IFI16 - IFI16

IFI16
Белок IFI16 PDB 2oq0.png
Доступные конструкции
PDBHuman UniProt search: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыIFI16, IFNGIP1, PYHIN2, интерферон гамма-индуцибельный белок 16
Внешние идентификаторыOMIM: 147586 MGI: 3695276 ГомолоГен: 115929 Генные карты: IFI16
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение IFI16
Геномное расположение IFI16
Группа1q23.1Начните158,999,968 бп[1]
Конец159,055,155 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE IFI16 208966 x at fs.png

PBB GE IFI16 208965 s в формате fs.png

PBB GE IFI16 206332 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001033384
NM_001177349
NM_001177350
NM_001368798
NM_001368799

RefSeq (белок)

н / д

Расположение (UCSC)Chr 1: 159 - 159,06 МбChr 1: 173,57 - 173,6 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Гамма-интерферон-индуцируемый белок Ifi-16 (Ifi-16) также известный как активатор транскрипции интерферон-индуцируемой миелоидной дифференцировки это белок что у людей кодируется IFI16 ген.[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует член семейства HIN-200 (гематопоэтические интерферон-индуцируемые ядерные антигены с 200 аминокислотными повторами) цитокины. Кодируемый белок содержит домены, участвующие в связывании ДНК, регуляции транскрипции и белок-белковых взаимодействиях. Белок локализуется в нуклеоплазма и ядрышки, и взаимодействует с p53,[8] ретинобластома-1 и BRCA1.[9] Он модулирует функцию p53 и подавляет рост клеток в Сигнальный путь Ras / Raf.[7] Было показано, что IFI16 играет роль в обнаружении внутриклеточных ДНК[10] - отличительный признак инфицированных вирусом клеток - а также был связан со смертью ВИЧ -зараженный хелперные CD4 Т-клетки от пироптоз, сильно воспалительная форма запрограммированной гибели клеток.[11][12]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163565 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000073491 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Трапани Дж. А., Браун К. А., Доусон М. Дж., Рамзи Р. Г., Эдди Р. Л., Show TB, White PC, Dupont B (октябрь 1992 г.). «Новый ген, конститутивно экспрессируемый в лимфоидных клетках человека, индуцируется интерфероном-гамма в миелоидных клетках». Иммуногенетика. 36 (6): 369–76. Дои:10.1007 / bf00218044. PMID  1526658. S2CID  1196925.
  6. ^ Трапани Дж. А., Доусон М., Апостолидис В. А., Браун К. А. (декабрь 1994 г.). «Геномная организация IFI16, интерферон-индуцируемого гена, экспрессия которого связана с дифференцировкой миелоидных клеток человека: корреляция предсказанных белковых доменов с организацией экзонов». Иммуногенетика. 40 (6): 415–24. Дои:10.1007 / bf00177824. PMID  7959953. S2CID  2602156.
  7. ^ а б «Энтрез Ген: интерферон IFI16, гамма-индуцибельный белок 16».
  8. ^ Оучи, Муцуко; Оучи, Тору (01.01.2008). «Роль IFI16 в повреждении ДНК и контрольной точке». Границы биологических наук. 13 (13): 236–239. Дои:10.2741/2673. ISSN  1093-9946. PMID  17981541.
  9. ^ Дутта, Дипанджан; Датта, Суджой; Веттил, Моханан Валия; Рой, Арунава; Ансари, Майрадж Ахмед; Икбал, Джавед; Чикоти, Лила; Кумар, Бинод; Джонсон, Карен Э. (2015-06-01). «BRCA1 регулирует опосредованное IFI16 врожденное ядерное восприятие ДНК вируса герпеса и последующую индукцию врожденной инфламмасомы и ответов интерферона-β». Патогены PLOS. 11 (6): e1005030. Дои:10.1371 / journal.ppat.1005030. ISSN  1553-7374. ЧВК  4487893. PMID  26121674.
  10. ^ Унтерхольцнер Л., Китинг С.Е., Баран М., Хоран К.А., Дженсен С.Б., Шарма С., Сироис С.М., Джин Т., Латц Э., Сяо Т.С., Фицджеральд К.А., Палудан С.Р., Боуи А.Г. (2010). «IFI16 - датчик врожденного иммунитета для внутриклеточной ДНК». Nat. Иммунол. 11 (11): 997–1004. Дои:10.1038 / ni.1932. ЧВК  3142795. PMID  20890285.
  11. ^ Монро К.М., Ян З., Джонсон-младший, Гэн Х, Дойч Г., Кроган Нью-Джерси, Грин WC (2014). «Датчик ДНК IFI16 необходим для гибели лимфоидных CD4 T-клеток, абортивно инфицированных ВИЧ». Наука. 343 (6169): 428–32. Bibcode:2014Наука ... 343..428М. Дои:10.1126 / science.1243640. ЧВК  3976200. PMID  24356113.
  12. ^ Дойч Г., Галлоуэй Н.Л., Гэн Х, Ян З., Монро К.М., Зепеда О, Хант П.В., Хатано Х., Совински С., Муньос-Ариас I, Грин В.К. (2014). «Гибель клеток в результате пироптоза приводит к истощению Т-лимфоцитов CD4 при инфекции ВИЧ-1». Природа. 505 (7484): 509–14. Bibcode:2014Натура.505..509D. Дои:10.1038 / природа12940. ЧВК  4047036. PMID  24356306.

дальнейшее чтение

внешние ссылки

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.