E2F1 - E2F1

E2F1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1П24, 1O9K, 2AZE
Идентификаторы
Псевдонимы	E2F1, E2F-1, RBAP1, RBBP3, RBP3, фактор транскрипции E2F 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 189971 MGI: 101941 ГомолоГен: 3828 Генные карты: E2F1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q11.22 Начинать 33,675,477 бп[1] Конец 33,686,385 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 H1 | 2 76,79 см Начинать 154,559,407 бп[2] Конец 154,569,892 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • связывание фактора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • активность димеризации белков • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • последовательное связывание ДНК • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание протеинкиназы • GO: 0001158 Связывание с ДНК проксимальной области корового промотора, специфичное для последовательности • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • цитоплазма • комплекс регуляторов транскрипции • Rb-E2F комплекс • ядерный хроматин • ядро клетки • митохондрия • нуклеоплазма • центросома • макромолекулярный комплекс • Комплекс факторов транскрипции РНК-полимеразы II Биологический процесс • клеточный ответ на стимул фактора роста нервов • отрицательная регуляция дифференцировки жировых клеток • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • процесс апоптоза линзовых волокон • негативная регуляция транскрипции, вовлеченная в G1 / S переход митотического клеточного цикла • положительное регулирование пролиферации фибробластов • отрицательная регуляция связывания ДНК • отрицательное регулирование пролиферации жировых клеток • Контрольная точка повреждения ДНК • клеточный ответ на ксенобиотический стимул • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • регулирование клеточного цикла • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция G1 / S перехода митотического клеточного цикла • стабилизация мРНК • положительная регуляция вставки белка в митохондриальную мембрану, участвующую в сигнальном пути апоптоза • положительная регуляция экспрессии генов • клеточный ответ на жирную кислоту • Anoikis • сперматогенез • внутренний апоптотический сигнальный путь в ответ на повреждение ДНК • внутренний апоптотический сигнальный путь медиатором класса p53 • клеточный цикл • развитие переднего мозга • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • клеточный ответ на гипоксию • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • апоптотический процесс • Ответ на повреждение ДНК, передача сигнала медиатором класса p53, приводящая к остановке клеточного цикла • регуляция транскрипции, вовлеченная в G1 / S переход митотического клеточного цикла • положительная регуляция апоптотического процесса • отрицательное регулирование перехода G0 на G1 • положительная регуляция пролиферации глиальных клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1869	13555
Ансамбль	ENSG00000101412	ENSMUSG00000027490
UniProt	Q01094	Q61501
RefSeq (мРНК)	NM_005225	NM_007891 NM_001291105
RefSeq (белок)	NP_005216	NP_001278034 NP_031917
Расположение (UCSC)	Chr 20: 33.68 - 33.69 Мб	Chr 2: 154,56 - 154,57 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции E2F1 это белок что у людей кодируется E2F1 ген.^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства E2F факторы транскрипции. Семейство E2F играет решающую роль в управлении клеточный цикл и действие подавитель опухолей белков, а также является мишенью для трансформирующих белков небольших ДНК опухолевых вирусов. Белки E2F содержат несколько эволюционно консервативных доменов, обнаруженных у большинства членов этого семейства. Эти домены включают ДНК-связывающий домен, домен димеризации, который определяет взаимодействие с регулируемыми дифференцировкой белками факторов транскрипции (DP), доменом трансактивации, обогащенным кислыми аминокислотами, и доменом ассоциации белка-супрессора опухоли, который встроен в домен трансактивации. Этот белок и еще 2 члена, E2F2 и E2F3, имеют дополнительный связывающий циклин домен. Этот белок связывается преимущественно с белок ретинобластомы pRB в зависимости от клеточного цикла. Он может опосредовать как пролиферацию клеток, так и p53 -зависимый / независимый апоптоз.^[6]

Транскрипция

Промотор E2F1 [PAX8] => E2F1 PMID  21602887

Взаимодействия

E2F1 был показан взаимодействовать с:

• ARID3A,^[7]
• CUL1,^[8]
• Циклин А1,^[9]
• Циклин А2,^[10]
• GTF2H1,^[11]
• MDM4,^[12]
• NCOA6,^[13]
• NDN,^[14][15]
• NPDC1,^[16]
• ПУРА,^[17]
• PHB,^{[18][19][20][21]}
• RB1,^{[14][22][23][24][25][26][27]}
• RBL1,^[22]
• SKP2,^[8]
• SP1,^[28][29][30]
• SP2,^[28]
• SP3,^[28]
• SP4,^[28]
• TFDP1^{[7][27][31][32]}
• TOPBP1,^[33][34]
• TP53BP1,^[25] и
• UBC.^[35]

Смотрите также

• E2F
• Белок ретинобластомы

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101412 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027490 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нойман Э., Селлерс В. Р., Макнил Дж. А., Лоуренс Дж. Б., Келин В. Г. (декабрь 1996 г.). «Структура и частичная геномная последовательность гена E2F1 человека». Ген. 173 (2): 163–9. Дои:10.1016/0378-1119(96)00184-9. PMID  8964493.
6. «Ген Entrez: фактор транскрипции E2F1 E2F 1».
7. Сузуки М., Окуяма С., Окамото С., Ширасуна К., Накадзима Т., Хачия Т., Нодзима Х., Секия С., Ода К. (август 1998 г.). «Новый связывающий E2F белок с мотивом HLH Myc-типа стимулирует E2F-зависимую транскрипцию путем образования гетеродимера». Онкоген. 17 (7): 853–65. Дои:10.1038 / sj.onc.1202163. PMID  9780002.
8. Марти А., Вирбелауэр С., Шеффнер М., Крек В. (май 1999 г.). «Взаимодействие между убиквитин-протеинлигазой SCFSKP2 и E2F-1 лежит в основе регуляции деградации E2F-1». Nat. Cell Biol. 1 (1): 14–9. Дои:10.1038/8984. PMID  10559858. S2CID  8884226.
9. Ян Р., Мюллер С., Хюин В., Фунг Ю.К., Йи А.С., Кёффлер Х.П. (март 1999 г.). «Функции циклина A1 в клеточном цикле и его взаимодействия с фактором транскрипции E2F-1 и белками семейства Rb». Мол. Клетка. Биол. 19 (3): 2400–7. Дои:10.1128 / mcb.19.3.2400. ЧВК  84032. PMID  10022926.
10. Сюй М., Шеппард К.А., Пэн С.Й., Йи А.С., Пивница-Вормс Х. (декабрь 1994 г.). «Циклин A / CDK2 связывается непосредственно с E2F-1 и ингибирует ДНК-связывающую активность E2F-1 / DP-1 путем фосфорилирования». Мол. Клетка. Биол. 14 (12): 8420–31. Дои:10.1128 / MCB.14.12.8420. ЧВК  359381. PMID  7969176.
11. Вандель Л., Кузаридес Т. (август 1999 г.). «Остатки, фосфорилированные TFIIH, необходимы для разложения E2F-1 во время S-фазы». EMBO J. 18 (15): 4280–91. Дои:10.1093 / emboj / 18.15.4280. ЧВК  1171504. PMID  10428966.
12. Strachan GD, Jordan-Sciutto KL, Rallapalli R, Tuan RS, Hall DJ (февраль 2003 г.). «Фактор транскрипции E2F-1 негативно регулируется своим взаимодействием с белком MDMX». J. Cell. Биохим. 88 (3): 557–68. Дои:10.1002 / jcb.10318. PMID  12532331. S2CID  38805122.
13. Kong HJ, Yu HJ, Hong S, Park MJ, Choi YH, An WG, Lee JW, Cheong J (ноябрь 2003 г.). «Взаимодействие и функциональное сотрудничество усиливаемого раком транскрипционного коактиватора, активирующего сигнал коинтегратора-2 и E2F-1 в пролиферации клеток». Мол. Рак Res. 1 (13): 948–58. PMID  14638867.
14. Таниура Х., Танигучи Н., Хара М., Йошикава К. (январь 1998 г.). «Некдин, постмитотический нейрон-специфический супрессор роста, взаимодействует с вирусными трансформирующими белками и клеточным фактором транскрипции E2F1». J. Biol. Chem. 273 (2): 720–8. Дои:10.1074 / jbc.273.2.720. PMID  9422723.
15. Кувако К., Таниура Х, Йошикава К. (январь 2004 г.). «Связанные с некдином белки MAGE по-разному взаимодействуют с фактором транскрипции E2F1 и рецептором нейротрофина p75». J. Biol. Chem. 279 (3): 1703–12. Дои:10.1074 / jbc.M308454200. PMID  14593116.
16. Sansal I, Dupont E, Toru D, Evrard C, Rouget P (октябрь 2000 г.). «NPDC-1, регулятор пролиферации и дифференцировки нервных клеток, взаимодействует с E2F-1, снижает его связывание с ДНК и модулирует его транскрипционную активность». Онкоген. 19 (43): 5000–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1203843. PMID  11042687.
17. Дарбинян Н., Галлия Г.Л., Кунду М., Щербик Н., Третьякова А., Джордано А., Халили К. (ноябрь 1999 г.). «Ассоциация Pur alpha и E2F-1 подавляет транскрипционную активность E2F-1». Онкоген. 18 (46): 6398–402. Дои:10.1038 / sj.onc.1203011. PMID  10597240.
18. Джоши Б., Ко Д., Ордонез-Эркан Д., Челлаппан С. П. (декабрь 2003 г.). «Предполагаемого спирального домена запретитина достаточно для репрессии опосредованной E2F1 транскрипции и индукции апоптоза». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 312 (2): 459–66. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.10.148. PMID  14637159.
19. Fusaro G, Dasgupta P, Rastogi S, Joshi B, Chellappan S (ноябрь 2003 г.). «Prohibitin индуцирует транскрипционную активность p53 и экспортируется из ядра при передаче сигналов апоптоза». J. Biol. Chem. 278 (48): 47853–61. Дои:10.1074 / jbc.M305171200. PMID  14500729.
20. Ван С., Чжан Б., Фаллер Д.В. (июнь 2002 г.). «Prohibitin требует Brg-1 и Brm для подавления E2F и роста клеток». EMBO J. 21 (12): 3019–28. Дои:10.1093 / emboj / cdf302. ЧВК  126057. PMID  12065415.
21. Ван С., Нат Н., Фусаро Г., Челлаппан С. (ноябрь 1999 г.). «Rb и запретитин нацелены на отдельные области E2F1 для репрессии и отвечают на различные восходящие сигналы». Мол. Клетка. Биол. 19 (11): 7447–60. Дои:10.1128 / mcb.19.11.7447. ЧВК  84738. PMID  10523633.
22. Дайсон Н., Дембски М., Фаттей А., Нгву С., Юэн М., Хелин К. (декабрь 1993 г.). «Анализ p107-ассоциированных белков: p107 ассоциирует с формой E2F, которая отличается от pRB-ассоциированного E2F-1». Дж. Вирол. 67 (12): 7641–7. Дои:10.1128 / JVI.67.12.7641-7647.1993. ЧВК  238233. PMID  8230483.
23. Николас Э., Айт-Си-Али С., Труш Д. (август 2001 г.). «Гистондеацетилаза HDAC3 нацеливает RbAp48 на белок ретинобластомы». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (15): 3131–6. Дои:10.1093 / nar / 29.15.3131. ЧВК  55834. PMID  11470869.
24. Пардо П.С., Люнг Дж. К., Луччези Дж. К., Перейра-Смит О. М. (декабрь 2002 г.). «MRG15, новый белок хромодомена, присутствует в двух различных мультибелковых комплексах, участвующих в активации транскрипции». J. Biol. Chem. 277 (52): 50860–6. Дои:10.1074 / jbc.M203839200. PMID  12397079.
25. Choubey D, Li SJ, Datta B, Gutterman JU, Lengyel P (октябрь 1996 г.). «Ингибирование E2F-опосредованной транскрипции с помощью p202». EMBO J. 15 (20): 5668–78. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00951.x. ЧВК  452311. PMID  8896460.
26. Fajas L, Paul C, Zugasti O, Le Cam L, Polanowska J, Fabbrizio E, Medema R, Vignais ML, Sardet C (июль 2000 г.). «pRB связывается и модулирует трансрепрессирующую активность E1A-регулируемого фактора транскрипции p120E4F». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (14): 7738–43. Bibcode:2000PNAS ... 97.7738F. Дои:10.1073 / pnas.130198397. ЧВК  16614. PMID  10869426.
27. Ву С.Л., Цукерберг Л.Р., Нгву К., Харлоу Е., Лис Дж. А. (май 1995 г.). «Связь in vivo белков семейства E2F и DP». Мол. Клетка. Биол. 15 (5): 2536–46. Дои:10.1128 / mcb.15.5.2536. ЧВК  230484. PMID  7739537.
28. Rotheneder H, Geymayer S, Haidweger E (ноябрь 1999 г.). «Факторы транскрипции семейства Sp1: взаимодействие с E2F и регуляция промотора мышиной тимидинкиназы». J. Mol. Биол. 293 (5): 1005–15. Дои:10.1006 / jmbi.1999.3213. PMID  10547281.
29. Lin SY, Black AR, Kostic D, Pajovic S, Hoover CN, Azizkhan JC (апрель 1996 г.). «Регулируемая клеточным циклом ассоциация E2F1 и Sp1 связана с их функциональным взаимодействием». Мол. Клетка. Биол. 16 (4): 1668–75. Дои:10.1128 / MCB.16.4.1668. ЧВК  231153. PMID  8657142.
30. Карлседер Дж., Ротенедер Х., Винтерсбергер Э. (апрель 1996 г.). «Взаимодействие Sp1 с фактором транскрипции E2F, регулируемым ростом и клеточным циклом». Мол. Клетка. Биол. 16 (4): 1659–67. Дои:10.1128 / mcb.16.4.1659. ЧВК  231152. PMID  8657141.
31. Сардет К., Видал М., Кобриник Д., Гэн Й., Онуфрик С., Чен А., Вайнберг Р.А. (март 1995 г.). «E2F-4 и E2F-5, два члена семейства E2F, экспрессируются на ранних фазах клеточного цикла». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (6): 2403–7. Bibcode:1995PNAS ... 92.2403S. Дои:10.1073 / пнас.92.6.2403. ЧВК  42492. PMID  7892279.
32. Хелин К., Ву К.Л., Фаттей А.Р., Лис Дж. А., Динлахт Б. Д., Нгву К., Харлоу Э. (октябрь 1993 г.). «Гетеродимеризация факторов транскрипции E2F-1 и DP-1 приводит к совместной трансактивации». Genes Dev. 7 (10): 1850–61. Дои:10.1101 / gad.7.10.1850. PMID  8405995.
33. Лю К., Линь Ф.Т., Рупперт Дж. М., Линь В. К. (май 2003 г.). «Регулирование E2F1 с помощью белка TopBP1, содержащего домен BRCT». Мол. Клетка. Биол. 23 (9): 3287–304. Дои:10.1128 / mcb.23.9.3287-3304.2003. ЧВК  153207. PMID  12697828.
34. Yu X, Chini CC, He M, Mer G, Chen J (октябрь 2003 г.). «Домен BRCT представляет собой домен, связывающий фосфо-белок». Наука. 302 (5645): 639–42. Bibcode:2003Наука ... 302..639Y. Дои:10.1126 / science.1088753. PMID  14576433. S2CID  29407635.
35. Чжоу Ф, Чжан Л., Ван А, Сонг Б., Гонг К., Чжан Л., Ху М., Чжан Х, Чжао Н., Гонг Y (май 2008 г.). «Связь GSK3 beta с E2F1 способствует дифференцировке нервных клеток, индуцированной фактором роста нервов». J. Biol. Chem. 283 (21): 14506–15. Дои:10.1074 / jbc.M706136200. PMID  18367454.

дальнейшее чтение

• Dupont E, Sansal I, Toru D, Evrard C, Rouget P (1997). «[Идентификация NPDC-1, гена, участвующего в контроле пролиферации и дифференцировки нейральных и глиальных предшественников]». C. R. Séances Soc. Биол. Fil. 191 (1): 95–104. PMID  9181131.
• Стивенс К., Ла Танге Н.Б. (2005). «Возникающая роль E2F-1 в ответе на повреждение ДНК и контроле контрольных точек». Ремонт ДНК (Amst.). 3 (8–9): 1071–9. Дои:10.1016 / j.dnarep.2004.03.034. PMID  15279795.
• Чжан З., Ван Х., Ли М., Рейберн Э., Агравал С., Чжан Р. (2006). «Новые р53-независимые функции MDM2, идентифицированные с помощью технологий подавления РНК». Анна. Акад. Наука. 1058 (1): 205–14. Дои:10.1196 / летопись.1359.030. PMID  16394138. S2CID  35683657.
• Шильд С., Вирт М., Райхерт М., Шмид Р.М., Заур Д., Шнайдер Г. (июль 2009 г.). «Передача сигналов PI3K поддерживает экспрессию c-myc для регулирования транскрипции E2F1 в клетках рака поджелудочной железы». Мол. Канцероген. 48 (12): 1149–58. Дои:10.1002 / mc.20569. PMID  19603422. S2CID  41545085.

внешняя ссылка

• E2F1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• FactorBook E2F1

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.