TFAP2A - TFAP2A
Фактор транскрипции AP-2 альфа (Аактивация связывания энхансера пRotein 2 альфа), также известный как TFAP2A, это белок что у людей кодируется TFAP2A ген.[5]
Функция
Альфа-белок AP-2 действует как специфичный для последовательности ДНК-связывающий фактор транскрипции распознавание и связывание с конкретной последовательностью ДНК и рекрутирование аппарата транскрипции. Его сайт связывания представляет собой GC-богатую последовательность, которая присутствует в цис-регуляторный области нескольких вирусных и клеточных генов.[6] AP2-alpha - 52 кДа ретиноевая кислота -индуцибельный и регулируемый в процессе развития активатор транскрипции, который связывается с консенсусной ДНК-связывающей последовательностью GCCNNNGGC в SV40 и металлотионеин промоутеры.[5]
AP-2 альфа выражается в нервный гребень клеточные клоны с наивысшими уровнями экспрессии, соответствующими ранним клеткам нервного гребня, предполагая, что AP-2 альфа играет роль в их дифференцировке и развитии. Фактор транскрипции AP-2 альфа выражается в эктодерма и в клетках нервного гребня, мигрирующих из черепных складок во время закрытия нервной трубки у мышей. Клетка черепного нервного гребня обеспечивает узор информация для черепно-лицевой морфогенез и генерируют большую часть костей черепа и черепные ганглии.[6][7][8][9]
АП-2 альфа нокаутные мыши умереть перинатально с кранио-абдоминошизис и тяжелый дисморфогенез лица, черепа, органов чувств и черепных ганглиев.[10] Гомозиготный Нокаутные мыши также имеют дефекты нервной трубки, за которыми следуют черепно-лицевые аномалии и аномалии стенок тела.[11] Доставка гена AP-2 альфа подавляла спонтанные кишечные полипы in vivo у мышей Apc (Min / +).[12] AP-2 альфа также функционирует как главный регулятор множества факторов транскрипции в печени мыши.[13]
В меланоцитарный экспрессия гена TFAP2A в клетках может регулироваться MITF.[14]
Клиническое значение
Мутации в гене TFAP2A часто вызывают бранчио-окуло-лицевой синдром со средней линией. заячья губа.[15] В семье с жаберно-окуло-лицевым синдромом (BOFS),[16] Обнаружена делеция 3,2 Mb на хромосоме 6p24.3.[17] Секвенирование генов-кандидатов в этой области у 4 дополнительных неродственных пациентов с BOFS выявило 4 различных de novo миссенс-мутации в экзонах 4 и 5 гена TFAP2A.
Нарушение сайта связывания AP-2 альфа в IRF6 энхансер связан с заячья губа.[18] Мутации в гене IRF6 вызывают Синдром Ван дер Вуда (VWS)[19] это редкое аутосомно-доминантное заболевание с менделевской расщелиной, с ямками на нижней губе у 85% больных.[20] Остальные 15% людей с синдромом Ван дер Вуде показывают только заячья губа и / или волчья пасть (CL / P) и клинически неотличимы от обычных несиндромальных CL / P. NSCL / P встречается примерно у 1/700 живорожденных и является одной из наиболее частых форм врожденных аномалий. Предыдущее исследование ассоциации между SNP в IRF6 и вокруг него и NSCL / P показало значительные результаты в разных популяциях.[21] и был независимо воспроизведен.[22][23][24][25]
Был проведен поиск случаев NSCL / P для потенциальных регуляторных элементов для гена IRF6 с выравниванием геномных последовательностей с областью 500 Кб, охватывающей IRF6 от 17 видов позвоночных. Последовательность человека в качестве эталона и поиск мультивидовых консервативных последовательностей (MCS). Области, содержащиеся в интронах 5 ’и 3’, фланкирующих IRF6, были проверены прямым секвенированием на предмет потенциальных причинных вариантов в 184 случаях NSCL / P. Редкий аллель SNP rs642961 показал значительную связь со случаями заячьей губы. Анализ сайта связывания фактора транскрипции показал, что аллель риска нарушает сайт связывания AP-2 альфа.[18]
Мутации в гене AP-2 alpha также вызывают жаберно-окуло-лицевой синдром,[17] который имеет общие черты с синдромом Ван дер Вуда, такие как орофациальная щель и случайные ямки на губах, что делает rs642961 хорошим кандидатом для этиологического варианта. Эти находки показывают, что IRF6 и AP-2 alpha находятся на одном и том же пути развития и идентифицируют вариант в регуляторной области, который вносит существенный вклад в общее комплексное расстройство.
Взаимодействия
Было показано, что TFAP2A взаимодействовать с:
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000137203 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021359 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ а б «Ген Entrez: фактор транскрипции TFAP2A AP-2 альфа (активирующий энхансер связывающий белок 2 альфа)».
- ^ а б Уильямс Т., Тьянь Р. (апрель 1991 г.). «Анализ ДНК-связывающих и активационных свойств человеческого фактора транскрипции AP-2». Гены и развитие. 5 (4): 670–82. Дои:10.1101 / gad.5.4.670. PMID 2010091.
- ^ Митчелл П.Дж., Ван С., Тьян Р. (сентябрь 1987 г.). «Положительная и отрицательная регуляция транскрипции in vitro: энхансер-связывающий белок AP-2 ингибируется Т-антигеном SV40». Клетка. 50 (6): 847–61. Дои:10.1016/0092-8674(87)90512-5. PMID 3040262. S2CID 25657738.
- ^ Уильямс Т., Адмон А., Люшер Б., Тьянь Р. (декабрь 1988 г.). «Клонирование и экспрессия AP-2, фактора транскрипции, специфичного для клеточного типа, который активирует индуцибельные энхансерные элементы». Гены и развитие. 2 (12A): 1557–69. Дои:10.1101 / gad.2.12a.1557. PMID 3063603.
- ^ Le Douarin NM, Ziller C, Couly GF (сентябрь 1993 г.). «Создание паттерна производных нервного гребня у птичьего эмбриона: исследования in vivo и in vitro». Биология развития. 159 (1): 24–49. Дои:10.1006 / dbio.1993.1219. PMID 8365563.
- ^ Schorle H, Meier P, Buchert M, Jaenisch R, Mitchell PJ (май 1996 г.). «Фактор транскрипции AP-2, необходимый для закрытия черепа и краниофациального развития». Природа. 381 (6579): 235–8. Bibcode:1996Натура.381..235S. Дои:10.1038 / 381235a0. PMID 8622765. S2CID 581362.
- ^ Zhang J, Hagopian-Donaldson S, Serbedzija G, Elsemore J, Plehn-Dujowich D, McMahon AP, Flavell RA, Williams T (май 1996 г.). «Дефекты нервной трубки, скелета и стенки тела у мышей, лишенных фактора транскрипции AP-2». Природа. 381 (6579): 238–41. Bibcode:1996Натура.381..238Z. Дои:10.1038 / 381238a0. PMID 8622766. S2CID 4367622.
- ^ Ли Кью, резюме Лера, Дэшвуд Р.Х. (сентябрь 2009 г.). «Белок-активатор 2alpha подавляет онкогенез кишечника у мышей Apc (min)». Письма о раке. 283 (1): 36–42. Дои:10.1016 / j.canlet.2009.03.026. ЧВК 2713803. PMID 19376641.
- ^ Ли Кью, Луо К., Лёр CV, Дэшвуд Р.Х. (август 2011 г.). «Белок-активатор-2α действует как главный регулятор множества факторов транскрипции в печени мыши». Гепатологические исследования. 41 (8): 776–83. Дои:10.1111 / j.1872-034X.2011.00827.x. ЧВК 4139281. PMID 21682828.
- ^ Хук К.С., Шлегель Н.С., Эйххофф О.М., Видмер Д.С., Преториус К., Эйнарссон С.О., Валгейрсдоттир С., Бергстейнсдоттир К., Щепски А., Даммер Р., Штайнгримссон Е. (декабрь 2008 г.). «Новые мишени MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов». Исследования пигментных клеток и меланомы. 21 (6): 665–76. Дои:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID 19067971. S2CID 24698373.
- ^ Диксон MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC (2011). «Расщелина губы и неба: понимание генетических влияний и факторов окружающей среды». Nature Reviews Genetics (12): 167-178.
- ^ Онлайн-менделевское наследование в человеке (OMIM): 113620
- ^ а б Милунски Дж. М., Махер Т. А., Чжао Дж., Робертс А. Е., Сталкер Х. Дж., Зори Р. Т., Берч М. Н., Клеменс М., Малликен Дж. Б., Смит Р., Лин А. Е. (май 2008 г.). «Мутации TFAP2A приводят к развитию жаберно-окуло-лицевого синдрома». Американский журнал генетики человека. 82 (5): 1171–7. Дои:10.1016 / j.ajhg.2008.03.005. ЧВК 2427243. PMID 18423521.
- ^ а б Рахимов Ф., Маразита М.Л., Визель А., Купер М.Э., Хитчлер М.Дж., Рубини М., Доманн Ф.Е., Говил М., Кристенсен К., Билле С., Мельбай М., Югессур А., Ли RT, Уилкокс А.Дж., Фицпатрик Д.Р., Грин Э.Д., Мосси П.А. , Little J, Steegers-Theunissen RP, Pennacchio LA, Schutte BC, Murray JC (ноябрь 2008 г.). «Нарушение сайта связывания AP-2alpha в энхансере IRF6 связано с заячьей губой». Природа Генетика. 40 (11): 1341–7. Дои:10,1038 / нг.242. ЧВК 2691688. PMID 18836445.
- ^ Онлайн-менделевское наследование в человеке (OMIM): 119300
- ^ Кондо С., Шютте BC, Ричардсон Р.Дж., Бьорк Б.К., Найт А.С., Ватанабе Ю., Ховард Е., де Лима Р.Л., Даак-Хирш С., Сандер А., Макдональд-Макгинн Д.М., Закай Е.Х., Ламмер Е.Дж., Эйлсворт А.С., Ардингер Х.Х., Lidral AC, Pober BR, Moreno L, Arcos-Burgos M, Valencia C, Houdayer C, Bahuau M, Moretti-Ferreira D, Richieri-Costa A, Dixon MJ, Murray JC (октябрь 2002 г.). «Мутации в IRF6 вызывают синдромы Ван дер Вуда и подколенного птеригиума». Природа Генетика. 32 (2): 285–9. Дои:10.1038 / ng985. ЧВК 3169431. PMID 12219090.
- ^ Zucchero TM, Cooper ME, Maher BS, Daack-Hirsch S, Nepomuceno B, Ribeiro L, Caprau D, Christensen K, Suzuki Y, Machida J, Natsume N, Yoshiura K, Vieira AR, Orioli IM, Castilla EE, Moreno L, Аркос-Бургос М., Лидрал А.С., Филд Л.Л., Лю Ю.Е., Рэй А, Гольдштейн Т.Х., Шульц Р.Э., Ши М., Джонсон М.К., Кондо С., Шютте BC, Маразита М.Л., Мюррей Дж.С. (август 2004 г.). «Варианты гена фактора регуляции интерферона 6 (IRF6) и риск изолированной расщелины губы или неба». Медицинский журнал Новой Англии. 351 (8): 769–80. Дои:10.1056 / NEJMoa032909. PMID 15317890.
- ^ Скаполи Л., Пальмиери А., Мартинелли М., Пеццетти Ф., Каринчи П., Тоньон М., Каринчи Ф. (январь 2005 г.). «Убедительное доказательство неравновесия по сцеплению между полиморфизмами в локусе IRF6 и несиндромной заячьей губой с волчьей пастью или без нее в итальянской популяции». Американский журнал генетики человека. 76 (1): 180–3. Дои:10.1086/427344. ЧВК 1196422. PMID 15558496.
- ^ Blanton SH, Cortez A, Stal S, Mulliken JB, Finnell RH, Hecht JT (сентябрь 2005 г.). «Вариация IRF6 способствует несиндромной расщелине губы и неба». Американский журнал медицинской генетики, часть A. 137A (3): 259–62. Дои:10.1002 / ajmg.a.30887. PMID 16096995. S2CID 25084563.
- ^ Ghassibé M, Bayet B, Revencu N, Verellen-Dumoulin C, Gillerot Y, Vanwijck R, Vikkula M (ноябрь 2005 г.). «Фактор регуляции интерферона-6: ген, предрасполагающий к изолированной заячьей губе с волчьей пастью или без нее у населения Бельгии». Европейский журнал генетики человека. 13 (11): 1239–42. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5201486. PMID 16132054.
- ^ Park JW, McIntosh I, Hetmanski JB, Jabs EW, Vander Kolk CA, Wu-Chou YH, Chen PK, Chong SS, Yeow V, Jee SH, Park BY, Fallin MD, Ingersoll R, Scott AF, Beaty TH (апрель 2007 г.) ). «Связь между IRF6 и несиндромной заячьей губой с волчьей пастью или без нее в четырех популяциях». Генетика в медицине. 9 (4): 219–27. Дои:10.1097 / GIM.0b013e3180423cca. ЧВК 2846512. PMID 17438386.
- ^ Ли Кью, Дэшвуд Р.Х. (октябрь 2004 г.). «Белок-активатор 2alpha связывается с аденоматозным полипозом coli / бета-катенином и ингибирует транскрипционную активность бета-катенина / Т-клеточного фактора в клетках колоректального рака». Журнал биологической химии. 279 (44): 45669–75. Дои:10.1074 / jbc.M405025200. ЧВК 2276578. PMID 15331612.
- ^ а б Bragança J, Eloranta JJ, Bamforth SD, Ibbitt JC, Hurst HC, Bhattacharya S (май 2003 г.). «Физические и функциональные взаимодействия между факторами транскрипции AP-2, p300 / CREB-связывающим белком и CITED2». Журнал биологической химии. 278 (18): 16021–9. Дои:10.1074 / jbc.M208144200. PMID 12586840.
- ^ Bragança J, Swingler T., Marques FI, Jones T, Eloranta JJ, Hurst HC, Shioda T., Bhattacharya S (март 2002 г.). «Человеческий CREB-связывающий белок / трансактиватор, взаимодействующий с p300 с ED-богатым хвостом (CITED) 4, новый член семейства CITED, функционирует как коактиватор для фактора транскрипции AP-2». Журнал биологической химии. 277 (10): 8559–65. Дои:10.1074 / jbc.M110850200. PMID 11744733.
- ^ Кампильос М., Гарсия М.А., Вальдивьесо Ф., Васкес Дж. (Март 2003 г.). «Активация транскрипции AP-2alpha модулируется онкогеном DEK». Исследования нуклеиновых кислот. 31 (5): 1571–5. Дои:10.1093 / нар / gkg247. ЧВК 149840. PMID 12595566.
- ^ Gaubatz S, Imhof A, Dosch R, Werner O, Mitchell P, Buettner R, Eilers M (апрель 1995 г.). «Активация транскрипции Myc находится под отрицательным контролем фактора транскрипции AP-2». Журнал EMBO. 14 (7): 1508–19. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07137.x. ЧВК 398238. PMID 7729426.
- ^ Макферсон Л.А., Локтев А.В., Вейгель Р.Дж. (ноябрь 2002 г.). «Активность AP2alpha по супрессору опухолей, опосредованная прямым взаимодействием с p53». Журнал биологической химии. 277 (47): 45028–33. Дои:10.1074 / jbc.M208924200. PMID 12226108.
дальнейшее чтение
- Мерфи Дж. Э., Кин Дж. Х. (май 1992 г.). «Сайты узнавания клатрин-ассоциированных белков AP-2 и AP-3 на трискелии клатрина». Журнал биологической химии. 267 (15): 10850–5. PMID 1587861.
- Гейнор Р. Б., Мухардт С., Ся Ю. Р., Клисак И., Мохандас Т., Спаркс Р. С., Лусис А. Дж. (Август 1991 г.). «Локализация гена ДНК-связывающего белка AP-2 на хромосоме человека 6p22.3-pter». Геномика. 10 (4): 1100–2. Дои:10.1016 / 0888-7543 (91) 90209-В. PMID 1916817.
- Уильямс Т., Тьянь Р. (март 1991 г.). «Характеристика мотива димеризации в AP-2 и его функции в гетерологичных ДНК-связывающих белках». Наука. 251 (4997): 1067–71. Bibcode:1991Sci ... 251.1067W. Дои:10.1126 / science.1998122. PMID 1998122.
- Уильямс Т., Тьянь Р. (апрель 1991 г.). «Анализ ДНК-связывающих и активационных свойств человеческого фактора транскрипции AP-2». Гены и развитие. 5 (4): 670–82. Дои:10.1101 / gad.5.4.670. PMID 2010091.
- Уильямс Т., Адмон А., Люшер Б., Тьянь Р. (декабрь 1988 г.). «Клонирование и экспрессия AP-2, фактора транскрипции, специфичного для клеточного типа, который активирует индуцибельные энхансерные элементы». Гены и развитие. 2 (12A): 1557–69. Дои:10.1101 / gad.2.12a.1557. PMID 3063603.
- Бауэр Р., Имхоф А., Пшерер А., Копп Х., Мозер М., Сигерс С., Кершер М., Тайский М.А., Хофстедтер Ф., Бюттнер Р. (апрель 1994 г.). «Геномная структура человеческого фактора транскрипции AP-2». Исследования нуклеиновых кислот. 22 (8): 1413–20. Дои:10.1093 / nar / 22.8.1413. ЧВК 307999. PMID 8190633.
- Бюттнер Р., Каннан П., Имхоф А., Бауэр Р., Йим С.О., Глоксхубер Р., Ван Дайк М.В., Тайский М.А. (июль 1993 г.). «Альтернативно сплайсированная мРНК из гена AP-2 кодирует негативный регулятор активации транскрипции AP-2». Молекулярная и клеточная биология. 13 (7): 4174–85. Дои:10.1128 / mcb.13.7.4174. ЧВК 359967. PMID 8321221.
- Уильямсон Дж. А., Бошер Дж. М., Скиннер А., Шир Д., Уильямс Т., Херст ХК (июль 1996 г.). «Хромосомное картирование гомологов человека и мыши двух новых членов семейства транскрипционных факторов AP-2». Геномика. 35 (1): 262–4. Дои:10.1006 / geno.1996.0351. PMID 8661133.
- Пироцци Г., МакКоннелл С.Дж., Увегес А.Дж., Картер Дж.М., Спаркс А.Б., Кей Б.К., Фаулкс Д.М. (июнь 1997 г.). «Идентификация новых белков, содержащих домен WW человека, путем клонирования лигандных мишеней». Журнал биологической химии. 272 (23): 14611–6. Дои:10.1074 / jbc.272.23.14611. PMID 9169421.
- Батше Э., Мухардт С., Беренс Дж., Херст Х.С., Кремзи С. (июль 1998 г.). «RB и c-Myc активируют экспрессию гена E-кадгерина в эпителиальных клетках посредством взаимодействия с фактором транскрипции AP-2». Молекулярная и клеточная биология. 18 (7): 3647–58. Дои:10.1128 / mcb.18.7.3647. ЧВК 108947. PMID 9632747.
- Mertens PR, Alfonso-Jaume MA, Steinmann K, Lovett DH (декабрь 1998 г.). «Синергетическое взаимодействие факторов транскрипции AP2 и YB-1 регулирует транскрипцию, зависимую от энхансера желатиназы A». Журнал биологической химии. 273 (49): 32957–65. Дои:10.1074 / jbc.273.49.32957. PMID 9830047.
- Гарсия М.А., Кампильос М., Марина А, Вальдивьесо Ф., Васкес Дж. (Февраль 1999 г.). «Активность фактора транскрипции AP-2 модулируется фосфорилированием, опосредованным протеинкиназой А». Письма FEBS. 444 (1): 27–31. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00021-6. PMID 10037142. S2CID 43874770.
- Розенталь Дж. А., Чен Х., Слепнев В. И., Пеллегрини Л., Сальчини А. Э., Ди Фьоре П. П., Де Камилли П. (ноябрь 1999 г.). «Эпсины определяют семейство белков, которые взаимодействуют с компонентами клатриновой оболочки и содержат новый белковый модуль». Журнал биологической химии. 274 (48): 33959–65. Дои:10.1074 / jbc.274.48.33959. PMID 10567358.
- Heicklen-Klein A, Ginzburg I (октябрь 2000 г.). «Промотор тау-белка придает нейрональную специфичность и связывает Sp1 и AP-2». Журнал нейрохимии. 75 (4): 1408–18. Дои:10.1046 / j.1471-4159.2000.0751408.x. PMID 10987820. S2CID 6558429.
- Nyormoi O, Wang Z, Doan D, Ruiz M, McConkey D, Bar-Eli M (август 2001 г.). «Фактор транскрипции AP-2alpha предпочтительно расщепляется каспазой 6 и разрушается протеасомой во время апоптоза, вызванного фактором некроза опухоли альфа, в клетках рака молочной железы». Молекулярная и клеточная биология. 21 (15): 4856–67. Дои:10.1128 / MCB.21.15.4856-4867.2001. ЧВК 87191. PMID 11438643.
- Рао Д.С., Чанг Дж.С., Кумар П.Д., Мизуками И., Смитсон Г.М., Брэдли С.В., Парлоу А.Ф., Росс Т.С. (ноябрь 2001 г.). «Белок 1, взаимодействующий с гентингтином, представляет собой белок, связывающий клатриновую оболочку, необходимый для дифференциации поздних сперматогенных предшественников». Молекулярная и клеточная биология. 21 (22): 7796–806. Дои:10.1128 / MCB.21.22.7796-7806.2001. ЧВК 99949. PMID 11604514.
- Bragança J, Swingler T., Marques FI, Jones T, Eloranta JJ, Hurst HC, Shioda T., Bhattacharya S (март 2002 г.). «Человеческий CREB-связывающий белок / трансактиватор, взаимодействующий с p300 с ED-богатым хвостом (CITED) 4, новый член семейства CITED, функционирует как коактиватор для фактора транскрипции AP-2». Журнал биологической химии. 277 (10): 8559–65. Дои:10.1074 / jbc.M110850200. PMID 11744733.
- Mertens PR, Steinmann K, Alfonso-Jaume MA, En-Nia A, Sun Y, Lovett DH (июль 2002 г.). «Комбинаторные взаимодействия p53, активирующего протеина-2 и YB-1 с одним энхансерным элементом регулируют экспрессию желатиназы А в неопластических клетках». Журнал биологической химии. 277 (28): 24875–82. Дои:10.1074 / jbc.M200445200. PMID 11973333.
- Элоранта Дж. Дж., Херст ХК (август 2002 г.). «Фактор транскрипции AP-2 взаимодействует с SUMO-конъюгированным ферментом UBC9 и суммируется in vivo». Журнал биологической химии. 277 (34): 30798–804. Дои:10.1074 / jbc.M202780200. PMID 12072434.
- Бен-Зимра М., Колер М., Орли Дж. (Август 2002 г.). «Транскрипция цитохрома Р450, расщепляющего боковую цепь холестерина, в плаценте: активирующий белок-2 принимает на себя роль стероидогенного фактора-1 за счет связывания с перекрывающимся элементом промотора». Молекулярная эндокринология. 16 (8): 1864–80. Дои:10.1210 / me.2002-0056. PMID 12145340.
внешняя ссылка
- GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о бранхоокуло-лицевом синдроме
- TFAP2A + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
- FactorBook AP-2alpha
- TFAP2A расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
- TFAP2A детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.