NRF1 - NRF1

Не путать с ядерный фактор (эритроидный 2) -подобный 1 или же NFE2L1.

NRF1
Идентификаторы
Псевдонимы	NRF1, АЛЬФА-ПАЛ, ядерный респираторный фактор 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 600879 MGI: 1332235 ГомолоГен: 3674 Генные карты: NRF1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7q32.2 Начинать 129,611,720 бп[1] Конец 129,757,082 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 A3.3 | 6 12,47 см Начинать 30,047,988 бп[2] Конец 30,153,458 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • активность гомодимеризации белков • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание ДНК, специфичное для последовательности основного промотора • Связывание ДНК с последовательностью корового промотора РНК-полимеразы II • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции Сотовый компонент • внеклеточная экзосома • нуклеоплазма • цитозоль • ядро клетки Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • митохондриальная организация • производство метаболитов-предшественников и энергии • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4899	18181
Ансамбль	ENSG00000106459	ENSMUSG00000058440
UniProt	Q16656	Q9WU00
RefSeq (мРНК)	NM_005011 NM_001040110 NM_001293163 NM_001293164	NM_001164226 NM_001164227 NM_001164228 NM_001164229 NM_001164230 NM_010938 NM_001361692 NM_001361693 NM_001361694 NM_001361695
RefSeq (белок)	NP_001035199 NP_001280092 NP_001280093 NP_005002	NP_001157698 NP_001157699 NP_001157700 NP_001157701 NP_001157702 NP_035068 NP_001348621 NP_001348622 NP_001348623 NP_001348624
Расположение (UCSC)	Chr 7: 129.61 - 129.76 Мб	Chr 6: 30.05 - 30.15 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ядерный респираторный фактор 1, также известный как Nrf1, Nrf-1, NRF1 и NRF-1, кодирует белок, который гомодимеризуется и функционирует как фактор транскрипции который активирует выражение некоторого ключа метаболические гены регулирующие рост клеток и ядерные гены, необходимые для дыхания, биосинтез гема, и митохондриальная ДНК транскрипция и репликация. Белок также был связан с регулированием нейрит нарост. Альтернативный варианты транскрипционного сплайсинга, которые кодируют один и тот же белок, были охарактеризованы. Дополнительные варианты, кодирующие другой белок изоформы были описаны, но не были полностью охарактеризованы. В библиографических базах данных возникла путаница из-за общего символа NRF1 для этого гена и для «ядерного фактора (эритроидный 2) -подобный 1», который имеет официальный символ NFE2L1.^{[нужна цитата ]}

Функция

Nrf1 действует как фактор транскрипции, который активирует экспрессию некоторых ключевых метаболических генов, регулирующих рост клеток и ядерные гены, необходимые для митохондриального дыхания, и митохондриальный ДНК транскрипция и репликация. Nrf1 вместе с Nrf2, является посредником биогеномная координация между ядерным и митохондриальным геномами, напрямую регулируя экспрессию нескольких кодируемых ядром ТАК ДАЛЕЕ белков, и косвенно регулируя три кодируемых митохондриями СОХ субъединичные гены путем активации mtTFA, mtTFB1, и mtTFB2.

Nrf1 связан с регуляцией нейрит нарост.^[5]

Были охарактеризованы альтернативные варианты сплайсинга транскрипции, которые кодируют один и тот же белок. Были описаны дополнительные варианты, кодирующие различные изоформы белков, но они не были полностью охарактеризованы.^[6]

Циклин D1-зависимая киназа посредством фосфорилирования NRF-1 по S47 координирует синтез ядерной ДНК и функцию митохондрий.^[7]

Взаимодействия

NRF1 был показан взаимодействовать с DYNLL1,^[8] PPARGC1A,^[9] и PPRC1.^[10]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000106459 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000058440 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чанг В.Т., Чен Х.И., Чиу Р.Дж., Чен С.Й., Хуанг А.М. (август 2005 г.). «Новая функция фактора транскрипции альфа-Pal / NRF-1: увеличение роста нейритов». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 334 (1): 199–206. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.06.079. PMID  15992771.
6. "Энтрез Ген: ядерный респираторный фактор 1 NRF1".
7. Ван Ч, Ли З, Лу И, Ду Р, Катияр С., Ян Дж, Фу М., Лидер Дж. Э., Куонг А., Новикофф П. М., Пестелл Р. Г. (2006). «Репрессия циклином D1 ядерного респираторного фактора 1 объединяет синтез ядерной ДНК и функцию митохондрий». Труды Национальной академии наук. 103 (31): 11567–72. Bibcode:2006PNAS..10311567W. Дои:10.1073 / pnas.0603363103. JSTOR  30051572. ЧВК  1518800. PMID  16864783.
8. Герциг Р.П., Андерссон Ю., Скарпулла Р.С. (декабрь 2000 г.). «Легкая цепь динеина взаимодействует с NRF-1 и EWG, структурно и функционально родственными факторами транскрипции человека и дрозофилы». J. Cell Sci. 113 (23): 4263–73. PMID  11069771.
9. Wu Z, Puigserver P, Andersson U, Zhang C, Adelmant G, Mootha V, Troy A, Cinti S, Lowell B., Scarpulla RC, Spiegelman BM (июль 1999 г.). «Механизмы управления митохондриальным биогенезом и дыханием через термогенный коактиватор PGC-1». Клетка. 98 (1): 115–24. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80611-X. PMID  10412986. S2CID  16143809.
10. Андерссон У., Скарпулла Р.С. (май 2001 г.). «Коактиватор, связанный с PGC-1, новый сывороточный коактиватор зависимой от ядерного респираторного фактора 1 транскрипции в клетках млекопитающих». Мол. Клетка. Биол. 21 (11): 3738–49. Дои:10.1128 / MCB.21.11.3738-3749.2001. ЧВК  87014. PMID  11340167.

дальнейшее чтение

• Тиранти В., Росси Е., Рокки М., ДиДонато С., Дзуффарди О., Зевиани М. (1995). «Ген (NFE2L1) человеческого NRF-1, активатор, участвующий в ядерно-митохондриальных взаимодействиях, соответствует 7q32». Геномика. 27 (3): 555–7. Дои:10.1006 / geno.1995.1094. PMID  7558044.
• Гопалакришнан Л., Скарпулла Р.С. (1995). «Структура, экспрессия и хромосомная принадлежность гена человека, кодирующего ядерный респираторный фактор 1». J. Biol. Chem. 270 (30): 18019–25. Дои:10.1074 / jbc.270.30.18019. PMID  7629110.
• Эфиок Б.Дж., Кьорини Д.А., Сэфер Б. (1994). «Ключевой фактор транскрипции для фактора инициации эукариот-2 альфа сильно гомологичен факторам транскрипции онтогенеза и может связывать метаболические гены с ростом и развитием клеток». J. Biol. Chem. 269 (29): 18921–30. PMID  8034649.
• Вирбазиус СП, Скарпулла Р.С. (1994). «Активация гена фактора транскрипции митохондрий человека А ядерными респираторными факторами: потенциальная регуляторная связь между экспрессией ядерных и митохондриальных генов в биогенезе органелл». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (4): 1309–13. Bibcode:1994ПНАС ... 91.1309В. Дои:10.1073 / пнас.91.4.1309. ЧВК  43147. PMID  8108407.
• Вирбазиус CA, Вирбазиус СП, Скарпулла RC (1994). «NRF-1, активатор, участвующий в ядерно-митохондриальных взаимодействиях, использует новый ДНК-связывающий домен, законсервированный в семействе регуляторов развития». Genes Dev. 7 (12A): 2431–45. Дои:10.1101 / gad.7.12a.2431. PMID  8253388.
• Спелбринк Дж., Ван ден Богерт С (1996). «Пре-мРНК ядерного респираторного фактора 1, регулятора митохондриального биогенеза, альтернативно сплайсируется в тканях и клеточных линиях человека». Гм. Мол. Genet. 4 (9): 1591–6. Дои:10.1093 / hmg / 4.9.1591. PMID  8541844.
• Johnsen O, Skammelsrud N, Luna L, Nishizawa M, Prydz H, Kolstø AB (1996). «Малые белки Maf взаимодействуют с человеческим фактором транскрипции TCF11 / Nrf1 / LCR-F1». Нуклеиновые кислоты Res. 24 (21): 4289–97. Дои:10.1093 / nar / 24.21.4289. ЧВК  146217. PMID  8932385.
• Венугопал Р., Джайсвал А.К. (1997). «Nrf1 и Nrf2 положительно и c-Fos и Fra1 отрицательно регулируют опосредованную элементом антиоксидантного ответа экспрессию гена NAD (P) H: хиноноксидоредуктазы1 человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (25): 14960–5. Bibcode:1996ПНАС ... 9314960В. Дои:10.1073 / пнас.93.25.14960. ЧВК  26245. PMID  8962164.
• Чен С., Надь П.Л., Залкин Х. (1997). «Роль NRF-1 в двунаправленной транскрипции локуса биосинтеза пуринов человека GPAT-AIRC». Нуклеиновые кислоты Res. 25 (9): 1809–16. Дои:10.1093 / nar / 25.9.1809. ЧВК  146651. PMID  9108165.
• Токи Т., Ито Дж., Китадзава Дж., Араи К., Хатакеяма К., Акасака Дж., Игараси К., Номура Н., Йокояма М., Ямамото М., Ито Э (1997). «Малые белки Maf человека образуют гетеродимеры с факторами транскрипции семейства CNC и распознают мотив NF-E2». Онкоген. 14 (16): 1901–10. Дои:10.1038 / sj.onc.1201024. PMID  9150357.
• Марини М.Г., Чан К., Казула Л., Кан Ю.В., Цао А., Мой П. (1997). «hMAF, небольшой фактор транскрипции человека, который специфически гетеродимеризуется с Nrf1 и Nrf2». J. Biol. Chem. 272 (26): 16490–7. Дои:10.1074 / jbc.272.26.16490. PMID  9195958.
• Gugneja S, Scarpulla RC (1997). «Фосфорилирование серина в кратком амино-концевом домене в ядерном респираторном факторе 1 усиливает связывание ДНК». J. Biol. Chem. 272 (30): 18732–9. Дои:10.1074 / jbc.272.30.18732. PMID  9228045.
• Йонсен О., Мерфи П., Прюдз Х, Колсто А.Б. (1998). «Взаимодействие фактора CNC-bZIP TCF11 / LCR-F1 / Nrf1 с MafG: выбор сайта связывания и регуляция транскрипции». Нуклеиновые кислоты Res. 26 (2): 512–20. Дои:10.1093 / nar / 26.2.512. ЧВК  147270. PMID  9421508.
• Au HC, Scheffler IE (1998). «Анализ промотора гена железо-протеина сукцинатдегидрогеназы человека - требуются оба ядерных респираторных фактора NRF-1 и NRF-2». Евро. J. Biochem. 251 (1–2): 164–74. Дои:10.1046 / j.1432-1327.1998.2510164.x. PMID  9492280.
• Миранда С., Фонсеа Р., Герреро Дж., Лейтон Ф. (1999). «Окислительный стресс и активация генов митохондриального биогенеза в митохондриальных ДНК-истощенных клетках HeLa». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 258 (1): 44–9. Дои:10.1006 / bbrc.1999.0580. PMID  10222232.
• Ли Б., Холлоши Ю.О., Семенкович С.Ф. (1999). «Респираторное разобщение индуцирует экспрессию дельта-аминолевулинатсинтазы через ядерный респираторный фактор-1-зависимый механизм в клетках HeLa». J. Biol. Chem. 274 (25): 17534–40. Дои:10.1074 / jbc.274.25.17534. PMID  10364186.
• Wu Z, Puigserver P, Andersson U, Zhang C, Adelmant G, Mootha V, Troy A, Cinti S, Lowell B, Scarpulla RC, Spiegelman BM (1999). «Механизмы управления митохондриальным биогенезом и дыханием через термогенный коактиватор PGC-1». Клетка. 98 (1): 115–24. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80611-X. PMID  10412986. S2CID  16143809.
• Солецки Д., Бернхардт Г., Липп М., Виммер Э. (2000). «Идентификация сайта связывания ядерного респираторного фактора-1 в основном промоторе гена рецептора вируса полиомиелита человека / CD155». J. Biol. Chem. 275 (17): 12453–62. Дои:10.1074 / jbc.275.17.12453. PMID  10777530.
• Кумари Д., Усдин К. (2001). «Взаимодействие факторов транскрипции USF1, USF2 и альфа -Pal / Nrf-1 с промотором FMR1. Последствия для синдрома умственной отсталости ломкой Х-хромосомы». J. Biol. Chem. 276 (6): 4357–64. Дои:10.1074 / jbc.M009629200. PMID  11058604.

внешняя ссылка

• NRF1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• FactorBook Nrf1

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.