NFATC3 - NFATC3

NFATC3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2XRW, 2XS0
Идентификаторы
Псевдонимы	NFATC3, NFAT4, NFATX, ядерный фактор активированных Т-клеток 3, ядерный фактор активированных Т-клеток 3, NF-AT4c
Внешние идентификаторы	OMIM: 602698 MGI: 103296 ГомолоГен: 27827 Генные карты: NFATC3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16q22.1 Начните 68,084,751 бп[1] Конец 68,229,259 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 D3 | 8 53,08 см Начните 106,058,840 бп[2] Конец 106,130,537 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание хроматина • связывание фактора транскрипции Сотовый компонент • цитоплазма • нуклеоплазма • ядро клетки • цитозоль • комплекс регуляторов транскрипции Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • Сигнальный путь рецептора Fc-эпсилон • воспалительная реакция • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция транскрипции pri-miRNA с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция дифференцировки клеток гладких мышц сосудов • производство цитокинов • сигнальный каскад кальциневрин-NFAT • развитие многоклеточного организма Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	4775	18021
Ансамбль	ENSG00000072736	ENSMUSG00000031902
UniProt	Q12968	P97305
RefSeq (мРНК)	NM_173165 NM_004555 NM_173163 NM_173164	NM_010901 NM_001368796 NM_001368797
RefSeq (белок)	NP_004546 NP_775186 NP_775188 NP_004546.1 NP_775188.1	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 16: 68.08 - 68.23 Мб	Chr 8: 106.06 - 106.13 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ядерный фактор активированных Т-клеток, цитоплазматический 3 это белок что у людей кодируется NFATC3 ген.^[5][6]

Функция

Продукт этого гена является членом ядерных факторов ДНК-связывающего транскрипционного комплекса активированных Т-клеток. Этот комплекс состоит по крайней мере из двух компонентов: ранее существовавшего цитозольного компонента, который перемещается в ядро ​​при стимуляции рецептора Т-клеток (TCR), и индуцибельного ядерного компонента. Другие члены этой семьи также участвуют в формировании этого комплекса. Продукт этого гена играет роль в регуляции экспрессии генов в Т-клетках и незрелых тимоцитах. Для этого гена были идентифицированы четыре варианта транскрипта, кодирующие различные изоформы.^[6]

Смотрите также

• NFAT

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000072736 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031902 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Хои Т., Сунь Ю.Л., Уильямсон К., Сюй Х (май 1995 г.). «Выделение двух новых членов семейства генов NF-AT и функциональная характеристика белков NF-AT». Иммунитет. 2 (5): 461–72. Дои:10.1016/1074-7613(95)90027-6. PMID  7749981.
6. «Ген Entrez: ядерный фактор NFATC3 активированных Т-клеток, цитоплазматический, кальциневрин-зависимый 3».

дальнейшее чтение

• Рао А., Ло С., Хоган П. Г. (1997). «Факторы транскрипции семейства NFAT: регуляция и функция». Ежегодный обзор иммунологии. 15: 707–47. Дои:10.1146 / annurev.immunol.15.1.707. PMID  9143705.
• Crabtree GR (март 1999 г.). «Общие сигналы и конкретные результаты: передача сигналов через Ca2 +, кальциневрин и NF-AT». Ячейка. 96 (5): 611–4. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80571-1. PMID  10089876. S2CID  8817053.
• Хорсли В., Павлат Г.К. (март 2002 г.). «NFAT: повсеместный регулятор дифференцировки и адаптации клеток». Журнал клеточной биологии. 156 (5): 771–4. Дои:10.1083 / jcb.200111073. ЧВК  2173310. PMID  11877454.
• Масуда Э.С., Наито Ю., Токумицу Х., Кэмпбелл Д., Сайто Ф., Ханнум К., Араи К., Араи Н. (май 1995 г.). «NFATx, новый член ядерного фактора семейства активированных Т-клеток, который преимущественно экспрессируется в тимусе». Молекулярная и клеточная биология. 15 (5): 2697–706. Дои:10.1128 / mcb.15.5.2697. ЧВК  230500. PMID  7739550.
• Jabado N, Le Deist F, Fisher A, Hivroz C (ноябрь 1994 г.). «Взаимодействие gp120 ВИЧ и антител к CD4 с молекулой CD4 на человеческих CD4 + Т-клетках ингибирует связывающую активность NF-AT, NF-каппа B и AP-1, трех ядерных факторов, регулирующих активность энхансера гена интерлейкина-2». Европейский журнал иммунологии. 24 (11): 2646–52. Дои:10.1002 / eji.1830241112. PMID  7957556.
• Vacca A, Farina M, Maroder M, Alesse E, Screpanti I, Frati L, Gulino A (ноябрь 1994 г.). «Вирус иммунодефицита человека типа 1 tat усиливает активность промотора интерлейкина-2 за счет синергизма с сложным эфиром форбола и опосредованной кальцием активации цис-регуляторного мотива NF-AT». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 205 (1): 467–74. Дои:10.1006 / bbrc.1994.2689. PMID  7999066.
• Ди Сомма М.М., Майолини М.Б., Бурастеро С.Е., Телфорд Дж. Л., Балдари Коннектикут (сентябрь 1996 г.). «Чувствительность длинного концевого повтора ВИЧ-1 к циклоспорину А позволяет идентифицировать различные p56lck-зависимые пути, активируемые запуском CD4». Европейский журнал иммунологии. 26 (9): 2181–8. Дои:10.1002 / eji.1830260933. PMID  8814265.
• Масуда Э.С., Лю Дж., Имамура Р., Имаи С.И., Араи К.И., Араи Н. (апрель 1997 г.). «Контроль ядерной транслокации NFATx1 с помощью регулируемого кальциневрином ингибиторного домена». Молекулярная и клеточная биология. 17 (4): 2066–75. Дои:10.1128 / mcb.17.4.2066. ЧВК  232054. PMID  9121455.
• Чоу К.В., Ринкон М., Кавана Дж., Диккенс М., Дэвис Р.Дж. (ноябрь 1997 г.). «Ядерное накопление NFAT4 противодействует пути передачи сигнала JNK». Наука. 278 (5343): 1638–41. Bibcode:1997Sci ... 278.1638C. Дои:10.1126 / science.278.5343.1638. PMID  9374467.
• Амасаки Ю., Масуда Е.С., Имамура Р., Араи К., Араи Н. (март 1998 г.). «Определенные белки семейства NFAT вовлечены в ядерные комплексы связывания NFAT-ДНК из субпопуляций тимоцитов человека». Журнал иммунологии. 160 (5): 2324–33. PMID  9498773.
• Чжу Дж., Шибасаки Ф., Прайс Р., Гиллемо Дж. К., Яно Т., Дёч В., Вагнер Г., Феррара П., МакКеон Ф. (май 1998 г.). «Внутримолекулярное маскирование ядерного сигнала импорта на NF-AT4 казеинкиназой I и MEKK1». Ячейка. 93 (5): 851–61. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81445-2. PMID  9630228. S2CID  9515426.
• Арамбуру Дж., Гарсия-Козар Ф., Рагхаван А., Окамура Х., Рао А., Хоган П. Г. (апрель 1998 г.). «Селективное ингибирование активации NFAT пептидом, охватывающим сайт нацеливания кальциневрина NFAT». Молекулярная клетка. 1 (5): 627–37. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80063-5. PMID  9660947.
• Имамура Р., Масуда Е.С., Наито Ю., Имаи С., Фуджино Т., Такано Т., Араи К., Араи Н. (октябрь 1998 г.). «Карбокси-концевая 15-аминокислотная последовательность NFATx1, возможно, создается тканеспецифическим сплайсингом и необходима для трансактивационной активности в Т-клетках». Журнал иммунологии. 161 (7): 3455–63. PMID  9759864.
• Лофтус Б.Дж., Ким Ю.Дж., Снеддон В.П., Калуш Ф., Брэндон Р., Фурманн Дж., Мейсон Т., Кросби М.Л., Барнстед М., Кронин Л., Деслаттес Мейс А., Цао Y, Сюй RX, Кан Х.Л., Митчелл С., Эйхлер Э. ПК, Вентер Дж. С., Адамс, доктор медицины (сентябрь 1999 г.). «Дупликации генома и другие особенности в 12 Mb последовательности ДНК из хромосомы 16p и 16q человека». Геномика. 60 (3): 295–308. Дои:10.1006 / geno.1999.5927. PMID  10493829.
• Амасаки Ю., Адачи С., Исида Ю., Ивата М., Араи Н., Араи К., Миятаке С. (июль 2002 г.). «Конститутивно ядерная форма NFATx проявляет эффективную трансактивационную активность и индуцирует дифференцировку CD4 (+) CD8 (+) Т-клеток» (PDF). Журнал биологической химии. 277 (28): 25640–8. Дои:10.1074 / jbc.M201860200. PMID  11997392. S2CID  27918489.
• Chagnon P, Michaud J, Mitchell G, Mercier J, Marion JF, Drouin E, Rasquin-Weber A, Hudson TJ, Richter A (декабрь 2002 г.). «Миссенс-мутация (R565W) цирроза печени (FLJ14728) при циррозе у детей в Северной Америке». Американский журнал генетики человека. 71 (6): 1443–9. Дои:10.1086/344580. ЧВК  378590. PMID  12417987.

внешние ссылки

• NFATC3 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.