ZNF300 - ZNF300

ZNF300
Идентификаторы
Псевдонимы	ZNF300, белок цинковых пальцев 300
Внешние идентификаторы	OMIM: 612429 ГомолоГен: 56531 Генные карты: ZNF300
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q33.1 Начинать 150,894,392 бп[1] Конец 150,904,983 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • связывание нуклеиновой кислоты • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • последовательное связывание ДНК • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • внутриклеточный • ядро клетки • ядрышко Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	91975	н / д
Ансамбль	ENSG00000145908	н / д
UniProt	Q96RE9	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_001172831 NM_001172832 NM_052860	н / д
RefSeq (белок)	NP_001166302 NP_001166303 NP_443092	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 5: 150,89 - 150,9 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	н / д
Викиданные
Просмотр / редактирование человека

Цинк палец протеин 300 это белок что у людей кодируется ZNF300 ген.^[3][4] Белок, кодируемый этим геном, относится к типу C2H2. цинковый палец ДНК-связывающий белок и вероятный фактор транскрипции.

Антисмысловой по отношению к человеческому гену, C16orf71, что указывает на возможность регулируемой альтернативной экспрессии.^[5]

Клиническая значимость

Это связано с болезнью Крона.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000145908 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. Гоу Д., Ван Дж., Гао Л., Сунь И, Пэн Х, Хуан Дж, Ли В. (январь 2004 г.). «Идентификация и функциональный анализ нового гена цинкового пальца человека KRAB / C2H2 ZNF300». Биохим. Биофиз. Acta. 1676 (2): 203–9. Дои:10.1016 / j.bbaexp.2003.11.011. PMID  14746915.
4. «Entrez Gene: белок цинковых пальцев 300».
5. [email protected], Даниэль Тьерри-Миг и Жан Тьерри-Миег, NCBI / NLM / NIH. «AceView: Gene: C16orf71, исчерпывающая аннотация генов человека, мыши и червя с мРНК или ESTsAceView». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2017-05-20.
6. Прескотт Нью-Джерси, Домини К.М., Кубо М., Льюис К.М., Фишер С.А., Редон Р., Хуанг Н., Незнакомец Б.Е., Блащик К., Хадспит Б., Паркес Дж., Хосоно Н., Ямазаки К., Онни С.М., Форбс А., Дермитзакис Е.Т., Накамура Ю. , Мэнсфилд Дж. К., Сандерсон Дж., Херлс М. Е., Робертс Р. Г., Мэтью К. Г. (май 2010 г.). «Независимая популяционная ассоциация вариантов риска в локусе IRGM с болезнью Крона» (PDF). Гм. Мол. Genet. 19 (9): 1828–39. Дои:10.1093 / hmg / ddq041. ЧВК  2850616. PMID  20106866.

дальнейшее чтение

• Фэн Т., Чжу X (2010). «Полногеномный поиск редких генетических вариантов в данных WTCCC». Гм. Genet. 128 (3): 269–80. Дои:10.1007 / s00439-010-0849-9. ЧВК  2922446. PMID  20549515.
• Цю Х., Сюэ Л., Гао Л. и др. (2008). «Идентификация ДНК-связывающего элемента белка ZNF300 человека». Клетка. Мол. Биол. Латыш. 13 (3): 391–403. Дои:10.2478 / с11658-008-0005-х. ЧВК  6275660. PMID  18350257.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Xu JH, Wang T, Wang XG и др. (2010). «PU.1 может регулировать промотор ZNF300 в промиелоцитах HL-60, производных от APL». Лейк. Res. 34 (12): 1636–46. Дои:10.1016 / j.leukres.2010.04.009. PMID  20471086.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Сюэ Л., Цю Х, Ма Дж. И др. (2010). «ZNF300, недавно идентифицированный фактор транскрипции человека, активирует промотор человеческого IL-2RÎ2 через перекрывающийся сайт связывания ZNF300 / EGR1». Клетка. Мол. Биол. Латыш. 15 (4): 530–40. Дои:10.2478 / s11658-010-0025-1. ЧВК  6275642. PMID  20585888.
• О Дж. Х., Ян Дж., Хан И и др. (2005). «Транскриптомный анализ рака желудка человека». Мамм. Геном. 16 (12): 942–54. Дои:10.1007 / s00335-005-0075-2. PMID  16341674. S2CID  69278.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Cao Y, Li JX, Ji CN и др. (2007). «Молекулярное клонирование и характеристика нового варианта сплайсинга человеческого гена ZNF300, который высоко экспрессируется в семенниках». ДНК Seq. 18 (4): 312–5. Дои:10.1080/10425170701243393. PMID  17541838. S2CID  12932222.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Консорциум Wellcome Trust Case Control; Клейтон, Дэвид Дж .; Cardon, Lon R .; Крэддок, Ник; Делукас, Панос; Дункансон, Одри; Kwiatkowski, Dominic P .; Маккарти, Марк I .; Ouwehand, Willem H .; Samani, Nilesh J .; Тодд, Джон А .; Доннелли, Питер; Барретт, Джеффри С.; Бертон, Пол Р .; Дэвисон, Дэн; Доннелли, Питер; Истон, Дуг; Эванс, Дэвид; Люн, Хин-Так; Марчини, Джонатан Л .; Моррис, Эндрю П .; Спенсер, Крис С. А .; Тобин, Мартин Д .; Cardon, Lon R .; Клейтон, Дэвид Дж .; Attwood, Antony P .; Бурман, Джеймс П .; Кант, Барбара; Эверсон, Урсула; и другие. (2007). «Полногеномное ассоциативное исследование 14 000 случаев семи распространенных заболеваний и 3000 общих контрольных заболеваний». Природа. 447 (7145): 661–78. Bibcode:2007Натура.447..661Б. Дои:10.1038 / природа05911. ЧВК  2719288. PMID  17554300.