GTF2E1 - GTF2E1

GTF2E1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1VD4, 2JTX, 2RNQ, 2RNR, 5IY9, 5IYC, 5IYD, 5IY7, 5IYA, 5IY6, 5IYB, 5IY8
Идентификаторы
Псевдонимы	GTF2E1, FE, TF2E1, TFIIE-A, субъединица 1 общего фактора транскрипции IIE
Внешние идентификаторы	OMIM: 189962 MGI: 1921447 ГомолоГен: 38062 Генные карты: GTF2E1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q13.33 Начинать 120,742,637 бп[1] Конец 120,783,069 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 16 (мышь)[2] Группа 16 | 16 B3 Начинать 37,509,790 бп[2] Конец 37,539,789 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • последовательное связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание ядра РНК-полимеразы II • Связывание фактора транскрипции класса TFIIH • GO: 0000983 Активность общего фактора инициации транскрипции РНК-полимеразы II Сотовый компонент • ядро клетки • нуклеоплазма • комплекс фактора транскрипции TFIID • цитозоль • транскрипционный преинициационный комплекс • комплекс фактора транскрипции TFIIE Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция мяРНК с промотора РНК-полимеразы II • GO: 0022415 вирусный процесс • образование открытого транскрипционного комплекса на промоторе РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2960	74197
Ансамбль	ENSG00000153767	ENSMUSG00000022828
UniProt	P29083	Q9D0D5
RefSeq (мРНК)	NM_005513	NM_028812 NM_001355727
RefSeq (белок)	NP_005504	NP_083088 NP_001342656
Расположение (UCSC)	Chr 3: 120,74 - 120,78 Мб	Chr 16: 37,51 - 37,54 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица 1 общего транскрипционного фактора IIE (GTF2E1), также известный как фактор инициации транскрипции IIE субъединица альфа (TFIIE-альфа), является белок что у людей кодируется GTF2E1 ген.^[5]

Смотрите также

• Фактор транскрипции II E

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000153767 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000022828 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Энтреза: общий фактор транскрипции IIE».

дальнейшее чтение

• Jeronimo C, Forget D, Bouchard A, Li Q, Chua G, Poitras C, Thérien C, Bergeron D, Bourassa S, Greenblatt J, Chabot B, Poirier GG, Hughes TR, Blanchette M, Price DH, Coulombe B (июль 2007 г. ). «Систематический анализ сети взаимодействия белков для человеческого аппарата транскрипции раскрывает идентичность кэпирующего фермента 7SK». Молекулярная клетка. 27 (2): 262–74. Дои:10.1016 / j.molcel.2007.06.027. ЧВК  4498903. PMID  17643375.
• Langelier MF, Forget D, Rojas A, Porlier Y, Burton ZF, Coulombe B (октябрь 2001 г.). «Структурные и функциональные взаимодействия фактора транскрипции (TF) IIA с TFIIE и TFIIF в инициации транскрипции с помощью РНК-полимеразы II». Журнал биологической химии. 276 (42): 38652–7. Дои:10.1074 / jbc.M106422200. ЧВК  4492724. PMID  11509574.
• Вега А., Салас А., Милн Р.Л., Карраседо Б., Рибас Дж., Руибал А., де Леон А.С., Гонсалес-Эрнандес А., Бенитес Дж., Карраседо А. (январь 2009 г.). «Оценка новых SNP-кандидатов как факторов риска с низкой пенетрантностью при спорадическом раке груди: двухэтапное испанское исследование методом случай-контроль». Гинекологическая онкология. 112 (1): 210–4. Дои:10.1016 / j.ygyno.2008.09.012. PMID  18950845.
• Ямамото С., Ватанабе И, ван дер Спек П.Дж., Ватанабе Т., Фудзимото Х., Ханаока Ф., Окума Й. (январь 2001 г.). «Исследования функции нематод TFIIE показывают связь между фосфорилированием Ser-5 РНК-полимеразы II и переходом от инициации транскрипции к элонгации». Молекулярная и клеточная биология. 21 (1): 1–15. Дои:10.1128 / MCB.21.1.1-15.2001. ЧВК  86563. PMID  11113176.
• Ватанабэ Т., Хаяси К., Танака А., Фурумото Т., Ханаока Ф., Окума Ю. (апрель 2003 г.). «Карбокси-конец малой субъединицы TFIIE регулирует переход от инициации транскрипции к удлинению с помощью РНК-полимеразы II». Молекулярная и клеточная биология. 23 (8): 2914–26. Дои:10.1128 / mcb.23.8.2914-2926.2003. ЧВК  152561. PMID  12665589.
• Джавхари А., Уринг М., Де Карло С., Распятие С., Токкини-Валентини Г., Морас Д., Шульц П., Потерсман А. (май 2006 г.). «Структура и олигомерное состояние человеческого фактора транскрипции TFIIE». Отчеты EMBO. 7 (5): 500–5. Дои:10.1038 / sj.embor.7400663. ЧВК  1479554. PMID  16547462.
• Орфаниды Г., Лагранж Т., Рейнберг Д. (ноябрь 1996 г.). «Общие факторы транскрипции РНК-полимеразы II». Гены и развитие. 10 (21): 2657–83. Дои:10.1101 / gad.10.21.2657. PMID  8946909.
• Кимура К., Вакамацу А., Судзуки И., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Й, Ирие Р, Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (январь 2006 г. ). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геномные исследования. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Аршамбо Дж., Пан Дж., Дахмус Г.К., Картье М., Маршалл Н., Чжан С., Дахмус М.Э., Гринблатт Дж. (Октябрь 1998 г.). «FCP1, RAP74-взаимодействующая субъединица протеинфосфатазы человека, которая дефосфорилирует карбоксиконцевой домен РНК-полимеразы IIO». Журнал биологической химии. 273 (42): 27593–601. Дои:10.1074 / jbc.273.42.27593. PMID  9765293.
• Ким Т.К., Эбрайт Р.Х., Рейнберг Д. (май 2000 г.). «Механизм плавления АТФ-зависимого промотора под действием фактора транскрипции IIH». Наука. 288 (5470): 1418–22. Bibcode:2000Sci ... 288.1418K. Дои:10.1126 / science.288.5470.1418. PMID  10827951.
• Ikeda K, Halle JP, Stelzer G, Meisterernst M, Kawakami K (январь 1998 г.). «Участие отрицательного кофактора NC2 в активной репрессии фактором транскрипции гомеодомена цинкового пальца AREB6». Молекулярная и клеточная биология. 18 (1): 10–8. Дои:10.1128 / mcb.18.1.10. ЧВК  121442. PMID  9418848.
• Ю X, Ли П., Рёдер Р. Г., Ван З. (июль 2001 г.). «Ингибирование транскрипции, опосредованной рецептором андрогенов, с помощью аминоконцевого усилителя расщепления». Молекулярная и клеточная биология. 21 (14): 4614–25. Дои:10.1128 / MCB.21.14.4614-4625.2001. ЧВК  87125. PMID  11416139.
• Ди Лелло П., Миллер Дженкинс Л.М., Мас С., Ланглуа С., Малицкая Е., Фраде-Тюркотт А., Аршамбо Дж., Лего П., Омичински Дж. Г. (январь 2008 г.). «p53 и TFIIEalpha имеют общий сайт связывания на субъединице Tfb1 / p62 TFIIH». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 105 (1): 106–11. Bibcode:2008ПНАС..105..106Д. Дои:10.1073 / pnas.0707892105. ЧВК  2224167. PMID  18160537.
• Лю Л., Исихара К., Ичимура Т., Фудзита Н., Хино С., Томита С., Ватанабе С., Сайто Н., Ито Т., Накао М. (февраль 2009 г.). «MCAF1 / AM участвует в Sp1-опосредованном поддержании активности теломеразы, связанной с раком». Журнал биологической химии. 284 (8): 5165–74. Дои:10.1074 / jbc.M807098200. PMID  19106100.
• Окамото Т., Ямамото С., Ватанабэ Ю., Охта Т., Ханаока Ф., Рёдер Р.Г., Окума Ю. (июль 1998 г.). «Анализ роли TFIIE в регуляции транскрипции посредством структурно-функциональных исследований субъединицы TFIIEbeta». Журнал биологической химии. 273 (31): 19866–76. Дои:10.1074 / jbc.273.31.19866. PMID  9677423.
• Окуда М., Танака А., Араи Й, Сато М., Окамура Х., Нагадои А., Ханаока Ф., Окума Й., Нисимура Й. (декабрь 2004 г.). «Новая структура цинкового пальца в большой субъединице общего фактора транскрипции TFIIE человека». Журнал биологической химии. 279 (49): 51395–403. Дои:10.1074 / jbc.M404722200. PMID  15385556.
• Окуда М., Танака А., Сато М., Мизута С., Такадзава М., Окума Ю., Нисимура И. (апрель 2008 г.). «Структурное понимание взаимодействия TFIIE-TFIIH: TFIIE и p53 имеют общую область связывания на TFIIH». Журнал EMBO. 27 (7): 1161–71. Дои:10.1038 / emboj.2008.47. ЧВК  2275666. PMID  18354501.
• Fraser RA, Heard DJ, Adam S, Lavigne AC, Le Douarin B, Tora L, Losson R, Rochette-Egly C, Chambon P (июнь 1998 г.). «Предполагаемый кофактор TIF1alpha представляет собой протеинкиназу, которая гиперфосфорилируется при взаимодействии с лигандными ядерными рецепторами». Журнал биологической химии. 273 (26): 16199–204. Дои:10.1074 / jbc.273.26.16199. PMID  9632676.
• Раваси Т., Сузуки Х, Каннистрачи К.В., Катаяма С., Баджик В.Б., Тан К., Акалин А., Шмайер С., Канамори-Катаяма М., Бертин Н., Карнинчи П., Дауб КО, Форрест А.Р., Гоф Дж., Гриммонд С., Хан Дж. Хашимото Т., Хидэ В., Хофманн О., Камбуров А., Каур М., Каваджи Х., Кубосаки А., Лассманн Т., ван Нимвеген Е., Макферсон С. Р., Огава С., Радованович А., Шварц А., Тисдейл Р. Д., Тегнер Дж., Ленхард Б., Тайхманн С.А., Аракава Т., Ниномия Н., Мураками К., Тагами М., Фукуда С., Имамура К., Кай С., Исихара Р., Китадзуме И., Кавай Дж., Хьюм Д.А., Идекер Т., Хаяшизаки Ю. (март 2010 г.). «Атлас комбинаторной регуляции транскрипции у мышей и человека». Клетка. 140 (5): 744–52. Дои:10.1016 / j.cell.2010.01.044. ЧВК  2836267. PMID  20211142.