NKX6-1 Идентификаторы Псевдонимы NKX6-1 , NKX6.1, NKX6A, NK6 гомеобокс 1Внешние идентификаторы OMIM: 602563 MGI: 1206039 ГомолоГен: 4495 Генные карты: NKX6-1 Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • последовательное связывание ДНК • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • связывание хроматина • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • ядро клетки • внеклеточная экзосома Биологический процесс • сглаженный сигнальный путь • обнаружение глюкозы • развитие поджелудочной железы • транскрипция, ДНК-шаблон • регуляция удлинения аксона • развитие многоклеточного организма • клеточный ответ на стимул пептидного гормона • дифференциация нейронов центральной нервной системы • ответ на никотин • отрицательная регуляция дифференцировки глиальных клеток • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II, участвующего в спецификации судьбы мотонейрона спинного мозга • пролиферация клеток поджелудочной железы типа B • клеточный ответ на цитокиновый стимул • позитивная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции • нейрогенез • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II, участвующего в спецификации интернейронов вентральной части спинного мозга • развитие клеток поджелудочной железы типа B • положительная регуляция дифференцировки нейронов • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция развития клеток поджелудочной железы типа B • созревание клеток поджелудочной железы типа B • дифференцировка олигодендроцитов • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • клеточная пролиферация • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • ответ на наркотик • положительная регуляция дифференцировки глиальных клеток • дифференциация клеток • положительное регулирование секреции инсулина • морфогенез органов животных • регуляция миграции нейронов • миграция нейронов • регулирование секреции инсулина • эндокринное развитие поджелудочной железы • дифференцировка клеток поджелудочной железы типа B Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи Разновидность Человек Мышь Entrez Ансамбль UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (белок) Расположение (UCSC) Chr 4: 84,49 - 84,5 Мб Chr 5: 101.66 - 101.66 Мб PubMed поиск[3] [4] Викиданные
Гомеобокс протеин Nkx-6.1 это белок что у людей кодируется NKX6-1 ген .[5] [6]
Функция
в поджелудочная железа , NKX6.1 требуется для разработки бета-клетки и представляет собой мощный бифункциональный регулятор транскрипции, который связывается с последовательностями, богатыми AT, в промоторной области генов-мишеней.[6]
Рекомендации
^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163623 - Ансамбль , Май 2017^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035187 - Ансамбль , Май 2017^ "Справочник человека по PubMed:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .^ "Ссылка на Mouse PubMed:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .^ Иноуэ Х., Рудник А., Герман М.С., Вейле Р., Донис-Келлер Х., Пермутт, Массачусетс (март 1997 г.). «Выделение, характеристика и хромосомное картирование человеческого гена Nkx6.1 (NKX6A), нового гена гомеобокса островков поджелудочной железы». Геномика . 40 (2): 367–70. Дои :10.1006 / geno.1996.4568 . PMID 9119408 . ^ а б "Entrez Gene: NK6 homeobox 1" .дальнейшее чтение
Schisler JC, Fueger PT, Babu DA и др. (2008). «Стимуляция пролиферации островковых бета-клеток человека и крысы с сохранением функции фактора транскрипции гомеодомена Nkx6.1» . Мол. Клетка. Биол . 28 (10): 3465–76. Дои :10.1128 / MCB.01791-07 . ЧВК 2423154 . PMID 18347054 . Хори Й, Гу Икс, Се Икс, Ким СК (2005). «Дифференциация инсулин-продуцирующих клеток от клеток-предшественников нейронов человека» . PLOS Med . 2 (4): e103. Дои :10.1371 / journal.pmed.0020103 . ЧВК 1087208 . PMID 15839736 . Йоргенсен М.С., Вестергирд Петерсен Х., Эриксон Дж. И др. (1999). «Клонирование и ДНК-связывающие свойства фактора Nkx6.1, специфичного для бета-клеток поджелудочной железы крысы». FEBS Lett . 461 (3): 287–94. Дои :10.1016 / S0014-5793 (99) 01436-2 . PMID 10567713 . S2CID 1735843 . Айпе Т., Тейлор Д.Г., Зисманн С.М. и др. (2004). «Репрессор транскрипции Nkx6.1 также функционирует как контекстно-зависимый активатор транскрипции дезоксирибонуклеиновой кислоты во время дифференцировки бета-клеток поджелудочной железы: свидетельство обратной связи активации гена nkx6.1 посредством Nkx6.1» . Мол. Эндокринол . 18 (6): 1363–75. Дои :10.1210 / мес.2004-0006 . PMID 15056733 . Ёкои Н., Канамори М., Хорикава Ю. и др. (2006). «Ассоциативные исследования вариантов генов, участвующих в функции бета-клеток поджелудочной железы при диабете 2 типа у японцев» . Сахарный диабет . 55 (8): 2379–86. Дои :10.2337 / db05-1203 . PMID 16873704 . Zhu S, Xia HH, Yang Y, et al. (2009). «Изменения экспрессии гомеопротеина желудка при инфекции Helicobacter pylori, резцовой антрализации и кишечной метаплазии». Копать землю. Dis. Наука . 54 (5): 996–1002. Дои :10.1007 / s10620-008-0459-8 . PMID 18754095 . S2CID 25173708 . Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США , который находится в всеобщее достояние .
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния (bZIP )(1.2) Базовая спираль-петля-спираль (bHLH )
Группа А Группа B Группа C bHLH-PAS Группа D Группа E Группа F bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP (1.4) НФ-1 (1.5) RF-X (1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
(2) Цинковый палец ДНК-связывающие домены
(2.1) Ядерный рецептор (Cys4 )
подсемейство 1 подсемейство 2 подсемейство 3 подсемейство 4 подсемейство 5 подсемейство 6 подсемейство 0
(2.2) Другой Cys4 (2.3) Cys2 Его2 (2.4) Cys6 (2.5) Чередующийся состав (2.6) WRKY
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(0) Другие факторы транскрипции
смотрите также дефицит фактора транскрипции / корегулятора