HOXA3 - HOXA3

HOXA3
Идентификаторы
Псевдонимы	HOXA3, HOX1, HOX1E, гомеобокс A3
Внешние идентификаторы	OMIM: 142954 MGI: 96175 ГомолоГен: 40725 Генные карты: HOXA3
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 7 (человек)
Конец	27,152,581 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 6 (мышь)
Конец	52,213,336 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• последовательное связывание ДНК; • Связывание ДНК; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • Привязка коробочного домена HMG; • GO: 0001948 связывание с белками; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• нуклеоплазма; • ядро клетки;
Биологический процесс	• морфогенез эмбриональной скелетной системы; • морфогенез языкоглоточного нерва; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • развитие тимуса; • транскрипция, ДНК-шаблон; • развитие эмбриональной скелетной системы; • развитие многоклеточного организма; • формирование органов животных; • ремоделирование кровеносных сосудов; • развитие щитовидной железы; • развитие хряща; • развитие паращитовидных желез; • ангиогенез; • положительное регулирование пролиферации клеток; • морфогенез органов животных; • определение положения органов животного; • спецификация переднего / заднего рисунка; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • транспорт ионов кальция; • экспрессия гена; • гомеостаз ионов магния; • минерализация костей; • отрицательная регуляция транспорта ионов кальция; • фосфат-ионный гомеостаз; • гомеостаз ионов кальция; • положительное регулирование связывания рецепторов; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3200
	15400
	ENSG00000105997
	ENSMUSG00000079560
	O43365
	P02831
	NM_030661; NM_153631; NM_153632
	NM_010452
	NP_109377; NP_705895
	NP_034582
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Homeobox протеин Hox-A3 это белок что у людей кодируется HOXA3 ген.^[5]^[6]^[7]

Функция

У позвоночных гены, кодирующие класс факторов транскрипции, называемых генами гомеобокса, находятся в кластерах с названиями A, B, C и D на четырех отдельных хромосомах. Экспрессия этих белков регулируется пространственно и временно во время эмбрионального развития. Этот ген является частью кластера А на хромосоме 7 и кодирует ДНК-связывающий фактор транскрипции, который может регулировать экспрессию генов, морфогенез и дифференцировку. Для этого гена были обнаружены три варианта транскрипта, кодирующие две разные изоформы.^[7]

Во время нормального развития плода HoxA3 экспрессируется в мезенхимальных клетках нервного гребня и энтодермальных клетках, обнаруженных в третьем глоточном кармане.^[8] Экспрессия HoxA3 в этих клетках влияет на правильное формирование тимуса, щитовидной железы и органов паращитовидной железы.^[9]^[10] Хотя этот ген, по-видимому, не влияет на пролиферацию или миграцию клеток нервного гребня глотки, он, похоже, запускает события клеточной дифференцировки, необходимые для формирования этих органов.^[9] Нокаут HoxA3 приводит к нарушению формирования тимуса (атимия) и паращитовидной железы (апартироидизм).^[10] Мутант HoxA3 также вызывает уменьшение размеров щитовидной железы. Хотя фолликулярные и парафолликулярные клетки все еще дифференцируются, их количество уменьшается, и они неравномерно распределяются по железе.^[9] Мутантные модели HoxA3 демонстрируют фенотипы, сходные с фенотипами, наблюдаемыми при синдроме ДиДжорджи, и, возможно, они связаны.^[9]

Регулирование

Ген HOXA3 - это подавленный посредством микроРНК miR-10a.^[11]

Смотрите также

Homeobox

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105997 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000079560 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ McAlpine PJ, Shows TB (июль 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика. 7 (3): 460. Дои:10.1016 / 0888-7543 (90) 90186-Х. PMID 1973146.
^ Скотт MP (ноябрь 1992 г.). «Номенклатура генов гомеобокса позвоночных». Ячейка. 71 (4): 551–3. Дои:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.
^ ^а ^б "Entrez Gene: HOXA3 homeobox A3".
^ Хант П., Гулисано М., Кук М., Шам М. Х., Файелла А., Уилкинсон Д., Бончинелли Е., Крумлауф Р. (октябрь 1991 г.). «Отчетливый Hox-код для жаберной области головы позвоночного». Природа. 353 (6347): 861–4. Bibcode:1991Натура.353..861H. Дои:10.1038 / 353861a0. PMID 1682814. S2CID 4312466.
^ ^а ^б ^c ^d Мэнли Н.Р., Капеччи М.Р. (июль 1995 г.). «Роль Hoxa-3 в развитии тимуса и щитовидной железы мышей». Разработка. 121 (7): 1989–2003. PMID 7635047.
^ ^а ^б Chojnowski JL, Masuda K, Trau HA, Thomas K, Capecchi M, Manley NR (октябрь 2014 г.). «Множественные роли HOXA3 в регулировании дифференцировки и морфогенеза тимуса и паращитовидных желез у мышей». Разработка. 141 (19): 3697–708. Дои:10.1242 / dev.110833. ЧВК 4197593. PMID 25249461.
^ Хан Л., Уитмер П.Д., Кейси Э., Валле Д., Сукумар С. (август 2007 г.). «Метилирование ДНК регулирует экспрессию MicroRNA». Биология и терапия рака. 6 (8): 1284–8. Дои:10.4161 / cbt.6.8.4486. PMID 17660710.

дальнейшее чтение

Апиу Ф, Флагиелло Д., Силло С., Малфой Б., Поупон М. Ф., Датрилло Б. (1996). «Тонкое картирование кластеров генов HOX человека». Цитогенетика и клеточная генетика. 73 (1–2): 114–5. Дои:10.1159/000134320. PMID 8646877.
Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID 8889548.
Мэнли Н.Р., Капеччи М.Р. (март 1998 г.). «Паралоги Hox группы 3 регулируют развитие и миграцию тимуса, щитовидной и паращитовидных желез». Биология развития. 195 (1): 1–15. Дои:10.1006 / dbio.1997.8827. PMID 9520319.
Центр Сангера, The; Центр секвенирования генома Вашингтонского университета, The (ноябрь 1998 г.). «К полной последовательности человеческого генома». Геномные исследования. 8 (11): 1097–108. Дои:10.1101 / гр. 8.11.1097. PMID 9847074.
Малдер Г.Б., Мэнли Н., Маджо-Прайс Л. (декабрь 1998 г.). «Вызванные ретиноевой кислотой аномалии тимуса у мышей связаны с измененной морфологией глотки, дефектами созревания тимоцитов и измененной экспрессией Hoxa3 и Pax1». Тератология. 58 (6): 263–75. Дои:10.1002 / (SICI) 1096-9926 (199812) 58: 6 <263 :: AID-TERA8> 3.0.CO; 2-A. PMID 9894676.
Мансанарес М., Нарделли Дж., Джиларди-Хебенстрейт П., Маршалл Х., Джудичелли Ф., Мартинес-Пастор М. Т., Крумлауф Р., Чарней П. (февраль 2002 г.). «Krox20 и kreisler сотрудничают в транскрипционном контроле сегментарной экспрессии Hoxb3 в развивающемся заднем мозге». Журнал EMBO. 21 (3): 365–76. Дои:10.1093 / emboj / 21.3.365. ЧВК 125344. PMID 11823429.
Косаки К., Косаки Р., Сузуки Т., Ёсихаши Х., Такахаши Т., Сасаки К., Томита М., Макгиннис В., Мацуо Н. (февраль 2002 г.). «Полная панель анализа мутаций 39 генов HOX человека». Тератология. 65 (2): 50–62. Дои:10.1002 / tera.10009. PMID 11857506.
Ким Дж., Бхинг А.А., Морган XC, Айер В.Р. (январь 2005 г.). «Картирование взаимодействий ДНК-белок в больших геномах с помощью анализа последовательности тегов геномного обогащения». Природные методы. 2 (1): 47–53. Дои:10.1038 / nmeth726. PMID 15782160. S2CID 6135437.
Wissmüller S, Kosian T, Wolf M, Finzsch M, Wegner M (2006). «Домен группы с высокой подвижностью белков Sox взаимодействует с ДНК-связывающими доменами многих факторов транскрипции». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (6): 1735–44. Дои:10.1093 / нар / gkl105. ЧВК 1421504. PMID 16582099.

внешняя ссылка

HOXA3 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

Эта статья о ген на хромосома человека 7 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105997 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000079560 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1973146-5] McAlpine PJ, Shows TB (июль 1990 г.). «Номенклатура генов гомеобокса человека». Геномика. 7 (3): 460. Дои:10.1016 / 0888-7543 (90) 90186-Х. PMID 1973146.

[pmid1358459-6] Скотт MP (ноябрь 1992 г.). «Номенклатура генов гомеобокса позвоночных». Ячейка. 71 (4): 551–3. Дои:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID 1358459. S2CID 13370372.

[entrez-7] а ^б "Entrez Gene: HOXA3 homeobox A3".

[Hunt_1991-8] Хант П., Гулисано М., Кук М., Шам М. Х., Файелла А., Уилкинсон Д., Бончинелли Е., Крумлауф Р. (октябрь 1991 г.). «Отчетливый Hox-код для жаберной области головы позвоночного». Природа. 353 (6347): 861–4. Bibcode:1991Натура.353..861H. Дои:10.1038 / 353861a0. PMID 1682814. S2CID 4312466.

[Manley_1995-9] а ^б ^c ^d Мэнли Н.Р., Капеччи М.Р. (июль 1995 г.). «Роль Hoxa-3 в развитии тимуса и щитовидной железы мышей». Разработка. 121 (7): 1989–2003. PMID 7635047.

[Chojnowski_2014-10] а ^б Chojnowski JL, Masuda K, Trau HA, Thomas K, Capecchi M, Manley NR (октябрь 2014 г.). «Множественные роли HOXA3 в регулировании дифференцировки и морфогенеза тимуса и паращитовидных желез у мышей». Разработка. 141 (19): 3697–708. Дои:10.1242 / dev.110833. ЧВК 4197593. PMID 25249461.

[pmid17660710-11] Хан Л., Уитмер П.Д., Кейси Э., Валле Д., Сукумар С. (август 2007 г.). «Метилирование ДНК регулирует экспрессию MicroRNA». Биология и терапия рака. 6 (8): 1284–8. Дои:10.4161 / cbt.6.8.4486. PMID 17660710.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]