ARNTL - ARNTL

ARNTL
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыARNTL, BMAL1, BMAL1c, JAP3, MOP3, PASD3, TIC, bHLHe5, ядерный транслокатор рецептора арилуглеводорода, подобный
Внешние идентификаторыOMIM: 602550 MGI: 1096381 ГомолоГен: 910 Генные карты: ARNTL
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE ARNTL 209824 s на fs.png

PBB GE ARNTL 210971 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

406

11865

Ансамбль

ENSG00000133794

ENSMUSG00000055116

UniProt

O00327

Q9WTL8

RefSeq (мРНК)

NM_001243048
NM_007489
NM_001357070
NM_001368412
NM_001374642

RefSeq (белок)

NP_001229977
NP_031515
NP_001343999
NP_001355341
NP_001361571

Расположение (UCSC)н / дChr 7: 113.21 - 113.31 Мб
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Ядерный транслокатор-подобный белок 1 рецептора арилуглеводородов (ARNTL) или ARNT-подобный 1 для мозга и мышц (BMAL1) это белок что у людей кодируется Bmal1 ген, также известный как ARNTL, MOP3и, реже, BHLHE5, BMAL, BMAL1C, JAP3, PASD3 и TIC.

BMAL1 кодирует фактор транскрипции с основная спираль-петля-спираль (bHLH) и два PAS домены. Человек Arntl ген предсказал 24 экзоны и находится на полосе p15 11-я хромосома.[4] Белок BMAL1 - 626 аминокислоты долго и играет ключевую роль в качестве одного из положительных элементов ауторегуляции млекопитающих. петля отрицательной обратной связи транскрипции-трансляции (TTFL), который отвечает за генерацию молекулярных циркадные ритмы. Исследования показали, что Bmal1 - единственный ген часов, без которого циркадные часы не могут работать у человека.[5] Bmal1 также был идентифицирован как ген-кандидат на чувствительность к гипертония, сахарный диабет, и ожирение,[6][7] и мутации в Bmal1 были связаны с бесплодие, глюконеогенез и липогенез проблемы и изменены спать узоры.[8] BMAL1, согласно полногеномному профилированию, нацелен на более чем 150 сайтов в геноме человека, включая все гены часов и гены, кодирующие белки, регулирующие метаболизм.[9]

История

В Arntl ген был первоначально открыт в 1997 году двумя группами исследователей, Джон Б. Хогенеш и другие. в марте под названием Швабра3 [10] Икеда и Номура в апреле[11] как часть суперсемейства факторов транскрипции домена PAS.[10] В 1998 году дополнительная характеристика MOP3 Хогенешем показала, что его роль в качестве партнера транскрипционного фактора bHLH-PAS ЧАСЫ был важен для функции циркадных часов млекопитающих.[12] Было обнаружено, что белок MOP3, как он был первоначально известен группой Hogenesch, димеризовать с MOP4, ЧАСЫ, и факторы, вызываемые гипоксией.[10] Названия BMAL1 и ARNTL были приняты в более поздних работах. Одна из самых ранних обнаруженных функций белка ARNTL в регуляции циркадных ритмов была связана с CLOCK-BMAL1 (CLOCK-ARNTL). гетеродимер, который будет связываться через Электронная коробка усилитель для активации транскрипция гена, кодирующего вазопрессин.[13] Однако важность гена в циркадные ритмы не был полностью реализован до тех пор, пока нокаут гена у мышей не показал полную потерю циркадных ритмов в локомоции и других формах поведения.[14]

Генетика

Регулирование Bmal1 Мероприятия

SIRT1 регулирует деградацию белка PER путем ингибирования транскрипционной активности гетеродимера BMAL1: CLOCK циркадным образом посредством деацетилирование.[15] Распад белков PER предотвращает образование большого белкового комплекса и, таким образом, подавляет транскрипционную активность BMAL1: CLOCK. гетеродимер. Белок CRY также сигнализируется о деградации за счет полиубиквитинирования из FBXL3 белок, приводящий к растормаживанию BMAL1: CLOCK гетеродимер Мероприятия.[16]

В дополнение к циркадной регуляторной петле TTFL, Bmal1 транскрипция регулируется путем конкурентного связывания с ретиноевая кислота -связанные с сиротский рецептор сайт связывания элемента ответа (RORE) в промоторе Bmal1. Гетеродимер CLOCK / BMAL1 также связывается с элементами E-box в промоторных областях Rev-Erbα и гены RORα / ß, активирующие транскрипцию и перевод белков REV-ERB и ROR. Белки REV-ERBα и ROR регулируют экспрессию BMAL1 через вторичную петлю обратной связи и конкурируют за связывание с Rev-Erb/ ROR элементы ответа в Bmal1 промотор, в результате чего экспрессия BMAL1 подавляется REV-ERBα и активируется белками ROR. Другие ядерные рецепторы тех же семейств (NR1D2 (Рев-эрб-β); NR1F2 (ROR-β); и NR1F3 (ROR-γ)) также действует на Bmal1 транскрипционная активность аналогичным образом.[17][18][19][20]

Несколько посттрансляционные модификации BMAL1 определяют синхронизацию петель обратной связи CLOCK / BMAL1. Фосфорилирование BMAL1 нацелен на убиквитинирование и деградацию, а также на деубиквитинирование и стабилизацию. Ацетилирование BMAL1 привлекает CRY1 для подавления трансактивация ЧАСОВ / BMAL1.[21] В сумоилирование BMAL1 малым убиквитин-родственный модификатор 3 сигнализирует о своем убиквитинирование в ядре, что приводит к трансактивация гетеродимера CLOCK / BMAL1.[22] Трансактивация CLOCK / BMAL1,[23] активируется фосфорилированием казеинкиназой 1ε и ингибируется фосфорилированием MAPK.[24] Фосфорилирование CK2α регулирует внутриклеточную локализацию BMAL1 [25] и фосфорилирование GSK3B контролирует стабильность BMAL1 и настраивает его для убиквитинирование.[26]

В 2004 г. Рора было обнаружено, что это активатор Bmal1 транскрипция в супрахиазматическом ядре (SCN), регулируемая его основными часами.[27] Было обнаружено, что Рора необходима для нормального Bmal1 выраженность, а также укрепление повседневной двигательной активности.[27] Это говорит о том, что противоположные активности орфанных ядерных рецепторов RORA и REV-ERBα, последний из которых репрессирует Bmal1 экспрессии, важны для поддержания функции циркадных часов.[27] В настоящее время, Рора расследуется на предмет связи с аутизм, что может быть следствием его функции в качестве регулятора циркадных ритмов.[28]

Резюме регулирования активности Bmal1
Регулятор / модификатор Bmal1Положительный или отрицательный регуляторПрямой или косвенныйМеханизмИсточник (и)
SIRT1ОтрицательныйнепосредственныйBMAL1: ЧАСЫ гетеродимерного деацетилирования[15]
FBLX3ПоложительныйКосвенныйПолиубиквитинирование PER способствует деградации PER[16]
REV-ERBα / βОтрицательныйнепосредственныйРепрессия путем связывания промотора Bmal1[18][19][20]
ROR-α / β / γПоложительныйнепосредственныйАктивация путем связывания промотора Bmal1[17][18][19][27]
АцетилированиеОтрицательныйнепосредственныйРекрутирует CRY1 для ингибирования гетеродимера BMAL1: CLOCK[21]
Малый модификатор, связанный с убиквитином 3ПоложительныйнепосредственныйСумоилирование BMAL1[22]
Казеинкиназа 1εПоложительныйнепосредственныйФосфорилирование гетеродимера CLOCK / BMAL1[23]
MAPKПоложительныйнепосредственныйФосфорилирование гетеродимера CLOCK / BMAL1[24]
CK2αНе понятнонепосредственныйФосфорилирование BMAL1[25]
GSK3BПоложительныйнепосредственныйФосфорилирование BMAL1[26]

Распространение видов

Наряду с млекопитающими, такими как люди и мыши, ортологи из Arntl ген также обнаружен у рыб (AF144690.1),[29] птицы (Arntl),[30] рептилии, амфибии (XI.2098) и Дрозофила (Цикл, который кодирует белок, у которого отсутствует гомологичный C-концевой домен, но все еще димеризуется с белком CLOCK).[31] В отличие от млекопитающих Arntl, циркадные регулируемые, Дрозофила Цикл (ген) выражается конститутивно.[32] У человека были обнаружены три варианта транскрипта, кодирующие две разные изоформы этого гена.[11] Важность этих вариантов транскрипции неизвестна.

Мутации и болезни

В Arntl Ген расположен в локусах предрасположенности к гипертонии хромосомы 1 у крыс. Исследование однонуклеотидный полиморфизм (SNP) в этом локусе обнаружили два полиморфизма, которые встречаются в последовательности, кодирующей Arntl и были связаны с сахарный диабет II типа и гипертония. При переводе с модели крысы на модель человека это исследование предполагает причинную роль Arntl генная изменчивость при патологии сахарного диабета II типа.[33] Последние данные фенотипа также предполагают, что этот ген[34] и его партнер Clock[35] играют роль в регуляции глюкозы гомеостаз и метаболизм, что может привести к гипоинсулинемия или диабет при нарушении.[36]

Что касается других функций, другое исследование показывает, что комплекс CLOCK / BMAL1 активирует человеческий LDLR промоторная активность, предполагающая Arntl ген также играет роль в холестерин гомеостаз.[37] Кроме того, было показано, что BMAL1 влияет на возбудимость и судорожный порог.[38] К тому же, Arntl экспрессия гена, наряду с экспрессией других генов основных часов, была обнаружена ниже у пациентов с биполярное расстройство, что указывает на проблемы с циркадной функцией у этих пациентов.[39] SNP в Bmal1 был идентифицирован как имеющий связь с биполярным расстройством.[40] Arntl, Npas2, и Per2 также были связаны с сезонное аффективное расстройство в людях.[41] У пациентов с болезнью Альцгеймера наблюдаются разные ритмы метилирования BMAL1, что позволяет предположить, что его неправильная регуляция способствует когнитивному дефициту.[42] Исследования также показали, что BMAL1 и другие гены часов управляют экспрессией генов, контролируемых часами, которые связаны с расстройством аутистического спектра (РАС).[43] Наконец, Arntl был идентифицирован с помощью функциональных генетический скрининг в качестве предполагаемого регулятора супрессор опухолей p53 Этот путь предполагает возможное участие в циркадных ритмах раковых клеток.[44]

В моделях животных рассеянный склероз (MS), а именно экспериментальный аутоиммунный энцефаломиелит (EAE) было показано, что суточные циркадные ритмы могут играть важную роль в патологии болезни.[45] Индуцирование EAE посредством активной иммунизации мышей с миелиновый олигодендроцитарный гликопротеин (MOG) пептид во время фазы покоя более эффективен по сравнению с пептидом во время активной фазы.[46] Неравенство в индукции EAE критически зависит от экспрессии BMAL1 в Т-клетки и миелоидные клетки. Т-клеточная или миелоид-специфическая делеция Bmal1 было показано, что он вызывает более серьезную патологию и достаточен для отмены эффекта покоя по сравнению с активной индукцией.[46]

Структура

Белок BMAL1 содержит четыре домена в соответствии с его кристаллографической структурой: bHLH домен, два домена PAS, называемые PAS-A и PAS-B, и трансактивирующий домен. Димеризация белков CLOCK: BMAL1 включает сильные взаимодействия между bHLH, PAS A и PAS B как в CLOCK, так и в BMAL1 и образует асимметричный гетеродимер с тремя различными интерфейсами белков. Взаимодействие PAS-A между CLOCK и BMAL1 включает взаимодействие, в котором α-спираль ЧАСОВ PAS-A и ß-лист BMAL1 PAS-A, и мотив α-спирали домена BMAL1 PAS-A и ß-лист CLOCK PAS-A.[47] Домены CLOCK и BMAL1 PAS-B складываются параллельно, что приводит к сокрытию различных гидрофобных остатков на ß-листе BMAL1 PAS-B и спиральной поверхности CLOCK PAS-B, таких как Тюр 310 и Phe 423.[47] Ключевые взаимодействия с определенными аминокислотными остатками, особенно ЧАСЫ Его 84 и BMAL1 Лея 125, важны в димеризации этих молекул.[48]

Функция

Циркадные часы

Белок, кодируемый Bmal1 ген у млекопитающих связывается со вторым белком bHLH-PAS через домен PAS, ЧАСЫ (или его паралог, NPAS2 ) с образованием гетеродимера в ядре.[16] Через свой домен BHLH этот гетеродимер связывается с Электронная коробка элементы ответа[16] в промоутер регионы За (Per1 и Per2 ) и Плакать гены (Cry1 и Cry2 ).[16] Это связывание активирует транскрипцию Per1, Per2, Cry1 и Cry2 мРНК.

Петли TTFL активности Bmal1

После того, как белки PER и CRY накапливаются до достаточного уровня, они взаимодействуют своими мотивами PAS с образованием большого репрессорного комплекса, который перемещается в ядро ​​и ингибирует транскрипционную активность гетеродимера CLOCK: BMAL1. [49] Это ингибирует гетеродимерную активацию транскрипции За и Плакать гены, и вызывает падение уровня белка PER и CRY. Эта петля отрицательной обратной связи транскрипции-трансляции (TTFL) модулируется в цитоплазме путем фосфорилирования белков PER казеинкиназой 1ε или δ (CK1 ε или CK1 δ), нацеливая эти белки на деградацию протеасомой 26S.[16][50] Петля TTFL ночных мышей уровни транскрипции гена Bmal1 достигают пика на CT18, в середине субъективной ночи, противофазно уровням транскрипции За, Плакатьи другие гены, управляющие часами, пик которых достигает CT6 в середине субъективного дня. Этот процесс происходит с периодом около 24 часов и подтверждает представление о ритмичности этого молекулярного механизма.[51]

Нокаут-исследования

В Arntl Ген является важным компонентом регуляторной сети часовых генов млекопитающих. Это точка чувствительности в сети, поскольку это единственный ген, единичный нокаут которого в мышиной модели вызывает аритмичность как на молекулярном, так и на поведенческом уровнях.[14] Помимо дефектов в часах, эти Арнтл-нулевые мыши также имеют репродуктивные проблемы,[52] небольшого роста, быстро стареют,[53] и иметь прогрессивный артропатия[54] это приводит к меньшей общей двигательной активности, чем у мышей дикого типа. Однако недавние исследования показывают, что в циркадной функции организма может быть некоторая избыточность. Arntl со своим паралогом Bmal2.[55] BMAL1 KO не является эмбрионально летальным, и мыши с BMAL1, удаленным во взрослом возрасте, не проявляют симптомов мышей BMAL1 KO.[56]

Связывание BMAL1 тканеспецифично регулируется многочисленными факторами, в том числе не циркадными.[57] Затем тканеспецифические КО вызывают уникальные эффекты. BMAL1 важен для метаболизм костей так как остеобласт У мышей BMAL1 KO костная масса ниже, чем у их собратьев дикого типа.[58] Он также важен для энергетического метаболизма, поскольку BMAL1 модулирует регуляцию метаболитов в печени, секрецию инсулина и пролиферацию островков поджелудочной железы, а также дифференцировку и липогенез адипоцитов.[42] Любопытно, что глобальный KO BMAL1 не влияет на активность упреждающего приема пищи (FAA) у мышей, но делеции BMAL1 в определенных областях гипоталамуса за пределами SCN устраняют FAA.[59] Нокаут-исследования показали, что BMAL1 является ключевым посредником между циркадными часами и реакцией иммунной системы. Потеря Ccl2 регуляции BMAL1 KO в миелоидных клетках приводит к нарушению моноцит рекрутинг, клиренс патогенов и противовоспалительный ответ (соответствует фенотипу артропатии).[60] Иммунные клетки, такие как TNF-α и ИЛ-1β реципрокно подавляют активность BMAL1.[60] Наконец, BMAL1 взаимодействует с HSF1 запускает синхронизацию часов и высвобождение факторов, способствующих выживанию, подчеркивая вклад BMAL1 в клеточный стресс и реакции на выживание.[61]

Взаимодействия

Arntl был показан взаимодействовать с:

Смотрите также

  • Arntl2 - Arntl2 (Bmal2) представляет собой паралог Arntl (Bmal1), который кодирует фактор транскрипции основного домена PAS спираль-петля-спираль. Было показано, что он также играет циркадную роль, поскольку его белок BMAL2 образует транскрипционно активный гетеродимер с белком CLOCK. Это также может играть роль при гипоксии.[67]
  • Цикл - Цикл - это Дрозофила меланогастр ортолог Arntl.

Рекомендации

  1. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000055116 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Подобный ядерному транслокатору рецептор ARNTL арилуглеводород [Homo sapiens (человек)]». Национальный центр биотехнологической информации.
  5. ^ Репперт С.М., Уивер Д.Р. (август 2002 г.). «Координация суточного ритма у млекопитающих». Природа. 418 (6901): 935–41. Bibcode:2002Натура 418..935р. Дои:10.1038 / природа00965. PMID  12198538. S2CID  4430366.
  6. ^ Паппа К.И., Газули М., Анастасиу Э., Илиодромити З., Анцаклис А., Анагноу Н.П. (февраль 2013 г.). «Главный циркадный кардиостимулятор ARNT-подобный протеин-1 (BMAL1) связан с предрасположенностью к гестационному сахарному диабету». Исследования диабета и клиническая практика. 99 (2): 151–7. Дои:10.1016 / j.diabres.2012.10.015. PMID  23206673.
  7. ^ Ричардс Дж, Диаз А.Н., Гумз М.Л. (октябрь 2014 г.). «Гены часов при гипертонии: новые идеи, полученные на моделях грызунов». Мониторинг артериального давления. 19 (5): 249–54. Дои:10.1097 / MBP.0000000000000060. ЧВК  4159427. PMID  25025868.
  8. ^ «Ген ARNTL». Генные карты: Сборник генома человека. Lifemap Sciences, Inc.
  9. ^ Хатанака Ф., Мацубара С., Мён Дж., Йоритака Т., Камимура Н., Цуцуми С., Канаи А., Судзуки Ю., Сассоне-Корси П., Абуратани Х., Сугано С., Такуми Т. (декабрь 2010 г.). «Полногеномное профилирование основных тактовых белков-мишеней BMAL1 показывает строгую связь с метаболизмом». Молекулярная и клеточная биология. 30 (24): 5636–48. Дои:10.1128 / MCB.00781-10. ЧВК  3004277. PMID  20937769.
  10. ^ а б c d Хогенеш Дж. Б., Чан В. К., Джеки В. Х., Браун Р. К., Гу Ю. З., Прей-Грант М., Пердью Г. Х., Брэдфилд, Калифорния (март 1997 г.). «Характеристика подмножества суперсемейства basic-helix-loop-helix-PAS, которое взаимодействует с компонентами пути передачи сигналов диоксина». Журнал биологической химии. 272 (13): 8581–93. Дои:10.1074 / jbc.272.13.8581. PMID  9079689.
  11. ^ а б Икеда М., Номура М. (апрель 1997 г.). «Клонирование кДНК и тканеспецифическая экспрессия нового основного белка спираль-петля-спираль / PAS (BMAL1) и идентификация альтернативно сплайсированных вариантов с использованием альтернативного сайта инициации трансляции». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 233 (1): 258–64. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6371. PMID  9144434.
  12. ^ Ко CH, Takahashi JS (октябрь 2006 г.). «Молекулярные компоненты циркадных часов млекопитающих». Молекулярная генетика человека. 15 Спец. № 2 (прил_2): Р271-7. Дои:10.1093 / hmg / ddl207. PMID  16987893.
  13. ^ Джин X, Shearman LP, Weaver DR, Zylka MJ, de Vries GJ, Reppert SM (январь 1999 г.). «Молекулярный механизм, регулирующий ритмический выход супрахиазматических циркадных часов». Клетка. 96 (1): 57–68. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80959-9. PMID  9989497. S2CID  6916996.
  14. ^ а б Bunger MK, Wilsbacher LD, Moran SM, Clendenin C, Radcliffe LA, Hogenesch JB, Simon MC, Takahashi JS, Bradfield CA (декабрь 2000 г.). «Mop3 является важным компонентом главного кардиостимулятора у млекопитающих». Клетка. 103 (7): 1009–17. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 00205-1. ЧВК  3779439. PMID  11163178.
  15. ^ а б Ашер Г., Гатфилд Д., Стратманн М., Рейнке Х., Дибнер С., Креппель Ф., Мостославский Р., Альт Ф. В., Шиблер Ю. (июль 2008 г.). «SIRT1 регулирует экспрессию гена циркадных часов посредством деацетилирования PER2». Клетка. 134 (2): 317–28. Дои:10.1016 / j.cell.2008.06.050. PMID  18662546. S2CID  17267748.
  16. ^ а б c d е ж Бур ЭД, Такахаши Дж.С. (2013). «Молекулярные компоненты циркадных часов млекопитающих». Циркадные часы. Справочник по экспериментальной фармакологии. 217. С. 3–27. Дои:10.1007/978-3-642-25950-0_1. ISBN  978-3-642-25949-4. ЧВК  3762864. PMID  23604473.
  17. ^ а б Акаси М., Такуми Т. (май 2005 г.). «Орфанный ядерный рецептор RORalpha регулирует циркадную транскрипцию основных часов Bmal1 млекопитающих». Структурная и молекулярная биология природы. 12 (5): 441–8. Дои:10.1038 / nsmb925. PMID  15821743. S2CID  20040952.
  18. ^ а б c Guillaumond F, Dardente H, Giguère V, Cermakian N (октябрь 2005 г.). «Дифференциальный контроль циркадной транскрипции Bmal1 с помощью ядерных рецепторов REV-ERB и ROR». Журнал биологических ритмов. 20 (5): 391–403. Дои:10.1177/0748730405277232. PMID  16267379. S2CID  33279857.
  19. ^ а б c Уэда Х.Р., Хаяси С., Чен В., Сано М., Мачида М., Сигэёси Ю., Иино М., Хашимото С. (февраль 2005 г.). «Идентификация на системном уровне транскрипционных схем, лежащих в основе циркадных часов млекопитающих». Природа Генетика. 37 (2): 187–92. Дои:10,1038 / ng1504. PMID  15665827. S2CID  18112337.
  20. ^ а б Лю А.С., Чан Х.Г., Чжан Э.Э., священник А.А., Валлийский округ Колумбия, Кей С.А. (февраль 2008 г.). «Избыточная функция REV-ERBalpha и beta и несущественная роль для цикла Bmal1 в регуляции транскрипции внутриклеточных циркадных ритмов». PLOS Genetics. 4 (2): e1000023. Дои:10.1371 / journal.pgen.1000023. ЧВК  2265523. PMID  18454201.
  21. ^ а б Хираяма Дж., Сахар С., Гримальди Б., Тамару Т., Такамацу К., Накахата Ю., Сассоне-Корси П. (декабрь 2007 г.). «CLOCK-опосредованное ацетилирование BMAL1 контролирует циркадную функцию». Природа. 450 (7172): 1086–90. Bibcode:2007Натура.450.1086H. Дои:10.1038 / природа06394. PMID  18075593. S2CID  4340848.
  22. ^ а б c Lee J, Lee Y, Lee MJ, Park E, Kang SH, Chung CH, Lee KH, Kim K (октябрь 2008 г.). «Двойная модификация BMAL1 с помощью SUMO2 / 3 и убиквитина способствует циркадной активации комплекса CLOCK / BMAL1». Молекулярная и клеточная биология. 28 (19): 6056–65. Дои:10.1128 / MCB.00583-08. ЧВК  2546997. PMID  18644859.
  23. ^ а б Eide EJ, Vielhaber EL, Hinz WA, Virshup DM (май 2002 г.). «Циркадные регуляторные белки BMAL1 и криптохромы являются субстратами казеинкиназы Iepsilon». Журнал биологической химии. 277 (19): 17248–54. Дои:10.1074 / jbc.m111466200. ЧВК  1513548. PMID  11875063.
  24. ^ а б Санада К., Окано Т., Фукада Ю. (январь 2002 г.). «Активированная митогеном протеинкиназа фосфорилирует и отрицательно регулирует основной фактор транскрипции« спираль-петля-спираль-PAS »BMAL1». Журнал биологической химии. 277 (1): 267–71. Дои:10.1074 / jbc.m107850200. PMID  11687575.
  25. ^ а б Тамару Т., Хираяма Дж., Исодзима Ю., Нагаи К., Нориока С., Такамацу К., Сассоне-Корси П. (апрель 2009 г.). «CK2alpha фосфорилирует BMAL1 для регулирования часов млекопитающих». Структурная и молекулярная биология природы. 16 (4): 446–8. Дои:10.1038 / nsmb.1578. ЧВК  6501789. PMID  19330005.
  26. ^ а б Сахар С., Зоччи Л., Киношита С., Боррелли Е., Сассоне-Корси П. (январь 2010 г.). «Регулирование стабильности белка BMAL1 и циркадной функции посредством GSK3beta-опосредованного фосфорилирования». PLOS ONE. 5 (1): e8561. Bibcode:2010PLoSO ... 5.8561S. Дои:10.1371 / journal.pone.0008561. ЧВК  2797305. PMID  20049328.
  27. ^ а б c d Сато Т.К., Панда С., Миралья Л.Дж., Рейес Т.М., Рудик Р.Д., Макнамара П., Наик К.А., Фитцджеральд Г.А., Кей С.А., Хогенеш Дж.Б. (август 2004 г.). «Стратегия функциональной геномики показывает Rora как компонент циркадных часов млекопитающих». Нейрон. 43 (4): 527–37. Дои:10.1016 / j.neuron.2004.07.018. PMID  15312651. S2CID  8938983.
  28. ^ Нгуен А., Раух Т.А., Пфайфер Г.П., Ху В.В. (август 2010 г.). «Глобальное профилирование метилирования линий лимфобластоидных клеток показывает эпигенетический вклад в расстройства аутистического спектра и новый ген-кандидат аутизма, RORA, белковый продукт которого снижается в мозге аутистов». Журнал FASEB. 24 (8): 3036–51. Дои:10.1096 / fj.10-154484. ЧВК  2909294. PMID  20375269.
  29. ^ Чермакиан Н., Уитмор Д., Фоулкс Н.С., Сассоне-Корси П. (апрель 2000 г.). «Асинхронные колебания двух партнеров ЧАСОВ рыбок данио показывают дифференциальное управление и функцию часов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 97 (8): 4339–44. Bibcode:2000PNAS ... 97.4339C. Дои:10.1073 / пнас.97.8.4339. ЧВК  18243. PMID  10760301.
  30. ^ Окано Т., Ямамото К., Окано К., Хирота Т., Касахара Т., Сасаки М., Таканака Ю., Фукада Ю. (сентябрь 2001 г.). «Гены часов шишковидной железы цыпленка: участие BMAL2 как двунаправленного регулятора в колебаниях циркадных часов». Гены в клетки. 6 (9): 825–36. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2001.00462.x. PMID  11554928.
  31. ^ Рутила Дж. Э., Сури В., Ле М, Со В. В., Росбаш М., Холл Дж. К. (май 1998 г.). «CYCLE - это второй часовой белок bHLH-PAS, необходимый для циркадной ритмичности и транскрипции периода дрозофилы и вне времени». Клетка. 93 (5): 805–14. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81441-5. PMID  9630224. S2CID  18175560.
  32. ^ Meireles-Filho AC, Amoretty PR, Souza NA, Kyriacou CP, Peixoto AA (октябрь 2006 г.). «Ритмическая экспрессия гена цикла в векторе гематофаговых насекомых». BMC Молекулярная биология. 7: 38. Дои:10.1186/1471-2199-7-38. ЧВК  1636064. PMID  17069657.
  33. ^ Woon PY, Kaisaki PJ, Bragança J, Bihoreau MT, Levy JC, Farrall M, Gauguier D (сентябрь 2007 г.). «Ядерный транслокатор рецептора арилуглеводородов (BMAL1) связан с предрасположенностью к гипертонии и диабету 2 типа». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 104 (36): 14412–7. Bibcode:2007PNAS..10414412W. Дои:10.1073 / pnas.0703247104. ЧВК  1958818. PMID  17728404.
  34. ^ Rudic RD, McNamara P, Curtis AM, Boston RC, Panda S, Hogenesch JB, Fitzgerald GA (ноябрь 2004 г.). «BMAL1 и ЧАСЫ, два важных компонента циркадных часов, участвуют в гомеостазе глюкозы». PLOS Биология. 2 (11): e377. Дои:10.1371 / journal.pbio.0020377. ЧВК  524471. PMID  15523558.
  35. ^ Турек Ф.В., Джошу К., Косака А., Линь Е., Иванова Г., МакДирмон Е., Лапоски А., Лоси-Олсон С., Истон А., Дженсен Д. Р., Экель Р. Х., Такахаши Дж. С., Басс Дж. (Май 2005 г.). «Ожирение и метаболический синдром у мышей-мутантов по циркадным часам». Наука. 308 (5724): 1043–5. Bibcode:2005Наука ... 308.1043Т. Дои:10.1126 / science.1108750. ЧВК  3764501. PMID  15845877.
  36. ^ Марчева Б., Рэмси К.М., Бур Э.Д., Кобаяши Ю., Су Х., Ко СН, Иванова Г., Омура С., Мо С., Витерна М. Х., Лопес Дж. П., Филипсон Л. Х., Брэдфилд, Калифорния, Кросби С. Д., ДжеБэйли Л., Ван X, Такахаши Дж. , Bass J (июль 2010 г.). «Нарушение работы компонентов часов CLOCK и BMAL1 приводит к гипоинсулинемии и диабету». Природа. 466 (7306): 627–31. Bibcode:2010Натура.466..627М. Дои:10.1038 / природа09253. ЧВК  2920067. PMID  20562852.
  37. ^ Ли Й.Дж., Хан Д.Х., Пак Ю.К., Чо Ш. (ноябрь 2012 г.). «Циркадная регуляция активности промотора рецептора липопротеинов низкой плотности с помощью CLOCK / BMAL1, Hes1 и Hes6». Экспериментальная и молекулярная медицина. 44 (11): 642–52. Дои:10.3858 / emm.2012.44.11.073. ЧВК  3509181. PMID  22913986.
  38. ^ Хан С., Нобили Л., Хатами Р., Лодденкемпер Т., Кайочен С., Дейк Д.Д., Эрикссон С.Х. (декабрь 2018 г.). «Циркадный ритм и эпилепсия». Ланцет. Неврология. 17 (12): 1098–1108. Дои:10.1016 / S1474-4422 (18) 30335-1. PMID  30366868. S2CID  53101791.
  39. ^ Ян С., Ван Донген Х.П., Ван К., Берреттини В., Бучан М. (февраль 2009 г.). «Оценка циркадной функции фибробластов у пациентов с биполярным расстройством». Молекулярная психиатрия. 14 (2): 143–55. Дои:10.1038 / mp.2008.10. PMID  18301395.
  40. ^ Charrier A, Olliac B, Roubertoux P, Tordjman S (апрель 2017 г.). «Гены часов и измененные ритмы сна и бодрствования: их роль в развитии психических расстройств». Международный журнал молекулярных наук. 18 (5): 938. Дои:10.3390 / ijms18050938. ЧВК  5454851. PMID  28468274.
  41. ^ Партонен Т., Трейтлайн Дж., Альпман А., Франк Дж., Йоханссон С., Депнер М., Арон Л., Ритчел М., Веллек С., Соронен П., Паунио Т., Кох А., Чен П., Латроп М., Адольфссон Р., Перссон М. Л., Каспер С. , Шаллинг М., Пелтонен Л., Шуман Г. (2007). «Три гена циркадных часов Per2, Arntl и Npas2 способствуют зимней депрессии». Анналы медицины. 39 (3): 229–38. Дои:10.1080/07853890701278795. PMID  17457720. S2CID  36387074.
  42. ^ а б Maiese K (25 августа 2017 г.). «Движение к ритму с генами часов (циркадных), аутофагией, mTOR и SIRT1 при дегенеративных заболеваниях и раке». Текущие нейрососудистые исследования. 14 (3): 299–304. Дои:10.2174/1567202614666170718092010. ЧВК  5600856. PMID  28721811.
  43. ^ Джеффри М.М., Николас А., Сперанца М., Джорджифф Н. (ноябрь 2016 г.). «Являются ли циркадные ритмы новыми путями для понимания расстройства аутистического спектра?». Журнал физиологии, Париж. 110 (4, ст. B): 434–438. Дои:10.1016 / j.jphysparis.2017.06.002. PMID  28625682. S2CID  28295989.
  44. ^ Маллендерс Дж., Фабиус А.В., Мадиредджо М., Бернардс Р., Бейерсберген Р.Л. (2009). «Широкомасштабный экран штрих-кода shRNA идентифицирует компонент циркадных часов ARNTL как предполагаемый регулятор пути подавления опухоли p53». PLOS ONE. 4 (3): e4798. Bibcode:2009PLoSO ... 4.4798M. Дои:10.1371 / journal.pone.0004798. ЧВК  2653142. PMID  19277210.
  45. ^ Druzd D, Matveeva O, Ince L, Harrison U, He W, Schmal C, Herzel H, Tsang AH, Kawakami N, Leliavski A, Uhl O, Yao L, Sander LE, Chen CS, Kraus K, de Juan A, Hergenhan С.М., Элерс М., Колецко Б., Хаас Р., Сольбах В., Остер Н., Шайерманн С. (январь 2017 г.). «Циркадные часы лимфоцитов контролируют перемещение лимфатических узлов и адаптивные иммунные ответы». Иммунитет. 46 (1): 120–132. Дои:10.1016 / j.immuni.2016.12.011. ЧВК  5263259. PMID  28087238.
  46. ^ а б Де Сомма Э., Джайн Р.В., Пун К.В., Тресиддер К.А., Сегал Дж. П., Гасемлоу Н. (май 2018 г.). «Хронобиологическая регуляция психосоциальных и физиологических исходов при рассеянном склерозе». Неврология и биоповеденческие обзоры. 88: 73–83. Дои:10.1016 / j.neubiorev.2018.03.011. PMID  29548931. S2CID  3910164.
  47. ^ а б Хуанг Н., Челлия Й., Шан Й., Тейлор К.А., Ю Ш., Партч С., Грин CB, Чжан Х., Такахаши Дж.С. (июль 2012 г.). «Кристаллическая структура гетеродимерного комплекса транскрипционных активаторов CLOCK: BMAL1». Наука. 337 (6091): 189–94. Bibcode:2012Наука ... 337..189H. Дои:10.1126 / science.1222804. ЧВК  3694778. PMID  22653727.
  48. ^ Ван З., Ву И, Ли Л., Су XD (февраль 2013 г.). «Межмолекулярное распознавание, выявленное сложной структурой основных доменов спираль-петля-спираль человека CLOCK-BMAL1 с E-box ДНК». Клеточные исследования. 23 (2): 213–24. Дои:10.1038 / cr.2012.170. ЧВК  3567813. PMID  23229515.
  49. ^ Боллинджер Т, Шиблер У (2014). «Циркадные ритмы - от генов до физиологии и болезней». Швейцарский медицинский еженедельник. 144: w13984. Дои:10.4414 / smw.2014.13984. PMID  25058693.
  50. ^ Maywood ES, Chesham JE, Smyllie NJ, Hastings MH (апрель 2014 г.). «Тау-мутация казеинкиназы 1ε устанавливает период пейсмекера млекопитающих посредством регуляции тактовых белков Period1 или Period2». Журнал биологических ритмов. 29 (2): 110–8. Дои:10.1177/0748730414520663. ЧВК  4131702. PMID  24682205.
  51. ^ Уэда Х.Р., Чен В., Адачи А., Вакамацу Х., Хаяши С., Такасуги Т., Нагано М., Накахама К., Сузуки И., Сугано С., Иино М., Шигеёси Ю., Хашимото С. (август 2002 г.). «Элемент ответа фактора транскрипции для экспрессии генов в течение циркадной ночи». Природа. 418 (6897): 534–9. Bibcode:2002Натура.418..534U. Дои:10.1038 / природа00906. PMID  12152080. S2CID  4406987.
  52. ^ Боден MJ, Kennaway DJ (сентябрь 2006 г.). «Циркадные ритмы и воспроизведение». Размножение. 132 (3): 379–92. Дои:10.1530 / rep.1.00614. PMID  16940279.
  53. ^ Кондратов Р.В. (май 2007 г.). «Роль циркадной системы и циркадных белков в старении». Обзоры исследований старения. 6 (1): 12–27. Дои:10.1016 / j.arr.2007.02.003. PMID  17369106. S2CID  5910503.
  54. ^ Бангер М.К., Валиссер Дж. А., Салливан Р., Мэнли П. А., Моран С. М., Кальшер В. Л., Колман Р. Дж., Брэдфилд, Калифорния (март 2005 г.). «Прогрессирующая артропатия у мышей с целевым нарушением локуса Mop3 / Bmal-1». Бытие. 41 (3): 122–32. Дои:10.1002 / gene.20102. PMID  15739187.
  55. ^ Ши С., Хида А., МакГиннесс О.П., Вассерман Д.Х., Ямазаки С., Джонсон С.Х. (февраль 2010 г.). «Ген циркадных часов Bmal1 несущественен; функциональная замена его паралогом, Bmal2». Текущая биология. 20 (4): 316–21. Дои:10.1016 / j.cub.2009.12.034. ЧВК  2907674. PMID  20153195.
  56. ^ Дирикс П., Ван Лааке Л. В., Гейсен Н. (январь 2018 г.). «Циркадные часы: от стволовых клеток к гомеостазу и регенерации тканей». EMBO отчеты. 19 (1): 18–28. Дои:10.15252 / набр.201745130. ЧВК  5757216. PMID  29258993.
  57. ^ Шостак А., Бруннер М. (март 2019 г.). «Помощь моих друзей - сотрудничество BMAL1 с нециркадными факторами транскрипции». Гены и развитие. 33 (5–6): 255–257. Дои:10.1101 / gad.324046.119. ЧВК  6411012. PMID  30824531.
  58. ^ Сонг С, Ван Дж, Ким Би, Лу Ц, Чжан З, Лю Х, Кан Х, Сунь И, Гуань Х, Фанг З, Ли Ф (27.09.2018). «Понимание роли циркадных ритмов в костном метаболизме: многообещающая цель вмешательства?». BioMed Research International. 2018: 9156478. Дои:10.1155/2018/9156478. ЧВК  6180976. PMID  30363685.
  59. ^ Каба М., Мендоза Дж. (24 мая 2018 г.). «Поведение предвкушения пищи у новорожденных кроликов и грызунов: новая информация о роли часовых генов». Границы эндокринологии. 9: 266. Дои:10.3389 / fendo.2018.00266. ЧВК  5976783. PMID  29881373.
  60. ^ а б Curtis AM, Bellet MM, Sassone-Corsi P, O'Neill LA (февраль 2014 г.). «Белки циркадных часов и иммунитет». Иммунитет. 40 (2): 178–86. Дои:10.1016 / j.immuni.2014.02.002. PMID  24560196.
  61. ^ Тамару Т., Икеда М. (июль 2016 г.). «Циркадная адаптация к стрессам клеточного повреждения: решающее взаимодействие BMAL1 и HSF1». Журнал физиологических наук. 66 (4): 303–6. Дои:10.1007 / s12576-016-0436-5. PMID  26910317. S2CID  5171959.
  62. ^ а б c d Hogenesch JB, Gu YZ, Jain S, Bradfield CA (май 1998 г.). «Базовая спираль-петля-спираль-PAS сирота MOP3 образует транскрипционно активные комплексы с циркадными факторами и факторами гипоксии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (10): 5474–9. Bibcode:1998PNAS ... 95.5474H. Дои:10.1073 / пнас.95.10.5474. ЧВК  20401. PMID  9576906.
  63. ^ Оое Н., Сайто К., Миками Н., Накатука И., Канеко Х. (январь 2004 г.). «Идентификация нового основного фактора спираль-петля-спираль-PAS, NXF, показывает конкурентную положительную регуляторную роль Sim2 в экспрессии гена дребрина, модулятора дендритного цитоскелета». Молекулярная и клеточная биология. 24 (2): 608–16. Дои:10.1128 / MCB.24.2.608-616.2004. ЧВК  343817. PMID  14701734.
  64. ^ а б Макнамара П., Сео С.Б., Рудик Р.Д., Сегал А., Чакраварти Д., Фитцджеральд Г.А. (июнь 2001 г.). «Регулирование ЧАСОВ и MOP4 рецепторами ядерных гормонов в сосудистой сети: гуморальный механизм для сброса периферических часов». Клетка. 105 (7): 877–89. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00401-9. PMID  11439184. S2CID  6251321.
  65. ^ Такахата С., Одзаки Т., Мимура Дж., Кикучи Ю., Согава К., Фудзи-Курияма Ю. (сентябрь 2000 г.). «Механизмы трансактивации факторов транскрипции часов мыши, mClock и mArnt3». Гены в клетки. 5 (9): 739–47. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2000.00363.x. PMID  10971655.
  66. ^ а б c Сюй Х., Густафсон К.Л., Саммонс П.Дж., Хан С.К., Петрушка, Северная Каролина, Раманатан С., Ли Х.В., Лю А.С., Партч С.Л. (июнь 2015 г.). «Криптохром 1 регулирует циркадные часы посредством динамического взаимодействия с С-концом BMAL1». Структурная и молекулярная биология природы. 22 (6): 476–484. Дои:10.1038 / nsmb.3018. ЧВК  4456216. PMID  25961797.
  67. ^ Хогенеш Дж. Б., Гу Ю. З., Моран С. М., Шимомура К., Рэдклифф Л. А., Такахаши Дж. С., Брэдфилд, Калифорния (июль 2000 г.). «Основной белок MOP9 спираль-петля-спираль-PAS является специфическим для мозга гетеродимерным партнером циркадных факторов и факторов гипоксии». Журнал неврологии. 20 (13): RC83. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.20-13-j0002.2000. ЧВК  6772280. PMID  10864977.

внешняя ссылка

  • Человек ARNTL расположение генома и ARNTL страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: O00327 (Белок 1 ядерного транслокатора человеческого рецептора арилуглеводородов) на PDBe-KB.
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q9WTL8 (Арил углеводородный рецептор мыши, ядерный транслокатор-подобный белок 1) на PDBe-KB.