ЭРГ (ген) - ERG (gene)

ЭРГ
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1SXE, 4IRG, 4IRH, 4IRI
Идентификаторы
Псевдонимы	ЭРГ, erg-3, p55, ген ETS, гомолог онкогена E26 вируса эритробластоза v-ets, фактор транскрипции ETS, фактор транскрипции ETS ERG
Внешние идентификаторы	OMIM: 165080 MGI: 95415 ГомолоГен: 15848 Генные карты: ЭРГ
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 21 (человека)[1] Группа 21q22.2 Начните 38,380,027 бп[1] Конец 38,661,780 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 16 (мышь)[2] Группа 16 C4 | 16 56,04 см Начните 95,359,169 бп[2] Конец 95,586,593 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • последовательное связывание ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • связывание хроматина • активность преобразователя сигнала • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки • рибонуклеопротеин Биологический процесс • дифференциация клеток • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие эндокардиальной подушки • от эндокардиальной подушки до мезенхимального перехода, участвующего в формировании сердечного клапана • транскрипция, ДНК-шаблон • развитие многоклеточного организма • положительное регулирование ремоделирования кровеносных сосудов • фосфорилирование белков • клеточная пролиферация • миграция клеток • преобразование сигнала • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	2078	13876
Ансамбль	ENSG00000157554	ENSMUSG00000040732
UniProt	P11308	P81270
RefSeq (мРНК)	NM_001136154 NM_001136155 NM_001243428 NM_001243429 NM_001243432 NM_001243433 NM_001291391 NM_004449 NM_182918 NM_001331025	NM_133659 NM_001302152 NM_001302153 NM_001302154 NM_001302179 NM_001302183
RefSeq (белок)	NP_001129626 NP_001129627 NP_001230357 NP_001230358 NP_001230361 NP_001278320 NP_001317954 NP_004440 NP_891548	NP_001289081 NP_001289082 NP_001289083 NP_001289108 NP_001289112 NP_598420
Расположение (UCSC)	Chr 21: 38.38 - 38.66 Мб	Chr 16: 95.36 - 95.59 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ЭРГ (ETS-родственный ген) является онкоген.^[5][6][7] ERG является членом ETS (специфичное для трансформации эритробластов) семейство факторов транскрипции.^[8] В ЭРГ Ген кодирует белок, также называемый ERG, который функционирует как регулятор транскрипции. Гены семейства ETS регулируют эмбриональное развитие, распространение клеток, дифференциация, ангиогенез, воспаление, и апоптоз.

Функция

Регулятор транскрипции ERG - это ядерный белок, который связывает пурин -богатые последовательности ДНК.^[9][10] Регулятор транскрипции ERG необходим для адгезия тромбоцитов к субэндотелий и регулирует кроветворение. Оно имеет ДНК-связывающий домен и PNT (заостренный) домен.^[8] ERG экспрессируется на более высоких уровнях в раннем миелоциты чем в зрелом лимфоциты (типы белые кровяные клетки ). Следовательно, ERG может действовать как регулятор дифференцировки ранних гемопоэтических клеток.^[11]

Мутация Mld2, полученная при скрининге мутагенеза ENU, была первым нефункциональным аллелем Эрг. Гомозиготный Mld2 является эмбриональным летальным на 13.5 день. Взрослые мыши, гетерозиготные по мутации Mld2, имеют дефекты гемопоэтических стволовых клеток.^[12] Это означает, что, когда ген ERG не транскрибировался активно и не продуцировался белок ERG, гемопоэтические клетки мыши не могли нормально функционировать. Поскольку ERG важен для способности гемопоэтических клеток функционировать и самообновляться, могут быть применения в использовании стволовых клеток крови для восстановления тканей, трансплантации и других терапевтических применений.^[13]

Рак

Этот ген можно классифицировать как протоонкоген. Во время хромосомных транслокаций, которые происходят при делении клеток, ЭРГ может случайно застрять на хромосоме, отличной от той, на которой она принадлежит. Это аналогично другой транслокации, Филадельфийская хромосома. Это приводит к образованию продуктов слияния генов, что может иметь плохие последствия для клеток. Примерами этих продуктов гибридного гена могут быть TMPRSS2-ERG и NDRG1-ERG при раке простаты, EWS-ERG при саркоме Юинга и FUS-ERG при остром миелоидном лейкозе.^[14] ДНК-связывающий белок ERG сливается с РНК-связывающими белками EWS и TLS /FUS в саркома Юинга и острые миелоидные лейкозы соответственно и действуют как активаторы транскрипции.^[15][16] ERG и его слитые белки EWS-ERG и TLS / FUS-ERG ингибируют апоптоз.^[17] Морфолино олигонуклеотиды с переключением сплайсинга были использованы для индукции пропуска экзона 4 в рак простаты клеточные линии, мышиные модели и ткани эксплантаты, что приводит к противораковым эффектам, включая снижение пролиферации и индукцию апоптоза.^[18]

Слияние гена TMPRSS2

ЭРГ может сливаться с TMPRSS2 белок с образованием онкогенного ген слияния который обычно встречается при раке простаты человека, особенно гормонорезистентный рак простаты. Это говорит о том, что ЭРГ сверхэкспрессия может способствовать развитию андрогенной независимости при раке простаты за счет нарушения рецептор андрогенов сигнализация.^[19] Ген слияния имеет решающее значение для прогрессирования рака, поскольку он подавляет экспрессию рецепторов андрогенов, а также связывает и подавляет рецепторы андрогенов, уже присутствующие в клетке. По сути, слияние TMPRSS2-ERG нарушает способность клеток дифференцироваться в правильные клетки простаты, создавая нерегулируемую и неорганизованную ткань.^[19] В 90% случаев рака простаты со сверхэкспрессией ERG они также обладают слитым белком TMPRSS2-ERG, что позволяет предположить, что это слияние является преобладающим подтипом рака простаты.^[20]

Слияние генов EWS

Саркома Юинга связана с хромосомными транслокациями, что обычно приводит к слиянию генов с регуляторами транскрипции. Это означает, что белок, транскрибируемый геном, может продуцироваться в избытке или недостаточно продуцироваться, что приводит к неестественной активности клеток. Обычно это первый шаг на пути клетки к злокачественному новообразованию. Примерно в 10% случаев саркомы Юинга происходит слияние EWS1-ERG.^[8]

Слияние с TLS / FUS

В острый миелоидный лейкоз транслокация t (16; 21) при миелоидном лейкозе сливает TLS / FUS с ERG, что нарушает естественный домен связывания TLS / FUS РНК, и вместо этого вставляет домен связывания ДНК ERG.^[21]

Расположение

ЭРГ находится на 21 хромосоме.^[6] Белок ERG экспрессируется на одинаковом уровне во всем организме.^[8]

Взаимодействия

ЭРГ был показан взаимодействовать с участием:

• C-июн,^[22]
• ETS2,^[23]
• EWSR1,^[15]
• TLS,^[16] и
• TMPRSS2.^[19]
• USP9X.^[24]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000157554 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040732 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Редди Е.С., Рао В.Н., Папас Т.С. (сентябрь 1987 г.). «Ген erg: человеческий ген, связанный с онкогеном ets». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 84 (17): 6131–5. Bibcode:1987PNAS ... 84.6131R. Дои:10.1073 / пнас.84.17.6131. ЧВК  299022. PMID  3476934.
6. Рао В.Н., Папас Т.С., Редди Е.С. (август 1987 г.). "erg, человеческий ген, связанный с ets, на хромосоме 21: альтернативный сплайсинг, полиаденилирование и трансляция". Наука. 237 (4815): 635–9. Bibcode:1987Научный ... 237..635R. Дои:10.1126 / science.3299708. PMID  3299708.
7. Рао В.Н., Моди В.С., Драбкин HD, Паттерсон Д., О'Брайен С.Дж., Папас Т.С., Редди Е.С. (ноябрь 1988 г.). «Ген erg человека отображается на хромосоме 21, полоса q22: связь с транслокацией 8; 21 острого миелогенного лейкоза». Онкоген. 3 (5): 497–500. PMID  3274086.
8. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/2078
9. Редди Э.С., Рао В.Н. (декабрь 1991 г.). «erg, ген, связанный с ets, кодирует специфичные для последовательности активаторы транскрипции». Онкоген. 6 (12): 2285–9. PMID  1766675.
10. Сиддик Х. Р., Рао В. Н., Ли Л., Редди Е. С. (июль 1993 г.). «Характеристика доменов связывания ДНК и активации транскрипции белка erg». Онкоген. 8 (7): 1751–5. PMID  8510921.
11. Мураками К., Мавроталасситис Дж., Бхат Н.К., Фишер Р.Дж., Папас Т.С. (июнь 1993 г.). «Человеческий белок ERG-2 представляет собой фосфорилированный ДНК-связывающий белок - отдельный член семейства ets». Онкоген. 8 (6): 1559–66. PMID  8502479.
12. Loughran SJ, Kruse EA, Hacking DF, de Graaf CA, Hyland CD, Willson TA, Henley KJ, Ellis S, Voss AK, Metcalf D, Hilton DJ, Alexander WS, Kile BT (июль 2008 г.). «Фактор транскрипции Erg необходим для дефинитивного гемопоэза и функции взрослых гемопоэтических стволовых клеток». Иммунология природы. 9 (7): 810–9. Дои:10.1038 / ni.1617. PMID  18500345. S2CID  205361508.
13. Тауди С., Би Т, Хилтон А., Кнежевич К., Скотт Дж., Уилсон Т.А., Коллин С., Томас Т., Восс А.К., Кайл Б.Т., Александр В.С., Пиманда Дж.Э., Hilton DJ (февраль 2011 г.). «Зависимость от ЭРГ отличает контроль за развитием гемопоэтических стволовых клеток от гемопоэтических характеристик». Гены и развитие. 25 (3): 251–62. Дои:10.1101 / gad.2009211. ЧВК  3034900. PMID  21245161.
14. «Генные карты».
15. Оно Т., Оучида М., Ли Л., Гаталика З., Рао В. Н., Редди Е. С. (октябрь 1994 г.). «Ген EWS, связанный с опухолями семейства Юинга, злокачественной меланомой мягких частей тела и десмопластическими мелкоклеточными опухолями, кодирует РНК-связывающий белок с новыми регуляторными доменами». Онкоген. 9 (10): 3087–97. PMID  8084618.
16. Прасад Д.Д., Оучида М., Ли Л., Рао В.Н., Редди Е.С. (декабрь 1994 г.). «Слитый домен TLS / FUS химерного белка TLS / FUS-erg, возникающий в результате хромосомной транслокации t (16; 21) при миелоидном лейкозе человека, функционирует как домен активации транскрипции». Онкоген. 9 (12): 3717–29. PMID  7970732.
17. Йи Х., Фуджимура Й., Оучида М., Прасад Д.Д., Рао В.Н., Редди Е.С. (март 1997 г.). «Ингибирование апоптоза нормальными и аберрантными белками Fli-1 и erg, участвующими в солидных опухолях и лейкозах человека». Онкоген. 14 (11): 1259–68. Дои:10.1038 / sj.onc.1201099. PMID  9178886.
18. Ли Л., Хобсон Л., Перри Л., Кларк Б., Хиви С., Хайдер А. и др. (2020-06-25). «Нацеливание на онкоген ERG с помощью олигонуклеотидов, переключающих сплайсинг, как новая терапевтическая стратегия при раке простаты». Британский журнал рака. 123 (6): 1024–1032. Дои:10.1038 / s41416-020-0951-2. ЧВК  7493922. PMID  32581342. S2CID  220049871.
19. Yu J, Yu J, Mani RS, Cao Q, Brenner CJ, Cao X, Wang X, Wu L, Li J, Hu M, Gong Y, Cheng H, Laxman B, Vellaichamy A, Shankar S, Li Y, Dhanasekaran SM , Мори Р., Барретт Т., Лонигро Р.Дж., Томлинс С.А., Варамбалли С., Цинь З.С., Чиннайян А.М. (май 2010 г.). «Интегрированная сеть слияния генов рецептора андрогена, поликомб и TMPRSS2-ERG при прогрессировании рака простаты». Раковая клетка. 17 (5): 443–54. Дои:10.1016 / j.ccr.2010.03.018. ЧВК  2874722. PMID  20478527.
20. Томлинс С.А., Лаксман Б., Варамбалли С., Цао Х, Ю Дж., Хельгесон Б.Э., Цао К., Пренснер Дж.Р., Рубин М.А., Шах РБ, Мехра Р., Чиннайян А.М. (2008). «Роль слияния генов TMPRSS2-ERG при раке простаты». Неоплазия. 10 (2): 177–88. Дои:10.1593 / neo.07822. ЧВК  2244693. PMID  18283340.
21. Итикава Х., Симидзу К., Хаяси Й., Оки М. (июнь 1994 г.). «Ген РНК-связывающего белка, TLS / FUS, слит с ERG при миелоидном лейкозе человека с хромосомной транслокацией t (16; 21)». Исследования рака. 54 (11): 2865–8. PMID  8187069.
22. Verger A, Buisine E, Carrère S, Wintjens R, Flourens A, Coll J, Stéhelin D, Duterque-Coquillaud M (май 2001 г.). «Идентификация аминокислотных остатков фактора транскрипции ETS Erg, которые опосредуют образование тройного комплекса Erg-Jun / Fos-ДНК» (PDF). Журнал биологической химии. 276 (20): 17181–9. Дои:10.1074 / jbc.M010208200. PMID  11278640. S2CID  32288807.
23. Basuyaux JP, Ferreira E, Stéhelin D, Butticè G (октябрь 1997 г.). «Факторы транскрипции Ets взаимодействуют друг с другом и с комплексом c-Fos / c-Jun через отдельные белковые домены ДНК-зависимым и независимым образом». Журнал биологической химии. 272 (42): 26188–95. Дои:10.1074 / jbc.272.42.26188. PMID  9334186.
24. Wang S, Kollipara R, Srivastava N, Li R, Ravindranathan P, Hernandez E, Freeman E, Humphries C, Kapur P, Lotan Y, Fazli L, Gleave M, Plymate S, Raj G, Hsieh J, Kittler R (март 2014 г.) ). «Удаление онкогенного фактора транскрипции ERG путем ингибирования деубиквитиназы при раке простаты». Proc Natl Acad Sci USA. 111 (11): 4251–56. Bibcode:2014PNAS..111.4251W. Дои:10.1073 / pnas.1322198111. ЧВК  3964108. PMID  24591637.

дальнейшее чтение

• Йи Х., Фуджимура Й., Оучида М., Прасад Д.Д., Рао В.Н., Редди Е.С. (март 1997 г.). «Ингибирование апоптоза нормальными и аберрантными белками Fli-1 и erg, участвующими в солидных опухолях и лейкозах человека». Онкоген. 14 (11): 1259–68. Дои:10.1038 / sj.onc.1201099. PMID  9178886.
• Рао В.Н., Папас Т.С., Редди Е.С. (август 1987 г.). "erg, человеческий ген, связанный с ets, на хромосоме 21: альтернативный сплайсинг, полиаденилирование и трансляция". Наука. 237 (4815): 635–9. Bibcode:1987Научный ... 237..635R. Дои:10.1126 / science.3299708. PMID  3299708.
• Джованнини М., Бигель Дж. А., Серра М., Ван Дж. Й., Вей Ю. Х., Найкум Л., Эмануэль Б. С., Эванс Г. А. (август 1994 г.). «Транскрипты слияния EWS-erg и EWS-Fli1 в саркоме Юинга и примитивных нейроэктодермальных опухолях с вариантными транслокациями». Журнал клинических исследований. 94 (2): 489–96. Дои:10.1172 / JCI117360. ЧВК  295111. PMID  8040301.
• Данн Т., Прайссман Л., Хагаг Н., Виола М.В. (август 1994 г.). «Ген ERG перемещен в клеточную линию саркомы Юинга». Генетика и цитогенетика рака. 76 (1): 19–22. Дои:10.1016/0165-4608(94)90063-9. PMID  8076344.
• Итикава Х., Симидзу К., Хаяси Й., Оки М. (июнь 1994 г.). «Ген РНК-связывающего белка, TLS / FUS, слит с ERG при миелоидном лейкозе человека с хромосомной транслокацией t (16; 21)». Исследования рака. 54 (11): 2865–8. PMID  8187069.
• Прасад Д.Д., Рао В.Н., Ли Л., Редди Е.С. (февраль 1994 г.). «Продукт дифференцированного сплайсинга erg-3 действует как активатор транскрипции». Онкоген. 9 (2): 669–73. PMID  8290279.
• Duterque-Coquillaud M, Niel C, Plaza S, Stehelin D (июль 1993 г.). «Новые изоформы эрг человека, полученные путем альтернативного сплайсинга, являются активаторами транскрипции». Онкоген. 8 (7): 1865–73. PMID  8510931.
• Basuyaux JP, Ferreira E, Stéhelin D, Butticè G (октябрь 1997 г.). «Факторы транскрипции Ets взаимодействуют друг с другом и с комплексом c-Fos / c-Jun через отдельные белковые домены ДНК-зависимым и независимым образом». Журнал биологической химии. 272 (42): 26188–95. Дои:10.1074 / jbc.272.42.26188. PMID  9334186.
• Carrère S, Verger A, Flourens A, Stehelin D, Duterque-Coquillaud M (июнь 1998 г.). «Белки Erg, факторы транскрипции семейства Ets, образуют гомо, гетеродимеры и тройные комплексы через два различных домена». Онкоген. 16 (25): 3261–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1201868. PMID  9681824.
• Маклафлин Ф., Ладбрук В.Дж., Кола I, Кэмпбелл С.Дж., Рэнди А.М. (декабрь 1999 г.). «Характеристика элементов ответа фактора некроза опухоли (TNF) - (альфа) в промоторе человеческого ICAM-2». Журнал клеточной науки. 112 (24): 4695–703. PMID  10574717.
• Мастранжело Т., Модена П., Торниелли С., Буллрих Ф., Тести М.А., Меззелани А., Радис П., Аззарелли А., Пилотти С., Кроче С.М., Пьеротти М.А., Соцци Г. (август 2000 г.). «Новый ген цинкового пальца слит с EWS в небольшой круглоклеточной опухоли». Онкоген. 19 (33): 3799–804. Дои:10.1038 / sj.onc.1203762. PMID  10949935.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Verger A, Buisine E, Carrère S, Wintjens R, Flourens A, Coll J, Stéhelin D, Duterque-Coquillaud M (май 2001 г.). «Идентификация аминокислотных остатков фактора транскрипции ETS Erg, которые опосредуют образование тройного комплекса Erg-Jun / Fos-ДНК» (PDF). Журнал биологической химии. 276 (20): 17181–9. Дои:10.1074 / jbc.M010208200. PMID  11278640. S2CID  32288807.
• Ян Л., Ся Л., Ву Д.Й., Ван Х, Чански Х.А., Шубах У.Х., Хикштейн Д.Д., Чжан Ю. (январь 2002 г.). «Молекулярное клонирование ESET, новой гистон-H3-специфической метилтрансферазы, которая взаимодействует с фактором транскрипции ERG». Онкоген. 21 (1): 148–52. Дои:10.1038 / sj.onc.1204998. PMID  11791185.
• Mackereth CD, Schärpf M, Gentile LN, McIntosh LP (сентябрь 2002 г.). «Химический сдвиг и сохранение вторичной структуры доменов PNT / SAM из семейства транскрипционных факторов ets». Журнал биомолекулярного ЯМР. 24 (1): 71–2. Дои:10.1023 / А: 1020617426325. PMID  12449421. S2CID  80867076.
• Мацуи Ю., Чански Х.А., Барахманд-Пур Ф., Зелинска-Квятковска А., Цумаки Н., Мьюи А., Йошикава Х., Ян Л., Эйр Д. Р. (март 2003 г.). «Транскрипция гена коллагена COL11A2 по-разному регулируется гибридным белком саркомы EWS / ERG и ERG дикого типа». Журнал биологической химии. 278 (13): 11369–75. Дои:10.1074 / jbc.M300164200. PMID  12554743.

внешние ссылки

• ERG + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.