GBX2 - GBX2

GBX2
Идентификаторы
Псевдонимы	GBX2, гаструляция мозга гомеобокс 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 601135 MGI: 95668 ГомолоГен: 1138 Генные карты: GBX2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q37.2 Начинать 236,165,236 бп[1] Конец 236,168,386 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 D | 1 45,06 см Начинать 89,927,956 бп[2] Конец 89,931,179 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • последовательное связывание ДНК • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК с последовательностью корового промотора РНК-полимеразы II • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание фактора транскрипции • Связывание фактора транскрипции РНК-полимеразы II Сотовый компонент • ядро клетки Биологический процесс • развитие вегетативной нервной системы • морфогенез границы среднего и заднего мозга • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие таламуса • развитие заднего мозга • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • морфогенез трубки • транскрипция, ДНК-шаблон • развитие нервной системы • развитие мозжечка • пролиферация предшественников гранулярных клеток мозжечка • управление аксоном • развитие нейронов переднего мозга • пограничное развитие среднего и заднего мозга • ромбомер 2 развитие • морфогенез внутреннего уха • миграция клеток нервного гребня • ветвление, участвующее в морфогенезе кровеносных сосудов • клеточная пролиферация • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция развития нервной системы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2637	14472
Ансамбль	ENSG00000168505	ENSMUSG00000034486
UniProt	P52951	P48031
RefSeq (мРНК)	NM_001485 NM_001301687	NM_010262
RefSeq (белок)	NP_001288616 NP_001476	NP_034392
Расположение (UCSC)	Chr 2: 236.17 - 236.17 Мб	Chr 1: 89.93 - 89.93 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гомеобокс протеин GBX-2 это белок что у людей кодируется GBX2 ген.^[5][6][7]

Резюме

Gastrulation Brain Homeobox 2, или обычно известный как GBX2, представляет собой тип фактора транскрипции, который помогает в организации среднего и заднего мозга во время гаструляции. Задний мозг разбивается на семь или восемь ромбомеров во время гаструляции, а GBX2 отвечает за ромбомеры с первого по третий. GBX2 также участвует в передаче сигналов и экспрессии других генов. Было сказано, что существует пороговое требование для количества GBX2, поэтому то, что происходит, зависит от выраженной суммы. Напр., Определенные количества GBX2 необходимы для регулирования формирования переднего и заднего паттернов в заднем мозге. Если конкретный порог не достигнут, формирование паттерна не происходит. Так обстоит дело с другими генами, которые он помогает экспрессировать, как FGF8. С каждым геном связаны определенные заболевания. Мелкоклеточная карцинома толстой кишки и синдром Optiz-Gbbb, которые вызывают аномалии по всей средней линии тела, являются заболеваниями, наиболее тесно связанными с геном GBX2. ^[8]

Функция

Gastrulation Brain Homeobox 2 (GBX2) - это гомеобокс ген, участвующий в нормальном развитии ромбомеры 1-3, которая является областью среднего / заднего мозга. Этот ген зависит от дозировки фактор транскрипции участвует в регуляции правильной экспрессии других генов. Экспрессия GBX2 происходит во время гаструляции и продолжает экспрессироваться на более поздних стадиях эмбриогенез. На этих различных этапах GBX2 отвечает за несколько важных процессов. в нервная пластинка стадия GBX2 необходима для того, чтобы передние предшественники заднего мозга выжили и сформировались правильно. Также на этой стадии развития GBX2 необходим для правильной регуляции экспрессии различных генов, необходимой для раннего установления паттерна A / P в нервной пластинке. На ранних стадиях развития мозга морфогенез GBX2 необходим как для нормального развития передней части заднего мозга, так и для правильного формирования организатора среднего / заднего мозга. Из-за воздействия на организатор среднего / заднего мозга GBX2 участвует в позиционировании домена экспрессии для истмический FGF8. Поскольку это зависимый от дозировки ген, различное количество гена, присутствующего в определенном месте, может вызывать разные результаты. На FGF8 влияют разные дозировки в том месте, где он экспрессируется. Отсутствие GBX2 вызывает смещение экспрессии FGF8 каудально, а избыточная экспрессия GBX2 вызывает смещение экспрессии FGF8 рострально. Не все ромбомеры, в которых экспрессируется GBX2, требуют такой же строгости регулирования дозы. Из трех ромбомеров 2 предъявляются самые строгие требования к дозировке.

Исследования на животных

Нокаут гена GBX2 вызывает неспособность сформироваться многих структур, таких как истмические ядра, мозжечок, двигательный нерв V и многие другие производные ромбомеров 1-3. Эмбрионы с нокаутом гена GBX2 продолжат развиваться и достигнут доношенной беременности. Дети рождаются, но если экспрессия GBX2 отсутствует, все они умрут вскоре после рождения.^[9][10]

Нокдаун гена gbx2 приводит к усеченной передней части заднего мозга, а также к аномальным скоплениям клеточных тел в r2 и r3, которые связаны с проблемами в черепном нерве V. Было показано, что любые структуры, полученные из r1-r3, будут подвергаться неблагоприятному воздействию мутации или недостатки в gbx2. Эти структуры включают дугу аорты и правую подключичную артерию, которые при неправильном развитии могут привести к сердечно-сосудистым дефектам в дополнение к черепно-лицевым дефектам из-за неправильного развития черепного нерва V.^[11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000168505 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034486 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Kowenz-Leutz E, Herr P, Niss K, Leutz A (октябрь 1997 г.). «Ген гомеобокса GBX2, мишень онкогена myb, опосредует аутокринный рост и дифференцировку моноцитов». Клетка. 91 (2): 185–95. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80401-8. PMID  9346236. S2CID  15954797.
6. Лин X, Swaroop A, Vaccarino FM, Murtha MT, Haas M, Ji X, Ruddle FH, Leckman JF (февраль 1996 г.). «Характеристика и анализ последовательности человеческого гомеобокс-гена GBX2». Геномика. 31 (3): 335–42. Дои:10.1006 / geno.1996.0056. PMID  8838315.
7. "Entrez Gene: GBX2 гаструляция мозга гомеобокс 2".
8. Уотерс, С. Т. «Пороговое требование для уровней Gbx2 в развитии заднего мозга». Развитие, т. 133, нет. 10, 2006, стр. 1991–2000., DOI: 10.1242 / dev.02364.
9. Вассарман К.М., Левандоски М., Кэмпбелл К., Джойнер А.Л., Рубенштейн Д.Л., Мартинес С., Мартин Г.Р. (август 1997 г.). «Спецификация переднего заднего мозга и создание нормального организатора среднего / заднего мозга зависит от функции гена Gbx2». Разработка. 124 (15): 2923–34. PMID  9247335.
10. Waters ST, Lewandoski M (май 2006 г.). «Пороговое требование для уровней Gbx2 в развитии заднего мозга». Разработка. 133 (10): 1991–2000. Дои:10.1242 / dev.02364. PMID  16651541.
11. Накаяма Ю., Кикута Х, Канаи М., Йошикава К., Кавамура А., Кобаяши К., Ван З., Хан А., Каваками К., Ямасу К. (2013). «Gbx2 функционирует как репрессор транскрипции, чтобы регулировать спецификацию и морфогенез соединения среднего и заднего мозга в зависимости от дозы и стадии». Механизмы развития. 130 (11–12): 532–52. Дои:10.1016 / j.mod.2013.07.004. PMID  23933069.

дальнейшее чтение

• Берроуз-Гарсия Дж., Ситтараман В., Чандрасекхар А., Waters ST (апрель 2011 г.). «Эволюционно законсервированная функция Gbx2 в развитии передней части заднего мозга». Динамика развития. 240 (4): 828–38. Дои:10.1002 / dvdy.22589. PMID  21360792. S2CID  19225250.
• Heimbucher T, Murko C, Bajoghli B., Aghaallaei N, Huber A, Stebegg R, Eberhard D, Fink M, Simeone A, Czerny T. (январь 2007 г.). «Gbx2 и Otx2 взаимодействуют с доменом WD40 корепрессоров Groucho / Tle». Молекулярная и клеточная биология. 27 (1): 340–51. Дои:10.1128 / MCB.00811-06. ЧВК  1800652. PMID  17060451.
• Глинский Г.В., Березовская О., Глинский А.Б. (июнь 2005 г.). «Анализ микроматрицы идентифицирует сигнатуру смерти от рака, предсказывающую неэффективность терапии у пациентов с несколькими типами рака». Журнал клинических исследований. 115 (6): 1503–21. Дои:10.1172 / JCI23412. ЧВК  1136989. PMID  15931389.
• Гао А.С., Лу В., Айзекс Дж. Т. (февраль 2000 г.). «Повышенная экспрессия GBX2 стимулирует рост клеток рака предстательной железы человека за счет усиления транскрипции гена интерлейкина 6». Клинические исследования рака. 6 (2): 493–7. PMID  10690529.
• Гао А.С., Лу В., Айзекс Дж. Т. (апрель 1998 г.). «Подавление экспрессии гомеобокса гена GBX2 ингибирует клоногенную способность и онкогенность рака предстательной железы человека». Исследования рака. 58 (7): 1391–4. PMID  9537237.
• Мацуи Т., Хираи М., Хирано М., Куросава Ю. (декабрь 1993 г.). «Комплекс HOX, соседствующий с геном EVX, а также два других гомеобокс-содержащих гена, GBX-класс и EN-класс, расположены на тех же хромосомах 2 и 7 у человека». Письма FEBS. 336 (1): 107–10. Дои:10.1016 / 0014-5793 (93) 81620-Ф. PMID  7903253. S2CID  34546387.