ATBF1 - ATBF1

ZFHX3
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2DA1, 2DA2, 2DA3
Идентификаторы
Псевдонимы	ZFHX3, ATBF1, ATBT, ZNF927, homeobox 3 с цинковыми пальцами
Внешние идентификаторы	OMIM: 104155 MGI: 99948 ГомолоГен: 21366 Генные карты: ZFHX3
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 16 (человек)
Конец	73,891,871 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 8 (мышь)
Конец	108,961,630 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Связывание ДНК; • последовательное связывание ДНК; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции; • связывание ионов цинка; • связывание ионов металлов; • Связывание ДНК, специфичное для последовательности основного промотора; • GO: 0001948 связывание с белками; • связывание нуклеиновой кислоты; • связывание ферментов; • активность фактора транскрипции, связывание с дистальной энхансерной последовательностью РНК-полимеразы II; • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II; • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • ядерное тело; • комплекс регуляторов транскрипции; • ядро клетки; • нуклеоплазма;
Биологический процесс	• отрицательная регуляция дифференцировки миобластов; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • регуляция локомоторного ритма; • развитие мышечных органов; • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II; • циркадная регуляция экспрессии генов; • транскрипция, ДНК-шаблон; • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • положительная регуляция дифференцировки миобластов; • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • реакция на трансформирующий фактор роста бета; • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • остановка клеточного цикла; • развитие мозга; • регуляция дифференцировки нейронов; • положительная регуляция клеточной адгезии; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	463
	11906
	ENSG00000140836
	ENSMUSG00000038872
	Q15911
	Q61329
	NM_001164766; NM_006885
	NM_007496
	NP_001158238; NP_008816
	н / д
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Цинк-палец гомеобокс протеин 3 это белок что у людей кодируется ZFHX3 ген.^[5]^[6]^[7]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000140836 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038872 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Моринага Т., Ясуда Х, Хашимото Т., Хигасио К., Тамаоки Т. (декабрь 1991 г.). «Человеческий альфа-фетопротеин-энхансер-связывающий белок, ATBF1, содержит четыре гомеодомена и семнадцать цинковых пальцев». Mol Cell Biol. 11 (12): 6041–9. Дои:10.1128 / MCB.11.12.6041. ЧВК 361769. PMID 1719379.
^ Миура Й, Там Т, Идо А, Моринага Т, Мики Т, Хашимото Т, Тамаоки Т (декабрь 1995 г.). «Клонирование и характеристика изоформы ATBF1, которая экспрессируется зависимым от нейрональной дифференцировки способом». J Biol Chem. 270 (45): 26840–8. Дои:10.1074 / jbc.270.45.26840. PMID 7592926.
^ «Ген Entrez: ATBF1 AT-связывающий фактор транскрипции 1».

дальнейшее чтение

Ямада К., Миура Ю., Шейдл Т. и др. (1996). «Отнесение гена фактора транскрипции ATBF1 человека к хромосоме 16q22.3-q23.1». Геномика. 29 (2): 552–3. Дои:10.1006 / geno.1995.9967. PMID 8666409.
Бедфорд MT, Чан, округ Колумбия, Ледер П. (1997). «Домены FBP WW и домен Abl SH3 связываются с конкретным классом лигандов, богатых пролином». EMBO J. 16 (9): 2376–83. Дои:10.1093 / emboj / 16.9.2376. ЧВК 1169838. PMID 9171351.
Каспар П., Дворакова М., Кралова Дж. И др. (1999). «Myb-взаимодействующий белок, ATBF1, подавляет транскрипционную активность онкопротеина Myb». J. Biol. Chem. 274 (20): 14422–8. Дои:10.1074 / jbc.274.20.14422. PMID 10318867.
Лофтус Б.Дж., Ким Ю.Дж., Снеддон В.П. и др. (1999). «Дупликации генома и другие особенности в 12 Mb последовательности ДНК из хромосомы 16p и 16q человека». Геномика. 60 (3): 295–308. Дои:10.1006 / geno.1999.5927. PMID 10493829.
Каушик Н., Маласпина А., де Беллерош Дж. (2000). «Характеристика транскриптов, содержащих тринуклеотидные и тандемные повторы, полученных из библиотеки кДНК спинного мозга человека путем гибридизации с фильтром высокой плотности». ДНК клетки биол. 19 (5): 265–73. Дои:10.1089/10445490050021177. PMID 10855793.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Иида М., Имура Дж., Фуруичи Т. и др. (2004). «Изменение экспрессии фактора-1, связывающего мотив AT, при раке желудка, продуцирующем альфа-фетопротеин: это событие для дифференцировки и пролиферации опухолей?». Онкол. Представитель. 11 (1): 3–7. Дои:10.3892 / или 11.1.3. PMID 14654895.
Nojiri S, Joh T, Miura Y и др. (2004). «ATBF1 усиливает подавление передачи сигналов STAT3 за счет взаимодействия с PIAS3». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 314 (1): 97–103. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.12.054. PMID 14715251.
Мартин Дж., Хан С., Гордон Л.А. и др. (2005). «Последовательность и анализ богатой дупликацией хромосомы человека 16». Природа. 432 (7020): 988–94. Дои:10.1038 / природа03187. PMID 15616553.
Чжан З., Ямасита Х., Тояма Т. и др. (2005). «Экспрессия матричной РНК ATBF1-a коррелирует с лучшим прогнозом при раке груди». Clin. Рак Res. 11 (1): 193–8. PMID 15671546.
Сан Х, Фриерсон Х.Ф., Чен С. и др. (2005). «Частые соматические мутации фактора транскрипции ATBF1 при раке простаты человека». Nat. Genet. 37 (4): 407–12. Дои:10,1038 / ng1528. PMID 15750593. S2CID 19458711.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Xu J, Sauvageot J, Ewing CM и др. (2006). «Мутации зародышевой линии ATBF1 и риск рака простаты». Простата. 66 (10): 1082–5. Дои:10.1002 / pros.20430. PMID 16637072.
Sun X, Zhou Y, Otto KB и др. (2007). «Редкая мутация ATBF1 при раке груди человека». J. Cancer Res. Clin. Онкол. 133 (2): 103–5. Дои:10.1007 / s00432-006-0148-y. PMID 16932943. S2CID 12378418.
Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Мори Й., Катаока Х., Миура Й. и др. (2007). «Субклеточная локализация ATBF1 регулирует транскрипцию MUC5AC при раке желудка». Int. J. Рак. 121 (2): 241–7. Дои:10.1002 / ijc.22654. PMID 17330845. S2CID 37176312.
Чо Й.Г., Сонг Дж. Х., Ким Си Джей и др. (2007). «Генетические изменения гена ATBF1 при раке желудка». Clin. Рак Res. 13 (15, п. 1): 4355–9. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-07-0619. PMID 17671116.