 3) представляет собой ядерный рецептор закодировано RARG ген.^[5][6]

Взаимодействия

Было показано, что гамма-рецептор ретиноевой кислоты взаимодействовать с NCOR1.^[7]

Смотрите также

• Рецептор ретиноевой кислоты

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000172819 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001288 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Ген: рецептор ретиноевой кислоты RARG, гамма».
6. Lehmann JM, Hoffmann B, Pfahl M (февраль 1991 г.). «Геномная организация гамма-гена рецептора ретиноевой кислоты». Исследования нуклеиновых кислот. 19 (3): 573–8. Дои:10.1093 / nar / 19.3.573. ЧВК  333650. PMID  1849262.
7. Доуэлл П., Измаил Дж. Э., Аврам Д., Петерсон В. Дж., Невривы Д. Д., Лейд М. (май 1999 г.). «Идентификация корепрессора ядерного рецептора как белка, взаимодействующего с альфа-рецептором, активируемого пролифератором пероксисом». Журнал биологической химии. 274 (22): 15901–7. Дои:10.1074 / jbc.274.22.15901. PMID  10336495.

дальнейшее чтение

• Лейд М., Кастнер П., Лайонс Р., Накшатри Х., Сондерс М., Захаревски Т., Чен Дж.Й., Стауб А., Гарнье Дж. М., Мадер С. (январь 1992 г.). «Очистка, клонирование и идентичность RXR клеточного фактора HeLa, с которым RAR или TR гетеродимеризуются для эффективного связывания целевых последовательностей». Клетка. 68 (2): 377–95. Дои:10.1016 / 0092-8674 (92) 90478-У. PMID  1310259. S2CID  40617478.
• Воллберг Т.М., Нерви С., Джордж М.Д., Фуджимото В., Краст А., Джеттен А.М. (май 1992 г.). «Рецепторы ретиноевой кислоты как регуляторы дифференцировки эпидермальных кератиноцитов человека». Молекулярная эндокринология. 6 (5): 667–76. Дои:10.1210 / me.6.5.667. PMID  1318502.
• Lehmann JM, Zhang XK, Pfahl M (июль 1992 г.). «Экспрессия RAR гамма 2 регулируется посредством элемента ответа ретиноевой кислоты, встроенного в сайты Sp1». Молекулярная и клеточная биология. 12 (7): 2976–85. Дои:10.1128 / mcb.12.7.2976. ЧВК  364511. PMID  1320193.
• Маттей М.Г., Ривьер М., Краст А., Ингварссон С., Веннстрём Б., Ислам М.К., Леван Г., Каутнер П., Зелент А., Шамбон П. (август 1991 г.). «Хромосомное определение генов рецепторов ретиноевой кислоты (RAR) в геномах человека, мыши и крысы» (PDF). Геномика. 10 (4): 1061–9. Дои:10.1016 / 0888-7543 (91) 90199-О. HDL:1946/20678. PMID  1655630.
• Кастнер П., Краст А., Мендельсон С., Гарнье Дж. М., Зелент А., Лерой П., Стауб А., Шамбон П. (апрель 1990 г.). «Мышиные изоформы гамма-рецептора ретиноевой кислоты со специфическими паттернами экспрессии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 87 (7): 2700–4. Bibcode:1990PNAS ... 87,2700 К. Дои:10.1073 / pnas.87.7.2700. ЧВК  53758. PMID  2157210.
• Жигер В., Шаго М., Зирнгибл Р., Тейт П., Россант Дж., Вармуза С. (май 1990 г.). «Идентификация новой изоформы гамма рецептора ретиноевой кислоты, экспрессируемой в эмбрионе мыши». Молекулярная и клеточная биология. 10 (5): 2335–40. Дои:10.1128 / mcb.10.5.2335. ЧВК  360581. PMID  2157970.
• Ishikawa T, Umesono K, Mangelsdorf DJ, Aburatani H, Stanger BZ, Shibasaki Y, Imawari M, Evans RM, Takaku F (июнь 1990 г.). «Функциональный рецептор ретиноевой кислоты, кодируемый геном на хромосоме 12 человека». Молекулярная эндокринология. 4 (6): 837–44. Дои:10.1210 / mend-4-6-837. PMID  2172793.
• Краст А., Кастнер П., Петкович М., Зелент А., Шамбон П. (июль 1989 г.). «Третий человеческий рецептор ретиноевой кислоты, hRAR-гамма». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 86 (14): 5310–4. Bibcode:1989PNAS ... 86,53 · 10K. Дои:10.1073 / pnas.86.14.5310. ЧВК  297611. PMID  2546152.
• Рено Дж. П., Рошель Н., Рафф М., Виват В., Шамбон П., Гронемейер Н., Морас Д. (декабрь 1995 г.). «Кристаллическая структура RAR-гамма-лиганд-связывающего домена, связанного с полностью транс-ретиноевой кислотой». Природа. 378 (6558): 681–9. Bibcode:1995Натура 378..681Р. Дои:10.1038 / 378681a0. PMID  7501014. S2CID  4259376.
• Чжоу Л., Панг Дж., Манро Д.Г., Лау К. (май 1993 г.). «Гамма-изоформа рецептора ретиноевой кислоты человека гомологична гамма-7 рецептору ретиноевой кислоты мыши». Исследования нуклеиновых кислот. 21 (10): 2520. Дои:10.1093 / nar / 21.10.2520. ЧВК  309563. PMID  7685085.
• Зитник Р.Дж., Котлофф Р.М., Латифпур Дж., Чжэн Т., Уайтинг Н.Л., Швальб Дж., Элиас Дж. А. (февраль 1994 г.). «Ингибирование ретиноевой кислотой индуцированной IL-1 продукции IL-6 фибробластами легких человека». Журнал иммунологии. 152 (3): 1419–27. PMID  8301142.
• Ботлинг Дж., Кастро Д.С., Оберг Ф., Нильссон К., Перлманн Т. (апрель 1997 г.). «Гетеродимеры рецептора ретиноевой кислоты / рецептора ретиноида X могут быть активированы через обе субъединицы, обеспечивая основу для синергической трансактивации и клеточной дифференциации». Журнал биологической химии. 272 (14): 9443–9. Дои:10.1074 / jbc.272.14.9443. PMID  9083083.
• Лемо Дж., Смеланд Э. Б., Улвен С., Натараджан В., Бломхофф Р., Ганди У., Доусон М. И., Бломхофф Г. К. (апрель 1998 г.). «RAR-, а не RXR, лиганды ингибируют активацию клеток и предотвращают апоптоз в B-лимфоцитах». Журнал клеточной физиологии. 175 (1): 68–77. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4652 (199804) 175: 1 <68 :: AID-JCP8> 3.0.CO; 2-A. PMID  9491782.
• Клахольц Б.П., Рено Дж. П., Митчлер А., Зуси С., Шамбон П., Гронемейер Н., Морас Д. (март 1998 г.). «Конформационная адаптация агонистов к человеческому ядерному рецептору RAR гамма». Структурная биология природы. 5 (3): 199–202. Дои:10.1038 / nsb0398-199. PMID  9501913. S2CID  30471226.
• Zhang ZP, Gambone CJ, Gabriel JL, Wolfgang CL, Soprano KJ, Soprano DR (декабрь 1998 г.). «Arg278, но не Lys229 или Lys236, играет важную роль в связывании ретиноевой кислоты гамма-рецептором ретиноевой кислоты». Журнал биологической химии. 273 (51): 34016–21. Дои:10.1074 / jbc.273.51.34016. PMID  9852056.
• Ян Ц., Чжоу Д., Чен С. (декабрь 1998 г.). «Модуляция экспрессии ароматазы в ткани груди с помощью орфанного рецептора ERR альфа-1». Исследования рака. 58 (24): 5695–700. PMID  9865725.
• Nagpal S, Ghosn C, DiSepio D, Molina Y, Sutter M, Klein ES, Chandraratna RA (август 1999 г.). «Ретиноид-зависимое рекрутирование активности замещения гистона H1 рецептором ретиноевой кислоты». Журнал биологической химии. 274 (32): 22563–8. Дои:10.1074 / jbc.274.32.22563. PMID  10428834.
• Эгеа П.Ф., Митчлер А., Рошель Н., Рафф М., Шамбон П., Морас Д. (июнь 2000 г.). «Кристаллическая структура лиганд-связывающего домена RXRalpha человека, связанного с его природным лигандом: 9-цис-ретиноевой кислотой». Журнал EMBO. 19 (11): 2592–601. Дои:10.1093 / emboj / 19.11.2592. ЧВК  212755. PMID  10835357.
• Boudjelal M, Voorhees JJ, Fisher GJ (март 2002 г.). «Передача сигналов ретиноидов ослабляется протеасомной деградацией ретиноидных рецепторов в клетках HaCaT кератиноцитов человека». Экспериментальные исследования клеток. 274 (1): 130–7. Дои:10.1006 / excr.2001.5450. PMID  11855864.