HOXB1 - HOXB1

HOXB1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1B72
Идентификаторы
Псевдонимы	HOXB1, HCFP3, HOX2, HOX2I, Hox-2.9, гомеобокс B1
Внешние идентификаторы	OMIM: 142968 MGI: 96182 ГомолоГен: 1615 Генные карты: HOXB1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 17 (человек)
Конец	48,531,011 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 11 (мышь)
Конец	96,368,256 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание ДНК; • последовательное связывание ДНК; • специфическое связывание белкового домена; • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• ядро клетки;
Биологический процесс	• развитие многоклеточного организма; • процесс спецификации шаблона; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • транскрипция, ДНК-шаблон; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • морфогенез анатомической структуры; • спецификация переднего / заднего рисунка; • развитие ромбомера; • ромбомер 4 развитие; • ромбомер 5 развитие; • структурная организация лицевого нерва; • развитие лицевого ядра; • формирование анатомической структуры, участвующее в морфогенезе; • морфогенез эмбриональной скелетной системы;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3211
	15407
	ENSG00000120094
	ENSMUSG00000018973
	P14653
	P17919
	NM_002144
	NM_008266
	NP_002135
	NP_032292
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Гомеобокс протеин Hox-B1 это белок что у людей кодируется HOXB1 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

Этот ген принадлежит к семейству генов гомеобоксов. Гены гомеобокса кодируют высококонсервативное семейство факторов транскрипции, которые играют важную роль в морфогенезе всех многоклеточных организмов. Млекопитающие обладают четырьмя схожими кластерами генов гомеобокса, HOXA, HOXB, HOXC и HOXD, расположенными на разных хромосомах, состоящих из 9-11 генов, расположенных тандемно. Этот ген является одним из нескольких гомеобоксов HOXB генов, расположенных в кластере на 17 хромосоме.^[7]

Взаимодействия

HOXB1 показал взаимодействовать с участием АТС1.^[8]^[9]

Смотрите также

Homeobox

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000120094 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018973 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ McAlpine PJ, Shows TB (август 1990). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика. 7 (3): 460. Дои:10.1016 / 0888-7543 (90) 90186-Х. PMID 1973146.
^ Скотт MP (декабрь 1992 г.). «Номенклатура генов гомеобокса позвоночных». Ячейка. 71 (4): 551–3. Дои:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.
^ ^а ^б "Entrez Gene: HOXB1 гомеобокс B1".
^ Бертельсен Дж., Заппавинья В., Ферретти Е., Мавилио Ф., Блази Ф. (март 1998 г.). «Новый гомеопротеин Prep1 модулирует кооперативность белков Pbx-Hox». EMBO J. 17 (5): 1434–45. Дои:10.1093 / emboj / 17.5.1434. ЧВК 1170491. PMID 9482740.
^ Piper DE, Batchelor AH, Chang CP, Cleary ML, Wolberger C (февраль 1999 г.). «Структура гетеродимера HoxB1-Pbx1, связанного с ДНК: роль гексапептида и четвертой гомеодоменной спирали в образовании комплекса». Ячейка. 96 (4): 587–97. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80662-5. PMID 10052460. S2CID 16122785.

дальнейшее чтение

Acampora D, D'Esposito M, Faiella A, Pannese M, Migliaccio E, Morelli F, Stornaiuolo A, Nigro V, Simeone A, Boncinelli E (1989). «Семейство генов HOX человека». Нуклеиновые кислоты Res. 17 (24): 10385–402. Дои:10.1093 / nar / 17.24.10385. ЧВК 335308. PMID 2574852.
Бончинелли Э., Акампора Д., Паннесе М., Д'Эспозито М., Сомма Р., Гаудино Дж., Сторнаиуоло А., Кафиеро М., Файелла А., Симеоне А. (1989). «Организация генов гомеобокса класса I человека». Геном. 31 (2): 745–56. Дои:10.1139 / g89-133. PMID 2576652.
Гуацци С., Лонигро Р., Пинтонелло Л., Бончинелли Э., Ди Лауро Р., Мавилио Ф. (1994). «Ген фактора транскрипции щитовидной железы-1 является кандидатом-мишенью для регуляции Hox-белками». EMBO J. 13 (14): 3339–47. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06636.x. ЧВК 395231. PMID 7913891.
Миано Дж. М., Фирулли А. Б., Олсон Э. Н., Хара П., Джачелли С. М., Шварц С. М. (1996). «Ограниченная экспрессия генов гомеобокса отличает гладкомышечные клетки плода от взрослых людей». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (2): 900–5. Bibcode:1996ПНАС ... 93..900М. Дои:10.1073 / пнас.93.2.900. ЧВК 40155. PMID 8570656.
Апиу Ф, Флагиелло Д., Силло С., Малфой Б., Поупон М. Ф., Датрилло Б. (1996). «Тонкое картирование кластеров генов HOX человека». Cytogenet. Cell Genet. 73 (1–2): 114–5. Дои:10.1159/000134320. PMID 8646877.
Бертельсен Дж., Заппавинья В., Ферретти Э., Мавилио Ф., Блази Ф. (1998). «Новый гомеопротеин Prep1 модулирует кооперативность белков Pbx-Hox». EMBO J. 17 (5): 1434–45. Дои:10.1093 / emboj / 17.5.1434. ЧВК 1170491. PMID 9482740.
Piper DE, Batchelor AH, Chang CP, Cleary ML, Wolberger C (1999). «Структура гетеродимера HoxB1-Pbx1, связанного с ДНК: роль гексапептида и четвертой гомеодоменной спирали в образовании комплекса». Ячейка. 96 (4): 587–97. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80662-5. PMID 10052460. S2CID 16122785.
Jungbluth S, Bell E, Lumsden A (1999). «Спецификация различных идентичностей моторных нейронов с помощью уникальных действий отдельных Hox-генов». Развитие. 126 (12): 2751–8. PMID 10331985.
Джейкобс Y, Шнабель CA, Клири ML (1999). «Тримерная ассоциация гомеодоменных белков Hox и TALE опосредует активность усилителя заднего мозга Hoxb2». Мол. Cell. Биол. 19 (7): 5134–42. Дои:10.1128 / mcb.19.7.5134. ЧВК 84356. PMID 10373562.
Faiella A, Zortea M, Barbaria E, Albani F, Capra V, Cama A, Boncinelli E (1998). «Генетический полиморфизм в гене гомеобокса HOXB1 человека, подразумевающий тандемный повтор длиной 9 пар оснований в кодирующей области на амино-конце. Коротко о мутациях, № 200. Online». Гм. Мутат. 12 (5): 363. PMID 10671062.
Миккола И., Бруун Дж. А., Холм Т., Йохансен Т. (2001). «Суперактивация Pax6-опосредованной трансактивации из парных сайтов связывания домена путем независимого от ДНК рекрутирования различных белков гомеодомена». J. Biol. Chem. 276 (6): 4109–18. Дои:10.1074 / jbc.M008882200. PMID 11069920.
Инграм Дж. Л., Стоджелл С. Дж., Хайман С. Л., Фиглевич Д. А., Вайткамп Л. Р., Родье П. М. (2000). «Открытие аллельных вариантов HOXA1 и HOXB1: генетическая предрасположенность к расстройствам аутистического спектра». Тератология. 62 (6): 393–405. Дои:10.1002 / 1096-9926 (200012) 62: 6 <393 :: AID-TERA6> 3.0.CO; 2-V. PMID 11091361.
Ди Рокко Г., Гавалас А., Попперл Х., Крумлауф Р., Мавилио Ф., Заппавинья В. (2001). «Привлечение комплексов SOX / OCT и дифференциальная активность HOXA1 и HOXB1 модулируют функцию ауторегулирующего энхансера Hoxb1». J. Biol. Chem. 276 (23): 20506–15. Дои:10.1074 / jbc.M011175200. PMID 11278854.
Ли Дж., Табор Х. К., Нгуен Л., Глисон С., Лотспайх Л. Дж., Спайкер Д., Риш Н., Майерс Р. М. (2002). «Отсутствие ассоциации между вариантами генов HoxA1 и HoxB1 и аутизмом в 110 мультиплексных семьях». Am. J. Med. Genet. 114 (1): 24–30. Дои:10.1002 / ajmg.1618. PMID 11840501.
Косаки К., Косаки Р., Судзуки Т., Ёсихаши Х., Такахаши Т., Сасаки К., Томита М., Макгиннис В., Мацуо Н. (2002). «Полная панель анализа мутаций 39 генов HOX человека». Тератология. 65 (2): 50–62. Дои:10.1002 / tera.10009. PMID 11857506.
Fognani C, Kilstrup-Nielsen C, Berthelsen J, Ferretti E, Zappavigna V, Blasi F (2002). «Характеристика PREP2, паралога PREP1, который определяет новое подсемейство факторов транскрипции гомеодомена MEINOX TALE». Нуклеиновые кислоты Res. 30 (9): 2043–51. Дои:10.1093 / nar / 30.9.2043. ЧВК 113854. PMID 11972344.
Субраманиам Н., Кампьон Дж, Стропила I, Окрет С. (2003). «Перекрестная связь между сигналами глюкокортикоидов и ретиноевой кислоты, включая взаимодействие рецептора глюкокортикоидов с гомеодоменным белком Pbx1». Biochem. J. 370 (Pt 3): 1087–95. Дои:10.1042 / BJ20020471. ЧВК 1223238. PMID 12487626.

внешние ссылки

HOXB1 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P14653 (Гомеобоксный белок Hox-B1) в PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

Эта статья о ген на хромосома человека 17 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000120094 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018973 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1973146-5] McAlpine PJ, Shows TB (август 1990). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика. 7 (3): 460. Дои:10.1016 / 0888-7543 (90) 90186-Х. PMID 1973146.

[pmid1358459-6] Скотт MP (декабрь 1992 г.). «Номенклатура генов гомеобокса позвоночных». Ячейка. 71 (4): 551–3. Дои:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.

[entrez-7] а ^б "Entrez Gene: HOXB1 гомеобокс B1".

[pmid9482740-8] Бертельсен Дж., Заппавинья В., Ферретти Е., Мавилио Ф., Блази Ф. (март 1998 г.). «Новый гомеопротеин Prep1 модулирует кооперативность белков Pbx-Hox». EMBO J. 17 (5): 1434–45. Дои:10.1093 / emboj / 17.5.1434. ЧВК 1170491. PMID 9482740.

[pmid10052460-9] Piper DE, Batchelor AH, Chang CP, Cleary ML, Wolberger C (февраль 1999 г.). «Структура гетеродимера HoxB1-Pbx1, связанного с ДНК: роль гексапептида и четвертой гомеодоменной спирали в образовании комплекса». Ячейка. 96 (4): 587–97. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80662-5. PMID 10052460. S2CID 16122785.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]