NEUROD1 - NEUROD1

NEUROD1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2QL2
Идентификаторы
Псевдонимы	NEUROD1, BETA2, BHF-1, MODY6, NEUROD, bHLHa3, нейрональная дифференцировка 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 601724 MGI: 1339708 ГомолоГен: 1871 Генные карты: NEUROD1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q31.3 Начинать 181,673,088 бп[1] Конец 181,680,876 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 C3 | 2 47,58 см Начинать 79,452,521 бп[2] Конец 79,456,751 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • последовательное связывание ДНК • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • Связывание ДНК • активность димеризации белков • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание фактора транскрипции • связывание хроматина • РНК-полимераза II, активирующая связывание фактора транскрипции • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • Переплет электронного ящика • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков • связывание двухцепочечной ДНК • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • цитоплазма • внутриклеточный • нуклеоплазма • Комплекс факторов транскрипции РНК-полимеразы II • ядро клетки Биологический процесс • положительная регуляция связывания ДНК регуляторной области транскрипции • регуляция дифференцировки нейронов • нейрогенез • дифференциация клеток • обязательство клеточной судьбы • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • обязательство судьбы РР-клеток поджелудочной железы • гомеостаз глюкозы • регулирование секреции инсулина • дифференцировка энтероэндокринных клеток • развитие зубчатой ​​извилины • сигнальная трансдукция, участвующая в регуляции экспрессии генов • развитие нейрона • секреция инсулина • положительная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции • ответ на глюкозу • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • морфогенез эмбрионального органа • развитие мозжечка • транскрипция, ДНК-шаблон • развитие нервной системы • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие многоклеточного организма • развитие заднего мозга • ядерно-цитоплазматический транспорт • положительная регуляция дифференцировки нейронов • положительное регулирование дифференцировки клеток • передача сигнала, опосредованная оксидом азота • положительная регуляция апоптотического процесса • регуляция поддержания структуры эпителия кишечника • развитие внутреннего уха • развитие глаз по типу камеры • обязательство судьбы А-клеток поджелудочной железы • дифференцировка амакриновых клеток • регуляция остановки клеточного цикла • отрицательная регуляция процесса апоптоза клеток поджелудочной железы типа B • ответ на наркотик • клеточный ответ на стимул глюкозы • спецификация переднего / заднего рисунка • эндокринное развитие поджелудочной железы • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция каскада JAK-STAT Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4760	18012
Ансамбль	ENSG00000162992	ENSMUSG00000034701
UniProt	Q13562	Q60867
RefSeq (мРНК)	NM_002500	NM_010894
RefSeq (белок)	NP_002491	NP_035024
Расположение (UCSC)	Chr 2: 181.67 - 181.68 Мб	Chr 2: 79.45 - 79.46 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Нейрогенная дифференциация 1 (NeuroD1), также называемый β2,^[5] это фактор транскрипции из NeuroD -тип. Кодируется человеческим геном NEUROD1.

Это член семьи NeuroD основная спираль-петля-спираль (bHLH) факторы транскрипции. Белок образует гетеродимеры с другими белками bHLH и активирует транскрипцию генов, содержащих определенную последовательность ДНК, известную как E-бокс. Регулирует выражение ген инсулина, и мутации в этом гене приводят к сахарный диабет II типа.^[6]

Обнаружено, что NeuroD1 превращает реактивные глиальные клетки в функциональные нейроны в мозгу мышей in vivo.^[7]

Взаимодействия

NEUROD1 был показан взаимодействовать с MAP3K10,^[8] MAFA^[9] и Циклин D1.^[10]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000162992 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034701 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Poulin G, Turgeon B, Drouin J (ноябрь 1997 г.). «NeuroD1 / beta2 способствует клеточно-специфической транскрипции гена проопиомеланокортина». Молекулярная и клеточная биология. 17 (11): 6673–82. Дои:10.1128 / mcb.17.11.6673. ЧВК  232521. PMID  9343431.
6. «Ген Entrez: нейрогенная дифференцировка NEUROD1 1».
7. Guo Z, Zhang L, Wu Z, Chen Y, Wang F, Chen G (февраль 2014 г.). «Прямое перепрограммирование in vivo реактивных глиальных клеток в функциональные нейроны после травмы головного мозга и на модели болезни Альцгеймера». Стволовая клетка. 14 (2): 188–202. Дои:10.1016 / j.stem.2013.12.001. ЧВК  3967760. PMID  24360883.
8. Маркора Э., Гован К., Ли Дж. Э. (август 2003 г.). «Стимуляция активности NeuroD гентингтином и белками, ассоциированными с гентингтином HAP1 и MLK2». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (16): 9578–83. Bibcode:2003ПНАС..100.9578М. Дои:10.1073 / pnas.1133382100. ЧВК  170960. PMID  12881483.
9. Чжао Л., Го М., Мацуока Т.А., Хагман Д.К., Параццоли С.Д., Пуату В., Штейн Р. (март 2005 г.). «Обогащенный островковыми бета-клетками активатор MafA является ключевым регулятором транскрипции гена инсулина». Журнал биологической химии. 280 (12): 11887–94. Дои:10.1074 / jbc.M409475200. PMID  15665000.
10. Ратино С., Петри М.В., Муто Н., Лейтер А.Б. (март 2002 г.). «Циклин D1 репрессирует основной фактор транскрипции спираль-петля-спираль, BETA2 / NeuroD». Журнал биологической химии. 277 (11): 8847–53. Дои:10.1074 / jbc.M110747200. PMID  11788592.

дальнейшее чтение

• Фаянс С.С., Белл Г.И., Полонский К.С. (сентябрь 2001 г.). «Молекулярные механизмы и клиническая патофизиология диабета зрелого возраста у молодых». Медицинский журнал Новой Англии. 345 (13): 971–80. Дои:10.1056 / NEJMra002168. PMID  11575290.
• Чо Дж. Х., Цай М. Дж. (Август 2004 г.). «Роль BETA2 / NeuroD1 в развитии нервной системы». Молекулярная нейробиология. 30 (1): 35–47. Дои:10.1385 / МН: 30: 1: 035. PMID  15247487. S2CID  19923393.
• Чэ Дж. Х., Стейн Г. Х., Ли Дж. Э. (декабрь 2004 г.). «NeuroD: предсказанное и удивительное». Молекулы и клетки. 18 (3): 271–88. PMID  15650322.
• Тамими Р., Стейнгримссон Е., Коупленд Н. Г., Дайер-Монтгомери К., Ли Дж. Э., Эрнандес Р., Дженкинс Н. А., Тапскотт С. Дж. (Июнь 1996 г.). «Ген NEUROD отображается на хромосоме 2q32 человека и хромосоме 2 мыши». Геномика. 34 (3): 418–21. Дои:10.1006 / geno.1996.0306. PMID  8786144.
• Ёкояма М., Ниси Ю., Миямото Ю., Накамура М., Акияма К., Мацубара К., Окубо К. (ноябрь 1996 г.). «Молекулярное клонирование нейробластомы человека из линии клеток нейробластомы, специфически экспрессированной в мозге плода и мозжечке взрослого». Исследование мозга. Молекулярные исследования мозга. 42 (1): 135–9. Дои:10.1016 / S0169-328X (96) 00154-4. PMID  8915591.
• Ёкояма М., Ниси Ю., Ёси Дж., Окубо К., Мацубара К. (октябрь 1996 г.). «Идентификация и клонирование генов, специфичных для нейробластомы и нервной ткани, посредством составленных профилей экспрессии». ДНК исследования. 3 (5): 311–20. Дои:10.1093 / днарес / 3.5.311. PMID  9039501.
• Ачарья Х. Р., Дули С. М., Торесон В. Б., Ахмад I. (апрель 1997 г.). «Клонирование кДНК и анализ экспрессии мРНК NeuroD в сетчатке человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 233 (2): 459–63. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6483. PMID  9144558.
• Poulin G, Turgeon B, Drouin J (ноябрь 1997 г.). «NeuroD1 / beta2 способствует клеточно-специфической транскрипции гена проопиомеланокортина». Молекулярная и клеточная биология. 17 (11): 6673–82. Дои:10.1128 / mcb.17.11.6673. ЧВК  232521. PMID  9343431.
• Furuta H, Horikawa Y, Iwasaki N, Hara M, Sussel L, Le Beau MM, Davis EM, Ogata M, Iwamoto Y, German MS, Bell GI (август 1998). «Факторы транскрипции бета-клеток и диабет: мутации в кодирующей области генов BETA2 / NeuroD1 (NEUROD1) и Nkx2.2 (NKX2B) не связаны с диабетом зрелого возраста у молодых японцев». Сахарный диабет. 47 (8): 1356–8. Дои:10.2337 / диабет.47.8.1356. PMID  9703340.
• Юн Ю.С., Нома Т., Ямасиро Ю., Ито Х., Накадзава А. (июль 1998 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика гена, кодирующего человеческий NeuroD». Письма о неврологии. 251 (1): 17–20. Дои:10.1016 / S0304-3940 (98) 00490-X. PMID  9714454. S2CID  39872130.
• Миячи Т., Маруяма Х, Китамура Т., Накамура С., Каваками Х. (июнь 1999 г.). «Структура и регуляция человеческого гена NeuroD (BETA2 / BHF1)». Исследование мозга. Молекулярные исследования мозга. 69 (2): 223–31. Дои:10.1016 / S0169-328X (99) 00112-6. PMID  10366743.
• Нома Т., Юн Ю.С., Ямаширо Ю., Фудзисава К., Накадзава А. (сентябрь 1999 г.). «Регулирование экспрессии NeuroD путем активации пути протеинкиназы-C в клетках ретинобластомы человека Y79». Письма о неврологии. 272 (1): 45–8. Дои:10.1016 / S0304-3940 (99) 00569-8. PMID  10507539. S2CID  3158332.
• Малецки М.Т., Джала США, Антонеллис А., Филдс Л., Дориа А., Орбан Т., Саад М., Варрам Дж. Х., Монмини М., Кролевски А.С. (ноябрь 1999 г.). «Мутации в NEUROD1 связаны с развитием сахарного диабета 2 типа». Природа Генетика. 23 (3): 323–8. Дои:10.1038/15500. PMID  10545951. S2CID  3216136.
• Глик Э., Лешковиц Д., Уокер, доктор медицины (январь 2000 г.). «Фактор транскрипции BETA2 действует совместно с E2A и PDX1 для активации промотора гена инсулина». Журнал биологической химии. 275 (3): 2199–204. Дои:10.1074 / jbc.275.3.2199. PMID  10636926.
• Лук Дж., Германн С., Грундстрём Т. (апрель 2000 г.). «Новый тип взаимодействия кальмодулина в ингибировании основных факторов транскрипции спираль-петля-спираль». Биохимия. 39 (15): 4366–74. Дои:10.1021 / bi992533u. PMID  10757985.
• Мотидзуки М., Амемия С., Кобаяси К., Кобаяши К., Исихара Т., Ая М., Като К., Касуга А., Накадзава С. (январь 2002 г.). «Связь полиморфизма Ala45Thr в NeuroD с детским диабетом типа 1a у японцев». Исследования диабета и клиническая практика. 55 (1): 11–7. Дои:10.1016 / S0168-8227 (01) 00242-X. PMID  11755474.
• Ратино С., Петри М.В., Муто Н., Лейтер А.Б. (март 2002 г.). «Циклин D1 репрессирует основной фактор транскрипции спираль-петля-спираль, BETA2 / NeuroD». Журнал биологической химии. 277 (11): 8847–53. Дои:10.1074 / jbc.M110747200. PMID  11788592.
• Вестерман Б.А., Поутсма А., Маруяма К., Шрайнемакерс Х.Ф., ван Вейк И.Дж., Oudejans CB (апрель 2002 г.). «Проневральные гены NEUROD1 и NEUROD2 экспрессируются во время инвазии трофобласта человека». Механизмы развития. 113 (1): 85–90. Дои:10.1016 / S0925-4773 (01) 00665-7. PMID  11900979. S2CID  11607202.
• Канацука А., Токуяма Ю., Нодзаки О, Мацуи К., Эгашира Т. (сентябрь 2002 г.). «Дисфункция бета-клеток у лиц с поздним началом диабета, несущих гомозиготную мутацию в факторах транскрипции NeuroD1 и Pax4». Метаболизм. 51 (9): 1161–5. Дои:10.1053 / meta.2002.34707. PMID  12200761.

внешняя ссылка

• NEUROD1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.