PAX2 - PAX2

PAX2
Идентификаторы
Псевдонимы	PAX2, PAPRS, FSGS7, парный ящик 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 167409 MGI: 97486 ГомолоГен: 2968 Генные карты: PAX2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q24.31 Начинать 100,735,603 бп[1] Конец 100,829,941 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 C3 | 19 38,09 см Начинать 44,756,045 бп[2] Конец 44,837,871 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • супероксид-генерирующая активность НАДФН-оксидазы • связывание фактора транскрипции • GO: 0001158 Связывание проксимальной области корового промотора с последовательностью ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции Сотовый компонент • аппарат Гольджи • центриолярный спутник • центр организации микротрубочек • белок-ДНК комплекс • ядрышко • лизосома • ядро клетки • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • клеточный ответ на перекись водорода • клеточный ответ на стимул глюкозы • развитие улитки • развитие пронефроса • клеточный ответ на ретиноевую кислоту • регуляция дифференцировки эпителиальных клеток метанефрических канальцев нефрона • развитие органов животных • развитие мочеточника • дифференциация клеток • отрицательная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • положительная регуляция ветвления, участвующая в морфогенезе зачатка мочеточника • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительная регуляция дифференцировки метанефрических DCT-клеток • регулирование размера метанефроса • аксоногенез • передача сигналов протеинкиназы B • отрицательная регуляция процесса апоптоза мезенхимальных клеток, участвующего в морфогенезе метанефрального нефрона • отрицательная регуляция апоптотического процесса, связанная с развитием метанефрального собирательного протока • положительная регуляция пролиферации эпителиальных клеток • морфогенез зрительного нерва • спецификация пронефрического поля • позитивная регуляция мезенхимального перехода в эпителиальный, участвующего в морфогенезе метанефроса • дифференцировка метанефрических мезенхимальных клеток • старение • развитие метанефрального эпителия • переход от мезенхимы к эпителию, участвующий в морфогенезе метанефроса • отрицательная регуляция апоптотического процесса • дифференцировка глиальных клеток • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • развитие пигментного эпителия сетчатки • формирование почечного протока • транскрипция, ДНК-шаблон • дифференцировка стволовых клеток • развитие метанефрических дистальных извитых канальцев • метаболический процесс активных форм кислорода • отрицательная регуляция процесса апоптоза мезенхимальных клеток, участвующего в развитии метанефроса • развитие мезонефроса • структурная организация зрительного нерва • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • клеточный ответ на стимул эпидермального фактора роста • образование канальцев метанефрального нефрона • положительная регуляция развития метанефрических клубочков • развитие многоклеточного организма • ветвление участвует в морфогенезе зачатка мочеточника • закрытие нервной трубки • реакция на уровень питательных веществ • отрицательная регуляция процесса апоптоза, участвующего в развитии канальцев метанефрального нефрона • созревание мочеточника • морфогенез внутреннего уха • морфогенез улитки • положительная регуляция формирования зрительного нерва • положительное регулирование пролиферации клеток • морфогенез глазного бокала, участвующий в развитии глаза камерного типа • развитие мочеполовой системы • определение судьбы клетки • отрицательная регуляция запрограммированной гибели клеток • формирование вестибулокохлеарного нерва • развитие глаз по типу камеры • развитие метанефрического коллектора • отрицательная регуляция метаболического процесса активных форм кислорода • спецификация судьбы мезодермальных клеток • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие метанефрической мезенхимы • развитие перекреста зрительного нерва • развитие зрительного нерва • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • визуальное восприятие • отрицательная регуляция цитолиза • морфогенез мозга • мезенхимальный переход в эпителиальный • окислительно-восстановительный процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5076	18504
Ансамбль	ENSG00000075891	ENSMUSG00000004231
UniProt	Q02962 Q5SZP1	P32114
RefSeq (мРНК)	NM_003990 NM_000278 NM_001304569 NM_003987 NM_003988 NM_003989 NM_001374303	NM_011037
RefSeq (белок)	NP_000269 NP_001291498 NP_003978 NP_003979 NP_003980 NP_003981 NP_001361232	NP_035167 NP_001355672 NP_001355673 NP_001355674 NP_001355675 NP_001355676 NP_001355677 NP_001355678 NP_001355679 NP_001355680
Расположение (UCSC)	Chr 10: 100,74 - 100,83 Мб	Chr 19: 44,76 - 44,84 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Парный бокс-ген 2, также известный как PAX2 это белок который у человека кодируется PAX2 ген.^[5][6]

Функция

Гены Pax, или гены, содержащие парный ящик, играют важную роль в развитии и пролиферации множества клеточных линий, развитии органов, а также развитии и организации центральной нервной системы.^[7] Ген фактора транскрипции Pax2 важен для регионализированного эмбриологического развития центральной нервной системы. У млекопитающих мозг развит в трех областях: переднем, среднем и заднем.^[8] Градиенты концентрации фактора роста фибробластов 8 (FGF8) и семейства сайтов интеграции MMTV бескрылого типа, члена 1 (Wnt1) контролируют экспрессию Pax2 во время развития среднего мозга или среднего мозга.^[9] Сходное формирование паттерна во время эмбриологического развития можно наблюдать у «базальных хордовых или асцидий», у которых организация центральной нервной системы у асцидий личинок также контролируется генами факторов роста фибробластов.^[8] Ген Pax2 кодирует фактор транскрипции, который, по-видимому, играет важную роль в организации областей среднего и заднего мозга и, самое раннее, может быть обнаружен по обе стороны от предельной борозды, которая разделяет двигательные и сенсорные нервные ядра.^[7][10]

PAX2 кодирует парная коробка ген 2, один из многих гомологов гена prd у Drosophila melanogaster у человека. Центральная особенность этого фактор транскрипции Семейство генов представляет собой консервативный ДНК-связывающий парный бокс-домен. PAX2, как полагают, является мишенью подавления транскрипции геном-супрессором опухоли. WT1. Pax 2 представляет собой фактор транскрипции, контролируемый сигнальными молекулами Wnt1 и Fgf8. Pax2 вместе с другими факторами транскрипции Pax5, Pax8, En1 и En 2 экспрессируются через границу Otx2-Gbx2 в средней части заднего мозга. Эти факторы транскрипции работают с сигнальными молекулами Wnt1 и Fgf8, чтобы поддерживать Организатор MHB. MHB контролирует развитие среднего мозга и мозжечка. Pax2 - это самый ранний из известных генов, который экспрессируется через границу Otx2-Gbx2. Он сначала экспрессируется на стадии поздней примитивной полоски и экспрессируется в узком кольце с центром в MHB во время сомитогенеза. Экспрессия трансгена в средней части заднего мозга и развивающейся почке направляется Pax2. Есть три различных MHB-специфичных энхансера в восходящей области Pax2. Экспрессия в MHB, начиная со стадии четырех сомитов и далее, направляется двумя поздними энхансерами в проксимальных и дистальных областях Pax2. Ранний энхансер, расположенный в промежуточной области, активирует область среднего заднего мозга эмбрионов поздней гаструлы. Активация Pax2, Pax5 и Pax8 является консервативной особенностью всех позвоночных.

Клиническое значение

Патологически было продемонстрировано, что Pax2 активирует промотор гена фактора роста гепатоцитов (HGF), и было показано, что оба они играют роль в раке простаты человека.^[11]

Было показано, что мутации в PAX2 приводят к повреждению зрительного нерва. колобомы и почечная гипоплазия. Альтернативная сварка этого гена приводит к множественным вариантам транскрипта.^[12] Pax2 и Pax8 также необходимы для образования пронефроса и последующих структур почек. Pax2 и Pax8 регулируют экспрессию Gata3. Без этих генов возникают мутации в мочеполовой системе.

Неверная экспрессия Pax2 часто наблюдается при пролиферативных нарушениях почек. Например, Pax2 высоко экспрессируется при поликистозной болезни почек (PKD), опухоли Вильмса (WT) и почечно-клеточной карциноме (RCC).^[13] Экспрессия Pax2 при этих заболеваниях проявляется в цикличности топливных элементов, ингибирует гибель клеток и придает устойчивость к химиотерапии.^[13] Благодаря своей роли в этих заболеваниях, Pax2 является привлекательной терапевтической мишенью, и был исследован ряд методов ингибирования его активности. Фактически, недавно была идентифицирована малая молекула, обладающая способностью нарушать опосредованную Pax2 транскрипцию, блокируя связывание Pax2 с ДНК.^[14][15]

Взаимодействия

PAX2 был показан взаимодействовать с PAXIP1.^[16]

Смотрите также

• Гены pax

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000075891 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004231 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Пилц А.Дж., Пови С., Грусс П., Эбботт К.М. (1993). «Картирование человеческих гомологов мышей, содержащих парные коробки». Геном млекопитающих. 4 (2): 78–82. Дои:10.1007 / BF00290430. PMID  8431641. S2CID  30845070.
6. Стэплтон П., Вейт А., Урбанек П., Козмик З., Басслингер М. (апрель 1993 г.). «Хромосомная локализация семи генов PAX и клонирование нового члена семьи, PAX-9». Природа Генетика. 3 (4): 292–8. Дои:10.1038 / ng0493-292. PMID  7981748. S2CID  21338655.
7. Мансури А., Грусс П. (2013). «Пакс Джин». В Хьюз К., Малой К. (ред.). Энциклопедия генетики Бреннера (2-е изд.). Сан-Диего: Elsevier Science. С. 246–248. Дои:10.1016 / B978-0-12-374984-0.01128-1. ISBN  978-0-08-096156-9.
8. Имаи К.С., Сато Н., Сато Й. (2002). «Региональные экспрессии генов в центральной нервной системе асцидийного эмбриона». Механизмы развития. 119 Дополнение 1: S275–7. Дои:10.1016 / S0925-4773 (03) 00128-X. PMID  14516697. S2CID  16714343.
9. GeneCard за WNT1
10. Нолти Дж (2009). Человеческий мозг: введение в его функциональную анатомию (6-е изд.). Филадельфия, Пенсильвания: Мосби / Эльзевьер. п. 685. ISBN  978-0-323-04131-7.
11. Уэда Т., Ито С., Сираиси Т., Танигучи Х., Каюкава Н., Наканиси Х. и др. (2015). «PAX2 способствовал инвазии клеток рака простаты посредством регуляции транскрипции HGF в модели in vitro». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная основа болезни. 1852 (11): 2467–73. Дои:10.1016 / j.bbadis.2015.08.008. PMID  26296757.
12. «Энтрез Ген: PAX2 парный бокс-ген 2».
13. Шарма Р., Санчес-Феррас О., Бушар М. (2015). «Гены Pax в развитии, заболеваниях и регенерации почек». Семинары по клеточной биологии и биологии развития. 44: 97–106. Дои:10.1016 / j.semcdb.2015.09.016. PMID  26410163.
14. Гримли Э., Ляо Ц., Рангини Э., Николовска-Колеска З., Дресслер Г (2017). «Ингибирование активации транскрипции Pax2 небольшой молекулой, нацеленной на ДНК-связывающий домен». ACS Химическая биология. 12 (3): 724–734. Дои:10.1021 / acschembio.6b00782. ЧВК  5761330. PMID  28094913.
15. Гримли Э, Дресслер ГР (2018). «Являются ли белки Pax потенциальными терапевтическими мишенями при заболевании почек и раке?». Kidney International. 94 (2): 259–267. Дои:10.1016 / j.kint.2018.01.025. ЧВК  6054895. PMID  29685496.
16. Лехнер М.С., Левитан I, Дресслер Г.Р. (июль 2000 г.). «PTIP, новый белок, содержащий домен BRCT, взаимодействует с Pax2 и связан с активным хроматином». Исследования нуклеиновых кислот. 28 (14): 2741–51. Дои:10.1093 / nar / 28.14.2741. ЧВК  102659. PMID  10908331.

дальнейшее чтение

• Нолл М. (август 1993 г.). «Эволюция и роль генов Pax». Текущее мнение в области генетики и развития. 3 (4): 595–605. Дои:10.1016 / 0959-437X (93) 90095-7. PMID  8241771.
• Даль Э, Косеки Х, Баллинг Р. (сентябрь 1997 г.). «Гены Pax и органогенез». BioEssays. 19 (9): 755–65. Дои:10.1002 / bies.950190905. PMID  9297966. S2CID  23755557.
• Eccles MR, He S, Legge M, Kumar R, Fox J, Zhou C., French M, Tsai RW (2003). «Гены PAX в развитии и болезни: роль PAX2 в развитии урогенитального тракта». Международный журнал биологии развития. 46 (4): 535–44. PMID  12141441.
• Экклс М.Р., Уоллис Л.Дж., Фидлер А.Э., Спурр Н.К., Гудфеллоу П.Дж., Рив А.Э. (май 1992 г.). «Экспрессия гена PAX2 в почках плода человека и опухоли Вильмса». Рост и дифференциация клеток. 3 (5): 279–89. PMID  1378753.
• Sanyanusin P, Schimmenti LA, McNoe LA, Ward TA, Pierpont ME, Sullivan MJ, Dobyns WB, Eccles MR (апрель 1995 г.). «Мутация гена PAX2 в семье с колобомами зрительного нерва, аномалиями почек и пузырно-мочеточниковым рефлюксом». Природа Генетика. 9 (4): 358–64. Дои:10.1038 / ng0495-358. PMID  7795640. S2CID  29180124.
• Уорд Т.А., Небель А., Рив А.Е., Экклс М.Р. (сентябрь 1994 г.). «Альтернативные формы матричной РНК и открытые рамки считывания в дополнительной консервативной области гена PAX-2 человека». Рост и дифференциация клеток. 5 (9): 1015–21. PMID  7819127.
• Стэплтон П., Вейт А., Урбанек П., Козмик З., Басслингер М. (апрель 1993 г.). «Хромосомная локализация семи генов PAX и клонирование нового члена семьи, PAX-9». Природа Генетика. 3 (4): 292–8. Дои:10.1038 / ng0493-292. PMID  7981748. S2CID  21338655.
• Пилц А.Дж., Пови С., Грусс П., Эбботт К.М. (1993). «Картирование человеческих гомологов мышей, содержащих парные коробки». Геном млекопитающих. 4 (2): 78–82. Дои:10.1007 / BF00290430. PMID  8431641. S2CID  30845070.
• Саньянусин П., Макнои Л.А., Салливан М.Дж., Уивер Р.Г., Экклс М.Р. (ноябрь 1995 г.). «Мутация PAX2 у двух братьев и сестер с синдромом почечной колобомы». Молекулярная генетика человека. 4 (11): 2183–4. Дои:10.1093 / hmg / 4.11.2183. PMID  8589702.
• Саньянусин П., Норриш Дж. Х., Уорд Т. А., Небель А., Макно Л. А., Экклс М. Р. (июль 1996 г.). «Геномная структура гена PAX2 человека». Геномика. 35 (1): 258–61. Дои:10.1006 / geno.1996.0350. PMID  8661132.
• Дехби М., Гахремани М., Лехнер М., Дресслер Дж., Пеллетье Дж. (Август 1996 г.). «Фактор транскрипции парного бокса, PAX2, положительно модулирует экспрессию гена-супрессора опухоли Вильмса (WT1)». Онкоген. 13 (3): 447–53. PMID  8760285.
• Боналду М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Schimmenti LA, Cunliffe HE, McNoe LA, Ward TA, French MC, Shim HH, Zhang YH, Proesmans W., Leys A, Byerly KA, Braddock SR, Masuno M, Imaizumi K, Devriendt K, Eccles MR (апрель 1997). «Дальнейшее определение синдрома почечной колобомы у пациентов с экстремальной вариабельностью фенотипа и идентичными мутациями PAX2». Американский журнал генетики человека. 60 (4): 869–78. ЧВК  1712484. PMID  9106533.
• Нарахара К., Бейкер Э., Ито С., Йокояма Ю., Ю. С., Хьюитт Д., Сазерленд Г. Р., Экклс М. Р., Ричардс Р. И. (март 1997 г.). «Локализация точки останова 10q в гене PAX2 у пациента с транслокацией de novo t (10; 13) и колобомой зрительного нерва почек». Журнал медицинской генетики. 34 (3): 213–6. Дои:10.1136 / jmg.34.3.213. ЧВК  1050895. PMID  9132492.
• Тавассоли К., Рюгер В., Хорст Дж. (Декабрь 1997 г.). «Альтернативный сплайсинг в PAX2 генерирует новую рамку считывания и расширенную консервативную кодирующую область на карбокси-конце». Генетика человека. 101 (3): 371–5. Дои:10.1007 / s004390050644. PMID  9439670. S2CID  43590139.
• Стейнер CK, Канлифф HE, Ward TA, Eccles MR (сентябрь 1998 г.). «Клонирование и характеристика промотора PAX2 человека». Журнал биологической химии. 273 (39): 25472–9. Дои:10.1074 / jbc.273.39.25472. PMID  9738017.
• Девриендт К., Маттейс Г., Ван Дамм Б., Ван Цесбрук Д., Экклс М., Ванрентергхем Ю., Фринс Дж. П., Лейс А. (август 1998 г.). «Миссенс-мутация и гексануклеотидная дупликация в гене PAX2 в двух неродственных семьях с почечно-колобомным синдромом (MIM 120330)». Генетика человека. 103 (2): 149–53. Дои:10.1007 / s004390050798. PMID  9760197. S2CID  8930257.
• Schimmenti LA, Shim HH, Wirtschafter JD, Panzarino VA, Kashtan CE, Kirkpatrick SJ, Wargowski DS, France TD, Michel E, Dobyns WB (2000). «Гомонуклеотидные экспансия и мутации сокращения PAX2 и включение мальформации Киари 1 как часть почечно-колобомного синдрома». Человеческая мутация. 14 (5): 369–76. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (199911) 14: 5 <369 :: AID-HUMU2> 3.0.CO; 2-E. PMID  10533062.

внешняя ссылка

• GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о синдроме почечной колобомы
• PAX2 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.