ATOH1 - ATOH1

ATOH1
Идентификаторы
Псевдонимы	ATOH1, ATH1, HATH1, MATH-1, bHLHa14, атональный фактор транскрипции bHLH 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 601461 MGI: 104654 ГомолоГен: 31297 Генные карты: ATOH1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q22.2 Начинать 93,828,753 бп[1] Конец 93,830,966 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 C1 | 6 30,03 см Начинать 64,729,125 бп[2] Конец 64,731,245 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • последовательное связывание ДНК • активность димеризации белков • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • связывание хроматина с ДНК • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • ядро клетки Биологический процесс • Notch сигнальный путь • регуляция дифференцировки нейронов • определение судьбы слуховых рецепторных клеток • дифференциация клеток • положительная регуляция дифференцировки слуховых рецепторных клеток • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительная регуляция дифференцировки рецепторных клеток внутреннего уха • отрицательная регуляция апоптотического процесса • миграция нейронов • спецификация судьбы слуховых рецепторных клеток • транскрипция, ДНК-шаблон • развитие нервной системы • управление аксоном • развитие многоклеточного организма • развитие центральной нервной системы • развитие мозга • дифференцировка слуховых рецепторных клеток • морфогенез внутреннего уха • положительная регуляция дифференцировки нейронов • дифференциация нейронов • развитие коры головного мозга • развитие внутреннего уха • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	474	11921
Ансамбль	ENSG00000172238	ENSMUSG00000073043
UniProt	Q92858	P48985
RefSeq (мРНК)	NM_005172	NM_007500
RefSeq (белок)	NP_005163	NP_031526
Расположение (UCSC)	Chr 4: 93,83 - 93,83 Мб	Chr 6: 64,73 - 64,73 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белковый атональный гомолог 1 это белок что у людей кодируется ATOH1 ген.^[5][6]

Функция

Этот белок относится к основная спираль-петля-спираль (BHLH) семейство факторы транскрипции. Это активирует Электронная коробка зависимая транскрипция вместе с TCF3 (E47).^[6] ATOH1 необходим для образования как нервных, так и ненейронных типов клеток. Используя генетическую делецию у мышей, было показано, что Atoh1 необходим для образования нейроны гранул мозжечка, внутреннее ухо волосковые клетки, интернейроны спинного мозга, Ячейки Меркель кожи и секреторных клеток кишечника (кубок, энтероэндокринный, и Клетки Панета ). ATOH1 является гомологом Drosophila melanogaster ген атональный. ATOH1 считается частью Notch сигнальный путь.

В 2009 году ATOH1 был идентифицирован как ген "выключения рака". [1]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000172238 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000073043 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Бен-Ари Н., МакКолл А.Э., Беркман С., Эйхеле Дж., Беллен Х.Дж., Зогби HY (Сентябрь 1996 г.). «Эволюционная консервация последовательности и экспрессии белка bHLH Atonal предполагает консервативную роль в нейрогенезе». Молекулярная генетика человека. 5 (9): 1207–16. Дои:10,1093 / чмг / 5.9.1207. PMID  8872459.
6. «Ген Entrez: атональный гомолог 1 ATOH1 (Drosophila)».

дальнейшее чтение

• Хелмс А.В., Джонсон Дж. Э. (март 1998 г.). «Прародители дорсальных комиссуральных интернейронов определяются экспрессией MATH1». Разработка. 125 (5): 919–28. PMID  9449674.
• Dintilhac A, Bernués J (март 2002 г.). «HMGB1 взаимодействует со многими очевидно неродственными белками, распознавая короткие аминокислотные последовательности» (PDF). Журнал биологической химии. 277 (9): 7021–8. Дои:10.1074 / jbc.M108417200. PMID  11748221. S2CID  39560486.
• Браун Н.Л., Дагене С.Л., Чен С.М., Глейзер Т. (февраль 2002 г.). «Молекулярная характеристика и картирование ATOH7, человеческого атонального гомолога с предполагаемой ролью в развитии ганглиозных клеток сетчатки». Геном млекопитающих. 13 (2): 95–101. Дои:10.1007 / s00335-001-2101-3. ЧВК  2262845. PMID  11889557.
• Леонард Дж. Х., Кук А. Л., Ван Геле М., Бойл Г. М., Инглис К. Дж., Спелеман Ф., Штурм Р. А. (сентябрь 2002 г.). «Экспрессия пронейральных и пронейроэндокринных факторов транскрипции в кожных механорецепторных (Меркель) клетках и клеточной карциноме Меркеля». Международный журнал рака. 101 (2): 103–10. Дои:10.1002 / ijc.10554. PMID  12209986. S2CID  20592545.
• Газит Р., Крижановский В., Бен-Арье Н. (февраль 2004 г.). «Math1 контролирует дифференцировку гранулярных клеток мозжечка, регулируя несколько компонентов пути передачи сигналов Notch». Разработка. 131 (4): 903–13. Дои:10.1242 / dev.00982. PMID  14757642.
• Леоу С.К., Полакис П., Гао В.К. (ноябрь 2005 г.). «Роль Hath1, фактора транскрипции bHLH, в аденокарциноме толстой кишки». Летопись Нью-Йоркской академии наук. 1059 (1): 174–83. Bibcode:2005НЯСА1059..174Л. Дои:10.1196 / летопись.1339.048. PMID  16382053. S2CID  21443239.
• Секин А., Акияма Й., Янагихара К., Юаса Й. (июнь 2006 г.). «Hath1 регулирует экспрессию гена муцина желудка в клетках желудка». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 344 (4): 1166–71. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.03.238. PMID  16647036.
• Муто Х, Сакамото Х, Хаякава Х, Арао Й, Сато К., Нокуби М, Сугано К. (июль 2006 г.). «Специфичный для кишечника гомеобоксный ген Cdx2 индуцирует экспрессию основного транскрипционного фактора спираль-петля-спираль Math1». Дифференциация; Исследования в области биологического разнообразия. 74 (6): 313–21. Дои:10.1111 / j.1432-0436.2006.00074.x. PMID  16831200.
• Park ET, Oh HK, Gum JR, Crawley SC, Kakar S, Engel J, Leow CC, Gao WQ, Kim YS (сентябрь 2006 г.). «Экспрессия HATH1 при муцинозном раке толстой кишки и родственных поражениях». Клинические исследования рака. 12 (18): 5403–10. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-06-0573. PMID  17000673.
• Цучия К., Накамура Т., Окамото Р., Канаи Т., Ватанабэ М. (январь 2007 г.). «Взаимное нацеливание Hath1 и бета-катенина с помощью киназы гликогенсинтазы 3beta Wnt при раке толстой кишки человека». Гастроэнтерология. 132 (1): 208–20. Дои:10.1053 / j.gastro.2006.10.031. PMID  17241872.
• Du X, Jensen P, Goldowitz D, Hamre KM (май 2007 г.). «Клетки дикого типа спасают генотипически Math1-нулевые волосковые клетки во внутреннем ухе химерных мышей». Биология развития. 305 (2): 430–8. Дои:10.1016 / j.ydbio.2007.02.028. PMID  17397818.
• Вестерман Б.А., Брейер Р.Х., Поутсма А., Чхатта А., Нордейн Л.А., Кулен М.Г., Postmus PE, Бланкенштейн М.А., Oudejans CB (2007). «Базовое профилирование факторов транскрипции спираль-петля-спираль опухолей легких показывает аберрантную экспрессию атонального гомолога 1 пронейрального гена (ATOH1, HATH1, MATH1) в нейроэндокринных опухолях». Международный журнал биологических маркеров. 22 (2): 114–23. Дои:10.1177/172460080702200205. PMID  17549667. S2CID  208043955.
• Шеффер Д., Сейдж К., Кори Д. П., Пинго V (октябрь 2007 г.). «Профиль экспрессии генов идентифицирует Hes6 как транскрипционную мишень ATOH1 в волосковых клетках улитки». Письма FEBS. 581 (24): 4651–6. Дои:10.1016 / j.febslet.2007.08.059. PMID  17826772. S2CID  13986512.
• Шройер Н.Ф., Хельмрат М.А., Ван В.Ю., Анталфи Б., Хеннинг С.Дж., Зогби HY (июнь 2007 г.). «Специфичное для кишечника удаление атонального гомолога 1 мыши (Math1) показывает его роль в клеточном гомеостазе». Гастроэнтерология. 132 (7): 2478–88. Дои:10.1053 / j.gastro.2007.03.047. PMID  17570220.

внешняя ссылка

• ATOH1 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• ATOH1 и подавление рака
• Человек ATOH1 расположение генома и ATOH1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.