Ядерный фактор зародышевой клетки - Germ cell nuclear factor

NR6A1
Идентификаторы
Псевдонимы	NR6A1, CT150, GCNF, GCNF1, NR61, RTR, hGCNF, hRTR, подсемейство ядерных рецепторов 6, член группы A 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602778 MGI: 1352459 ГомолоГен: 36308 Генные карты: NR6A1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q33.3 Начинать 124,517,275 бп[1] Конец 124,771,311 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 млрд Начинать 38,723,370 бп[2] Конец 38,927,688 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • последовательное связывание ДНК • активность гомодимеризации белков • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • связывание ионов цинка • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание ионов металлов • активность рецепторов стероидных гормонов • GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 активность ядерного рецептора • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II Сотовый компонент • нуклеоплазма • ядро клетки • комплекс регуляторов транскрипции Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • генерация гамет • сперматогенез • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • клеточная пролиферация • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • сигнальный путь внутриклеточного рецептора стероидного гормона • путь передачи сигнала внутриклеточного рецептора • сигнальный путь, опосредованный стероидными гормонами • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2649	14536
Ансамбль	ENSG00000148200	ENSMUSG00000063972
UniProt	Q15406	Q64249
RefSeq (мРНК)	NM_001278546 NM_001489 NM_033334 NM_033335	NM_001159548 NM_001159549 NM_010264
RefSeq (белок)	NP_001265475 NP_001480 NP_201591 NP_201591.2	NP_001153020 NP_001153021 NP_034394
Расположение (UCSC)	Chr 9: 124,52 - 124,77 Мб	Chr 2: 38,72 - 38,93 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

В ядерный фактор зародышевой клетки (GCNF), также известный как РТР (рецептор, связанный с ретиноидным рецептором, связанный с яичком) или NR6A1 (подсемейство ядерных рецепторов 6, группа A, член 1), представляет собой белок что у людей кодируется NR6A1 ген.^[5][6] GCNF является членом ядерный рецептор семья внутриклеточный факторы транскрипции .

У взрослых GCNH выражается в основном в стволовые клетки из гонады и участвует в регулировании эмбриогенез и зародышевые клетки дифференциация.^[7]

Паттерн его экспрессии предполагает, что он может участвовать в нейрогенезе и развитии зародышевых клеток. Белок может гомодимеризовать и связывать ДНК, но мишени in vivo не идентифицированы. Ген экспрессирует три альтернативно сплайсированных варианта транскрипта.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000148200 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000063972 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лей В., Хиросе Т., Чжан Л.X., Адачи Х., Спинелла М.Дж., Дмитровский Е., Джеттен А.М. (апрель 1997 г.). «Клонирование рецептора человеческого орфанного ядерного фактора зародышевой клетки / рецептора ретиноида, связанного с семенником, и его дифференциальная регуляция во время дифференцировки клеток эмбриональной карциномы». Журнал молекулярной эндокринологии. 18 (2): 167–76. Дои:10.1677 / jme.0.0180167. PMID  9134503.
6. Süsens U, Borgmeyer U (декабрь 1996 г.). «Характеристика гена ядерного фактора зародышевой клетки человека». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1309 (3): 179–82. Дои:10.1016 / s0167-4781 (96) 00157-1. PMID  8982251.
7. Zechel C (декабрь 2005 г.). «Ядерный фактор зародышевой клетки (GCNF)». Молекулярное воспроизводство и развитие. 72 (4): 550–6. Дои:10.1002 / мрд.20377. PMID  16155958. S2CID  39315293.
8. «Ген Entrez: ядерный рецептор NR6A1 подсемейства 6, группа A, член 1».

дальнейшее чтение

• Грещик Х, Шюле Р (1999). «Ядерный фактор зародышевой клетки: сиротский рецептор с неожиданными свойствами». Журнал молекулярной медицины. 76 (12): 800–10. Дои:10.1007 / s001090050284. PMID  9846950. S2CID  9368668.
• Хиросе Т., О'Брайен Д.А., Джеттен А.М. (январь 1995 г.). «RTR: новый член суперсемейства ядерных рецепторов, который высоко экспрессируется в семенниках мышей». Ген. 152 (2): 247–51. Дои:10.1016 / 0378-1119 (94) 00656-D. PMID  7835709.
• Ян Ж., Медведев А., Хиросе Т., Гото Х., Джеттен А.М. (апрель 1997 г.). «Характеристика ответного элемента и ДНК-связывающих свойств ядерного фактора зародышевой клетки орфанного рецептора / рецептора, связанного с яичками, связанного с ретиноидным рецептором». Журнал биологической химии. 272 (16): 10565–72. Дои:10.1074 / jbc.272.16.10565. PMID  9099702.
• Kapelle M, Krätzschmar J, Husemann M, Schleuning WD (май 1997 г.). «Клонирование кДНК двух близкородственных форм ядерного фактора зародышевой клетки человека (GCNF)». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1352 (1): 13–7. Дои:10.1016 / s0167-4781 (97) 00043-2. PMID  9177477.
• Агульник И.Ю., Чо Й., Нидербергер С., Кибак Д.Г., Куни А.Д. (март 1998 г.). «Клонирование, анализ экспрессии и хромосомная локализация гена ядерного рецептора человека GCNF». Письма FEBS. 424 (1–2): 73–8. Дои:10.1016 / S0014-5793 (98) 00142-2. PMID  9537518. S2CID  26848550.
• Грешик Х, Вюрц Дж. М., Хублитц П., Кёлер Ф., Морас Д., Шюле Р. (январь 1999 г.). «Характеристика ДНК-связывающих и димеризационных свойств ядерного фактора зародышевых клеток рецептора орфанных ядер». Молекулярная и клеточная биология. 19 (1): 690–703. Дои:10.1128 / mcb.19.1.690. ЧВК  83926. PMID  9858592.
• Schmitz TP, Süsens U, Borgmeyer U (сентябрь 1999 г.). «Связывание ДНК, взаимодействие белков и дифференциальная экспрессия ядерного фактора зародышевой клетки человека». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1446 (3): 173–80. Дои:10.1016 / s0167-4781 (99) 00079-2. PMID  10524192.
• Ян З, Джеттен AM (ноябрь 2000 г.). «Характеристика репрессорной функции ядерного орфанного рецептора, связанного с ретиноидным рецептором, связанного с яичками, рецептором / ядерным фактором зародышевой клетки». Журнал биологической химии. 275 (45): 35077–85. Дои:10.1074 / jbc.M005566200. PMID  10940306.
• Süsens U, Borgmeyer U (2001). «Геномная структура гена ядерного фактора зародышевых клеток мыши (GCNF). II. Сравнение с геномной структурой гена GCNF человека». Геномная биология. 2 (5): ИССЛЕДОВАНИЕ0017. Дои:10.1186 / gb-2001-2-5-research0017. ЧВК  32189. PMID  11387038.
• Мехта Д.В., Ким Ю.С., Диксон Д., Джеттен А.М. (апрель 2002 г.). «Характеристика экспрессии ретиноид-ассоциированного рецептора, ассоциированного с семенниками (RTR) в трофобластах». Плацента. 23 (4): 281–7. Дои:10.1053 / plac.2001.0779. PMID  11969338.
• Ян З., Ким Ю.С., Джеттен А.М. (август 2002 г.). «RAP80, новый ядерный белок, который взаимодействует с рецептором, связанным с яичками, связанным с ретиноидами». Журнал биологической химии. 277 (35): 32379–88. Дои:10.1074 / jbc.M203475200. PMID  12080054.
• Lan ZJ, Chung AC, Xu X, DeMayo FJ, Cooney AJ (декабрь 2002 г.). «Эмбриональная функция ядерного фактора зародышевых клеток зависит от ДНК-связывающего домена». Журнал биологической химии. 277 (52): 50660–7. Дои:10.1074 / jbc.M209586200. PMID  12381721.
• Ян Г, Чжан Ю.Л., Бухольд Г.М., Джеттен А.М., О'Брайен Д.А. (май 2003 г.). «Анализ транскриптов ядерных факторов зародышевых клеток и экспрессии белков во время сперматогенеза». Биология размножения. 68 (5): 1620–30. Дои:10.1095 / биолрепрод.102.012013. PMID  12606326.
• Райкович М., Миддендорф Р., Ветцель М.Г., Фркович Д., Дамеров С., Зейтц Х. Дж., Вайцель Дж. М. (декабрь 2004 г.). «Ядерный фактор зародышевой клетки снимает тау-опосредованную модулятором цАМФ-ответа активацию тестис-специфического промотора митохондриальной глицерин-3-фосфатдегидрогеназы человека». Журнал биологической химии. 279 (50): 52493–9. Дои:10.1074 / jbc.M404467200. PMID  15456763.

внешняя ссылка

• NR6A1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)