BHLHB2 - BHLHB2

BHLHE40
Идентификаторы
Псевдонимы	BHLHE40, BHLHB2, DEC1, HLHB2, SHARP-2, STRA13, Stra14, основной член семейства спираль-петля-спираль e40, Clast5, SHARP2
Внешние идентификаторы	OMIM: 604256 MGI: 1097714 ГомолоГен: 2722 Генные карты: BHLHE40
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 3 (человек)
Конец	4,985,323 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 6 (мышь)
Конец	108,666,925 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание ДНК; • активность димеризации белков; • активность гомодимеризации белков; • Привязка MRF; • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность; • специфическое связывание белкового домена; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • РНК-полимераза II, активирующая связывание фактора транскрипции; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • связывание фактора транскрипции bHLH; • Переплет электронного ящика; • GO: 0001948 связывание с белками; • активность гетеродимеризации белков; • активность фактора транскрипции, связывание с дистальной энхансерной последовательностью РНК-полимеразы II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II; • связывание фактора транскрипции; • последовательное связывание ДНК; • Последовательно-специфичное связывание двухцепочечной ДНК;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • ядро клетки; • ядерное тело;
Биологический процесс	• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • ответ на световой раздражитель; • ритмический процесс; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • циркадная регуляция экспрессии генов; • транскрипция, ДНК-шаблон; • отрицательная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции; • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • увлечение циркадных часов фотопериодом; • циркадный ритм; • сомитогенез; • Notch сигнальный путь; • дифференциация клеток; • регуляция нейрогенеза;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	8553
	20893
	ENSG00000134107
	ENSMUSG00000030103
	O14503
	O35185
	NM_003670
	NM_011498
	NP_003661
	NP_035628
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Основной белок спираль-петля-спираль класса E 40 это белок что у людей кодируется BHLHE40 ген.^[5]^[6]^[7]^[8]

Функция

DEC1 кодирует основной белок спираль-петля-спираль, экспрессируемый в различных тканях. Экспрессия в хондроцитах зависит от добавления Bt2cAMP. Полагают, что ген 1, экспрессируемый дифференцированным эмбрионом в хондроцитах, участвует в контроле дифференцировки клеток.^[8]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000134107 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030103 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Шен М., Кавамото Т., Ян В., Накамасу К., Тамагами М., Кояно И., Ноширо М., Като Ю. (июль 1997 г.). «Молекулярная характеристика нового основного белка спираль-петля-спираль DEC1, экспрессируемого в дифференцированных хондроцитах человеческого эмбриона». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 236 (2): 294–8. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6960. PMID 9240428.
^ Антоневич Т., Танежа Р. (октябрь 1999 г.). «Присвоение 1 гена Stra13 человека (STRA13) хромосоме 3p26 путем гибридизации in situ». Цитогенетика и клеточная генетика. 85 (3–4): 254–5. Дои:10.1159/000015305. PMID 10449910. S2CID 25761427.
^ Стивенс Дж. Д., Роалсон Э. Х., Скиннер МК (ноябрь 2008 г.). "Филогенетический анализ и анализ экспрессии основного семейства генов факторов транскрипции спираль-петля-спираль: геномный подход к клеточной дифференцировке". Дифференциация; Исследования в области биологического разнообразия. 76 (9): 1006–22. Дои:10.1111 / j.1432-0436.2008.00285.x. ЧВК 5728086. PMID 18557763.
^ ^а ^б "Ген Entrez: BHLHB2, содержащий основной домен спираль-петля-спираль, класс B, 2".

дальнейшее чтение

Терамото М., Накамасу К., Ноширо М., Мацуда Ю., Гото О, Шен М., Цуцуми С., Кавамото Т., Ивамото Ю., Като Ю. (март 2001 г.). «Структура гена и хромосомная локализация человеческого фактора транскрипции bHLH DEC1 x Stra13 x SHARP-2 / BHLHB2». Журнал биохимии. 129 (3): 391–6. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a002869. PMID 11226878.
Иванова А.В., Иванов С.В., Данилкович-Мягкова А., Лерман М.И. (май 2001 г.). «Регулирование STRA13 с помощью белка-супрессора опухоли фон Хиппеля-Линдау, гипоксии и пути деградации протеасомы UBC9 / убиквитина». Журнал биологической химии. 276 (18): 15306–15. Дои:10.1074 / jbc.M010516200. PMID 11278694.
Сун Х., Лу Б., Ли Р. К., Флавелл Р. А., Танежа Р. (ноябрь 2001 г.). «Дефектная активация Т-клеток и аутоиммунное расстройство у мышей с дефицитом Stra13». Иммунология природы. 2 (11): 1040–7. Дои:10.1038 / ni721. PMID 11668339. S2CID 26633291.
Юн Д.Ю., Бухлер П., Саарикоски С.Т., Хайнс О.Дж., Ребер Х.А., Ханкинсон О. (ноябрь 2001 г.). «Идентификация генов, дифференциально индуцированных гипоксией в раковых клетках поджелудочной железы». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 288 (4): 882–6. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5867. PMID 11688991.
Ли И, Чжан Х, Се М, Ху М, Ге С., Ян Д., Ван И, Ян Б. (октябрь 2002 г.). «Обильная экспрессия Dec1 / stra13 / sharp2 при карциноме толстой кишки: его антагонизирующая роль в апоптозе, вызванном лишением сыворотки, и селективном ингибировании активации прокаспазы». Биохимический журнал. 367 (Pt 2): 413–22. Дои:10.1042 / BJ20020514. ЧВК 1222902. PMID 12119049.
St-Pierre B, Flock G, Zacksenhaus E, Egan SE (ноябрь 2002 г.). «Гомодимеры Stra13 репрессируют транскрипцию через элементы E-бокса класса B». Журнал биологической химии. 277 (48): 46544–51. Дои:10.1074 / jbc.M111652200. PMID 12297495.
Miyazaki K, Kawamoto T., Tanimoto K, Nishiyama M, Honda H, Kato Y (декабрь 2002 г.). «Идентификация функциональных элементов ответа на гипоксию в промоторной области генов DEC1 и DEC2». Журнал биологической химии. 277 (49): 47014–21. Дои:10.1074 / jbc.M204938200. PMID 12354771.
Шен М., Ёсида Е., Ян В., Кавамото Т., Суардита К., Кояно И., Фудзимото К., Ноширо М., Като Ю. (декабрь 2002 г.). «Основной белок спираль-петля-спираль DEC1 способствует дифференцировке хондроцитов на ранних и конечных стадиях». Журнал биологической химии. 277 (51): 50112–20. Дои:10.1074 / jbc.M206771200. PMID 12384505.
Хонма С., Кавамото Т., Такаги Ю., Фудзимото К., Сато Ф., Ноширо М., Като Ю., Хонма К. (октябрь 2002 г.). «Dec1 и Dec2 являются регуляторами молекулярных часов млекопитающих». Природа. 419 (6909): 841–4. Bibcode:2002Натура.419..841H. Дои:10.1038 / природа01123. PMID 12397359.
Ли И, Се М., Сон Х, Граген С., Сачдева К., Ван И, Ян Б. (май 2003 г.). «DEC1 отрицательно регулирует экспрессию DEC2 посредством связывания с E-box в проксимальном промоторе». Журнал биологической химии. 278 (19): 16899–907. Дои:10.1074 / jbc.M300596200. PMID 12624110.
Гиатроманолаки А., Кукуракис М.И., Сивридис Э., Терли Х., Вайкофф С.К., Гаттер К.С., Харрис А.Л. (июнь 2003 г.). «Экспрессия белка DEC1 (STRA13) связана с гипоксией-индуцируемым фактором 1-альфа и сверхэкспрессией карбоангидразы-9 при немелкоклеточном раке легкого». Журнал патологии. 200 (2): 222–8. Дои:10.1002 / путь.1330. PMID 12754744. S2CID 26744393.
Иванова А.В., Иванов С.В., Чжан Х, Иванов В.Н., Тимофеева О.А., Лерман М.И. (июл 2004 г.). «STRA13 взаимодействует со STAT3 и модулирует транскрипцию STAT3-зависимых мишеней». Журнал молекулярной биологии. 340 (4): 641–53. Дои:10.1016 / j.jmb.2004.05.025. PMID 15223310.
Сато Ф., Кавамото Т., Фудзимото К., Ноширо М., Хонда К.К., Хонма С., Хонма К., Като Й. (ноябрь 2004 г.). «Функциональный анализ основного фактора транскрипции спираль-петля-спираль DEC1 в циркадной регуляции. Взаимодействие с BMAL1». Европейский журнал биохимии / FEBS. 271 (22): 4409–19. Дои:10.1111 / j.1432-1033.2004.04379.x. PMID 15560782.
Иванова А.В., Иванов С.В., Лерман М.Л. (фев 2005). «Ассоциация, взаимная стабилизация и транскрипционная активность белков STRA13 и MSP58». Клеточные и молекулярные науки о жизни. 62 (4): 471–84. Дои:10.1007 / s00018-004-4423-2. PMID 15719173. S2CID 6528873.
Иванова А., Ляо С.Ю., Лерман М.И., Иванов С., Стэнбридж Е.Д. (июль 2005 г.). «Экспрессия STRA13 и субклеточная локализация в нормальных и опухолевых тканях: значение для использования в качестве диагностического и дифференцирующего маркера». Журнал медицинской генетики. 42 (7): 565–76. Дои:10.1136 / jmg.2004.029835. ЧВК 1736099. PMID 15994878.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (сентябрь 2005 г.). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Ячейка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.

внешние ссылки

BHLHB2 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
FactorBook BHLHE40
Человек BHLHE40 расположение генома и BHLHE40 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
Человек DEC1 расположение генома и 1 декабря страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
Человек STRA13 расположение генома и STRA13 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

Эта статья о ген на хромосома человека 3 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000134107 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030103 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid9240428-5] Шен М., Кавамото Т., Ян В., Накамасу К., Тамагами М., Кояно И., Ноширо М., Като Ю. (июль 1997 г.). «Молекулярная характеристика нового основного белка спираль-петля-спираль DEC1, экспрессируемого в дифференцированных хондроцитах человеческого эмбриона». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 236 (2): 294–8. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6960. PMID 9240428.

[pmid10449910-6] Антоневич Т., Танежа Р. (октябрь 1999 г.). «Присвоение 1 гена Stra13 человека (STRA13) хромосоме 3p26 путем гибридизации in situ». Цитогенетика и клеточная генетика. 85 (3–4): 254–5. Дои:10.1159/000015305. PMID 10449910. S2CID 25761427.

[pmid18557763-7] Стивенс Дж. Д., Роалсон Э. Х., Скиннер МК (ноябрь 2008 г.). "Филогенетический анализ и анализ экспрессии основного семейства генов факторов транскрипции спираль-петля-спираль: геномный подход к клеточной дифференцировке". Дифференциация; Исследования в области биологического разнообразия. 76 (9): 1006–22. Дои:10.1111 / j.1432-0436.2008.00285.x. ЧВК 5728086. PMID 18557763.

[entrez-8] а ^б "Ген Entrez: BHLHB2, содержащий основной домен спираль-петля-спираль, класс B, 2".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]