Ретинобластома-подобный белок 1 - Retinoblastoma-like protein 1

RBL1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1H28, 4ЛЕТ, 4лет, 4 года
Идентификаторы
Псевдонимы	RBL1, CP107, PRB1, p107, ретинобластома-подобный 1, транскрипционный корепрессор RB, подобный 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 116957 MGI: 103300 ГомолоГен: 2172 Генные карты: RBL1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q11.23 Начинать 36,996,349 бп[1] Конец 37,095,997 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 H1 | 2 78,05 см Начинать 157,145,893 бп[2] Конец 157,204,534 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание фактора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • промотор-специфическое связывание хроматина • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • РНК-полимераза II, активирующая связывание фактора транскрипции Сотовый компонент • ядро клетки • комплекс регуляторов транскрипции • нуклеоплазма • хроматин Биологический процесс • регулирование клеточного цикла • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • клеточный цикл • GO: 0022415 вирусный процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция активности липидкиназы • отрицательная регуляция экспрессии генов • транскрипция, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция клеточного старения • организация хроматина • регуляция митотического клеточного цикла • дифференциация клеток • регуляция деления клеток • отрицательная регуляция перехода G1 / S митотического клеточного цикла Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5933	19650
Ансамбль	ENSG00000080839	ENSMUSG00000027641
UniProt	P28749	Q64701
RefSeq (мРНК)	NM_002895 NM_183404 NM_001323281 NM_001323282	NM_001139516 NM_011249
RefSeq (белок)	NP_001310210 NP_001310211 NP_002886 NP_899662	NP_001132988 NP_035379
Расположение (UCSC)	Chr 20:37 - 37,1 Мб	Chr 2: 157.15 - 157,2 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ретинобластома-подобная 1 (p107), также известный как RBL1, это белок что у людей кодируется RBL1 ген.^[5][6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, аналогичен по последовательности и, возможно, по своей функции продукту ретинобластома 1 (RB1 ) ген. Продукт гена RB1 представляет собой белок-супрессор опухолей который, похоже, участвует в клеточный цикл регуляции, так как он фосфорилируется при фазовом переходе S в M и дефосфорилируется в фазе G1 клеточного цикла. И белок RB1, и продукт этого гена могут образовывать комплекс с аденовирус Белок E1A и SV40 Большой Т-антиген, с SV40 большое связывание Т-антигена только с нефосфорилированной формой каждого белка. Кроме того, оба белка могут ингибировать транскрипцию генов клеточного цикла, содержащих E2F сайты связывания в их промоутеры. Из-за последовательности и биохимического сходства с белком RB1 считается, что белок, кодируемый этим геном, также может быть супрессором опухоли. Два варианта транскрипции, кодирующие разные изоформы были обнаружены для этого гена.^[5]

Взаимодействия

Белок 1, подобный ретинобластоме, может взаимодействовать с:

• НАЧАТЬ,^[7]
• BRCA1,^[8]
• BRF1,^[9]
• Циклин А2,^[10][11]
• Циклинзависимая киназа 2,^[12][13]
• E2F1,^[10]
• HDAC1,^[14][15]
• MYBL2^[11][16]
• Матери против декапентаплегического гомолога 3,^[17]
• Prohibitin,^[18] и
• RBBP8.^[19][7]

Смотрите также

• Карманное семейство протеинов

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000080839 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027641 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Ген: RBL1, подобный ретинобластоме 1 (p107)».
6. Ewen ME, Xing YG, Лоуренс JB, Ливингстон DM (сентябрь 1991 г.). «Молекулярное клонирование, хромосомное картирование и экспрессия кДНК для p107, белка, родственного продукту гена ретинобластомы». Клетка. 66 (6): 1155–64. Дои:10.1016 / 0092-8674 (91) 90038-Z. PMID  1833063. S2CID  27478008.
7. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
8. Fan S, Yuan R, Ma YX, Xiong J, Meng Q, Erdos M, Zhao JN, Goldberg ID, Pestell RG, Rosen EM (август 2001 г.). «Нарушение мотива LXCXE BRCA1 изменяет функциональную активность BRCA1 и регуляцию семейства RB, но не связывает белок RB». Онкоген. 20 (35): 4827–41. Дои:10.1038 / sj.onc.1204666. PMID  11521194.
9. Сатклифф Дж. Э., Кэрнс, Калифорния, Маклис А., Эллисон С. Дж., Тош К., Уайт Р. Дж. (Июнь 1999 г.). «Фактор транскрипции РНК-полимеразы III IIIB является мишенью для репрессии карманных белков p107 и p130». Молекулярная и клеточная биология. 19 (6): 4255–61. Дои:10.1128 / mcb.19.6.4255. ЧВК  104385. PMID  10330166.
10. Дайсон Н., Дембски М., Фаттей А., Нгву К., Юэн М., Хелин К. (декабрь 1993 г.). «Анализ p107-ассоциированных белков: p107 ассоциирует с формой E2F, которая отличается от pRB-ассоциированного E2F-1». Журнал вирусологии. 67 (12): 7641–7. Дои:10.1128 / JVI.67.12.7641-7647.1993. ЧВК  238233. PMID  8230483.
11. Хоакин М., Бесса М., Сэвилл М.К., Уотсон Р.Дж. (ноябрь 2002 г.). «B-Myb преодолевает опосредованный p107 блок пролиферации клеток, взаимодействуя с N-концевым доменом p107». Онкоген. 21 (52): 7923–32. Дои:10.1038 / sj.onc.1206001. PMID  12439743.
12. Шанахан Ф., Сегеззи В., Парри Д., Махони Д., Лис Е. (февраль 1999 г.). «Циклин E связывается с BAF155 и BRG1, компонентами комплекса SWI-SNF млекопитающих, и изменяет способность BRG1 вызывать остановку роста». Молекулярная и клеточная биология. 19 (2): 1460–9. Дои:10.1128 / mcb.19.2.1460. ЧВК  116074. PMID  9891079.
13. Ленг Х, Благородный М., Адамс П.Д., Цинь Дж., Харпер Дж. У. (апрель 2002 г.). «Отмена подавления роста p107 посредством прямого фосфорилирования циклин D1 / циклин-зависимой киназы 4». Молекулярная и клеточная биология. 22 (7): 2242–54. Дои:10.1128 / mcb.22.7.2242-2254.2002. ЧВК  133692. PMID  11884610.
14. Лай А., Ли Дж. М., Ян В. М., Де Каприо Дж. А., Кэлин В. Г., Сето Е., Брантон П. Э. (октябрь 1999 г.). «RBP1 рекрутирует как зависимую от гистондеацетилазы, так и независимую репрессивную активность белков семейства ретинобластомы». Молекулярная и клеточная биология. 19 (10): 6632–41. Дои:10.1128 / mcb.19.10.6632. ЧВК  84642. PMID  10490602.
15. Феррейра Р., Магнаги-Джаулин Л., Робин П., Харел-Беллан А., Траш Д. (сентябрь 1998 г.). «Три члена семейства карманных белков обладают общей способностью подавлять активность E2F за счет привлечения гистондеацетилазы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (18): 10493–8. Bibcode:1998PNAS ... 9510493F. Дои:10.1073 / пнас.95.18.10493. ЧВК  27922. PMID  9724731.
16. Хоакин М., Уотсон Р.Дж. (ноябрь 2003 г.). «Фактор транскрипции B-Myb, регулируемый клеточным циклом, преодолевает активность p57 (KIP2) по ингибированию циклин-зависимой киназы, взаимодействуя с его циклин-связывающим доменом». Журнал биологической химии. 278 (45): 44255–64. Дои:10.1074 / jbc.M308953200. PMID  12947099.
17. Чен К.Р., Кан Й., Сигел П.М., Массаге Дж. (Июль 2002 г.). «E2F4 / 5 и p107 как кофакторы Smad, связывающие рецептор TGFbeta с репрессией c-myc». Клетка. 110 (1): 19–32. Дои:10.1016 / s0092-8674 (02) 00801-2. PMID  12150994. S2CID  8945574.
18. Ван С., Нат Н., Адлам М., Челлаппан С. (июнь 1999 г.). «Prohibitin, потенциальный супрессор опухолей, взаимодействует с RB и регулирует функцию E2F». Онкоген. 18 (23): 3501–10. Дои:10.1038 / sj.onc.1202684. PMID  10376528.
19. Фуско К., Реймонд А., Зервос А.С. (август 1998 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика нового связывающего ретинобластому белка». Геномика. 51 (3): 351–8. Дои:10.1006 / geno.1998.5368. PMID  9721205.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

дальнейшее чтение

• Фаха Б., Юэн М.Э., Цай Л.Х., Ливингстон Д.М., Харлоу Э. (январь 1992 г.). «Взаимодействие между циклином A человека и белком p107, ассоциированным с аденовирусом E1A». Наука. 255 (5040): 87–90. Bibcode:1992 Наука ... 255 ... 87F. Дои:10.1126 / science.1532458. PMID  1532458.
• Ewen ME, Xing YG, Лоуренс JB, Ливингстон DM (сентябрь 1991 г.). «Молекулярное клонирование, хромосомное картирование и экспрессия кДНК для p107, белка, родственного продукту гена ретинобластомы». Клетка. 66 (6): 1155–64. Дои:10.1016 / 0092-8674 (91) 90038-Z. PMID  1833063. S2CID  27478008.
• Датта П.К., Райчаудхури П., Багчи С. (октябрь 1995 г.). «Ассоциация p107 с Sp1: генетически отделимые области p107 участвуют в регуляции E2F- и Sp1-зависимой транскрипции». Молекулярная и клеточная биология. 15 (10): 5444–52. Дои:10.1128 / mcb.15.10.5444. ЧВК  230794. PMID  7565695.
• Чжу Л., Чжу Л., Се Э, Чанг Л.С. (июль 1995 г.). «Различная роль двух тандемных сайтов E2F в репрессии человеческого промотора p107 ретинобластомой и белками p107». Молекулярная и клеточная биология. 15 (7): 3552–62. Дои:10.1128 / mcb.15.7.3552. ЧВК  230592. PMID  7791762.
• Сардет К., Видал М., Кобриник Д., Гэн Й., Онуфрик С., Чен А., Вайнберг Р.А. (март 1995 г.). «E2F-4 и E2F-5, два члена семейства E2F, экспрессируются на ранних фазах клеточного цикла». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (6): 2403–7. Bibcode:1995PNAS ... 92.2403S. Дои:10.1073 / пнас.92.6.2403. ЧВК  42492. PMID  7892279.
• Ким Ю.В., Оттерсон Г.А., Кратцке Р.А., Коксон А.Б., Кэй Ф.Дж. (ноябрь 1994 г.). «Дифференциальная специфичность связывания связывающего белка ретинобластомы 2 с RB, p107 и TATA-связывающим белком». Молекулярная и клеточная биология. 14 (11): 7256–64. Дои:10.1128 / mcb.14.11.7256. ЧВК  359260. PMID  7935440.
• Ginsberg D, Vairo G, Chittenden T., Xiao ZX, Xu G, Wydner KL, DeCaprio JA, Lawrence JB, Livingston DM (ноябрь 1994 г.). «E2F-4, новый член семейства факторов транскрипции E2F, взаимодействует с p107». Гены и развитие. 8 (22): 2665–79. Дои:10.1101 / gad.8.22.2665. PMID  7958924.
• Бейерсберген Р.Л., Керховен Р.М., Жу Л., Карле Л., Вурхув П.М., Бернардс Р. (ноябрь 1994 г.). «E2F-4, новый член семейства генов E2F, обладает онкогенной активностью и ассоциируется с p107 in vivo». Гены и развитие. 8 (22): 2680–90. Дои:10.1101 / gad.8.22.2680. PMID  7958925.
• Бейерсберген Р.Л., Хиджманс Е.М., Чжу Л., Бернардс Р. (сентябрь 1994 г.). «Взаимодействие c-Myc с pRb-родственным белком p107 приводит к ингибированию c-Myc-опосредованной трансактивации». Журнал EMBO. 13 (17): 4080–6. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06725.x. ЧВК  395329. PMID  8076603.
• Дайсон Н., Дембски М., Фаттей А., Нгву С., Юэн М., Хелин К. (декабрь 1993 г.). «Анализ p107-ассоциированных белков: p107 ассоциирует с формой E2F, которая отличается от pRB-ассоциированного E2F-1». Журнал вирусологии. 67 (12): 7641–7. Дои:10.1128 / JVI.67.12.7641-7647.1993. ЧВК  238233. PMID  8230483.
• Zhu L, van den Heuvel S, Helin K, Fattaey A, Ewen M, Livingston D, Dyson N, Harlow E (июль 1993 г.). «Ингибирование клеточной пролиферации с помощью p107, родственника белка ретинобластомы». Гены и развитие. 7 (7A): 1111–25. Дои:10.1101 / gad.7.7a.1111. PMID  8319904.
• Икеда М.А., Якой Л., Невинс-младший (апрель 1996 г.). «Уникальная роль белка Rb в контроле накопления E2F во время роста и дифференцировки клеток». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (8): 3215–20. Bibcode:1996PNAS ... 93.3215I. Дои:10.1073 / пнас.93.8.3215. ЧВК  39585. PMID  8622916.
• Сяо ZX, Гинзберг Д., Юэн М., Ливингстон Д.М. (май 1996 г.). «Регулирование белка р107, связанного с белком ретинобластомы, с помощью G1-циклин-ассоциированных киназ». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (10): 4633–7. Bibcode:1996PNAS ... 93.4633X. Дои:10.1073 / пнас.93.10.4633. ЧВК  39330. PMID  8643455.
• Видаль М., Брахманн Р.К., Фаттей А., Харлоу Э., Боке Д.Д. (сентябрь 1996 г.). «Обратные двугибридные и одногибридные системы для обнаружения диссоциации белок-белковых и ДНК-белковых взаимодействий». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (19): 10315–20. Bibcode:1996ПНАС ... 9310315В. Дои:10.1073 / пнас.93.19.10315. ЧВК  38381. PMID  8816797.
• Шао З., Зигерт Дж. Л., Рупперт С., Роббинс П. Д. (июль 1997 г.). «Rb взаимодействует с TAF (II) 250 / TFIID через несколько доменов». Онкоген. 15 (4): 385–92. Дои:10.1038 / sj.onc.1201204. PMID  9242374.
• Верона Р., Моберг К., Эстес С., Старз М., Вернон Дж. П., Лис Дж. А. (декабрь 1997 г.). «Активность E2F регулируется зависимыми от клеточного цикла изменениями в субклеточной локализации». Молекулярная и клеточная биология. 17 (12): 7268–82. Дои:10.1128 / mcb.17.12.7268. ЧВК  232584. PMID  9372959.
• Тримарчи Дж. М., Фэйрчайлд Б., Верона Р., Моберг К., Андон Н., Лис Дж. А. (март 1998 г.). «E2F-6, член семейства E2F, который может вести себя как репрессор транскрипции». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (6): 2850–5. Bibcode:1998PNAS ... 95.2850T. Дои:10.1073 / пнас.95.6.2850. ЧВК  19658. PMID  9501179.
• Штернер Дж. М., Дью-Найт С., Мусал С., Корнблут С., Горовиц Дж. М. (май 1998 г.). «Отрицательная регуляция репликации ДНК белком ретинобластомы опосредована его ассоциацией с MCM7». Молекулярная и клеточная биология. 18 (5): 2748–57. Дои:10.1128 / mcb.18.5.2748. ЧВК  110654. PMID  9566894.
• Woitach JT, Zhang M, Niu CH, Thorgeirsson SS (август 1998). «Связывающий ретинобластому белок, который влияет на контроль клеточного цикла и придает трансформирующую способность». Природа Генетика. 19 (4): 371–4. Дои:10.1038/1258. PMID  9697699. S2CID  11374970.
• Телятина Э, Эйзенштейн М., Ценг Ж., Гилл Дж. (Сентябрь 1998 г.). «Клеточный репрессор генов, стимулированных E1A, который ингибирует активацию E2F». Молекулярная и клеточная биология. 18 (9): 5032–41. Дои:10.1128 / mcb.18.9.5032. ЧВК  109088. PMID  9710587.

внешняя ссылка

• RBL1 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)