Матери против декапентаплегического гомолога 5 - Mothers against decapentaplegic homolog 5
SMAD5 Идентификаторы Псевдонимы SMAD5 , DWFC, JV5-1, MADH5, член семейства SMAD 5Внешние идентификаторы OMIM: 603110 MGI: 1328787 ГомолоГен: 4313 Генные карты: SMAD5 Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 B1 | 13 30,12 см Начинать 56,703,010 бп [2] Конец 56,742,377 бп [2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • связывание убиквитин-протеин-лигазы • Связывание DEAD / H-box РНК-геликазы • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • Белковый комплекс SMAD • комплекс регуляторов транскрипции • внутриклеточный • нуклеоплазма • ядро клетки • цитоплазма • цитозоль • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • развитие зародышевых клеток • развитие зачатка мочеточника • сокращение сердечной мышцы • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • Передача сигнала белка SMAD • спецификация эмбрионального паттерна • окостенение • клеточный ответ на органическое циклическое соединение • клеточный ответ на стимул BMP • BMP сигнальный путь • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • Регрессия мюллерова протока • фосфорилирование белков • развитие хряща • положительная регуляция дифференцировки остеобластов • дифференцировка эритроцитов • развитие костей • трансформирующий сигнальный путь бета-рецептора фактора роста • преобразование сигнала • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II, участвующего в клеточном ответе на химический стимул • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • обязательство судьбы остеобластов • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи Разновидность Человек Мышь Entrez Ансамбль UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (белок) Расположение (UCSC) Chr 5: 136.13 - 136.19 Мб Chr 13: 56,7 - 56,74 Мб PubMed поиск[3] [4] Викиданные
Матери против декапентаплегического гомолога 5 также известный как SMAD5 это белок что у людей кодируется SMAD5 ген .[5]
SMAD5, как следует из названия, является гомологом Дрозофила ген: "Матери против декапентаплегии ", основанный на традиции столь необычных имен в сообществе исследователей генов.[6] Он принадлежит к SMAD семейство белков, которые принадлежат к TGFβ суперсемейство модуляторов. Как и многие другие члены семейства TGFβ, SMAD5 участвует в клеточная сигнализация и модулирует сигналы костные морфогенетические белки (БМП). Связывание лигандов вызывает олигомеризация и фосфорилирование белка SMAD5. SMAD5 - это рецептор регулируемый SMAD (R-SMAD ) и активируется киназой рецептора костного морфогенетического белка типа 1. Он может играть роль в пути, в котором TGFβ является ингибитором кроветворный клетки-предшественники.
Рекомендации
^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113658 - Ансамбль , Май 2017^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021540 - Ансамбль , Май 2017^ "Справочник человека по PubMed:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .^ Риггинс Г.Дж., Тиагалингам С., Розенблюм Э., Вайнштейн К.Л., Керн С.Е., Гамильтон С.Р., Вилсон Дж. К., Марковиц С.Д., Кинзлер К.В., Фогельштейн Б. (июль 1996 г.). «Безумные гены у человека». Nat. Genet . 13 (3): 347–9. Дои :10.1038 / ng0796-347 . PMID 8673135 . S2CID 10124489 . ^ «Sonic Hedgehog, DICER и проблема с именованием генов» , 26 сентября 2014 г., Майкл Уайт. psmag.com
(2) Цинковый палец ДНК-связывающие домены
(2.1) Ядерный рецептор (Cys4 )
подсемейство 1 подсемейство 2 подсемейство 3 подсемейство 4 подсемейство 5 подсемейство 6 подсемейство 0
(2.2) Другой Cys4 (2.3) Cys2 Его2 (2.4) Cys6 (2.5) Чередующийся состав (2.6) WRKY
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(0) Другие факторы транскрипции
смотрите также дефицит фактора транскрипции / корегулятора
Тип I
ALK1 (ACVRL1 )ALK2 (ACVR1A )ALK3 (BMPR1A )ALK4 (ACVR1B )ALK5 (TGFβR1 )ALK6 (BMPR1B )Агонисты: BMP (2 , 4 , 5 , 6 , 7 , 8A , 8B , 15 (GDF9B) )Диботермин альфа Эптотермин альфа GDF (5 (БМП14) , 6 (БМП13) , 7 (BMP12) , 9 , 15 )Radotermin ALK7 (ACVR1C )
Тип II
TGFβR2 BMPR2 ACVR2A (ACVR2 )Агонисты: Активин (А , B , AB )BMP (2 , 4 , 5 , 6 , 7 , 8A , 8B , 15 (GDF9B) )Диботермин альфа Эптотермин альфа GDF (1 , 3 , 5 (БМП14) , 6 (БМП13) , 7 (BMP12) , 9 , 11 (БМП11) , 15 )Миостатин (GDF8) Узловой Radotermin ACVR2B Агонисты: Активин (А , B , AB )BMP (2 , 4 , 6 , 7 )Диботермин альфа Эптотермин альфа GDF (1 , 3 , 5 (БМП14) , 6 (БМП13) , 7 (BMP12) )Миостатин (GDF8) Узловой Остеогенин (BMP3, BMP3A) Radotermin AMHR2 (AMHR )
Тип III
Несортированный Смотрите также Рецепторные / сигнальные модуляторы Модуляторы сигнальных пептидов / белковых рецепторов Модуляторы рецепторов факторов роста Модуляторы цитокиновых рецепторов