FOXC2 - FOXC2

FOXC2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1Д5В
Идентификаторы
Псевдонимы	FOXC2, FKHL14, LD, MFH-1, MFH1, вилочная коробка C2
Внешние идентификаторы	OMIM: 602402 MGI: 1347481 ГомолоГен: 21091 Генные карты: FOXC2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16q24.1 Начинать 86,566,829 бп[1] Конец 86,569,728 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 E1 | 8 70,33 см Начинать 121,116,171 бп[2] Конец 121,118,895 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • последовательное связывание ДНК • Связывание ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • активность фактора транскрипции, связывание с дистальной энхансерной последовательностью РНК-полимеразы II • связывание хроматина с ДНК • промотор-специфическое связывание хроматина • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II Сотовый компонент • ядро клетки • нуклеоплазма • ядерное тело Биологический процесс • Notch сигнальный путь • сомитогенез • морфогенез эмбриональной скелетной системы • развитие скелетной системы • сигнальный путь рецептора инсулина • развитие зачатка мочеточника • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительное регулирование миграции клеток, участвующих в прорастании ангиогенеза • развитие клеток нервного гребня • формирование параксиальной мезодермы • обязательство судьбы параксиальных мезодермальных клеток • окостенение • лимфангиогенез • организация фибрилл коллагена • развитие почек • развитие гломерулярных мезангиальных клеток • морфогенез сердца • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • пролиферация клеток сердечной мышцы • развитие лимфатических сосудов • транскрипция, ДНК-шаблон • эмбриональное развитие сердечной трубки • положительная регуляция миграции эндотелиальных клеток • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие многоклеточного организма • морфогенез ткани желудочков сердечной мышцы • развитие сердца • ремоделирование кровеносных сосудов • сигнальный путь рецептора фактора роста эндотелия сосудов • развитие кровеносных сосудов • положительная регуляция заживления сосудистых ран • морфогенез артерии • ветвление, участвующее в морфогенезе кровеносных сосудов • гломерулярная дифференцировка висцеральных эпителиальных клеток • ответ на гормон • эмбриональный морфогенез висцерокраниума • морфогенез эмбрионального черепного скелета • развитие глаз по типу камеры • развитие гломерулярного эндотелия • положительная регуляция клеточной адгезии, опосредованная интегрином • развитие мезодермы • регулирование роста органов • развитие метанефроса • клеточная пролиферация • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция апоптотического процесса, вовлеченная в морфогенез тракта оттока • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • дифференциация клеток • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • морфогенез анатомической структуры • отрицательная регуляция термогенеза, вызванного холодом Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2303	14234
Ансамбль	ENSG00000176692	ENSMUSG00000046714
UniProt	Q99958	Q61850
RefSeq (мРНК)	NM_005251	NM_013519
RefSeq (белок)	NP_005242	NP_038547
Расположение (UCSC)	Chr 16: 86,57 - 86,57 Мб	Chr 8: 121.12 - 121.12 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Протеин C2 (FOXC2) также известный как белок, связанный с вилкой FKHL14 (ФХЛ14), фактор транскрипции FKH-14, или же мезенхима вилка голова протеин 1 (MFH1) - это белок что у людей кодируется FOXC2 ген.^[5][6] FOXC2 является членом вилка (FOX) семейство факторы транскрипции.

Структура и функции

Длина белка составляет 501 аминокислоту. У гена нет интроны; сингл экзон составляет примерно 1,5 КБ.^[6][7]

Факторы транскрипции FOX экспрессируются во время развития и связаны с рядом клеточных и онтогенетических дифференциация процессы. FOXC2 необходим на раннем этапе развития почек, включая дифференцировку подоциты и созревание клубочковая базальная мембрана. Он также участвует в раннем развитии сердца.^[8]

Повышенная экспрессия FOXC2 в адипоцитах может увеличить количество коричневой жировой ткани, что приведет к снижению веса и повышенной чувствительности к инсулину.^[9][10]

Роль в болезни

Было показано, что отсутствие FOXC2 приводит к неспособности лимфатических клапанов формироваться и проблемам с ремоделированием лимфатических сосудов. Ряд мутаций в гене FOXC2 был связан с Лимфедема-дистихиазный синдром,^[11][12] Также было высказано предположение, что может существовать связь между полиморфизмом FOXC2 и варикозным расширением вен.^[12][13]

FOXC2 также участвует в рак метастазы. В частности, экспрессия FOXC2 индуцируется, когда эпителиальные клетки пройти эпителиально-мезенхимальный переход (ЕМТ) и стать мезенхимальный ищущие клетки. EMT может быть индуцирован рядом генов, включая Улитка, Крутить, Гусекоид, и TGF-бета 1.^[14] Сверхэкспрессия FOXC2 была отмечена при подтипах рака молочной железы, которые являются высокометастатическими.^[8] Подавление экспрессии FOXC2 с использованием shRNA в сильно метастатическом рак молочной железы модель блокирует их метастатическую способность.^[15]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000176692 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000046714 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Kaestner KH, Bleckmann SC, Monaghan AP, Schlöndorff J, Mincheva A, Lichter P, Schütz G (июнь 1996). «Кластерное расположение генов крылатой спирали fkh-6 и MFH-1: возможные последствия для развития мезодермы». Разработка. 122 (6): 1751–8. PMID  8674414.
6. Миура Н., Иида К., Какинума Х, Ян XL, Сугияма Т. (май 1997 г.). «Выделение генов головы-1 мезенхимной вилки мыши (MFH-1) и человека (FKHL 14) показывает консервацию их генов и белковых структур». Геномика. 41 (3): 489–92. Дои:10.1006 / geno.1997.4695. PMID  9169153.
7. Фанг Дж., Дагенаис С.Л., Эриксон Р.П., Арльт М.Ф., Глинн М.В., Горски Дж. Л., Сивер Л.Х., Гловер Т.В. (декабрь 2000 г.). «Мутации в FOXC2 (MFH-1), транскрипционном факторе семейства вилкоголовых, ответственны за наследственный синдром лимфедема-дистихиаза». Am J Hum Genet. 67 (6): 1382–8. Дои:10.1086/316915. ЧВК  1287915. PMID  11078474.
8. Хадер С., Марлиер А., Кэнтли Л. (2010). «Мезенхимально-эпителиальный переход в эпителиальном ответе на повреждение: роль Foxc2». Онкоген. 29 (7): 1031–40. Дои:10.1038 / onc.2009.397. ЧВК  2824778. PMID  19935708.
9. Lidell ME, Seifert EL, Westergren R, Heglind M, Gowing A, Sukonina V, Arani Z, Itkonen P, Wallin S, Westberg F, Fernandez-Rodriguez J, Laakso M, Nilsson T, Peng XR, Harper ME, Enerbäck S ( Февраль 2011 г.). «Экспрессируемый адипоцитами фактор транскрипции вилки Foxc2 регулирует метаболизм через измененную функцию митохондрий». Сахарный диабет. 60 (2): 427–35. Дои:10.2337 / db10-0409. ЧВК  3028341. PMID  21270254.
10. Седерберг А., Гроннинг Л.М., Арен Б., Таскен К., Карлссон П., Энербак С. (2001). «FOXC2 - это ген крылатой спирали, который противодействует ожирению, гипертриглицеридемии и инсулинорезистентности, вызванной диетой». Клетка. 106 (5): 563–73. Дои:10.1016 / s0092-8674 (01) 00474-3. PMID  11551504. S2CID  7411570.
11. Коннелл Ф, Брайс Дж, Мортимер П. (2008). «Фенотипическая характеристика первичной лимфедемы». Анна. Акад. Наука. 1131: 140–6. Дои:10.1196 / летопись.1413.013. PMID  18519967. S2CID  20912436.
12. Нормен С., Иванов К.И., Ченг Дж., Занггер Н., Делорензи М., Жаке М., Миура Н., Пуолаккайнен П., Хорсли В., Ху Дж., Огюстин Г. Г., Юля-Хертуала С., Алитало К., Петрова Т. В. (май 2009 г.). «FOXC2 контролирует образование и созревание лимфатических собирающих сосудов посредством сотрудничества с NFATc1». J. Cell Biol. 185 (3): 439–57. Дои:10.1083 / jcb.200901104. ЧВК  2700385. PMID  19398761.
13. Н. М., Эндрю Т., Спектор Т. Д., Джеффри С. (март 2005 г.). «Связывание с участком FOXC2 хромосомы 16 при варикозном расширении вен в здоровых, неотобранных парах братьев и сестер». J. Med. Genet. 42 (3): 235–9. Дои:10.1136 / jmg.2004.024075. ЧВК  1736007. PMID  15744037.
14. Баттула В.Л., Эванс К.В., Холлиер Б.Г., Ши Й., Марини ФК, Айянан А., Ван Р.Й., Брискен С., Герра Р., Андрефф М., Мани С.А. (июнь 2010 г.). «Эпителиально-мезенхимальные клетки, производные от переходных процессов, демонстрируют потенциал множественной дифференцировки, аналогичный мезенхимальным стволовым клеткам». Стволовые клетки. 28 (8): 1435–45. Дои:10.1002 / шток.467. ЧВК  3523728. PMID  20572012.
15. Мани С.А., Ян Дж., Брукс М., Шванингер Дж., Чжоу А., Миура Н., Куток Дж. Л., Хартвелл К., Ричардсон А. Л., Вайнберг Р. А. (июнь 2007 г.). «Мезенхима Forkhead 1 (FOXC2) играет ключевую роль в метастазировании и связана с агрессивным базальным раком груди». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 104 (24): 10069–74. Дои:10.1073 / pnas.0703900104. ЧВК  1891217. PMID  17537911.

дальнейшее чтение

• Fauret AL, Tuleja E, Jeunemaitre X, Vignes S (2010). «Новая миссенс-мутация и два микроорганизма в гене FOXC2 в трех семьях с синдромом лимфедема-дистихиаз». Лимфология. 43 (1): 14–8. PMID  20552815.
• Витте М.Х., Эриксон Р.П., Халил М. и др. (2009). «Синдром лимфедема-дистихиаз без мутации FOXC2: доказательства дупликации хромосомы 16 выше FOXC2». Лимфология. 42 (4): 152–60. PMID  20218083.
• де Моой Ю.М., ван ден Аккер Н.М., Беккер М.Н. и др. (2009). «Аномальная экспрессия Shh и FOXC2 коррелирует с аберрантным лимфатическим развитием у плодов человека с повышенной затылочной прозрачностью». Пренат. Диаг. 29 (9): 840–6. Дои:10.1002 / pd.2316. PMID  19548265. S2CID  2293233.
• Sano H, Leboeuf JP, Новицкий С.В. и др. (2010). «Фактор транскрипции Foxc2 регулирует ангиогенез опухоли». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 392 (2): 201–6. Дои:10.1016 / j.bbrc.2010.01.015. ЧВК  2822046. PMID  20060810.
• Фрибург М., Хейтинк М.В., Дамстра Р.Дж. и др. (2008). «Синдром лимфедема-дистихиаз: особый тип первичной лимфедемы, вызванной мутациями в гене FOXC2». Int. J. Dermatol. 47 Дополнение 1: 52–5. Дои:10.1111 / j.1365-4632.2008.03962.x. PMID  18986489. S2CID  10265549.
• Куме Т. (2008). «Фактор транскрипции Foxc2: недавно описанный регулятор ангиогенеза». Тенденции Кардиоваск. Med. 18 (6): 224–8. Дои:10.1016 / j.tcm.2008.11.003. ЧВК  2674371. PMID  19185813.
• Йошида Т., Като К., Фуджимаки Т. и др. (2009). «Связь полиморфизма гена аполипопротеина E с хроническим заболеванием почек у японцев с метаболическим синдромом». Геномика. 93 (3): 221–6. Дои:10.1016 / j.ygeno.2008.11.001. PMID  19056482.
• Ма GC, Лю С.С., Чанг С.П. и др. (2008). «Повторяющаяся миссенс-мутация ITGA9 у плодов человека с тяжелым хилотораксом: возможная корреляция с плохим ответом на терапию плода». Пренат. Диаг. 28 (11): 1057–63. Дои:10.1002 / pd.2130. PMID  18973153. S2CID  206346009.
• Йергес Л. М., Клей Л., Каули Дж. А. и др. (2009). «Исследование ассоциации с высокой плотностью 383 генов-кандидатов на объемную МПК шейки бедра и поясничного отдела позвоночника среди мужчин старшего возраста». J. Bone Miner. Res. 24 (12): 2039–49. Дои:10.1359 / jbmr.090524. ЧВК  2791518. PMID  19453261.
• Лу И, Долле М.Э, Имхольц С. и др. (2008). «Множественные генетические варианты по пути-кандидату влияют на концентрацию холестерина липопротеинов высокой плотности в плазме». J. Lipid Res. 49 (12): 2582–9. Дои:10.1194 / мл. M800232-JLR200. PMID  18660489.
• ван Стинсель М.А., Дамстра Р.Дж., Хейтинк М.В. и др. (2009). «Новые миссенс-мутации в гене FOXC2 изменяют транскрипционную активность». Гм. Мутат. 30 (12): E1002–9. Дои:10.1002 / humu.21127. PMID  19760751. S2CID  7674502.
• Паппа К.И., Газули М., Эконому К. и др. (2010). «Сахарный диабет беременных имеет общие полиморфизмы генов, связанных с инсулинорезистентностью и диабетом 2 типа у греческого населения». Гинекологическая эндокринология. 27 (4): 267–272. Дои:10.3109/09513590.2010.490609. PMID  20540670. S2CID  28980963.
• Джослин Г., Равиндранатан А., Кисть Г. и др. (2010). «На изменение ответа на алкоголь у человека влияет изменение нейрональных сигнальных генов». Алкоголь. Clin. Exp. Res. 34 (5): 800–12. Дои:10.1111 / j.1530-0277.2010.01152.x. PMID  20201926.
• Фабретто А., Шардлоу А., Фалетра Ф. и др. (2010). «Случай синдрома лимфедема-дистихиаза, несущего новую мутацию сдвига рамки считывания FOXC2 de novo». Офтальмологический генет. 31 (2): 98–100. Дои:10.3109/13816811003620517. PMID  20450314. S2CID  22263077.
• Ghalamkarpour A, Debauche C, Haan E и др. (2009). «Спорадический генерализованный внутриутробный отек, вызванный мутациями в лимфангиогенных генах VEGFR3 и FOXC2». J. Pediatr. 155 (1): 90–3. Дои:10.1016 / j.jpeds.2009.02.023. PMID  19394045.
• Силандер К., Аланн М., Кристианссон К. и др. (2008). Janssens AC (ред.). «Гендерные различия в профилях генетического риска сердечно-сосудистых заболеваний». PLOS ONE. 3 (10): e3615. Дои:10.1371 / journal.pone.0003615. ЧВК  2574036. PMID  18974842.
• Деллинджер М.Т., Том К., Бернас М.Дж. и др. (2008). «Новая миссенс-мутация FOXC2, выявленная у пациента с синдромом лимфедема-дистихиаза, и обзор». Лимфология. 41 (3): 98–102. PMID  19013876.
• Corpeleijn E, Petersen L, Holst C и др. (2010). «Связанные с ожирением полиморфизмы и их связь со способностью регулировать окисление жиров у тучных европейцев: исследование NUGENOB». Ожирение (Серебряная весна). 18 (7): 1369–77. Дои:10.1038 / обy.2009.377. PMID  19876004. S2CID  205527246.
• Хорра А., Салазар Дж., Ферре Р. и др. (2009). «Экспрессия генов Prox-1 и FOXC2 в жировой ткани: потенциальный вклад лимфатической системы в семейную комбинированную гиперлипидемию». Атеросклероз. 206 (2): 343–5. Дои:10.1016 / j.atherosclerosis.2009.02.026. PMID  19339011.

внешняя ссылка

• GeneReviews / NCBI / NIH / UW запись о синдроме лимфедема-дистихиаз