FOXJ1 - FOXJ1

FOXJ1
Идентификаторы
ПсевдонимыFOXJ1, FKHL13, HFH-4, HFH4, вилка J1, CILD43
Внешние идентификаторыOMIM: 602291 MGI: 1347474 ГомолоГен: 1117 Генные карты: FOXJ1
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Genomic location for FOXJ1
Genomic location for FOXJ1
Группа17q25.1Начинать76,136,333 бп[1]
Конец76,141,245 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001454

NM_008240

RefSeq (белок)

NP_001445

NP_032266

Расположение (UCSC)Chr 17: 76.14 - 76.14 МбChr 11: 116.33 - 116.34 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Протеин для вилки J1 это белок что у людей кодируется FOXJ1 ген.[5] Он входит в состав Forkhead / winged helix (ЛИСА ) семья факторы транскрипции что участвует в цилиогенез.[6] FOXJ1 экспрессируется в реснитчатых клетках легкого,[7] сосудистое сплетение,[8] половые пути,[9] эмбриональная почка и пре-сомитная стадия эмбриона.[10]

Расположение гена

Человек FOXJ1 Ген расположен на длинном плече хромосомы 17, область 2, полоса 5, поддиапазон 1.[11]

Структура

FOXJ1 имеет консервативный ДНК-связывающий домен длиной 100 аминокислот.[12]

Функция

Этот ген кодирует член вилка семейство факторов транскрипции. Сходные гены у рыбок данио и мышей, как было показано, регулируют транскрипцию генов, которые контролируют производство подвижных ресничек. Ортолог мыши также действует при определении лево-правая асимметрия.[5]

Цилиогенез

Начальный цилиогенез является FOXJ1-зависимым, и этот фактор транскрипции необходим для подвижного реснитчатый дифференцировка клеток. Начало экспрессии FOXJ1 указывает на то, что клеткам суждено стать подвижными клетками с ресничками.[13] Клетки совершают цилиогенез до активации FOXJ1. Активация способствует базальное тело торговля, стыковка в апикальная мембрана и последующие аксонема рост.[14] Белок p73 входит в состав белок p53 семья напрямую регулирует FOXJ1 и является требованием для образования реснитчатых клеток. Сайт начала транскрипции длиной 10 000 п.н. FOXJ1 имеет три сайта связывания, специфичных для последовательности p73.[15]

Иммунная система

В клетках млекопитающих FOXJ1 подавляет NFκB, ключевой регулятор иммунного ответа[16] а также подавляет гуморальный ответ в В-клетки. Это происходит посредством регуляции ингибирующего компонента NFκB, называемого IκBβ и IL-6.[17]

Разработка

FOXJ1 экспрессируется в различных точках эмбрионального развития, связанных с прорастанием зубов, эмали, ротовой полости и языка. эпителий формирование и формирование поднижнечелюстных слюнных желез и волосяных фолликулов.[18] Отсутствие экспрессии FOXJ1 снижается кальпастатин, ингибитор протеазы Кальпаин. Нарушение регуляции кальпаина влияет на закрепление базального тела в апикальном цитоскелете, влияя на формирование аксеонемы.[19] Экспрессия FOXJ1 ингибируется IL-13.[20]

Клиническое значение

Полиморфизмы в этом гене связаны с системная красная волчанка и аллергический ринит.[5]

Было обнаружено, что вирусные инфекции дыхательной системы снижают экспрессию FOXJ1. Это влияет на цилиогенез и мукоциллярный действие.[21]

Рак молочной железы

Исследования линий тканей груди человека и первичных опухолей груди показали, что ген FOXJ1 аберрантно гиперметилированы в первичных опухолях. Это гиперметилирование служит для подавления продукции белка FOXJ1 и было предложено как потенциально важное событие в образовании опухоли.[22]

Чистая почечно-клеточная карцинома

Было показано, что экспрессия FOXJ1 повышена у пациентов со светлоклеточным раком почек и указывает на стадию опухоли, гистологический степень и размер опухоли. Высокая экспрессия FOXJ1 у пациентов с CRCC была связана с плохим прогнозом. FOXJ1 потенциально может действовать как онкоген маркер для пациентов с CRCC и имеет ценность в качестве терапевтической мишени.[23]

Синдром Аксенфельда – Ригера

Синдром Аксенфельда – Ригера пациенты имеют точечную мутацию в PITX2 регуляторный белок FOXJ1 ген. PITX2 рядом с LEF-1 и β-катенин регулировать FOXJ1. FOXJ1, в свою очередь, взаимодействует с PITX2, чтобы сформировать механизм положительной обратной связи. У точечного мутанта PITX2, способного связываться с FOXJ1, отсутствует способность активировать FOXJ1 промотора, это приводит к неправильному морфогенезу орально-лицевого нерва, что является фактором при ОРС.[24]

Гидроцефалия

Мутации в этом гене были связаны с аутосомно-доминантным синдромом, который включает: гидроцефалия и рандомизация асимметрии левого / правого тела.[25]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000129654 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034227 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c "Entrez Gene: вилка J1".
  6. ^ Yu X, Ng CP, Habacher H, Roy S (декабрь 2008 г.). «Факторы транскрипции Foxj1 являются главными регуляторами подвижной цилиогенной программы». Природа Генетика. 40 (12): 1445–53. Дои:10,1038 / нг.263. PMID  19011630. S2CID  205347068.
  7. ^ Blatt EN, Yan XH, Wuerffel MK, Hamilos DL, Brody SL (август 1999 г.). «Экспрессия фактора транскрипции Forkhead HFH-4 временно связана с цилиогенезом». Американский журнал респираторной клетки и молекулярной биологии. 21 (2): 168–76. CiteSeerX  10.1.1.317.9961. Дои:10.1165 / ajrcmb.21.2.3691. PMID  10423398.
  8. ^ Лим Л., Чжоу Х., Коста Р. Х. (апрель 1997 г.). «Фактор транскрипции крылатой спирали HFH-4 экспрессируется во время развития эпителия сосудистого сплетения у эмбриона мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (7): 3094–9. Bibcode:1997PNAS ... 94.3094L. Дои:10.1073 / пнас.94.7.3094. ЧВК  20327. PMID  9096351.
  9. ^ Hackett BP, Brody SL, Liang M, Zeitz ID, Bruns LA, Gitlin JD (май 1995 г.). «Первичная структура ядерного фактора гепатоцитов / гомолог 4 вилки и характеристика экспрессии генов в развивающемся респираторном и репродуктивном эпителии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (10): 4249–53. Bibcode:1995PNAS ... 92.4249H. Дои:10.1073 / пнас.92.10.4249. ЧВК  41921. PMID  7753791.
  10. ^ Пеллетье Г.Дж., Броуди С.Л., Лиапис Х., Уайт Р.А., Хакетт Б.П. (март 1998 г.). «Человеческий фактор транскрипции вилкообразной / крылатой спирали, экспрессирующийся в развивающемся легочном и почечном эпителии». Американский журнал физиологии. 274 (3, часть 1): L351–9. Дои:10.1152 / ajplung.1998.274.3.L351. PMID  9530170.
  11. ^ Джексон BC, Карпентер С., Неберт Д.В., Василиу В. (июнь 2010 г.). «Обновление семейств генов человека и мышей (FOX)». Геномика человека. 4 (5): 345–52. Дои:10.1186/1479-7364-4-5-345. ЧВК  3500164. PMID  20650821.
  12. ^ Clevidence DE, Overdier DG, Tao W., Qian X, Pani L, Lai E., Costa RH (май 1993 г.). «Идентификация девяти тканеспецифических факторов транскрипции семейства гепатоцитарного ядерного фактора 3 / ДНК-связывающего домена вилки». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 90 (9): 3948–52. Bibcode:1993PNAS ... 90.3948C. Дои:10.1073 / пнас.90.9.3948. ЧВК  46423. PMID  7683413.
  13. ^ Джайн Р., Пан Дж., Дрисколл Дж. А., Виснер Дж. В., Хуанг Т., Гунстен С. П., Ю Й, Броди С. Л. (декабрь 2010 г.). «Временная взаимосвязь между первичным и подвижным цилиогенезом в эпителиальных клетках дыхательных путей». Американский журнал респираторной клетки и молекулярной биологии. 43 (6): 731–9. Дои:10.1165 / rcmb.2009-0328OC. ЧВК  2993092. PMID  20118219.
  14. ^ Ю Й, Хуанг Т., Ричер Э. Дж., Шмидт Дж., Забнер Дж., Борок З., Броди С. Л. (апрель 2004 г.). «Роль f-box фактора foxj1 в дифференцировке реснитчатых эпителиальных клеток дыхательных путей». Американский журнал физиологии. Клеточная и молекулярная физиология легких. 286 (4): L650–7. Дои:10.1152 / ajplung.00170.2003. PMID  12818891. S2CID  17661686.
  15. ^ Marshall CB, Mays DJ, Beeler JS, Rosenbluth JM, Boyd KL, Santos Guasch GL, Shaver TM, Tang LJ, Liu Q, Shyr Y, Venters BJ, Magnuson MA, Pietenpol JA (март 2016 г.). «p73 необходим для полицилиогенеза и регулирует генную сеть, ассоциированную с Foxj1». Отчеты по ячейкам. 14 (10): 2289–300. Дои:10.1016 / j.celrep.2016.02.035. ЧВК  4794398. PMID  26947080.
  16. ^ Линь Л., Спур М.С., Герт А.Дж., Броди С.Л., Пэн С.Л. (февраль 2004 г.). «Модуляция активации Th1 и воспаления репрессором NF-kappaB Foxj1». Наука. 303 (5660): 1017–20. Bibcode:2004Научный ... 303.1017Л. Дои:10.1126 / science.1093889. PMID  14963332. S2CID  85412475.
  17. ^ Линь Л., Броуди С.Л., Пэн С.Л. (июль 2005 г.). «Сдерживание активации В-клеток с помощью Foxj1-опосредованного антагонизма NF-каппа B и IL-6». Журнал иммунологии. 175 (2): 951–8. Дои:10.4049 / jimmunol.175.2.951. PMID  16002694.
  18. ^ Venugopalan SR, Amen MA, Wang J, Wong L, Cavender AC, D'Souza RN, Akerlund M, Brody SL, Hjalt TA, Amendt BA (декабрь 2008 г.). «Новая экспрессия и регуляция транскрипции FoxJ1 во время орофациального морфогенеза». Молекулярная генетика человека. 17 (23): 3643–54. Дои:10.1093 / hmg / ddn258. ЧВК  2733810. PMID  18723525.
  19. ^ Гомпертс Б.Н., Гонг-Купер Х, Хакетт Б.П. (март 2004 г.). "Foxj1 регулирует прикрепление базального тела к цитоскелету мерцательных эпителиальных клеток легких". Журнал клеточной науки. 117 (Pt 8): 1329–37. Дои:10.1242 / jcs.00978. PMID  14996907.
  20. ^ Гомпертс Б.Н., Ким Л.Дж., Флаэрти С.А., Хакетт Б.П. (сентябрь 2007 г.). «IL-13 регулирует потерю ресничек и экспрессию foxj1 в эпителии дыхательных путей человека». Американский журнал респираторной клетки и молекулярной биологии. 37 (3): 339–46. Дои:10.1165 / rcmb.2006-0400OC. ЧВК  2720122. PMID  17541011.
  21. ^ Посмотрите DC, Уолтер MJ, Williamson MR, Pang L, You Y, Sreshta JN, Johnson JE, Zander DS, Brody SL (декабрь 2001 г.). «Влияние парамиксовирусной инфекции на экспрессию Foxj1 эпителиальных клеток дыхательных путей, цилиогенез и мукоцилиарную функцию». Американский журнал патологии. 159 (6): 2055–69. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 63057-X. ЧВК  1850590. PMID  11733356.
  22. ^ Демиркан Б., Дайер Л.М., Джерас М., Лобенхофер Е.К., Робертсон К.Д., Браун К.Д. (январь 2009 г.). «Сравнительная эпигеномика опухолей молочной железы человека и мыши». Гены, хромосомы и рак. 48 (1): 83–97. Дои:10.1002 / gcc.20620. ЧВК  2929596. PMID  18836996.
  23. ^ Чжу П, Пяо И, Дон Х, Цзинь Цзинь (сентябрь 2015 г.). «Экспрессия форкхед-бокса J1 повышается и коррелирует с прогнозом у пациентов со светлоклеточной почечно-клеточной карциномой». Письма об онкологии. 10 (3): 1487–1494. Дои:10.3892 / ol.2015.3376. ЧВК  4533638. PMID  26622696.
  24. ^ Венугопалан С.Р., Амен М.А., Ван Дж., Вонг Л., Кавендер А.С., Д'Суза Р.Н., Акерлунд М., Броуди С.Л., Хьялт Т.А., Амендт Б.А. (декабрь 2008 г.). «Новая экспрессия и регуляция транскрипции FoxJ1 во время орофациального морфогенеза». Молекулярная генетика человека. 17 (23): 3643–54. Дои:10.1093 / hmg / ddn258. ЧВК  2733810. PMID  18723525.
  25. ^ Валлмайер, Джулия; Фрэнк, Диана; Шумарк, Амелия; Нёте-Менхен, Табеа; Синдрик, Сандра; Ольбрих, Хайке; Логес, Ники Т .; Апреа, Изабелла; Догерти, Джерард В .; Пеннекамп, Петра; Кайзер, Томас (ноябрь 2019 г.). «Мутации De Novo в FOXJ1 приводят к подвижной цилиопатии с гидроцефалией и рандомизацией асимметрии левого / правого тела». Американский журнал генетики человека. 105 (5): 1030–1039. Дои:10.1016 / j.ajhg.2019.09.022. ISSN  0002-9297. ЧВК  6849114. PMID  31630787.

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.