TEAD4 - TEAD4

TEAD4
Идентификаторы
Псевдонимы	TEAD4, EFTR-2, RTEF1, TCF13L1, TEF-3, TEF3, TEFR-1, hRTEF-1B, фактор транскрипции домена ТЕА 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 601714 MGI: 106907 ГомолоГен: 74463 Генные карты: TEAD4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12п13.33 Начинать 2,959,330 бп[1] Конец 3,040,676 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 F3 | 6 62,92 см Начинать 128,224,288 бп[2] Конец 128,300,823 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание фактора транскрипции РНК-полимеразы II • последовательное связывание ДНК • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • нуклеоплазма • комплекс регуляторов транскрипции • ядро клетки Биологический процесс • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • развитие скелетной системы • развитие мышечных органов • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • Сигнальный путь бегемота • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • развитие эмбриональных органов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7004	21679
Ансамбль	ENSG00000197905	ENSMUSG00000030353
UniProt	Q15561	Q62296
RefSeq (мРНК)	NM_201443 NM_003213 NM_201441	NM_001080979 NM_011567
RefSeq (белок)	NP_003204 NP_958849 NP_958851	NP_001074448 NP_035697
Расположение (UCSC)	Chr 12: 2.96 - 3.04 Мб	Chr 6: 128,22 - 128,3 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор усилителя транскрипции TEF-3 это белок что у людей кодируется TEAD4 ген.^[5][6][7]

Функция

Этот генный продукт является членом семейства факторов транскрипции факторов усиления транскрипции (TEF), которые содержат ДНК-связывающий домен TEA / ATTS.^[8] Члены семейства у млекопитающих TEAD1, TEAD2, TEAD3, TEAD4. TEAD4 преимущественно экспрессируется в скелетных мышцах и связывается с регуляторным элементом M-CAT, обнаруженным в промоторах мышечно-специфичных генов, чтобы управлять экспрессией их генов. Для этого гена были описаны альтернативно сплайсированные транскрипты, кодирующие различные изоформы, некоторые из которых транслируются с использованием инициирующего кодона, отличного от AUG (UUG).^[7] Эксперименты по удалению генов на мышах (то есть мышах с нокаутом) показали, что TEAD4 важен для образования бластоцист во время доимплантационного развития эмбриона.^[9][10] Хотя изначально предполагалось, что это важно для спецификации линии трофэктодермы, позже было показано, что функциональная трофэктодерма может продуцироваться, приводя к образованию бластоцист в условиях in vitro, которые подавляют окислительный стресс.^[11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000197905 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030353 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Жакемин П., Депетрис Д., Маттей М.Г., Марсьяль Д.А., Дэвидсон I (январь 1999 г.). «Локализация генов человеческого фактора транскрипции TEF-4 и TEF-5 (TEAD2, TEAD3) в хромосомах 19q13.3 и 6p21.2 с использованием флуоресцентной гибридизации in situ и радиационного гибридного анализа». Геномика. 55 (1): 127–9. Дои:10.1006 / geno.1998.5628. PMID  9889009.
6. Стюарт А.Ф., Ричард К.В., Сузов Дж., Стефан Д., Веремович С., Мортон С.К., Адра С.Н. (октябрь 1996 г.). «Клонирование человеческого RTEF-1, гена, связанного с фактором усиления транскрипции-1, предпочтительно экспрессируемым в скелетных мышцах: свидетельство древнего мультигенного семейства». Геномика. 37 (1): 68–76. Дои:10.1006 / geno.1996.0522. PMID  8921372.
7. "Entrez Gene: член семьи домена TEAD4 TEA 4".
8. Bürglin TR (июль 1991 г.). «Домен ТЕА: новый высококонсервативный ДНК-связывающий мотив». Клетка. 66 (1): 11–2. Дои:10.1016 / 0092-8674 (91) 90132-И. PMID  2070413. S2CID  2819591.
9. Яги Р., Кон MJ, Караванова И., Канеко К.Дж., Вулхорст Д., ДеПамфилис М.Л., Буонанно А. (ноябрь 2007 г.). «Фактор транскрипции TEAD4 определяет клон трофэктодермы в начале развития млекопитающих». Разработка. 134 (21): 3827–36. Дои:10.1242 / dev.010223. PMID  17913785.
10. Нисиока Н., Ямамото С., Киёнари Х., Сато Х., Савада А., Ота М., Накао К., Сасаки Х. (2008). «Tead4 необходим для спецификации трофэктодермы у эмбрионов мышей до имплантации». Механизмы развития. 125 (3–4): 270–83. Дои:10.1016 / j.mod.2007.11.002. PMID  18083014. S2CID  13898262.
11. Канеко К.Дж., DePamphilis ML (сентябрь 2013 г.). «TEAD4 устанавливает энергетический гомеостаз, необходимый для образования бластоцелей». Разработка. 140 (17): 3680–90. Дои:10.1242 / dev.093799. ЧВК  3742148. PMID  23903192.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Hsu DK, Guo Y, Alberts GF, Copeland NG, Gilbert DJ, Jenkins NA, Peifley KA, Winkles JA (июнь 1996 г.). «Идентификация мышиного гена, родственного TEF-1, экспрессируемого после митогенной стимуляции покоящихся фибробластов и во время миогенной дифференцировки». Журнал биологической химии. 271 (23): 13786–95. Дои:10.1074 / jbc.271.23.13786. PMID  8662936.
• Жакмен П., Хван Дж. Дж., Марсьяль Д. А., Долле П., Дэвидсон И. (сентябрь 1996 г.). «Новое семейство регулируемых онтогенетических факторов транскрипции млекопитающих, содержащих ДНК-связывающий домен TEA / ATTS». Журнал биологической химии. 271 (36): 21775–85. Дои:10.1074 / jbc.271.36.21775. PMID  8702974.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Vaudin P, Delanoue R, Davidson I., Silber J, Zider A (ноябрь 1999 г.). «TONDU (TDU), новый человеческий белок, связанный с продуктом рудиментарного (vg) гена Drosophila melanogaster, взаимодействует с факторами TEF позвоночных и заменяет функцию Vg в формировании крыла». Разработка. 126 (21): 4807–16. PMID  10518497.
• Василев А., Канеко К.Дж., Шу Х., Чжао Ю., DePamphilis ML (май 2001 г.). «Факторы транскрипции TEAD / TEF используют домен активации YAP65, Src / Yes-ассоциированного белка, локализованного в цитоплазме». Гены и развитие. 15 (10): 1229–41. Дои:10.1101 / gad.888601. ЧВК  313800. PMID  11358867.
• Чен Х.Х., Бати С.Дж., Маеда Т., Брукс С., Бейкер Л.К., Уэяма Т., Гурсой Е., Саба С., Салама Дж., Лондон Б., Стюарт А.Ф. (ноябрь 2004 г.). «У трансгенных мышей, связанных с фактором-усилителем транскрипции, развиваются дефекты сердечной проводимости, связанные с измененным фосфорилированием коннексина». Тираж. 110 (19): 2980–7. Дои:10.1161 / 01.CIR.0000146902.84099.26. PMID  15520314.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламосас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р. С., Ванденхаут Дж., Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Аппукуттан Б., МакФарланд Т.Дж., Дэвис М.Х., Атчанеясакул Л.О., Чжан Й., Бабра Б., Пэн И., Розенбаум Д.Т., Акотт Т., Пауэрс М.Р., Стаут Д.Т. (август 2007 г.). «Идентификация новых альтернативно сплайсированных изоформ RTEF-1 в эндотелиальных клетках глазных сосудов человека и сетчатке мыши». Исследовательская офтальмология и визуализация. 48 (8): 3775–82. Дои:10.1167 / iovs.06-1172. PMID  17652751.

внешняя ссылка

• TEAD4 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)